Cours 5

Question 1

Quelles sont les similarités entre les Papovaviridae/Papillomaviridae et les Adenoviridae? (3)

Answer 1

1) Réplication nucléaire
2) Non enveloppé
3) Phase précoce-tardive

Question 2

Quelles sont les différences entre les Papovaviridae/Papillomaviridae et les Adenoviridae? (3)

Answer 2

1) P: ADN pol cellulaire; A: ADN pol virale
2) P: ADN Bi Circ; A: ADN Bi Li
3) P: Amorce par ARN; A: Amorce par protéine terminale

Question 3

Qu’est-ce que les Parvoviridae ont en commun avec les Papova, Papilloma et Adeno- viridae? (2)

Answer 3

1) Réplication nucléaire
2) Non enveloppé

Question 4

Qu’est-ce que les Parvoviridae ont en commun avec les Adenoviridae?

Answer 4

1) ADN polymérase virale

Question 5

Quelles particularités différencie les Parvoviridae des Papova, Papilloma et Adeno-viridae? (2)

Answer 5

1) ADN Bi Li
2) Pas d’amorces, mais plutôt hairpin de l’extrémité 3’ OH

Question 6

Quelles particularitées sont notable des Herpesviridae, qui sont à génome ADN Bi Li?

Answer 6

1) Il se circularise dans le noyau
2) Plusieurs phases: Pré-précoce, précoce, tardive, latence
3) mécanisme de cercle roulant créant un concatémère pour l’encapsidation

Question 7

Quelle particularité est notable à propos des poxviridae?

Answer 7

Ils se multiplient exclusivement dans le cytoplasme

Question 8

La multiplication exclusive des Poxviridae dans le cytoplasme implique quoi?

Answer 8

Qu’ils possèdent toutes les enzymes nécessaires à la synthèse et la transcription du génome viral.

Question 9

Pourquoi les génomes viraux subissent un taux de multiplication plus élevées que les génomes cellulaires?

Answer 9

Car plusieurs virus utilisent des polymérases n’ayant pas de mécanismes de corrections, particulièrement chez les génomes à ARN.

Question 10

Quels types de mutations nucléotidiques existent-ils? (4)

Answer 10

1) Silencieuse: lorsqu’elle n’entraîne pas de changement à l’a.a.
2) Neutre: lorsqu’elle n’entraîne pas de changement phénotypique
3) Létales: lorsque le virus ne peut plus se répliquer
4) mutation: lorsqu’elle entraîne un changment modéré du phénotype, qui, si avantageux, sera sélectionné, contribuant à l’évolution du virus.

Question 11

Quels sortes de mutations existent-ils?

Answer 11

1) Conditionnelles
2) Supression
3) Réversions
4) Phénomène de complémentation

Question 12

Qu’est-ce qu’une mutation conditionnelle?

Answer 12

lorsque le phénotype mutant s’expriment dans certaines situations, mais que le phénotype normal peut être observé sous d’autres conditions.

Question 13

Qu’est-ce qu’une réversion intragénique vs extragénique?

Answer 13

Une réversion intragénique est soit une mutation qui retourne un nucléotide muté au nucléotide original; ou est une mutation qui retourne la conformation originale de la protéine en mutant un deuxième nucléotide dans le même gène. Il s’agit alors d’une mutation compensatoire.

Une réversion extragénique, ou supression, est une mutation dans un deuxième gène qui annule la mutation dans le premier gène. Des mutations à un site d’intéraction par exemple.

Question 14

Qu’est-ce que la complémentation?

Answer 14

Lorsqu’un virus est muté de manière à bloquer sa multiplication, ce mutant peut parfois se propager en présence d’une infection par un virus fournissant la fonction manquante.

Question 15

Qu’est-ce que le mélange phénotypique?

Answer 15

Lorsque la présence simultanée de deux génomes viraux entraîne la formation de virus portant, au sein de leur capside ou leur enveloppe, des protéines appartenant à ces deux génomes.

Question 16

Qu’est-ce que la recombinaison chez les virus?

Answer 16

Lorsqu’il se produit un échange de matériel génétique entre des gènes viraux homologue.

Question 17

Comment la recombinaison diffère-t-elle entre les virus à ADN et à ARN?

Answer 17

ADN: la recombinaison se fait par les mécanismes classiques de crossing over.

ARN: mécanisme de changement de matrice (commence sur un brin, fini sur un autre brin, recombinant ainsi l’ARN de deux brins sur un seul brins négatif)

Question 18

Qu’est-ce que le réassotiment?

Answer 18

L’échange de segments de gènes complets entre deux virus possédant un génome segmenté et infectant la même cellule. L’échange se produit alors lors de l’encapsidation.

Question 19

Qu’est-ce que la génétique inverse?

Answer 19

lorsqu’on ute un gène donné par les approches modernes de mutagenèse dirigée et que l’on examine le phénotype, soit l’inverse de la procédure dite classique.

Question 20

Quelle est la procédure de la génétique classique?

Answer 20

On isole un mutant par l’observation de son phénotype avant de déterminer le gène affecté ainsi que la nature de la mutation.

Question 21

Comment la génétique inverse est-elle utilisé en virologie?

Answer 21

lorsqu’on introduit une mutation donnée au sein du génome viral afin d’examiner l’effet de la mutation sur le virus ou sa multiplication.

Question 22

Comment peut-on étudier par génétique inverse un virus à génome ARN de polarité positive?

Answer 22

En utilisant une transcriptase inverse pour générer de l’ADN à partir du génome ARN puis en utilisant le promoteur de T7 afin de générer des transcriptions de l’ADN in vitro.

Question 23

Comment peut-on étudier par génétique inverse un virus à génome ARN bicaténaire?

Answer 23

La nature segmenté des génome ARN bicaténaire implique qu’en plus d’utiliser le promoteur T7, il faut introduire un exemplaire de chacun des gènes viraux en même temps. Afin que l’extrémité fin donne un CATC, un ribozyme est utilisé pour couper l’ADN au bon endroit pour générer des ARN viraux

Question 24

Comment peut-on étudier par génétique inverse un virus à génome ARN de polarité négative?

Answer 24

Similaire à bicaténaire: mais parfois avec d’autres polymérases.

2 systèmes:

1) 12 plasmides: 8 plasmides contenant le génome et 4 contenant les protéines précoces
2) 8 plasmides: utilisant la transcription dans les deux sens pour produire et l’ARN génomique et les protéines précoces.

Question 25

Comment peut-on étudier par génétique inverse un rétrovirus?

Answer 25

Les mutations sont introduit dans un clone d’ADN viral (clone proviral où l’ADN viral est flanqué d’ADN cellulaire) qui est ensuite introduit directement dans la cellule.

Question 26

Comment peut-on étudier par génétique inverse un virus à génome ADN circulaire (papovaviridae)?

Answer 26

Transgenèse dirigée, mutation d’un nucléotides.

Question 27

Comment peut-on étudier par génétique inverse un virus à génome ADN linéaire (Herpesviridae, Adenoviridae, Poxviridae)?

Answer 27

Puisque l’ADN est très gros, on peut juste cloner une partie à la fois et l’intégrer à un plasmide. Il faut ensuite faire muté ce gène et l’introduire dans une cellule avec le virus original et par recombinaison homologue, certains virus auront la mutation et d’autre non. Via cribblage il faut ensuite sélectionné le virus muté et en faire des stocks pour l’étude.