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PHR306 > Antimicrobien > Flashcards

Antimicrobien Flashcards

1
Q

Bactéries gram-négatif

A

Elles ont une membrane cytoplasmique interne & externe. La membrane externe bloque les antibiotiques.

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Q

Bactéries gram positif

A

Elles ont une membrane cytoplasmique interne, sans membrane externe, ce qui permet les antibiotiques de pénétrer la paroi. (exemple vancomycine).

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3
Q

Étapes générales de la réplication et transcription

A

-Déroulement de l’ADN par l’hélicase et la gyrase

-Liaison de la polymérase et synthèse du brin directeur

-Synthèse du brin discontinu par fragment impliquant une ARN polymérase (amorce), ADN polymérase et Ligase

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4
Q

Étapes de la synthèse des protéines

A

Initiation, liaison d’un ARNt, Formation du lien peptidique, translocation, élongation (croissance) du peptide.

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5
Q

Quinolone - CIBLE

A

S’attaque à la gyrase et la topoisomérase IV

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6
Q

Rifampicine

A

Bloque l’initiation de la transcription

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7
Q

Nitroimidazole

A

Dommage à l’ADN causés par des groupements radicaux

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8
Q

Membrane cytoplasmique

A

Insertion du composé dans la membrane ex: daptomycine, colistine

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9
Q

Membrane cytoplasmique; quels composés et comment

A

Insertion du composé dans la membrane; daptomycine et colistine

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10
Q

Rôle de l’ADN gyrase

A

Introduit du surenroulement pour éliminer le surenroulement de l’ADN

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11
Q

Rôle de l’ADN Topo IV

A

Défait les concatémères générés lors de la réplication.

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12
Q

Nomme des stratégies de recherche d’antibiotiques

A

Recherche de nouvelles molécules naturelles, chemical repurposing, modification des molécules déjà existantes.

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13
Q

Comment est-ce qu’on évalue l’activité d’un antibiotique? (target based)

A

1) Stratégie target based: Test de collections de molécules sur une cible bactérienne spécifique. En utilisant la méthode de clé serrure. On fait un criblage virtuel. On identifie la cible, puis on valide celle ci, ensuite on va identifier les molécules possibles, puis optimiser et développer en phase préclinique.

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14
Q

Comment est-ce qu’on évalue l’activité d’un antibiotique? (Bio-essai)

A

CMI,
Spectre d’activité
bactéricide vs bactériostatique

Premièrement, on évalue l’activité des molécules antimicrobiales, ensuite on évalue la toxicité des molécules. Puis, on identifie et on caractérise le mécanisme d’action. Finalement, on fait l’optimisation et le développement préclinique.

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15
Q

Beta lactamides

A

Ils ont tous un anneau beta-lactame. À la base, ils s’attaquent à la transpeptidation.

4 familles: Pénicillines, céphalosporines, carbopénèmes, monobactams.

Pénicillines: 5 familles, naturelles, forme + active contre certaines espèces bactériennes. Résistantes aux beta-lactamases.

Céphalosporines: 4 générations. large spectre. Résistantes aux beta-lactamases.

Carbapénèmes: Spectre le + large. Lie PBP1 et PBP2 des gram + et gram -. Résistant à la plupart des beta-lactamases, mais résistance bactérienne à ces médicaments est inquiettante.

Monobactams: Lie les PBP3 des gram - aérobie et anaérobie. Résiste à la plupart des beta-lactamases.

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16
Q

Mécanisme de résistance et effets secondaires beta-lactames

A

Mécanismes de résistance
-Mutations des PBP
-Surexpression des PBPs
-Nouvelle PBP
-Production de beta-lactamases. (+ de 1300 sortes). elles sont souvent encodés par des plasmides transférables par conjugaison.

Effets secondaires:
-RXN allergiques
-Hypersensibilité immédiate (choc anaphylactique)
-Accéléré (30min à 3 jours)
-retardée (+3 jours)
-Manifestations digestives: diarrhées, infections à C. Difficile.

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17
Q

Glycopeptides

A

Grosses molécules polaires composées d’acides aminés.
- Doit être injecté
-Bactéricide limité aux gram +

Vancomycine, téicoplanine

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18
Q

Glycopeptides mécanisme et résistance

A

Mécanisme: Inhibe la liaison du deuxième alanine dans la synthèse de la paroi cellulaire.
Résistance: Résistance due aux gènes Van (A,B,C,D,E)
Résistance naturelle

***La résistance médié par VanA peut être transférable via des éléments génétiques mobiles. (transposons)

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19
Q

Comment est-ce qu’on évalue la toxicité d’un antibiotique?

A

On détermine le CC50 (concentration cytotoxique)

20
Q

5 cibles des antibiotiques

A

1) Paroi cellulaire
2) Ribosomes (synthèse des protéines)
3) Réplication et transcription
4) Membrane plasmique
5) Métabolites essentiels

21
Q

Quel est le rôle de la transpeptidation?

A

Liaison entre les peptides (qui dépend si on est gram + ou gram -)

Les peptides se lient à un sucre (NAM), puis une liaison à plusieurs polypeptides par les PBP (Penicilline binding protein).

Antibiotiques ciblent plusieurs différentes étapes de la synthèse des peptidoglycans.

exemple:
-Daptomycine: s’attaque à la membrane
-Beta-lactamines: s’attaque à la transpeptidation (PBP)
-Glycopeptides: s’attaque au lien de la 2e alanine.

22
Q

Kirby Bauer

A

Évaluation de l’Activité d’un antibiotique. Disque contenant une concentration d’antibiotique pré determinée. Ensuite on fait un ensemencement sur gélose + disque + incubation. Puis selon les standards, on compare le diamètre des colonies.

23
Q

E-test

A

Bandelettes qui contiennent une concentration croissante d’antibiotiques.

24
Q

Microdilution ou dilution en bouillon

A

Utilisation de bouillon avec concentrations croissantes d’antibiotiques.
Dernière concentration qui inhibe = CMI.

25
Q

La courbe de mortalité sert à quoi?

A

Elle sert à déterminer si un composé est bactéricide ou bactériostatique.

Bactériostatique = inhibe la croissance
Bactéricide = tue les bactéries

26
Q

Quel est le but de faire l’évaluation de la perméabilité membranaire?

A

Déterminer si la molécule sera absorbée par les cellules humaines.

27
Q

Qu’est-ce qu’une évaluation du potentiel carcinogène? AMES 4 étapes

A
  1. Préparer 2 cultures bactériennes qui ont perdu la capacité de synthétiser l’histidine.
  2. Ajouter de la substance présumée mutagène à une culture et ajouter un échantillon de foie de rat aux deux cultures.
  3. Ensemencer les deux échantillons sur des millieux dépourvus d’histidine et d’incubation (Ici seul les bactéries qui ont retrouvé par une mutation inverse la capacité de synthétiser l’histidine formeront des colonies.
  4. Boite témoin: possibilité de contenir quelques rétromutants
    Boite expérimentale: possède un grand nombre de colonies si l’agent chimique testé est cancérigène.
28
Q

Évaluation préclinique chez les animaux

A

-Suspension fécale de souris
-Inoculation avec nombre précis de bactéries
-Ajout ATB - À diverses concentrations
-Déterminer la viabilité par dénombrement bactérien

29
Q

Quels sont les 4 phases de l’évaluation clinique chez l’humain?

A

Phase 0 :
-10 à 15 individus
-Très petite dose
-Tolérance au composé

Phase 1:
-15 à 30 individus
-Meilleure voie d’admin.
-Dosage + fréquence
-Dose max sécuritaire
-Effets secondaires
-ADME

Phase 2:
-Moins de 100 individus
-on regarde l’efficacité
-Optimisation dosage
-effets secondaires
-ADME

Phase 3:
-100 à quelques 1000 individus
-Efficacité VS meilleur traitement VS placebo
-Plusieurs hopitaux impliqués

Phase 4:
-++ milliers d’individus
-Suivi post marché
-effets secondaire long terme

30
Q

Les quinolones (Évolution, cible, structure)

A

Évolution: Dérivés de l’acide nalidixique
Structure: Présence de groupements qui influencent l’activité du composé.

Cibles & mécanisme:
Gyrase + topoisomérase IV
Liaison du médicament bloque l’ADN polymérase. Alors ça bloque la réplication & fait une inhibition de croissance.

30
Q

Mécanismes de résistance (4) quinolones et effets secondaires (2)

A

Mécanismes de résistance:
1) Mutation gyrase (gram -)
2) Mutation topo IV (gram +)
3) Pompes à efflux (permet à la bactérie de faire sortir des élements comme les ATB
4) Protéine QNrA - Lie la gyrase et empêche l’ATB de se lier. Pas une résistance élevée, mais peut causer d’autres mutations.

ES:
-Infections C. Difficile.
-Fragilisation des tendons (tendinopathie)

30
Q

Caractéristiques des aminoglycosides

A

-Molécule naturelles produites par des microorganismes (streptomycines)
-Thérapie combinée: peuvent être utilisés sur bactéries à gram + si combiné avec des beta-lactamines et glycopeptides. (trithérapie?)

31
Q

Cible des aminoglycosides

A

Liaison irréversible à la sous unité 30s chez les bactéries gram - et bactéries aérobies.

32
Q

Mécanisme d’action des aminoglycosides

A

Traverse la membrane externe des gram - via les porines, ce qui permet à des molécules d’entrer dans le sens contraire des pompes à efflux.
Mécanisme ATP dépendant
peu efficace en anaérobie

Liaison au 30s des ribosomes:
-Bloque l’initiation, l’élongation et cause l’incorporation d’un mauvais acide aminé

33
Q

Mécanisme de résistance et effets secondaires des aminoglycosides

A

Mécanisme de résistance:
-Faible perméabilité (FPM faible anaérobie)
-Enzymes encodés sur les plasmides ce qui modifie les aminoglycosides. acétylase, adénylase, phosphorylase.
-Mutation ribosomique RARE

ES
-Nephrotoxicité: personnes agés (fonction rénale réduite) alors surdosage
-Ototoxicité: Altération des cellules de l’oreille interne
***Dosage sanguin systémique afin d’assurer un dosage adéquate + suivi rénal.

34
Q

Macrolides et lincosamides

A

Caractéristiques:
forme naturelle des macrolides = streptomyces (erythromycine)
forme synthétique = clarithromycine et azithromycine.
Anneau lactone
Lincosamide = clindamycine

Mécanisme d’action: Cible l’élongation du polypeptide
lincosamide cible le lien peptidique

35
Q

Streptogramines et linézolide

A

Linézolide = synthétique

Streptogramines: 2 types…

1) Dalfopristine
2) Quinupristine (semi-synthétique)

Ciblent le lien peptidique

36
Q

Mécanismes de résistance + ES Macrolides, lincosamides, streptogramines, et linézolide

A

1) Diminution perméabilité membranaire (résistance naturelle des gram -)
2)Modification de L’ARNr par méthylation enzymatique
3)Pompe à efflux
4)Mutation ARNr 23s = résistance linézolide

ES : DIGESTIF, OTOTOXIQUE. ÉRUPTIONS ALLERGIQUES

37
Q

Sulfamides et triméthoprime

A

1er atb utilisé 1930.
inhibiteur compétitif d’enzyme bactérienne
peut être utilisé comme antiparasitaire.

mécanisme: inhibe enzymes responsables de la formation de purine.

Résistance:
diminution perméabilité membranaire
-affinité variable des enzymes clés
-enzymes clés modifiés et transférables sur transposons.
Surproduction PABA

38
Q

Antituberculeux

A

Agent qui a un effet sur les mycobactéries.
Médicaments approuvés; fluoroquinolone, streptomycine, macrolides, rifamycine

39
Q

Structure des mycobactéries

A

Structure présente au dessus du peptidoglycan…
Arabinogalactan
acide mycolique
capsule: composé de protéines et polysaccharides.

39
Q

Exemple thérapie combiné antituberculeux

A

On peut faire une thérapie combinée ayant comme but de réduire la résistance.

isoniazide + ethionamide = inhibe synthèse de l’acide mycolique
ethambutol = inhibe la synthèse de la paroi cellulaire
pyrazinamide = inhibe synthèse de la membrane cellulaire.

40
Q

Résistance et ES antituberculeux

A

Le mycobacterium tuberculosis se développe à l’intérieur des cellules, ce qui donne un problème d’accessibilité des ATB.

Plusieurs souches sont devenus multi-résistantes.

ES;
Multiples, traitement prolongé et potentiel toxique des atb. On fait un suivi de la fonction hépatique.

41
Q

Antifongiques:

A

Mécanismes:
-Synthèse ergostérol: triazole (fluconazole), terbinafine
-Synthèse membrane: amphotéricine
-synthèse paroi: caspofungin
-synthèse acide nucléiques: fluorocytosine

42
Q

Mécanismes de résistance antifongiques

A

1) remplacement de l’ergostérol dans les membranes

2) Mutation dans les enzymes, efflux.

43
Q

Amibes ou flagellés

A

Amibes ou flagellés = diarrhées sanglotantes
Paramomycine et métronidazole

44
Q

Plasmidium falciparum = paludisme, malaria

A

= paludisme, malaria
possède cycle asexué et sexué
hôte définitif (reproduction séxuée) et hôte intermédiaire (asexuée)

2 types de traitements: prophylactique (prévention)
-quinines, tue les parasites une fois qu’ils quittent le foie.

Traitements thérapeutiques (crises)
artémisine, sulfamides.

PHR306 (4 decks)

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