BM9 3) Les recombinases spécifiques de site Flashcards Preview

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Flashcards in BM9 3) Les recombinases spécifiques de site Deck (22):
1

Quelles sont les 2 familles de recombinases spécifiques de site?

Recombinases à sérine
Recombinases à tyrosine

2

Qu'engendre la coupre de l'ADN par les recombinases spécifiques de site?

La formation d'un complexe protéine-ADN intermédiaire

3

Comment est la réaction de formation d'un complexe protéine-ADN intermédiaire?

Conservatrice

4

Pour quelle liaison le complexe protéine-ADN intermédiaire conserve-t-elle l'énergie de la liaison phosphodiester?

Pour la liaison Protéine-ADN

5

La réaction conservatrice du complexe protéine-ADN est-elle réversible?

oui

6

Quelles sont les 2 étapes du mécanisme conservatif chez la recombinase à sérine

1) Le résidu sérine (-OH) fait une attaque nucléophile sur le pont phosphodiester
2) Le groupe hydroxyle du brin clivé peut attaquer à son tour la liaison covalente protéine-ADN de la recombinase, ce qui scell l'ADN et libère l'enzyme

7

Que comprend la recombinase à sérine?

-1 recombinase tétramèrique dont les 4 sous unités sont physiquement liées
-2 molécules double brin clivées
- Région centrale plane et hydrophobe instable
-Régions hydrophyles + et -

8

Chaque sous unités (R1, R2, R3 et R4) de la recombinase à sérine catalysent le clivage de combien de brins?

un seul

9

Combien de coupures simple brin sont nécessaires avant l'échange des brins avec la recombinase à sérine?

4

10

Avec la recombinase à sérine, quelles régions sont clivées?

R1 avec R2
R3 avec R4

11

Avec la recombinase à sérine, quelles régions sont recombinées?

R2 avec R3
R1 avec R4

12

Qu'arrive-t-il après l'échange de brins avec la recombinase à sérine?

les 3' OH libres de chacun des brins clivés attaquent les liaisons covalentes Recombinase-ADN de leurs nouveaux partenaires.

13

Avec la recombinase à sérine, qu'arrive-t-il après que les 3' OH libres de chacun des brins clivés attaquent les liaisons covalentes Recombinase-ADN de leurs nouveaux partenaires?

Cela libère l'énergie conservée par les 4 complexes covalents Protéine-ADN

14

Pour quoi est utilisé l'énergie libérée avec la recombinase à sérine?

Pour sceller les brins recombinés

15

Que permet la région centrale plane et hydrophobe instable de la recombinase à sérine?

Elle permet de faire une rotation de 180 degrés pour échanger les brins entre l'ADN #1 et l'ADN #2

16

À quoi servent les régions hydrophiles + et - ?

À stabilser la structure de l'enzyme dans sa position initiale et après sa rotation à 180 degrés

17

Quel est le synonyme de Complexe protéine-ADN intermédiaire?

Complexe synaptique à liaison covalente

18

Que fait la recombinase à tyrosine?

Elle coupe et scelle 1 paire de brins à la fois donc échange 1 brin à la fois

19

Où est le site de coupure de la recombinase à tyrosine?

1er nucléotide de la région de croisement

20

Quelles sont les étapes de la recombinaison par la recombinase à tyrosine?

1a) R1 et R3 coupent l'ADN en 3'OH avec leur résidu tyrosine
1b) formation d'un complexe Tyrosine-P-3'-ADN.
1c) Échange des 2 premiers brins lorsque les extrémités 5'-OH attaquent les ponts Tyrosine-P-3'-ADN
2) R2 et R4 agissent de la même manière.

21

Quelle est la structure de la recombinase à tyrosine?

Tétramère où chaque sous unité se lie à un site lox, mais où seulement une paire de sites à la fois a une activité catalytique.

22

Qu'est-ce qui assure la coupure séquencielle d'un seul brin à la fois?

1 changement de conformation des deux paires de dimères qui permet de couper l'autre brin