T7 est-il lytique ou tempéré ?
Lytique
Vrai ou faux : T7 code pour sa propre ARN polymérase.
Vrai.
Vrai ou faux : T7, comme T4, est retrouvé dans les intestins de mammifères et dans les eaux d’égout.
Vrai.
Décrivez la classification du phage T7.
Famille des Podoviridae, l’ordre des Caudovirales.
Selon leur nouvelle classification, il fait partie de la famille des Autographiviridae et l’espèce est Teseptimavirus T7
Quelles sont les particularités des Podovirus et du phage T7 ?
- Ne sont capables que du cycle lytique
- Codent pour une ARN polymérase à une seule sous-unité
- Aucun phage T7 peut infecter des bactéries à Gram +
Décrivez la structure de la capside du phage T7.
- Diamètre d’environ 60 nm
- Formée principalement de la protéine gp10
- Son noyau est une structure cylindrique interne qui assure l’injection de l’ADN
- Génome T7 occupe 45 % du volume de la tête et est enroulé autour du noyau.
De quelle protéine sont composées les 6 fibres caudales ?
gp17
Quelle est la taille de génome d’un phage T7 et pour combien de gènes code-t-il ?
Environ 40 000 pb et 60 gènes.
Vrai ou faux : Les séquences de paires de base répétées à chaque extrémité du chromosome sont de la même longueur que celles chez T4.
Faux. Elles sont plus courtes (160 pb)
Nommez deux différences majeures entre le génome du phage T4 et T7.
Le génome T7 ne se circularise pas dans la cellule.
L’ADN de T7 ne contient pas de bases modifiées.
Nommez deux formes de résistance contre les enzymes de restriction chez T7.
Plusieurs sites de restriction sont sous-représentés. Des codons synonymes ont été utilisés pour éviter de former la suite de nucléotides qui est reconnue par les enzymes de restriction.
De plus, tous les génomes de phages T7 contiennent des restes d’éléments d’ADN mobiles (cela rend l’étude et l’assemblage plus difficle).
Quelles sont les 4 phases de réplication ?
- Adsorption
- Synthèse des acides nucléiques et protéines du phage
- Assemblage des virus
- Libération des virion
Comment se fait la reconnaissance et l’attachement initial du phage T7 à la bactérie ?
- L’extrémité C-terminale des fibres caudales reconnait les LPS
- L’extrémité de la queue se lie aux récepteur
Comment le phage pénètre-t-il dans la bactérie ?
- Les premières protéines libérées de la nucléocapside forment un canal à travers la membrane externe
- Les deuxièmes protéines passent par le canal et dégradent le peptidoglycane
- Le canal s’étend jusqu’à la membrane plasmique et permet l’entrée de l’ADN dans le cytoplasme
- Le reste du virion reste attaché à la surface de la cellule
Quel est l’avantage de laisser entrer l’ADN dans la cellule une section à la fois ?
- Assure que les gènes sortants soient les premiers transcrits
- Reste du génome est encore dans la capside, donc encore protégé des nucléases cellulaires
- ARN pol cellulaire recouvre STAT l’extrémité du génome (transcription + protection)
Combien de types de promoteurs existe-t-il dans le génome T7 ?
Deux types.
1. Promoteurs reconnus par l’ARN polymérase (permet la fabrication de l’ARN polymérase virale)
2. Promoteurs reconnus par l’ARN polymérase virale
Vrai ou faux : Les gènes T7 sont tous transcrits dans la même direction (pas de sens horaire et anti-horaire).
Vrai.
Quel avantage a-t-il d’avoir qu’une seule direction de la transcription ?
La régulation ! Les gènes à gauche sont toujours transcrits avant ceux à droite.
Quel est le rôle des gènes de Classe I (early gènes) ? Quand sont-ils transcrits ? Par quelle enzyme sont-ils transcrits ?
- 2 à 8 minutes après le début de l’infection
- Créent des conditions favorables dans la cellule pour le développement des phages
- Transcrits par l’ARN polymérase d’E. coli.
Les premiers gènes transcrits ont quelle fonction ?
- Protéines inhibant certaines enzymes de restriction cellulaires
- ARN polymérase virale
Qu’arrive-t-il lorsqu’il y a une accumulation d’ARN polymérase T7 ?
Cette accumulation rend superflu l’usage de l’ARN polymérase cellulaire. Cette dernière est donc inhibée.
Quelles sont les caractéristiques de l’ARN polymérase T7 ?
- Une sous-unité de 883 aa
- 5 fois plus rapide que l’ARN pol cellulaire
- Moins fidèle que l’ARN pol cellulaire
Quel est le rôle des gènes de Classe II ? Quand sont-ils transcrits ? Par quelle enzyme sont-ils transcrits ?
- 6 à 15 minutes après le début de l’infection
- Impliqués dans le métabolisme de l’ADN
- Transcrits pas l’ARN polymérase T7
- Dégradent l’ADN de l’hôte (source de nt, empêche renfermement de l’ADN de l’hôte dans la capside lors de l’assemblage)
Quels protéines ou enzymes sont produites par les gènes de classe II ? Comment la transcription de ces gènes est-elle provoquée ?
- Provoquée par l’entrée graduelle de l’ADN viral et l’accumulation de l’ARN pol T7
- ADN polymérase est transcrite
