Prvi klk 4. predavanje Flashcards

(59 cards)

1
Q

šta čini rnk hromatin

A

iRNK i proteini koji čine iRNP

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

eukariotski operoni RNK predstvaljaju

A

Set funkcionalno povezanih iRNK
čija se ekspresija kontroliše
zajedničkim regulatornim
elementima - USER elementi

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

šta omogućavaju operoni RNK

A

da ćelija brzo odgovori na uslove sredine

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

kako se formiraju operoni, pomoću čega

A

pomoću USER elemenata- isti element na više RNK= zajednička regulacija svih tih RNK

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

da li je veća fleksibilnost eukariotskih RNK operona ili prokariotskih dnk operona

A

veća je fleksibilnost RNK operona

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

ko reguliše ekspresiju opreona RNK
u skladu sa potrebama ćelije

A

Signalni molekuli i metaboliti

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

kako Signalni molekuli i metaboliti regulišu ekspresiju opreona RNK

A

Modulišu aktivnost RBP
(kovalentne modifikacije- fosforilacija,
promena nivoa ekspresije)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

kada dolazi do presvlačena iRNP

A

pri prelasku iz jedra u citoplazmu

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

kada se regrutuju faktori SR, EJC, hnRNP

A

još u jedru

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

šta je vezano za 5 i 3prim kraj translaciono aktivne iRNP pri ulasku u citoplazmu

A

za 5’-kape iRNP je, uglavnom, vezan kompleks CBC20/80, dok su za poli(A) rep vezani i PABPN1 i PABPC1.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

za šta služi CBC20/80

A

vezan je za 5prim kapu, služi kao inicijacioni faktor translacije, pri čemu uspostavlja interakciju sa eIF4G

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

kako počinje pionirska runda translacije

A

cbc20/80 kao inicijacioni faktor translacije interaguje sa eif4g, formira se kružna struktura i bezuje se mala subj ribozoma koja nosi ternarni kompleks. dolaskom na start kodon pridružuje se i velika subj i počinje pionirska runda translacije

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

šta čini ternarni kompleks

A

eIF2, GTP i inicijatorksa tRNK(sa metioninom)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

kada se dešava drugo presvlačenje iRNP

A

tokom pionirske runde translacije

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

šta se dešava sa cbc20/80 i sa PABPN1 tokom translacije

A

cbc se zamenjuje sa eIF4E, a pabpn sa PABPC1

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

šta se dešava sa iRNK koje ne podležu odmah trnslaciji pri prelasku u citoplazmu

A

lokalizuju se i translaciono utišavaju sve dok ne dođe neki signal za početak njihove translacije

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

ko sve ima kružnu strukturu

A

translaciono aktivne, ali i translaciono neaktivne iRNK

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

za šta služi kružna struktura iRNK

A

1) olakšava kontrolu translacije zbog regulatornih elemenata u 3prim UTR
2) povećava afinitet eIF4E za 5prim kapu
3) promoviše efikasnu reinicijaciju translacije
4) štiti oba kraja transkripta od mašinerija za degradaciju iRNK

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

uloge eIF4E

A

prepoznavanje i vezivanje 5prim kape

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

uloge eIF4A

A

ATP zavisna RNK helikaza

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

uloge eIF4G

A

stupa u interakciju sa eIF4E, PABP, eIF3

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

uloga PABP

A

cirkularizacija RNK

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

uloga eIF3

A

regrutovanje male
subjedinice ribozoma sa ternarnim
kompleksom (eIF2-GTP-tRNK)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

uloga eIF2

A

GTP vezivni protein koji je deo ternarnog kompleksa i dovodi inicijatorsku tRNK na P mesto

25
uloge eRF1 i eRF3
to su faktori oslobađanja, služe pri terminaciji translacije, eRF1 prepoznaje stop kodon, eRF3 interaguje sa PABPC1
26
šta je IRES i za šta služi
IRES je unutrašnje mesto vezivanja ribozoma i služi kod RNK molekula koji imaju translaciju nezavisnu od 5prim kape IRES su specifične sekundarne strukture koje direktno regrutuju malu subj ribozoma IRES postoji kod virusnih RNK i kod ćelijskih iRNK koje imaju duge 5¢-UTR sa visokim sadržajem GC, koji su podložni formiranju sekundarnih struktura.
27
gde se nalazi IRES
u 5prim UTR ili u kodirajućem regionu
28
kada IRES efikasno iniciraju translaciju
kada se kompromituje translacija zavisna od 5¢-kape, IRES efikasno iniciraju translaciju jer ne zavise od prisustva ili integriteta nekoliko prethodno opisanih kanonskih faktora inicijacije translacije, pre svega eIF4E i eIF2. u normlnim fiziološkim uslovima iRES su neefikasne
29
šta zahtevaju IRES za efikasnu translaciju
eIF4G- RNK šaperoni eIF4A ITAF
30
kako IRES regrutuju ribozome u blizini start kodona
direktno preko eIF4G- imitirajući kapu
31
kakva može biti regulacija translacije
translaciono utišavanje specifičnih iRNK sa RBP i miRNK globalno reprogramiranje translacije
32
kako se ostvaruje TRANSLACIONO UTIŠAVANJE SPECIFIČNIH IRNK
vezivanjem RBP i miRNK za regulatorne elemente iRNK Vezivanje specifičnih RBP za 5’-UTR blokira ribozom u pretraživanju start kodona miRNK kroz kompetitivno vezivanje mogu otkloniti represiju Vezivanje RBP za regulatorne elemente u 3’-UTR-u interferira sa funkcijom eIF4E
33
RBP prepoznaje specifične regulatorne elemente u 3¢UTR-u i regrutuje:
4E-BP – proteini koji direktno vezuju eIF4E, inhibirajći asembliranje eIF4F Alternativni protein koji direktno vezuju 5¢-kapu, sprečavajući eIF4E da se veže za istu
34
Molekulski mehanizmi kojima RPB ostvaruju reprimiranje translacije specifičnih iRNK su:
kompetitivna inhibicija vezivanja eIF4E za eIF4G, kompetitivna inhibicija vezivanja eIF4E za 5¢- kapu i citoplazmatično skraćivanje poli(A) repa (često povezano sa kompetitivnom inhibicijom vezivanja eIF4E za eIF4G).
35
kako funkcionise skracivanje polia repa
u 3¢-UTR-u postoje dve sekvence- poli(A) signal i jedna ili više kopija uzvodnih elemenata za citoplazmatičnu poliadenilaciju CPE CPE prepoznaje CPEB protein kao dodatni protein CPEB regrutuje i maskin protein koji pripada familiji 4E BP
36
primeri za skraćivanje polia repa
maternalne iRNK oocita Xenopus iRNK neurona- sinaptička plastičnost
37
ključna kontrolna tačka za regulaciju incijacije translacije i opštu inhibiciju sinteze proteina u ćelijama pod uslovima stresa
ternarni kompleks
38
ko reguliše brzinu sinteze proteina
Kinaze eIF2 fosorilacijom eIF2
39
ko je senzor stresa
kinaze eIF2
40
šta je marker stresa
fosforilacija eIF2α
41
šta je marker reparacije stresa
defosforilacija eIF2α
42
kako fosforilacija eIF2α remeti translaciju
interferira sa formiranjem ternarnog kompleksa. alfa subjedinica eIF2 se fosfriliše i tad ovaj faktor ima veliki afinitet za eIF2B, vezuje se za njega i blokira razmenu GTPa
43
šta je TOR
proteinska kinaza koja stmuliše prosečnu brzinu sinteze proteina
44
kako se ponaša mTOR ustresnim uslovima
inaktiviran je
45
Supstrati mTOR-a koji direktno regulišu translaciju
4E-BP S6K
46
Supstrati mTOR-a koji indirektno utiču na translaciju
transkripcioni faktori gena za komponente ribozoma, tRNK, faktore translacije svi zajedno aktiviraju sintezu proteina i rast ćelije
47
šta radi Protein Rheb
vezuje se za mTOR i aktivira njegovu kinaznu aktivnost
48
šta radi Proteinski kompleks TSC1/TSC2
reguliše rheb- vrši hidrolizu GTPa vezanog za njega
49
aktiviraju TSC1/2
hipoksija nepovoljno energetsko stanje
50
inhibira TSC1/2
faktori rasta
51
nezavisno od TSC1 šta inhibira mtor
nedostatak hranljivih materija
52
šta sve radi mTOR
inhibira autofagiju deluje na sintezu proteina na metabolizam ćelije na angiogenezu na rast ćelije
53
Kao odgovor na reprogramiranje translacije formiraju se
reverzibilne granule stresa
54
Glavni fiziološki okidač za formiranje granula stresa je
fosforilacija eIF2α
55
Deasembliranje granula stresa zahteva aktivnost
fosfataze GADD34 i reaktivira translaciju
56
šta radi Ribonukleaza angiogenin
seče tRNK u antikodonskoj petlji dajući tiRNK (male RNK nastale od tRNK u uslovima stresa)
57
5’-tiRNK
globalno reprimiraju translaciju indukuju formiranje granula stresa formiraju tetramolekularni G kvadripleks
58
uticaj angiogenina na okolne ćelije
štiti ih od stresa, može delovati na okolne kada ga sekretuju ćelije nekog tkiva, ili sistemski, kada se stvara u jetri
59