Del 1 - Avel i små populationer Flashcards
Alla populationer påverkas av?
Migration
Mutation
Selektion
Vad är inavel?
Inavel är parning mellan besläktade individer
Innebär att avkomman kan få två alleler i ett locus som är identiska genom arv
Vad påverkas bara små populationer av?
Bara små populationer påverkas av slumpen. Det som kallas för:
- genetisk drift
- inavel
Hur betecknas inavelskoefficienten?
F
Vad mäter inavelskoefficienten?
Inavelskoefficient, F: den mäter sannolikheten att två alleler i ett genpar hos en individ är identiska genom arv
F kan beräknas för?
enskilda individer
populationer
Inavel (F) för en individ
Individen A har fått avkommorna B och C, som sen i sin tur har parats för att ge avkomman X
Om individ A nedärver den mörkblåa allelen till avkomman C, vad är då sannolikheten att den också ska nedärva den mörkblåa allelen till avkomman B?
Ja, det finns två alleler att välja på så sannolikheten är 50%
Inavel (F) för en individ
Individen A har fått avkommorna B och C, som sen i sin tur har parats för att ge avkomman X
Om nu de mörkblåa allelerna finns hos både avkomman B och avkomman C, vad är då sannolikheten att B och C nedärver de mörkblåa allelerna ner till X?
Fx = ½ x ½ x ½ = [½]^3 = ⅛
Att B nedärver den mörkblåa allelen till X är 50%
Att C nedärver den mörkblåa allelen till X är 50%
Totalt sett så är sannolikheten att X har alleler som är identiska genom arv är 0,5 x 0,5 x 0,5, eller 0,5^3 som är en åttondel
Beräkning av inavelskoefficienten (F) för individ X?
Regel: gå från ena föräldern till den andra (via gemensam ana) och räkna alla individer (inklusive föräldrarna): n
Fx = (½)^n [1 + FA]
Vad betyder F=⅛ på individnivå?
Om vi tittar på många genpar (loci) i en individ:
Andelen genpar hos denna individ som är identiska genom arv, alltså pga att föräldrar är släkt med varandra
En individ - många genpar
En av dessa 8 genpar är identiska genom arv
Vad betyder F=⅛ på populationsnivå?
Om vi tittar på ett genpar (locus) i många individer:
Andelen individer som är identiska genom arv i detta (ett visst) locus
Ett genpar - många individer
Beräkna F för individ X
A och B har fått två avkommor C och D, vilka parar sig och får avkomman X
Vad är inavelskoefficienten för X?
- Om vi börjar gå från individ C till A och ner till D, dvs från ena föräldern till gemensam släkting och ner till andra föräldern
- Sedan kan vi göra samma sak och går från C till B och ner till D
- Därefter hittar vi inte fler lopar
- Då blir sannolikheten ⅛ plus ⅛ vilket är ¼
Fx = (½)^3 + (½)^3 = ⅛ + ⅛ = ¼
Inavlad ana?
Vad händer om anan själv är inavlad?I det här fallet individen G, som i sin tur är inavlad med en gemensam ana som heter A. Vad skulle då inavelskoefficienten för X bli i det här fallet?
Vi börjar med att titta på individen X från ena föräldern till den andra (H till G till I), vilket är 3 individer, dvs 1/2^3. Men sedan måste vi multiplicera med 1+FG. Vad är FG, jo då går vi från D till E och det är 5 individer i den loopen, dvs 1 + 1/2^5
Fx = (½)^3 [1 + FG] = (½)^3 [1 + (½)^5] =
= (½)^3 + (½)^3+5 = (⅛) + (1/256) =
= (33/256) = 12,9%
Vad är släktskapsgrad?
Släktskapsgrad = andel gener som är identiska genom arv hos två individer
Släktskap mellan förälder och avkomma?
Det finns alltid ett släktskap mellan förälder och avkomma som är 0,5. Individen har alltid hälften av generna eller allelerna som är identiska genom arv från vardera av sina föräldrar.
