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MD1 SF3 Microbio Exam 2 > Cours 9 - Les virus > Flashcards

Cours 9 - Les virus Flashcards

1
Q

Les virus ont été décrits initialement comme des _____________ par Ivanovsky en _____?

A

Des agents filtrables
1892

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Q

Que veut-on dire par agents filtrables?

A

Les virus sont des agents qui peuvent être filtré par des filtres conçus pour retenir les bactéries.

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3
Q

Les virus sont des parasites _________________ puisqu’ils dépendent de la _____________ de la C hôte pour la réplication

A

intraC obligatoire
machinerie biochimique

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4
Q

V/F : Les virus peuvent malgré tout produire de l’énergie et des protéines par eux-mêmes?

A

FAUX : Agent ne pouvant produire ni énergie ni protéines indépendamment de la C hôte

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5
Q

V/F : Les virus peuvent être à ARN, à ADN ou les 2 en même temps?

A

FAUX : Ils sont constitués d’un génome viral d’ADN ou d’ARN, mais jamais les 2 en même temps

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6
Q

Quelle caractéristique physiologique est importante pour leur transmission?

A

Le fait qu’ils soient enveloppé ou non

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7
Q

V/F : Les virus se reproduisent par division C?
Expliquer

A

FAUX: Les virus sont des agents infectieux dont les composantes individuelles sont assemblées, donc qui ne se reproduisent pas par division C

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8
Q

Les virus ____________ vivants.

Ils doivent infecter les C pour assurer leur ________________ et leur _____________.

A

ne sont pas

leur réplication et leur propagation (leur survie genre)

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9
Q

V/F : Les virus doivent être capable d’utiliser la machinerie C de l’hôte pour produire leurs propres composantes?

A

VRAI

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10
Q

V/F : Les virus doivent encoder tous les processus requis qui ne sont pas « fournis » par la C hôte?

A

VRAI

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11
Q

V/F : Les composantes virales s’assemblent grâce à la C hôte?

A

FAUX : Elles doivent s’assembler par elles-mêmes

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12
Q

Expliquer le concept que tous les virus ne peuvent pas infecter toutes les C ou tous les hôtes (le tropisme C).

A
  • Le virus doit pouvoir entrer dans la C hôte
  • Une fois le virus entré, la C hôte doit posséder la machinerie biochimique et C appropriée pour lui permettre de se répliquer
  • Une fois répliqué, le virus doit pouvoir être libéré de la C pour transmettre l’infection (et pouvoir ainsi assurer sa survie)
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13
Q

La taille des virus se mesure en _________ (_____)?

A

nanomètres (nm)

Les + petits (parvovirus) = 18 nm
Les + gros (poxvirus) = 300 nm
Mais malgré ça, ils ne sont pas vrm visibles en microscopie optique

En général, les + gros virions ont un plus gros génome qui encode pour plus de prot et sont géné plus complexes que les petits virus.

*Les + gros virus sont comparables aux + petites bactéries

Diapo 10

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14
Q

Qu’est-ce qu’un virion?
Le génome?
La capside?
La nucléocapside?

A
  • Virion : particule virale
  • Génome d’acide nucléique compris dans
  • Une couche protectrice de protéines = la capside
  • Nucléocapside = génome d’acide nucléique + capside
    · Icosahédrique (symétrique)
    · Hélicoïdale (symétrique)
    · Complexe (asymétrique)
  • Tous les virus ont une nucléocapside
  • Avec ou sans enveloppe
    (la capside est incluse dans l’enveloppe)

Diapo 11

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15
Q

diapo 12

A
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16
Q

Expliquer le génome d’acide nucléique… ADN vs ARN

A

diapo 13

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17
Q

V/F : La couche la plus externe d’un virus peut être la capside ou l’enveloppe selon le virus?

A

VRAI

Elles constituent la structure, la protection et le véhicule de transmission du virus

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18
Q

Les structures présentes à la surface de la capside ou de l’enveloppe permettent _____________________________ via une prot d’attachement virale (PAV) ou autre structure

Expliquer

A

L’interaction entre le virus et la C hôte

  • Si on détruit la couche la plus externe d’un virus (la capside ou l’enveloppe), on inactive le virus
  • Les AC développés contre les composantes de ces structures de surface peuvent prévenir l’infection
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19
Q

Décrire la capside virale

A
  • Faite de protéines
  • Structure rigide capable de résister à des conditions environnementales difficiles
  • Les virus nus (non enveloppés) sont géné résistants à la sécheresse, à l’acidité, aux détergents
    · Incluant l’acide et la bile du tractus digestif
    · Ceci détermine leur mode de transmission
  • La capside est symétrique (icosaédrique ou hélicoïdale) ou asymétrique (complexe)

*Donc enveloppé = vraiment + fragiles
Nus (juste capside) = super rigide et résistant

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20
Q

Décrire comment s’assemble les composantes de la capside icosahédrique

A

Pour la former, les sous-unités protéiques virales s’unissent en protomères.
5 protomères s’unissent pour former des capsomères (pentamères) qui s’assemblent en capside

Sous-unités –> Protomères –> 5 Protomères –> Pentamères –> Capside

diapo 16

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21
Q

Décrire la capside icosaédrique

A

La capside ico simple est formée de 12 capsomères. Chacun des 12 capsomères (aux 12 sommets) interagit avec 5 autres capsomères
· On appelle ces capsomères de pentamères ou pentons

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22
Q

Expliquer les différences que peuvent avoir certains virus au niveau de leur capside

A
  • La capside ico ressemble à une sphère et est constituée par l’assemblage de sous-unités prot
  • Toutes les faces de l’ico simple sont identiques
  • L’acide nucléique est compris au centre de la capside qui le protège de l’environnement

Des virions à plus grosse capside sont fabriqués en insérant des capsomères (hexons) entre les pentons

diapo 17

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23
Q

Décrire la capside hélicoïdale

A

Les sous-unités protéiques interagissent entre elles et avec l’acide nucléique pour former une structure qui ressemble à un bâtonnet

Ex : virus de la mosaïque du tabac

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24
Q

Quelle est la composition de l’enveloppe?

A

L’enveloppe est une membrane composée de lipides, de protéines et de glycoprotéines.

Elle a un structure similaire aux membranes C

diapo 21

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25
Q

Quelle est la structure de l’enveloppe?

A

Des glycoprotéines virales sont ancrées sur l’enveloppe et se projettent hors de la surface du virion, comme des spicules « spikes »
- Certains agissent comme prot d’attachement virales (PAV), capables de se lier à des C cibles
- Sont des AG majeurs pouvant éliciter une immunité protectrice
- Autres fonctions possibles

Contrairement aux virus non-enveloppés, les virus enveloppés sont facilement inactivés par la sécheresse, l’acidité, les détergents et les solvants
- La plupart de ces virus ne peuvent survivre dans le tractus digestif

La structure de l’enveloppe peut être maintenue uniquement dans une solution aqueuse (doivent rester mouillés)
- Ces virus sont géné transmis par les fluides tels que le sang, les gouttelettes respiratoires et les tissus (donc pas par voie fécale-orale ex)

26
Q

Comment sont classifiés les virus au niveau internationale?

A

Les virus sont classifiés principalement selon
1) la nature de leur génome et
2) leur structure (morphologie)

1 –> Acide nucléique : ADN ou ARN
· Simple brin ou double brin (pour les génomes d’ARN : polarité (+/-)
· Segmenté ou non
Linéaire ou circulaire

2 –> Structure du virion
· Symétrie de la nucléocapside (ico, hélico ou complexe)
· Enveloppé ou non
· Nb de capsomères
· Autres

27
Q

Connaître les terminaisons :

  • Ordre = ?
  • Famille = ?
  • Sous-famille = ?
  • Genre = ?
  • Espèce = ?
A

diapo 24

28
Q

Virus à ADN

A

diapo 25

29
Q

Virus à ARN

A

26

30
Q

Nommer qq familles de virus à ADN et des membres importants

A

Famille : Hepadnaviridae
Membres : Virus de l’hépatite B

Famille : Papillomaviridae
Membres : Virus du papillome humaine (VPH)

31
Q

Nommer qq familles de virus à ARN et des membres importants

A

Famille : Orthomyxoviridae
Membres : Influenza types A et B

Famille : Coronaviridae
Membres : Coronavirus commun, SRAS-CoV-1, SRAS-CoV-2

Famille : Retroviridae
Membres : VIH, HTLV I et II

32
Q

Expliquer les généralités de la réplication virale

A
  • Les principales étapes de la réplication virale sont les mêmes d’un virus à un autre
  • La C hôte agit comme une usine en fournissant les substrats, l’énergie et la machinerie nécé à la synthèse des prot virales et à la réplication du génome
  • Ce qui n’est pas fourni par le C hôte doit être encodé dans le génome du virus
33
Q

Quelles sont les 8 étapes de la réplication virale?

A
  1. Reconnaissance de la C cible
  2. Attachement
  3. Entrée dans la C à travers la membrane plasmatique
  4. Décapsidation
  5. Synthèse des constituants viraux (multiplication virale)
    · Synthèse de l’ARNm précoce et des prot non-structurales
    · Réplication du génome
    · Synthèse de l’ARNm tardif et des prot structurales
    · Modification post-traduction de la protéine
  6. Assemblage du virus
  7. Bourgeonnement des virus enveloppés
  8. Relâchement du virus hors de la C hôte

diapo 31

34
Q

Expliquer l’étape 1, soit la reconnaissance, et l’étape 2, soit l’attachement à la C cible

A
  • Les protéines d’attachement virales (PAV) ou d’autres structures à la surface du virus se lient à des récepteurs sur la C hôte
    · Les virus peuvent se lier à des récepteurs présents sur certains C seulement (spécifiques au type de C), parfois présents chez certains hôtes seulement (spécifiques à l’hôte)
    · Les C susceptibles ciblées définissent le tropisme tissulaire :
    · ex : le virus de l’hépatite C est hépatotrophe
    · ex : le virus EBV est lymphotrope (trouve les lymphocytes particulièrement)
35
Q

Nommer qq exemples de tropisme et de maladies virales

A

diapo 33

36
Q

Donner des exemples de protéines d’attachement virales (PAVs)?

Donner des exemples de récepteurs de la C hôte?

A

PAVs
- gp120 (glycoprotéine 120) du VIH
- HA gp (hémagglutinine) du virus Influenza A

Récepteurs
- CD4 et co-récepteur chemokine sur les lymphocytes T « helper T-Cell » pour le VIH
- Acide sialique des C épithéliales pour Influenza A

37
Q

Exemples de protéines de surface de la C hôte servant de récepteurs viraux

  • Virus de la rage = ?
  • SRAS-CoV-2 = ?
A
  • Virus de la rage = Récepteur de l’acétylcholine des neurones
  • SRAS-CoV-2 = Récepteur de l’enzyme de conversion de l’angiotensine-2 (ACE2)
38
Q

Expliquer l’étape 3, soit l’entrée dans la C

A

Virus non enveloppés
Principalement : endocytose médiée par un récepteur

Virus enveloppés
Les virus vont s’accolés et ensuit il va y avoir une fusion des membranes du virus et de la C cible (précédée ou non d’endocytose).
La nucléocapside ou le génome viral est ensuite relâché dans le cytoplasme

39
Q

Expliquer l’étape 4, soit le décapsidation

A

Après internalisation, la nucléocapside doit arriver au site de réplication et se rompre

  • Le génome d’ADN est habituellement transporté au noyau (exception : poxvirus) –> souvent ces virus peuvent rester latents ou incorporer notre génome par ex
  • Le génome d’ARN reste habituellement dans le cytoplasme (exceptions : orthomyxovirus et retrovirus)
40
Q

Expliquer l’étape 5, soit la synthèse des constituants viraux (multiplication virale)

A
  1. Transcription du génome en ARNm pour traduction en protéines non-structurales (produits précoces)
  2. Réplication du génome
  3. Transcription du génome en ARNm pour traduction en protéines structurales (produits tardifs)
  4. Modification post-traduction de la protéine
41
Q

Expliquer comment la synthèse des constituants viraux varie en fonction des virus à ARN ou à ADN

A
  • La machinerie C nécé pour la transcription de l’ARNm se trouve dans le noyau de la C
  • La plupart des virus à ADN utilisent les polymérases de la C hôte pour synthétiser l’ARNm dans le noyau
  • La plupart des virus à ARN se répliquent dans le cytoplasme et doivent eux-mêmes encoder les enzymes nécé à la transcription et à la réplication (la C hôte n’a pas ce qu’il faut pour répliquer de l’ARN) (encodent pour leur propre polymérases)
    · Il y a bcp d’erreurs qui sont faites par les ARN polymérases (virales) –> c’est un avantage parfois car permet de s’évader de notre système immunitaire
42
Q

Expliquer l’étape 6, soit l’assemblage

A
  • Le site et le mécanisme d’assemblage du virus dépend d’où la réplication a eu lieu et si la structure finale est celle d’un virus nu ou d’un virus enveloppé
    · La plupart des virus à ADN sont assemblés dans le noyau
    · La plupart des virus à ARN sont assemblés dans le cytoplasme
    • Les capsides virales peuvent être assemblées et ensuite remplies du génome ou peuvent être assemblées autour du génome

Des erreurs sont faites durant l’assemblage et résultent en la formation de virions vides ou contenant un génome défectueux

43
Q

Expliquer l’étape 7, soit le bourgeonnement du virus

A

L’enveloppe est acquise lors du bourgeonnement du virus
- La plupart des virus à ARN bourgeonnent de la membrane plasmatique sans tuer la C (donc ils partent avec une portion de la membrane des C hôtes)
- D’autres virus acquièrent leur enveloppe du réticulum endoplasmique et de l’appareil de Golgi

*les virus nus eux n’ont pas d’enveloppe et ils doivent faire la lyse de la C pour sortir

44
Q

Expliquer l’étape 8, soit le relâchement hors de la C hôte

A
  • Les virus sont relâchés de la C
    · par lyse C (virus nus)
    · par exocytose
    · par bourgeonnement à travers la membrane plasmatique (virus enveloppés)

*Les virus nus sont souvent relâchés après lyse C et les virus enveloppés le sont souvent par bourgeonnement par la membrane plasmatique sans tuer le C

Les virus qui bourgeonnent dans le cytoplasme sont relâchés par exocytose ou lyse C

45
Q

V/F : La lyse de la C est plus avantageuse que le bourgeonnement

A

FAUX : L’enveloppe ressemble à nos C car c’est notre membrane, donc évade le SI. Et le virus n’a pas d’avantage à tuer son hôte car c’est lui qui lui permet de se propager

46
Q

Quels sont les modes de transmission des virus?

A

Mécanismes de transmission virale
- Aérosols (dispersion dans l’air, peu de virus)
- Ingestion de nourriture et eau contaminées (fécale-orale)
- Fomites (objets vecteurs comme jouets dans garderies)
- Contact direct avec les sécrétions (salive, plaie) –> gouttelettes (habituellement à l’intérieur d’un mètre)
- Contact sexuel
- Sang contaminé ou transplantation d’organe
- Zoonoses (animaux, insectes)
- De la mère à l’enfant (transmission verticale)

47
Q

Le mode de transmission dépend de quoi?

Quel est le déterminant principal structural du mode de transmission virale?

A

Le mode de transmission dépend de quelle est la source du virus et de la capacité du virus à endurer les conditions de l’environnement et du corps jusqu’à sa C cible

La présence ou non d’une enveloppe est le principal déterminant structural du mode de transmission virale
· Les virus non-enveloppés sont résistants à la sécheresse, les détergents, les extrêmes de T° et de pH contrairement aux virus enveloppés

48
Q

V/F : Les virus enveloppés peuvent donc survivre à l’acidité de l’estomac et à l’effet détergent des acides biliaires de l’intestin.
· C’est pourquoi ils sont souvent transmis par voie fécale-orale
· C’est pourquoi la source fréquente = des objets contaminés (fomites)

A

FAUX : Ce sont les virus non enveloppés

Ex : Virus de l’hépatite A, adénovirus, calicivirus, etc

49
Q

V/F : Les virus enveloppés sont plus fragiles : ils ont besoin d’une enveloppe intacte pour rester infectieux et doivent rester mouillés
· C’est pourquoi ils sont souvent transmis par gouttelettes respiratoires, mucus, salive, sperme, sang, organe transplanté

A

VRAI

Ex: Le VIH, le virus de l’hépatite B, le virus de l’Influenza, etc

50
Q

Tableau résumé de l’influence de la structure du virion sur les propriétés virales

A

diapo 48

51
Q

Qu’est-ce qu’une zoonose et une arbovirose?

A
  • Les animaux peuvent être des vecteurs, c-a-d qu’ils transmettent l’infection à d’autres animaux ou à des humains
  • Ils peuvent aussi agir comme réservoir : maintiennent et amplifient le virus dans l’environnement

· Les maladies virales qui peuvent atteindre les animaux (ou les insectes) et les humains sont appelées zoonoses
ex : la rage
· Lorsque les arthropodes (moustiques, tiques, mouches…) sont le vecteur d’une infection virale, l’infection est une arbovirose
ex : flavivirus (virus de la Dengue où vecteur = moustique)

52
Q

Quelles autres sources peuvent être associées à la transmission?

A
  • Attention aux infections asymptomatiques qui peuvent contribuer à la transmission (ITSS)
  • Conditions de vie, promiscuité (porter un masque quand proximité)
  • Travail et loisirs (qq1 qui travaille en forêt = + de chance arbovirose ex)
  • Styles de vie (utilisateurs de drogue injectables)
  • Fréquentation des garderies
  • Voyages
53
Q

Quelles sont les 4 façons de détecter des virus et de Dx des infections virales?

A
  1. Culture virale sur des C dérivées de tissus humains en couche monoC
    · On peut observer l’apparition d’effets cytopathiques caractéristiques
    · Était encore utilisé pour certains spécimens avant la pandémie : on ne l’utilise plus en labo médicaux
  2. Détection d’AC spécifiques chez l’hôte infecté
    · Sérologie (sérum précoce, sérum tardif (phase aiguë ou latente/chronique))
    · Utilisée pour certaines infections virales
    · sérologie = recherche d’AC
  3. Détection du matériel génétique viral (PCR)
    · Devenu la méthode de choix (très rapide, très précis, très sensible)
  4. Observation en microscopie électronique
    · En laboratoire de recherche seulement
54
Q

Comment peut-on assurer le contrôle des infections virales?

A

Principalement :
- Hygiène (lavage des mains, équipement de protection individuelle, distanciation, etc)
- Vaccination (prévention)
· Inactivités, vivants atténués ou autres
- Tx antiviral
· Pour certains infections virales seulement

55
Q

Quelles sont les cibles du Tx antiviral?

A

Les cibles thérapeutiques sont principalement les étapes du cycle de réplication virale

*La plupart des infections virales n’ont pas besoins d’être traitées

56
Q

Tx antiviral

Expliquer l’inhibition de l’attachement du virus à la C (1)

A
  • AC neutralisants
    · ex : immunisation passive de l’hépatite B (immunoglobulines)
  • Antagonistes de récepteurs spécifiques
    · Analogues des récepteurs C ou de la PAV qui bloquent l’interaction entre le virus et la C
    · ex : inhibiteurs du récepteur C CCR5 qui empêchent le VIH de se lier aux macrophages et certaines C CD4
57
Q

Tx antiviral

Expliquer l’inhibition de l’entrée dans la C (2) et de la décapsidation (3)

A

Si ce processus est bloqué, le génome du virus ne peut pas être relâché dans la C pour se répliquer
· Pour les virus qui entrent pas des vésicules endocytiques, certains antiviraux vont neutraliser le pH de ces compartiments pour empêcher la fusion ou le bris de la membrane, empêchant la décapsidation

Ex : Amantadine et rimantadine
58
Q

Tx antiviral

Est-ce que l’inhibition de la synthèse de l’ARNm est une bonne cible de Tx antiviral?

A

NON, pas une bonne cible

L’ARNm n’est pas une bonne cible car il est difficile d’inhiber l’ARNm du virus sans inhiber l’ARNm de la C hôte

59
Q

Tx antiviral

Expliquer l’inhibiteurs de la réplication du génome (4)

A

diapo 58

60
Q

Expliquer l’exemple de Lamivudine dans le Tx du VIH

A
  • Analogue nucléosidique de la polymérase du VIH
  • Mécanisme d’action :
    · Analogue de la cytosine : compétition avec le substrat naturel
    · Tri-phosphorylation par des kinases des C de l’hôte
    · Incorporation de l’analogue nucléosidique triphosphorylé dans la chapine d’ADN virale qui résulte en la terminaison de l’élongation de la chapine
61
Q

Tx antiviral

Expliquer l’assemblage de virus (5) et le relâchement hors de la C (6)

A

On veut inhiber des enzymes responsables de ces étapes

  • Inhibiteurs de la protéase du VIH, enzyme essentielle à l’assemblage du virus et à la production de virions infectieux
  • Inhibiteurs de la neuraminidase de l’Influenza A et B (la neuraminidase permet au virus d’être libéré hors de la C) - les virus sont donc pris à la surface des C
62
Q

CONCLUSION

Un virus est un parasite _________________________.

Composé d’un génome _________________ (ARN ou ADN) entassé dans une capside +/- _____________.

Classification principalement selon la nature du génome (ARN ou ADN) et sa _____________________.

Le mode de réplication virale est spécifique au virus (ARN vs ADN)

Le mode de transmission dépend bcp de la présence ou non de _________________.

Les Tx antiviraux disponibles ciblent le plus souvent _____________________________.

A

obligatoire intraC

d’acide nucléique, enveloppé

structure +/- enveloppe

d’une enveloppe

une étape du cycle de réplication virale

MD1 SF3 Microbio Exam 2 (9 decks)

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