Cours 1 Les grandes voies metaboliques et rappel notion base Flashcards

1
Q

V ou F

Les organisme vivants ne sont jamais à l’équilibre

A

V

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Q

V ou F

Oragnismes vivants n’ont pas besoin d’apport énergétique libre constant afin de maintenir un ordre

A

F

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Q

V ou F

Oragnismes vivants sont dans un état stable grace à des rx métaboliques complexes

A

V

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4
Q

Definir métbolisme

A

processus global qui assure aux organismes vivants l’apport et l’utilisation de l’énergie libre pour assurer leurs différentes fonctions

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5
Q

V ou F

Les rx exergoniques provenant de l’oxydation des nutriments sont couplées aux processus endergoniques (nécessaires au maintien en vie)

A

V

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6
Q

Expliquer les principes phototrophes et chimiotrophes

A
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7
Q

Definir ce qu’est les voies métaboliques

A

séries de rx enzymatiqus successives qui forment des produits spécifiques

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8
Q

Definir metabolites

A

substrats, intermédaires et produits

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9
Q

Quel est le niveau de glucose minimum nécessaire pour l’humain

A

5mmol

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10
Q

Dans quel organe a lieu la gluconeogenese

A

foie

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11
Q

Quelles sont les 2 grandes catégores de voies dans le métabolisme

A

Catabolisme et Anabolisme

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12
Q

Definir catabolisme

A

Assure la degradation exergonique des nutriments et des constituants cellulaires pou rrécupérer leurs unités de base et/ou produire de l’énergie libre

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13
Q

Definir anabolisme

A

assure la synthèse de biomolécules à partir de constituants plus simples

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14
Q

V ou F

L’énergie libre libérée au cours du catabolisme est captée en synthétisant de l’ATP à partir d’ADP et phisphate ou en réduisant le coenzyme NADP+ en NADPH

A

V

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15
Q

Quelles sont les prinipales sources d’énergie libre pour les voies anaboliques

A

ATP et NADPH

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16
Q

Nommez 5 caractéristiques des voies métaboliques

A
  1. Les voies metaboliques sont IRRÉVERSIBLES (les rx dans la voie peuvent etre reversible, mais au total pas possible)
  2. L’anabolisme et catabolisme doivent emprunter des voies différentes
  3. Chaque voie métabolique comprend une ‘‘rx d’engagement’’
  4. Toutes les voies métaboliques sont régulées afin de ne pas gaspiller d’énergie
  5. Chez les eucaryotes, les voies métaboliques se déroulent dans des sites intracellulaires spécifiques
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17
Q

V ou F

Les voies métaboliques sont réversibles

A

F

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18
Q

V ou F

Anabolisme et catabolisme doivent emprunter des voies differentes

A

V

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19
Q

V ou F

Ce n’est pas toutes les voies métaboliques qui vont comprendre une ‘‘rx d’engagement’’

A

F

Chacune en a une

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20
Q

V ou F

Chez les procaryotes, les voies métaboliques se deroulent dans des sites intracellulaires spécifiques

A

F

chez les eucaryotes

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21
Q

V ou F

La quasi-totalité de touets les rx des voies metaboliques sont des rx organiques enzymatiques

A

V

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22
Q

Nommez les 4 categories qu’on peut diviser les rx biochimiques

A
  1. rx de transfert de groupes
  2. oxydoréductions
  3. éliminatoin, isomérisations et réarrangements
  4. rx de formation et de rupture de liaisons de C-C
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23
Q

Quelle est une des liaison la plus rupturé dans les systèmes biologiques (rx chimiques)

A

C-H

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24
Q

La rupture C-H est homolytique ou hétérolytique?

A

Les deux !

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25
Q

Nommez les 2 grandes categories qui englobent les composés qui participent aux rx avec rupture hétérolytiques et à formation de liaisons

A

Nucléophiles (aiment noyau)

électrophiles (aiment électrons)

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26
Q

Expliquez ce qu’est un nucléophile

A

composés riches en électrons

sont chargés négativement ou ont des paires d’electrons non-partagés

caractères nucleophiles et basiques étroitement liés

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27
Q

Expliquez ce qu’est un électrophiles

A

composés déficients en électrons

peuvent etre chargés positivement ou pas

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28
Q

Donnez un exemple de rx nucléophile - électrophiles

A
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29
Q

V ou F

Dans toutes les rx metaboliques, les regles de la logique chimique s’appliquent toujours

A

V

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30
Q

V ou F

Les transferts de groupes sont aussi appelés substitution nucleophile

A

V

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31
Q

V ou F

Dans les transferts de groupes dans les systèmes biochimiques impliquent le transfert d’un groupe électrophile d’un nucléophile à un autre

A

V

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32
Q

Nommez les groupes les plus frequemment transférés das les rx biochimiques

A

acyle

phosphoryle

glycosyle

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33
Q

V ou F

Les rx d’oxydo-réduction (redox) se traduisent par la perte ou le gain d’électrons

A

V

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34
Q

V ou F

Plusieurs rx redox impliquent la rupture d’une liaison C-H avec la perte de 2 electrons par l’atome de carbone

A

V

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35
Q

V ou F

Dans le cas des rx d’oxydo-réduction, des électrons sont transférés a un accepteur d’électrons comme le NAD+

A

V

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36
Q

V ou F

Dans le cas des rx d’oxydo-réduction, pour les organismes aérobies, l’accepteur terminal des paires d’électrons provenant des métabolites oxydés st l’oxygène moléculaire (O2)

A

V

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37
Q

V ou F

Dans le cas des rx d’oxydo-réduction, O2 ne peut pas accepter le transfert d’électrons qu’un à la fois. Ceci est possible grace à l’intervention de coenzymes dont la flavine adénine dinucléotide (FAD)

A

V

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38
Q

V ou F

Les rx d’élimination mènent à la formation de doubles liaisons C-C

A

V

39
Q

V ou F

La substance la plus souvent éliminée est H2O. Les autres possibilités sont NH3, un alcool (ROH) ou une amine primaire (RNH2)

A

V

40
Q

En chimie organique, qu’est ce qu’est un isomère?

A

molécules avec la meme formule brute mais possédant des proprietes chimiques et biologiques différentes

41
Q

Concernant les isomères, imaginez les liens entre : isomère de structure, stereoisomère, diastéromères, isomères cis-trans, énantiomère

A
42
Q

Definir énantiomérie

A

molécules isomères images l’une de l’autre dans un miroir, MAIS NON SUPERPOSABLE

exemple, nos 2 mains

43
Q

Que definit la forme L et D au niveau des énantiomères

A

L et D désignent la conformation actuelle de la molécules en 3 dimensions.

44
Q

V ou F

Nomemclature énantiomère forme L et D est la même que nomemclature lévrogyre (-) ou dextrogyre (+)

A

FAUX

nomemclature lévrogyre et dextrogyre indique les propriétés optiques des molécules

45
Q

V ou F

Les énantiomères de forme D sont favorisés pour les acides aminés

A

F

c’est la forme L

46
Q

V ou F

Les énantiomères de forme D sont favorisés pour les glucose

A

V

47
Q

Pour quelle raison est ce que les rx d’isomérisation biochimiques impliquent le déplacement intramoléculaire d’un atome

A

afin de déplacer la position d’une double liaison

pour se faire, un proton est enlevé d’un atome de carbone et ajouté à un autre

48
Q

Complètez la phrase suivante :

La rx d’isomérisation la plus importante dans le métabolisme est ………… ……………… , une rx à catalyse acido-basique au cours de laquelle se forment des intermédiaires ……………………………….

A

interconversion aldose - cétose

anion ènediolate

49
Q

Complètez la phrase suivante :

La rx d’isomérisation la plus importante dans le métabolisme est ………… ……………… , une rx à catalyse acido-basique au cours de laquelle se forment des intermédiaires ……………………………….

A

interconversion aldose - cétose

anion ènediolate

50
Q

V ou F

L’interconversion aldose - cétose est une rx à catalyse acido-basique au cours de laquelle se forment des intermédiaires anion ènediolate

A

V

TOUJOURS rx isomérisation lorsque anion ènediolate est impliqué

51
Q

Donnez un exemple de rx isomérisation interconversion aldose-cétose

A

phosphoglucose isomérase, enzyme de la glycolyse

52
Q

Definir racémisation

A

rx d’isomérisation dans laquelle un atome d’hydrogène d’un centre chiral modifie sa localisation stéréochimique

ex : conversion frme lévrogyre (-) à forme dextrogyre (+)

53
Q

Definir épimérisation

A

Lorsque la molécule comporte plusieurs centres chiraux, la rx d’isomérisation autour d’un seul carbone asymétrique

54
Q

Que fait la rx de réarrangments

A

modifie les squelettes carbonés. Ces rx rompent et reforment des liaisons C-C

NB : pas courant, il existe peu de rx métaboliques de ce genre

55
Q

Donnez exemple de rx de réarrangement

A

conversion du L-méthylmalonyl-CoA en Succinyl-CoA
à l’aide de l’enzyme méthylmalonyl-CoA mutase

56
Q

V ou F

Rx de formation et de rupture de liaisons C-C constituent la base du métabolisme de biosynthèse seul

A

F

dégradation ET biosynthèse

57
Q

La dégradation du glucose en CO2 implique la rupture de …….. liaisons C-C

A

5

58
Q

V ou F

Rx de la synthèse impliquent l’addition d’un carbanion nucléophile sur un atome de carbon éléctrophile

A

V

59
Q

Quels sont les atomes de carbon électrophiles les plus fréquents

A

aldéhyde

cétone

ester

CO2

60
Q

En ce qui concerne la thermodynamique des composés phosphorylés, comment est-il possible que les processus endergoniques qui assurent le maintient de la vie des organismes sont rendus possibles?

A

Grace aux rx exergoniques de l’oxydation des nutriments

ce couplage dépend étroitement de la synthèse d’intermédiaires ‘‘riches en énergie’’. Ces intermédiaires servent de ‘’ monnaie’’ universelle d’énergie libre nécessaire aux processus endergoniques biologiques

61
Q

V ou F

adénosine triphosphate (ATP) est présent dans quelques être vivant ET est composé riche en énergie le plus courant

A

F et V

présent dans tous les etre vivant

62
Q

V ou F

Rx de transfert de gruopement phosphoryle ont une importance métabolique considérable

A

V

63
Q

Que permet l’hydrolyse de l’ATP

A

libération de l’énergie nécessire à de nombreux processus biochimiques

Ex : ADP ou AMP

64
Q

Comment est assuré la regénération de l’APT

A

par le couplage avec un processus métabolique encore plus exergonique que son hydrolyse

65
Q

V ou F

ATP est limité

A

V

66
Q

V ou F

Rx couplages mettent ATP en jeu. La phosphorylation du glucose permet l’obtention du glucose-6-phosphate et ADP

A

V

67
Q

Definir Énergie libre de Gibbs / enthalpie libre

A

potentiel thermodynamique qui représente le maximum d’énergie utilisable pour effectuer un travail mécanique

68
Q

Pour une rx chimique, la valeur deltaG indique ………

A

différence en énergie qui résulte quand les réactifs chimiques passent d’un état à un autre

69
Q

V ou F

Une rx chimique (ou bien enzymatique lorsqu’on parle des rx métaboliques) est dite FAVORABLE/spontanée quand la valeur de deltaG est négative (-). Une Rx est DÉFAVORABLE/non-spontanée quand deltaG est positif

A

V

70
Q

À quoi sert deltaG

A

force motrice pour lex rx chimique

71
Q

Quelle est la formule d’énergie libre de Gibbs lorsque les conditions sont non-standard?

A
72
Q

Que signifie deltaG

A

force pour atteindre l’équilibre chimique

73
Q

Montrez formules pour énergie de Gibbs (G)

A
74
Q

Que signifie une valeur de 0 pour deltaG

A

rx à l’équilibre

75
Q

Que signifie quand Keq est plus grand que 1
Que signifie quand Keq est plus petit que 1

A
76
Q

Que remplace -RTlnKeq

A
77
Q

Que signifie lorsque Q est plus grand que Keq
Que signifie lorsque Q est plus petit que Keq
Que signifie lorsque Q est égal à Keq

A
78
Q

Nommez quelques caractéristiques de deltaG et deltaG*

A
79
Q

V ou F

Il y a présence de variation d’énergie libre standard lors de l’hydrolyse de quelques composés phosphorylés

A

V

80
Q

Sous quelles conditions utilisons nous les termes suivants:

liaisons à haut potentiel énergétique
liaisons “riches en énergie’’

et quel est leur symbole

A

En présence de liaisons dont l’hydrolyse s’accompagne d’un deltaG* TRES négatif (plus petit que -25 kJ-mol-1)

81
Q

Comment les réactions de transfert de groupement phosphoryle de l’ATP sont elles si exergoniques?

A

augmentation de résonnance
diminution de rx élastique

stabilisation à l’aide d’électrostatique et par résonnance du pyrophosphate et phosphate inorganique

82
Q

Donnez des exemples d’utilisation de l’ATP

A
  1. Amorcage de la dégradation de substrats (phosphorylation fructore-6-phosphate par ATP pour donner fructore-1.6-biphosphate et ADP
  2. Activation des acides aminés lors de la synthèse protéique
  3. plusieurs processus biologiques nécessitant un apprt énergétique (contraction musculaire, transport membranaire, réplication de l’ADN, mouvement flagellaire des spermatozoides) à l’aide de l’ATPase qui transforme l’ATP en ADP + Pi
83
Q

V ou F

Les rx d’oxydo-réduction, qui se traduisent par des transferts d’électrons, n’ont pas d’importnce biochimique considérable

A

F

84
Q

Comment se traduit les rx d’oxydo-réduction

A

par des transferts d’électrons

85
Q

Comment est fournie la plus grande partie de l’énergie libre des organismes vivants

A

Par les rx d’oxydo-réduction

ex: glucose est oxydé (perte électrons) en CO2 et l’O2 est réduit en (gain d’électrons) en H2O

86
Q

À quoi ressemble les rx d’oxydo-réduction (rx redox)

A

rx de transfert de groupes

87
Q

Lors des rx d’oxydo-réduction, quels sont les groupes transférés?

A

groupes transférés sont des électrons, qui vont d’un donneur d’électrons (agent réducteur) vers un accepteur d’électrons (agent oxydant)

88
Q

V ou F

Agent réducteur = accepteur électrons
Agent oxydant = donne électrons

A

F

inverse!

89
Q

À quoi servent les demi-rx présentes chez les rx d’oxydo-réduction

A

Ils ont lieu au cours du métabolisme OXYDATIF lors du transfert vital d’électron qui se déroule dans les mitochondries, sous la dépendence de la cytochrome C oxydase

90
Q

Est ce que les rx de transfert d’électrons ont une grande importance biologique
Si oui, donnez exemple

A

OUI

ex : dans la chaine de transfert d’électrons mitochondriale (source promaire d’ATP chez eucaryotes), les électrons sont transférés du NADH en passant par une série d’accepteur d’électrons de potentiels de réduction croissants

91
Q

Definir le potentiel d’oxydo-réduction (potentiel redox)

A

pression en électrons exercée par une pole électrochimque

92
Q

Comment est défini le potentiel d’oxydo-réduction

A

Si deltaE est positif, deltaG est négatif, la rx est spontanée et elle peut donc accomplir du travail

93
Q

Donnez exemple de l’oxydatoin du NADH par O2 et montrez les demi-rx

A
94
Q

Démontrez, à l’aide d’une figure, les effets su le potentiel d’action lors d’une rx avec eau, avec et sans enzyme appropriée

A

À l’équilibre, vitesse de rx de gauche à droite est la même

Augmentation de la rx biochimique à l’aide des enzymes