Cours 04 Flashcards
Régulation globale.
Régulation de plusieurs gènes et opérons afin de répondre à un signal de l’environnement
Régulon.
Ensemble de gènes et opérons qui répondent à un régulateur commun.
Les gènes et les opérons peuvent faire partie de plus qu’un régulon.
Stimulon.
Souvent, les régulons se chevauchent dans leurs réponses aux conditions variables de l’environnement.
L’ensemble des régulons qui sont induits par un signal de l’environnement particulier est un STIMULON.
Donnez des exemples de régulateurs globaux.
- Facteurs sigma.
- Petits ARNs.
- Systèmes à 2 composantes.
- Activateurs ou répresseurs.
- Petites molécules effectrices.
Régulation catabolique chez E.coli : CAP et cAMP.
- Un des + grands systèmes de régulation global chez les bactéries.
- Coordonne l’expression des gènes impliqués dans l’utilisation des sources de carbone et d’É.
Catabolites.
Petites molécules générées par la dégradation de molécules plus larges.
Qu’est-ce que permet la régulation catabolique aux cellules?
D’utiliser la meilleure source de carbone disponible.
Effet glucose.
Le glucose va normalement réprimer fortement les opérons pour d’autres sources de carbone.
La cellule a besoin de quoi pour utiliser le glucose?
De convertir le glucose-6P qui peut entrer dans la voie de la glycolyse.
Qu’est-ce que génère l’effet glucose?
- Une croissance diauxique des bactéries lorsqu’une autre source de carbone est également présente dans le milieu.
- Cellule va utiliser le glucose en premier.
- Quand glucose ÉPUISÉ : délai de croissance pendant laquelle les cellules vont générer les enzymes requises pour l’utilisation du galactose.
Quel est le système de régulation catabolique chez E.coli et les bactéries entériques?
Le système cAMP-dépendant (AMP cyclique).
Régulation de la synthèse de cAMP.
- S’effectue en fonction de la [ cAMP].
- [cAMP] est inversement proportionnelle à la [ ] d’une source de Carbone facilement métabolisable, comme le glucose.
- La [ cAMP ] est élevée quand les bactéries sont dans un milieu contenant une source de carbone relativement pauvre telle que le lactose ou le maltose.
Trouver l’énoncé qui est faux concernant la régulation catabolique chez E.coli.
a) L’effet glucose se caractérise par une croissance diauxique lorsque le glucose et une autre source de carbone sont présents dans le milieu de culture.
b) Le glucose est la meilleure source de carbone.
c) La [ cAMP ] est inversement proportionnelle à la [ glucose].
d) La première étape de la dégradation de tous les sucres est leur transformation en glucose-6-P.
e) Aucune de ces réponses.
Via quel intermédiaire la synthèse de cAMP est régulée?
La régulation de l’adénylate cyclase.
Adénylate cyclase.
Enzyme qui synthétise le cAMP à partir d’ATP.
- Plus active quand la qté de glucose est FAIBLE.
- Associée à la membrane interne.
- Codée par le gène cya.
Quel est le système qui joue un rôle clé dans la régulation du niveau d’activité de l’adénylate cyclase (AC)?
Le système PTS .
Système PTS.
- Responsable du transport de certains sucres dans la cellule (glucose).
- Protéine IIAglc.
Protéine IIA Glc.
Peut exister sous une forme non phosphorylée (IIA Glc) ou sous une forme phosphorylée (IIA Glc-P).
C’est la forme phosphorylée ou non phosphorylée de la protéine IIA Glc qui active l’AC?
La forme phosphorylée (IIA Glc-P).
–> Pour qu’elle synthétise le cAMP.
Quand le niveau cellulaire de glucose (ou autre sucre) est élevé dans le milieu de culture, les protéines IIA Glc sont sous la forme…
Non phosphorylée car IIA Glc-P donne son phosphate au glucose durant son transport.
Par quoi est déterminé le ratio IIA Glc-P/ IIA Glc?
Par le ration PEP/pyruvate dans la cellule.
Quand un sucre rapidement métabolisable est présent dans le milieu de culture, le ratio PEP/pyruvate est haut ou bas?
Bas.
Que se passe-t-il quand la source de carbone est élevée dans le milieu?
Le PEP transfert son phosphate à la protéine Hpr pour générer Hrp-P du pyruvate.
Qu’est-ce qui arrive quand le taux de glucose est élevé et que le ration PEP/pyruvate est bas?
PEP donne pyruvate et ATP. IIA Glc non phosphorylée bloque les perméases pour les autres sucres.
Qu’est-ce qui arrive quand le taux de glucose est bas et que le ration PEP/pyruvate est élevé?
PEP donne son pyruvate et HRP-P.
HRP-P phosphoryle IIA Glc.
IIA Glc-P active l’adénylate cyclase.
cAMP est synthétisé.
Qu’est-ce qu’inhibe la protéine IIA Glc?
Des perméases spécifiques de sucres tels que le lactose.
Trouver l’énoncé qui est faux à propos de la régulation de la synthèse de cAMP.
a) L’adénylate cyclase est activée par la protéine IIA Glc phosphorylée pour synthétiser le cAMP.
b) La protéine Hrp-P est hautement phosphorylée via le PEP lorsque le glucose est abondant.
c) La protéine IIA Glc non-phosphorylée est responsable de l’inducteur.
d) Le cAMP est synthétisé à partir de l’ATP.
e) Aucune de ces réponses.
Quels promoteurs peut activer la cAMP? et de quelle manière?
- Les promoteurs catabolites-sensibles.
- Via son interaction avec le produit du gène crp qui est un activateur de la transcription de ces promoteurs.
Activateur CAP-cAMP.
Interagit avec l’ARN pol pour activer les promoteurs d’opérons sous son contrôle.
Opérons membres du CAP.
lac, gal, ara et mal.
Vrai ou Faux?
Les mécanismes de régulation CAP-cAMP peuvent agir comme activateur mais aussi comme répresseur.
Vrai.
Tout dépend de l’endroit ou il interagit par rapport au promoteur.
À quel moment CAP peut interagir avec son site d’attachement?
Seulement lorsqu’elle est liée à la cAMP.
