Effets sublétaux Flashcards
1
Q
Poissons et biomaqueurs
A
- beaucoup de biomarqueurs ont été développés pour les organismes aquatiques, principalement pour les poissons
- les milieux aquatiques sont facilement contaminés par plusieurs leurs sources (ponctuelles : rejet d’une usine, et diffuses : infiltration contaminants agricoles)
- les poissons sont présents dans presque tous les écosystèmes, où ils jouent un rôle écologiques majeur via le transfert d’énergie
- biomarqueurs applicables à un grand nombre d’espèces, faibles à élever en laboratoire
2
Q
Foie
A
- le foie est impliqué dans la détoxication de xénobiotiques et contaminants inorganiques
- il est donc le lieu de plusieurs réactions enzymatiques associées à l’exposition aux contaminants
- les contaminants peuvent y être activés
- plus sensible à la prolifération cellulaire que beaucoup d’autres organes
- il est plus gros organe des viscères, présent chez tous les vertébrés
- grand nombre de biomarqueurs moléculsi
3
Q
Organe biomarqueur : le foie
A
- métallothionéines : grande affinité pour métaux inductibles, excrétion dans lysosomes
- nécrose ou apoptose : mort cellulaire induite ou programmée, gonflement cellulaire ou corps apoptotiques
- stress oxidatif :production d’ERO, péroxydation des lipides, production de MDA
- aberrations chromosomales : échanges de chromatides soeurs, bris de chromosomes, micronoyaux
4
Q
Approches omiques : définition
A
- évaluation simultanée de la totalité des gènes, protéines, métabolites ou lipides dans un tissu ou un organisme
- génomique : ce qui peut se passer
- transcriptomique : ce qui semble se passer
- protéomique : ce qui fait que ça se passe
- métabolomique : ce qui s’est passé ou est en train de se passé
5
Q
Approches omiques informationnelles
A
- conservation d’échantillon
- préparation d’échantillon
- techniques à appliquer
- traitement de données
- métadonnées générées
6
Q
Omiques vs. métaomique
A
- génomique : culture d’une seule colonie microbienne, fragmentation de l’ADN, séquençage
- métagénomique : communauté microbienne, isolation, puis fragmentation de l’ADN, séquençage, analyses
- transcriptomique vs métatranscriptomique
- protéomique vs métaprotéomique
7
Q
Utilité en écotoxicologie pour suivre la réponse et comprendre les mécanismes
A
- exemple oiseau exposé contaminant
- tissu : ADN (épigénétique), ARN (transcritomique), protéines (protéomique)
- plume : ADN (génomique), ADNe (microbiome0, microbles sur les plumes
- foie : délai court de préservation, ARN (transcriptomique), protéines (protéomique), métabolites (métobolomique), lipides (lipidomique)
8
Q
Transcriptomique
A
- mesure de l’expression des gènes
- poisson exposé vs contrôle
- organe, tissu, ARNm
- regarde gènes et quantitification
- tous le
- compare les deux (un peu et l’autre beaucoup expression)
9
Q
Épigénétique
A
- un contaminant peut altérer l’environnement cellulaire de l’ADN
- ex :
- antidépresseur affecte l’expression d’une enzyme impliquée dans la méthylation de l’ADN d’un embryon de poisson, après une exposition de 6 jours
- entraine une répression transcriptionnelle
- baisse d’une hormone de stress sur 3 générations par la suite
10
Q
ADN environnemental : analyses du macrobiote
A
- permet d’estimer la biodiversité
- mais perte d’expertise en taxonomie
- pour l’instant, on obtient la présence ou l’absence au lieu de l’abondance
11
Q
Métagénomique
A
- comprendre comme les contaminants influencent les microorganismes intestinaux, dermaux, dans les biofilms
- ex : effet des antibiotiques dans les eaux usées
- comprendre comment les microorganismes modifient les contaminants
- ex : nourriture traditionnelle contaminée en Hg, présence de bactéries résistantes au Hg
12
Q
Voies conduisant à des effets indésirables (AOP)
A
- processus systématiques qui utilisent les informations mécanistiques disponibles concernant une réponse toxicologique et décrit les liens causaux ou mécanistiques entre un événement d’initiation moléculaire, une série d’événements clés intermédiaires et l’effet néfastes
- les approches multi-omiques pourraient permettre de bonnes avancées
- possible émergence de CRISPR en inactivant des gènes pour comprendre le rôle d’une enzyme
13
Q
Effets sublétaux
A
- modifications aux niveaux moléculaire, subcellulaire, cellulaire et histologique causées par les contaminants ont également des conséquences sur l’individu
- les contaminants peuvent causer la mortalité mais auront d’abord des effets sublétaux, soit des effets adverses au fitness de l’individu
- agissent sur la croissance, développement, reproduction, physiologie, immunologie, comportement
14
Q
Si un organisme est exposé à une faible concentration d’un contaminant, sa croissance va …?
A
- augmenter
15
Q
Croissance
A
- souvent choisie comme une variable-réponse pour les effets sublétaux, car elle est facile à mesurer et intègre des effets biochimiques et physiologiques
- parfois relation dose-réponse linéaire, parfois avec seuil ou modèle de dose-réponse diphasique (hormèse)
- diminution de la croissance avec exposition au contaminant
- augmentation de la croissance à de faibles doses, puis réduction
16
Q
Réponse hormétique
A
- découvert grâce à ;a diminution des limites de détection, l’utilisation d’approches in vitro et à l’utilisation d’études temporelles
- applicable à la croissance, la cognition et la longévité
- réponse en deux phases :
- à faibles doses : surcompensation de l’organisme face à une stimulation qui perturbe l’homéostasie
- à doses croissantes : toxicité induite envers l’individu et ses tissus