Examen 1 Flashcards

(125 cards)

1
Q

Qu’est-ce qui change par rapport à l’ADN selon son organisme?

A

1.Organsiation
2. Quantité
3. Régulation

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Q

Quelles sont les 3 composantes de la dogme central?

A

ADN
ARNmessager
Protéines

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3
Q

Combien de paires de bases possèdent une cellule?

A

Environ 3 milliards de pb

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4
Q

Définir le génome et donnez sa forme.

A

1 à plusieurs molécules d’ADN
Sous forme de chromosomes

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Q

Quels sont les 3 rôles de l’ADN?

A

Caractère hériditaire
Matériel génétique contenant information
Variation/mutation génétique

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6
Q

Combien de liaison d’hydrogène A-T et G-C ont-ils? Laquelle de ces liaisons est la plus stable?

A

2 liaisons A-T
3 liaison G-C (plus stable et plus difficile à séparer)

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7
Q

Pourquoi isoler un gène est important?

A
  1. Déterminer la séquence d’un gène
  2. Transférer des gènes d’un organisme à un autre
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8
Q

À quoi servent les clones d’ADN?

A

À créer une bande d’ADN (nécessite plusieurs bactéries pour connaître plus de séquence)

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9
Q

Vrai ou faux, on coupe les plasmides pour insérer un fragment d’ADN.

A

Vrai

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10
Q

Qu’est-ce que chaque colonies de bactéries sur une pétri représente?

A

Une séquence codant pour formation d’une bande d’ADN

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11
Q

Nommez une enzyme de restriction.

A

EcoR1 (coupe 6 nucléotides)

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12
Q

Combien de nucléotides peuvent être couper par des enzymes de restriction?

A

4 à 6 nucléotides

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13
Q

Définir : Système immunitaire pour les bactéries.

A

Enzyme de restriction

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14
Q

Est-ce qu’on peut utiliser EcoR1 pour créer bande d’ADN?

A

Oui

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15
Q

À quoi servent les endonucléases?

A

À couper à l’intérieur des molécules d’ADN

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16
Q

Quelles sont les 2 façons d’isoler l’ADN?

A

Centrifugation
Choc thermique

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17
Q

Décrire un peu le choc thermique qui permet l’isolation de l’ADN.

A

Bactérie compétante avec une membrane perturbé par Calcium puis CHOC THERMIQUE qui fait sortir le calcium et qui fait rentrer le plasmique à l’intérieur

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18
Q

Définir lac-, gal- et tetr.

A

Lac- : pas capable d’utiliser du lactose comme source de carbone
Gal- : pas capable d’utiliser du galactose comme source de carbone
Tetr : gène de résistance à la tétracycline

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19
Q

À quoi sert ori dans un plasmide?

A

Origine de réplication pour faire fourche de réplication

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20
Q

Si nous coupons avec BamH 1 375, à quelle endroit l’ADN va s’installer?

A

Après BamH

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21
Q

Vrai ou faux, le plasmide se replit rarement sur lui-même?

A

Faux, la plupart de temps, le plasmide se replit sur lui-même

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22
Q

Quel gène code la bêta-galactosidase?

A

Lac Z

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23
Q

Pourquoi chaque enzyme coupe seulement à une place?

A

Seulement présent à un endroit, car n’existe pas ailleurs donc coupe à un endroit spécifique

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24
Q

Dans un plasmide, qu’est-ce qui est toujours présent?

A

Origine de réplication (ori)
Résistance à antibiotique

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25
Quelle est la simple différence entre pUC ori et f1 ori?
Nombre de réplication varie entre les 2 types d’ori
26
Définir T7
Promoteur pour les procaryotes nécessaire pour faire ARNmessager
27
Définir Pcmv
Promoteur utiliser chez les eucaryotes pour faire ARNmessager
28
Définir SV40
Provient du gène de l’herpès
29
Définir BGH pA (2)
Site de polyadénisation Provient de l’hormone de croissance de la vache
30
Pourquoi la topoisomérase rend le clonage plus facile?
Topo reconnaît vecteurs donc 2 extrémités ne peuvent pas se coller ensemble donc rend plus facile le clonage
31
À quoi se lie le GFP dans le gène?
V5 épitope et His6
32
Qu’est-ce que les enzymes de restriction coupe précisément?
Palindrome
33
Donnez 3 caractéristiques claires des enzymes de restriction.
1. Produites par bactéries pour se défendre contre les phages 2. Coupent l’ADN du phage, ce qui l’inactive 3. Coupent à endroits précis de l’ADN
34
Les enzymes de restriction coupent effectivement à des endroits précis de l’ADN, où se trouvent ses séquences?
Dans TOUTES les molécules d’ADN
35
Définir palindrome.
2 brins ont la même séquence mais orientation antiparallèle
36
Après le clivage, comment est l’extrémité?
Extrémité collante (ou cohésive)
37
Sma1 est une enzyme de restriction à bout franc ou bout collant?
Bout franc, comme Hae3
38
Quel est le rôle de la méthylation et nommez les 2 nucléotides où la méthylation peut se produire.
Protège la bactérie contre la coupure par ses propres enzymes de restriction Sur A et C
39
Décrire les bactéries utilisées en biomol.
Déficientes en méthylases et en enzymes de restriction
40
Rôle de l’ADN ligament
Relier les molécules d’ADN
41
À quoi sert la phosphatase.
Enlève groupement phosphate donc plasmide ne se referme pas, même avec ligase, mais quand il va être mis dans bactérie = il va se refermer
42
Est-ce qu’une bactérie peut avoir plusieurs plasmides?
Oui, après l’amplification (réplication)
43
Nommez les 5
Vecteur d’expression Phages simple-brin Cosmides Fosmides Plasmides
44
Qu’est-ce que permet les plasmides?
Permet clonage de grosses molécules d’ADN
45
Nommez les 2 avantages des fosmides.
1 seule copie Moins de toxicité
46
Les plasmides sont inutilisables si insert supérieur à combien de kb
20 kb
47
À quoi sert le gène de résistance à un antibiotique dans les plasmides?
Sélection phénotypique
48
Que signifie la sélection pour une colonie blanche.
ADN présent Pas de clivage de X-gal
49
Que signifie la sélection pour une colonie de bactéries bleue
Pas ADN Enzyme clive X-gal
50
Nommez les 2 avantages des phages pour le clonage de gène.
1. Empaquetage d’environ 50 kb 2. Bras de 15 kb à chaque extrémité de l’insert
51
Nommez le site qui est reconnue par la tête des phages.
Site cos
52
Définir les sites clos par rapport au schéma à la page 175
Reconnu par virus pour encapsulation par fragment 15 kb
53
Les comides sont des vecteurs hybrides entre quoi et quoi.
Phages lamda Plasmide
54
Nommez l’avantage des cosmides p/r aux inserts
Insert de 45 kb
55
Est-ce que les plasmides, les fosmides et les phages cause de l’infection?
Oui
56
Quels est le phage simple-brin le plus utilisé?
Phage M13
57
Quelle est l’avantage des phages simple-brin?
Avantageux pour la séquençage par la technique de Sanger
58
Quels est l’objectif des vecteurs d’expression?
Déterminer la résultante protéique du gène cloné
59
Combien de nucléotides sont présents dans une amorce?
Environ 20 nucléotides
60
Quelle activité les transcriptase inverse?
Activité RNAse H
61
À quel niveau se situe le point de branchement du lasso présent lors d’épissage d’introns?
Adénine (hautement conservée)
62
Quelles sont les 3 étapes du mécanisme d’épissage des intrants?
1. Site 2-OH attaque site d’épissage 5’ 2. Relie 5’ de l’intron à 2-OH 3. Formation liaison phosphodiester 2-5 a/n du A avant le 3’
63
À quoi servent les RNPpn?
Catalyse les réactions d’excision et d’épissage
64
Donnez les composantes des RNPpn.
Protéines Petits ARN nucléaires (ARNpn)
65
À l’aide de quel type de liaison les RNPpn peuvent aider à aligner les sites d’épissage avec les séquences situées aux limites exon-intron?
Liaisons hydrogène
66
À quel niveau la TATA box est-elle dans les cellules eucaryotes?
-35
67
Décrire brièvement le fonctionnement de la transcriptase inverse.
Copie ARNmessager en ADN complémentaire
68
Quel est le rôle des splicéosome?
Catalyse les réactions d’épissage
69
Nommez les 3 composantes des splicéosomes.
RNPpn Pré-ARNm Facteurs associés
70
À quoi se lie le O-3’ lors de l’épissage des introns?
P-5’
71
Quelle est la demi-vie de l’ARNm mature eucaryote?
20-30 minutes à 20-24 heures
72
Nommez le cas exceptionnel d’épissage d’ARN et expliquez le un peu.
Protozoaire Tetrahymena Épissage catalysé par ARN transcrit (ARN possède activité catalytique)
73
Nommez : ARN dotés d’une activité enzymatique
Ribozymes
74
Quels sont les 3 codons stop?
UAA UAG UGA
75
Quels est le codons de départ?
AUG (méthionine)
76
Combien y’a de possibilité de codon?
64
77
Quelle serait une répercussion d’une mutation dans un ARN de transfert?
Aucune modification Ou Ajout du mauvais AA
78
Nommez : boucle du milieu de l’ARNt
Anticodon
79
Un codon est traduit en acide aminé par quoi?
Par ARNt comportant une séquence complémentaire
80
Est-ce qu’un ARNt peut reconnaître plusieurs codons?
Oui, peut aussi en reconnaître juste 1
81
Définir le I dans la traduction.
Inosine
82
Selon les règles des codons-anticodons, compléter les paires si l’extrémité 5’ est 1. G, 2. C, 3. À, 4. U, 5.I
1. U C 2. G 3. U 4. A G 5. CAU
83
Qu’est-ce que les facteurs d’élongations utilisent?
GTP
84
Lors de la terminaison de la traduction, les codons non-sens sont reconnus par quoi?
Facteurs de libération
85
Définir l’initiation fait par les ribosomes lors de la traduction chez les eucaryotes.
Ribosome portant ARNt initiateur se fixe, guidé par coiffe 5’, puis glisse jusqu’à AUG
86
Quelle est la séquence d’initiation chez les procaryotes lors de la traduction?
Séquence Shine-Dalgarno
87
Contrôle de la transcription, donnez les 2 lois
1. Cellules doivent être capable d’activer ou réprimer la transcription 2. Cellules doivent savoir reconnaître les conditions environnementales
88
Définir le promoteur.
Région régulatrice proche de 5’ qui sert de site de liaison pour l’ARN polymérase
89
Définir le répresseur.
Protéine qui bloque l’expression des gènes adjacents
90
Définir l’opérateur.
Région d’ADN située à une extrémité d’un opéron
91
Définir un inducteur
Agent de l’environnement qui déclenche la transcription à partir d’un oépron
92
Définir l’opéron.
Groupe de gènes de structure proche dont l’ARNm est synthétisé en un seul morceau, avec les signaux régulateurs proches qui affectent la transcription de ces gènes de structure (séquence codante)
93
Où s’installe le répresseur?
Sur l’opérateur
94
Quelle est la différence entre le lactose et le IPTG?
IPTG ne se dégrade pas
95
Définir les opérateurs cis et trans.
Cis : Agit sur sa propre allèle Trans : Influence sur les 2 allèles
96
Lorsqu’il y a beaucoup de glucose, comment est l’AMPc?
AMPc est bloqué
97
Définir le AMPc quand glucose et lactose présents et quand pas glucose, mais lactose présent.
1. AMPc faible (peu de ARNmessager lac) 2. AMPc élevé (ARNmessager lac ++)
98
À quoi sert le Gal80?
Inducteur
99
Donnez la définition d’auxotrophe.
Incapacité d’un organisme vivant de synthétiser un composé organique nécessaire à son développement
100
Définir prototrophe.
Organisme peut lui-même synthétiser le composé organique nécessaire à son développement
101
Complétez la phrase ; lors de la polymérisation de l’ARN, les nouveaux nucléotides sont _______ ajoutés à l’extrémité ____ de la molécule en cours d’________
Toujours 3’ Élongation
102
Est-ce que les procaryotes ont des introns?
NON
103
Promoteur
Élément de régulation
104
Dans un gène avec 1 exons, combien y’a-t’il d’introns.
Aucun introns
105
Avec quel type de division cellulaire à lieu les transmission des mutations de maladie?
Méiose
106
Quel truc génétique saute normalement une génération
Récessif relié à X
107
Qu’est-ce que l’ADN pol ajoute lors de la polymérisation?
Désoxyribonucléotides à 3’ en cours d’élongation
108
La réplication de ADN à lieu dans quelle phase?
S
109
Rôle ADN polymérase 1
Enlève amorces d’ARN
110
Rôle fragment Okazaki
Ajoute des amorces
111
Rôle hélicase
Ouvre fourche de réplication
112
Rôle ligase
Ferme dernier lien phosphodiester
113
Vrai ou faux, il y a toujours 2 fourches de réplication
Oui, 1 dans chaque sens
114
Est-ce que les télomérase sont présent à la fin de la réplication de l’ADN chez les eucaryotes?
OUI
115
Quelles sont les 3 propriétés de l’ARN
Chaîne nucléotidique simple brin adoptant des structure tridimensionnelles complexes Sucre = ribose Uracile présent
116
Nommez l’ARN informationnels
ARNmessager (eucaryotes à partir du pré-ARNm)
117
Nommez différence entre ARN fonctionnels et ARN informationnels?
ARN fonctionnel = jamais traduit en protéine
118
2 exemples d’ARN fonctionnels
ARNr ARNt
119
Donnez le sens de la transcription de l’ADN en ARNm
TOUJOURS 5’ vers 3’
120
Complétez ; _____ rencontre boîte TATA puis ________________ pour commencer la transcription
Holoenzyme Changement de conformation
121
Donnez durée demi vie de ARNm chez les bactérie
Moins de 2 minutes
122
Nommez la coiffe chez les eucaryotes
7-méthyle guanosine tri-phosphate
123
Combien d’adénosine sont ajouté sur la coiffe lors de l’élongation de la transcription chez les eucaryotes
150 à 200 A
124
Est-ce que les pré-ARN possède des introns?
Oui donc ils doivent être modifier
125
Est-ce que les pré-ARN possède des introns?
Oui donc ils doivent être modifier