Carrieri_FASTAfile Flashcards
(26 cards)
Differenze tra PDB e CSD
47
Come arrivo all’identificazione di un hit?
47
Formato di archiviazione PDB
47.1
Formato di archiviazione PQR
47.1
Formato di archiviazione MOL2
47.1
Formato di archiviazione SDF
47.1
Formato di archiviazione MOPAC
47.1
Calcolo delle cariche delle molecole. Metodi e differenze
47.1
Metodo Gasteiger
47.1
Metodo AM1-BCC
47.1
Sovrapposizione per forma e per punti. Differenze, calcoli e valori ottimali
48
Calcolo dell’energia molecolare con metodi di fisica classica
48.1
Def di energia molecolare, componenti che tengo in considerazione. Come le tengo in considerazione?
48.1
Che algoritmi uso per monitorare la conformazione di molecole tipo idrocarburi?
49
Algoritmi per monitorare l’energia conformazionale per le molecole
49
Che algoritmi uso per monitorare la conformazione di molecole tipo proteine o macromolecole?
49
Differenza tra meccanica molecolare e meccanica quantistica, assunzioni diverse
49
Quali sono gli obiettivi di una minimizzazione energetica?
49.1
Algoritmi di minimizzazione energetica
49.1
Quali sono i criteri di stop per la minimizzazione energetica?
50
Obiettivi di un’analisi conformazionale
50.1
Come posso effettuare analisi conformazionale? Con che metodi e che differenze ci sono? (overview)
50.1
Come si può usare l’analisi sistematica per un’analisi conformazionale?
50.1
Come si può usare l’analisi stocastica per un’analisi conformazionale?
50.1
