בקרת ביטוי גנים בחיידקים-הרצאה 10 ד"ר יונתן פרידמן Flashcards

1
Q

באילו רמות יכולה להתבצע בקרת גנים?

A

שעתוק, תרגום , פעילות

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

מהו יחס הזמנים בין שיעתוק ותרגום בחיידקים?

A

קורה בו זמנית

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

באיזה צורה מאורגנים רוב הגנים בפרוקריוטים?

A

באופרונים

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

מהו אופרון?

A

רצף של גנים שמשועתקים יחד ביצורים פרוקריוטים

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

ממה מורכב האופרון?

A

איזור בקרה אחד או שניים - פרומוטור ואופרטור, וגנים.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

מהו הפרומוטור?

A

האיזור אליו נקשר הרנ”א פולימראז

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

מה עלול להיקשר לאופרטור ולהפריע לשיעתוק?

A

רפרסור

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

מהי בקרת עידוד (אינדקשן)

A

הגברת שיעתוק

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

כיצד עובד אופרון הארגינין?

A

באיתות סיגנל, נקשר רפרסור
לאופרטור, שיכול למנוע מהפולימרז לשעתק. הארגינין משמש ככקו רפרסור שעוזר לרפרסור להיקשר לפרומוטור
ולהפסיק לייצר ארגינין
(עיכוב על ידי תוצר)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

מהו הקו-רפרסור

A

מולקולה קטנה שנקשרת לרפרסור, משנה את הקונפורמציה ועוזרת לקישור
הרפרסור לאופרטור ומונעת שיעתוק

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

אופרון המלטוז הוא דוגמה לאיזה סוג של בקרה?

A

בקרה חיובית

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

מדוע הפולימראז צריך סיוע בקישור לפרומוטור שלו באופרון המלטוז?

A

בשל זיקה נמוכה בין הפולימראז לאופרון

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

מי עוזר לפולימרז להיקשר לפרומוטור?

A

האינדיוסר

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

מתי האקטיבטור יכול לצאת לעזרת הרנ”א פולימראז להתחבר לאקטיבטור?

A

בנוכחות אינדיוסר, המלטוז

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

למה מקודד אופרון הלקטוז?

A

לגנים שאמורים לפרק את הלקטוז

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

מהם הגנים שנמצאים על אופרון הלקטוז?

A

lacZ, lacY, lacA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

מה תפקיד האינדיוסר באופרון הלקטוז?

A

משחרר את הרפרסור מהאופרון ולאפשר שיעתוק תקין של הגנים לפירוק הלקטוז

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

איך נקרא האינדיוסר באופרון הלקטוז?

A

אלו-לקטוז

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

כשחיידק חי בסביבה שיש בה מקורות פחמן שונים, האם תיווצר רמה של אנזימי פירוק לכל מקורות הפחמן?

A

לא, ייוצרו אנזימי פירוק בהתאם למקור המועדף

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

מהי הבקרה הגלובלית על אופרון הלקטוז?

A

כשכמות הגלוקוז בתא נמוכה, ציקליק AMP
נקשר לפקטור שיעתוק CRP
CRP נקשר לרנ”א פולימראז ומתבצע שיעתוק

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

כשהגלוקוז נמוך, רמת הציקליק AMP

A

עולה

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

מהו האיזון בין גלוקוז ללקטוז אשר מבטיח שיעתוק של הגנים באופרון הלקטוז?

A

מעט גלוקוז, הרבה לקטוז

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

מהי רמת השיעתוק כשיש מעט גלוקוז והרבה לקטוז?

A

יש שיעתוק משמעותי

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

מהי רמת השיעתוק כשיש

הרבה גלוקוז ולקטוז נמוך?

A

אין שיעתוק

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
מהי רמת השיעתוק כשיש | מעט לקטוז ומעט גלוקוז?
אין שיעתוק
26
מהי רמת השיעתוק כשיש | הרבה לקטוז והרבה גלוקוז?
אין שיעתוק, כי התא מעדיף להשתמש בגלוקוז לפני לקטוז
27
אילו רמות של גלוקוז ולקטוז יתנו ביטוי משמעותי של שעתוק אופרון הלקטוז?
מעט גלוקוז והרבה לקטוז
28
כיצד פועלת בקרת תרגום sRNA?
יכול להיקשר לאתר קשירת הריבוזום או בכך לעכב תרגום/לעודד תרגול על ידי פתיחת ההתעקלות של ה--מרנ"א יכול לעודד קישור של ריבונוקלאז או להגן מפניו
29
האם sRNA | יכול גם לעודד תרגום?
כן, כאשר הוא נקשר לרנ"א במקום להיקשר אל איזור קישור הריבוזום
30
על פי ההערכה, מתי הופיעו חיידקים לראשונה?
לפני כ-3.5-4 מיליארד שנים
31
באיזו סביבת אוויר הופיעו החיידקים הראשונים?
סביבה ללא אוויר
32
על כמה מהביומסה אחראים הפרוקריוטים בכדור הארץ?
כ-14%
33
על פי אילו קריטריונים מסווגים מינים של חיידקים?
לפי דימיון בגנים
34
כמה מיני חיידקים יש בכדור הארץ?
בודדו וזוהו רק 10,000 מינים | אך ההשערה היא שיש מעל מיליוני מינים
35
ככל שאנחנו נמצאים גבוה יותר בים, מה יש יותר : חיידקים או ארכאות
יש יותר חיידקים, | פחות ארכאות
36
ככל שאנחנו נמצאים עמוק יותר בים, מה יש יותר : חיידקים או ארכאות
יותר ארכאות פחות חיידקים
37
מהם פיטופלנקטונים?
אורגניזמים אשר חיים באוקיינוס
38
מה עושים הפיטופלנקטונים?
פוטוסינתזה
39
מהו שם החיידק הפוטוסינתתי הכי קטן ונפוץ בכדור הארץ?
פרוקלורוקוקוס
40
מהו החיידק הנפוץ ביותר באוקיינוס?
SAR 11
41
מהו היחס בין וירוסים לחיידקים בים?
פי עשרה יותר וירוסים מאשר חיידקים
42
באיזו צורה נפוצים הוירוסים בתוך הים?
בקטריופאג'ים
43
כמה חיידקים נמצא בגרם אדמה?
כ-10 מיליארד מיקרואורגניזמים
44
אילו חידקים נותנים לאדמה את הריח שלה?
אקטינומיצטים
45
מה מייצרים האקטינומיצטים?
אנטיביוטיקה
46
מה מאפשר לקרקע להיות קרקע פורייה להרבה מיני חיידקים?
העובדה שהיא הטרוגנית ומשתנה מאיזור לאיזור | מבחינת לחות/חמצן/מינרלים/טמפרטורה וכו'
47
מה צריכים חיידקים כדי לשרוד בתנאים קיצוניים?
אנזימים יציבים ופעילים, | ממברנה תקינה ופעילות של ריבוזומים ומקארו מולקולות אחרות
48
מהו תנאי שהכי משפיע על גידול חיידקים?
טמפרטורה
49
מה קורה לקצב גידול החיידק כשהוא נמצא אחרי טמפ' האופטימום?
יורד בצורה חדה במיוחד
50
מה קורה לממברנה בטמפ' נמוכות מאוד?
הופכת לג'ל, לא חדירה ויש עצירה של הגידול
51
מה קורה לחיידק פוטוסינתי כתוצאה מעלייה קלה בטמפ' המים?
מת ומפסיק לתפקד
52
לאילו קבוצות מחלקים את החיידקים בהתאם לטמפ' המתאימה להם?
פסיכרופילים מזופילים תרמופילים היפרתרמופילים
53
אילו חיידקים חיד בטמפ' הנמוכות?
פסיכרופילים
54
אילו חיידקים מתקיימים בתנאים החמים ביותר?
היפרתרמופילים
55
מהם חיידקים מזופילים?
חיידקים שחיים בטמפ' דומה לזו שמתאימה לבע"ח,צמחים והאדם
56
עם מה צריכים להתמודד חיידקים שחיים בחום?
דנטורציה של חלבונים
57
מהן הבעיות שנוצרות אצל חיידקים שחיים בטמפ' גבוהות?
דנטורציה של חלבונים, חדירות יתר של הממברנה, חוסר יציבות של מולקולות מסוימות
58
איזה סוג חומצות שומן יעדיפו חיידקים שנאלצים להתמודד עם חום רב?
חומצות שומן רוויות | כדי שישאירו את הממברנה מוצקה גם בהעלאת טמפ'
59
באיזו סביבה בדרך כלל חיים חיידקים פסיכורופילים?
באוקיינוסים
60
מעל איזו טמפ' סביבה לרוב חיידקים פסיכורופילים מתים?
מעל כ-5 מעלות צלסיוס
61
מהן הבעיות שנוצרות אצל חיידקים החיים בסביבה קרה?
ממברנה נוקשה, קפיאה של הממברנה
62
איזה סוג חומצות שומן יעדיפו חיידקים שנאלצים להתמודד עם קור רב?
חומצות שומן לא רוויות | כי טמפ' הקפיאה שלהם נמוכה יותר והם ישמרו על גמישות הממברנה גם בתנאי קור קיצוני
63
מהם סוגי החיידקים המחולקים לפי סביבת החומציות שבהם הם חיים?
אסידופיליים נויטרופילים אלקליפילים
64
באיזו רמת חומציות גדלים חיידקים נויטרוילים?
בין 5.4 ל8.5
65
איזה מנגנון פיתחו חיידקים אלקיליפילים ואסידופילים?
שמירה על חומציות ניטרלית תוך תאית באמצעות משאבות פרוטונים
66
מהם סוגי החיידקים המחולקים לפי סביבת המליחות | בה הם חיים
הלוטולרנטים הלופילים אקסטרים הלופילים
67
מהי סביבה היפוטונית?
סביבה שבה ריכוז המלחים בתוך בתא יותר גבוה והמים זורמים פנימה כדי לאזן את המליחות
68
מהי סביבה היפר טונית?
סביבה שהיא מלוחה יותר מפנים התא ובה המים זורמים החוצה | לשם האיזון
69
מה הסכנה בסביבה היפוטונית עבור התא?
זרימה של מים אליו שתגרום לפיצוץ התא
70
איך שורד תא בסביבת מלחים גבוה?
מגדיל את כמות המומסים מסיסי מים בתוכו, | שואב יונים מן הסביבה אל התא
71
איך מתמודד חיידק ההלופארקס הוולקניאיי שנמצא בים המלח עם רמת מליחות גבוהה במיוחד?
שומר על ריכוז תוך תאי גבוה של אשלגן
72
כיצד חיידק מתמודד עם שינוי בתנאי לחות/יובש?
1. ייצור ביוסורפקטנטים שמשאיר את המים על המשטח | 2. יצירת ביופילם המגנים מפני היובש על ידי שימור הלחות בפנים