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origine biochem > exam final > Flashcards

exam final Flashcards

1
Q

C’est quoi la structure de base d’un acide aminé

A

NH2—C(R)—COOH

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Q

Quel est la forme majoritaire de l’acide aminé

A

L

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Q

C’est quoi le code de l’acide glutamique

A

Glu et E

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4
Q

C’est quoi le code de Acide aspartique

A

Asp et D

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5
Q

C’est quoi le code de l’alanine

A

Ala et A

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6
Q

C’est quoi le code de l’arginine

A

Arg et R

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7
Q

C’est quoi le code de la asparagine

A

Asn et N

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8
Q

C’est quoi le code de la cystéine

A

Cys et C

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9
Q

C’est quoi le code de la glutamine

A

Gln et Q

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10
Q

C’est quoi le code de la glycine

A

Gly et G

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11
Q

C’est quoi le code de l’histidine

A

His et H

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12
Q

C’est quoi le code de l’isoleucine

A

Ile et I

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13
Q

C’est quoi le code de la leucine

A

Leu et L

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14
Q

C’est quoi le code de Lysine

A

Lys et K

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15
Q

C’est quoi le code de la méthionine

A

Met et M

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16
Q

C’est quoi le code de la phénylalanine

A

Phe et F

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17
Q

C’est quoi le code de la proline

A

Pro et P

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18
Q

C’est quoi le code de la Sérine

A

Ser et S

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19
Q

C’est quoi le code de la thréonine

A

Thr et T

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20
Q

C’est quoi le code de la tryptophane

A

Trp et W

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21
Q

C’est quoi le code de la tyrosine

A

Tyr et Y

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22
Q

C’est quoi le code de la valine

A

Val et V

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23
Q

C’est quoi la chaine latérales de la glycine

A

H

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24
Q

C’est quoi la chaine latérales de l’alaline

A

CH3

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25
Q

C’est quoi la chaine latérales de la valine

A

CH(CH3)2

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26
Q

C’est quoi la chaine latérales de la leucine

A

CH2CH(CH3)2

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27
Q

C’est quoi la chaine latérales de l’isoleucine

A

CH(CH3)CH2CH3

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28
Q

C’est quoi la chaine latérales de la methionine

A

CH2CH2SCH3

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29
Q

C’est quoi la chaine latérales de la proline

A

cyclopentane avec 4C et 1 NH

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30
Q

C’est quoi la chaine latérales de phénylalanine

A

CH2–Aromatique

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31
Q

C’est quoi la chaine latérales de tryptophane

A

CH2-cyclopentane-aromatique

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32
Q

C’est quoi la chaine latérales de la sérine

A

CH2OH

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33
Q

C’est quoi la chaine latérales de thréonine

A

CH(OH)CH3

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34
Q

C’est quoi la chaine latérales de la tyrosine

A

CH2–Aromatique–OH

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35
Q

C’est quoi la chaine latérales de asparagine

A

CH2C=O(NH2)

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36
Q

C’est quoi la chaine latérales de glutamine

A

CH2CH2C=O(NH2)

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37
Q

C’est quoi la chaine latérales de la cysteine

A

CH2SH

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38
Q

C’est quoi la chaine latérales de la lysine

A

CH2CH2CH2CH2NH2

39
Q

C’est quoi la chaine latérales de arginine

A

CH2CH2CH2NHC=NH(NH2)

40
Q

C’est quoi la chaine latérales de la histidine

A

CH2–cyclopentane avec 3C, 1N et 1NH

41
Q

C’est quoi la chaine latérales de l’acide aspartique

A

CH2COOH

42
Q

C’est quoi la chaine latérales de l’acide glutamique

A

CH2CH2COOH

43
Q

C’est quoi les propriétés physico-chimiques de l’acide glutamique

A

Polaire, chargés négativement

44
Q

C’est quoi les propriétés physico-chimiques de l’acide aspartique

A

Petit, Polaire, chargée négativement

45
Q

C’est quoi les propriétés physico-chimiques de l’alanine

A

hydrophobe, petit, minuscule

46
Q

C’est quoi les propriétés physico-chimiques de l’arginine

A

Polaire, chargée positivement

47
Q

C’est quoi les propriétés physico-chimiques de l’asparagine

A

Petit, polaire

48
Q

C’est quoi les propriétés physico-chimiques de la cystine

A

hydrophobe, petit

49
Q

C’est quoi les propriétés physico-chimiques de la cystéine

A

hydrophobe, polaire, petit, minuscule

50
Q

C’est quoi les propriétés physico-chimiques de la glutamine

A

polaire

51
Q

C’est quoi les propriétés physico-chimiques de la glycine

A

Hydrophobe, petit, minuscules

52
Q

C’est quoi les propriétés physico-chimiques de la histidine

A

hydrophobe, aromatiques, polaire chargée positivement

53
Q

C’est quoi les propriétés physico-chimiques de la isoleucine

A

hydrophobes, aliphatiques

54
Q

C’est quoi les propriétés physico-chimiques de la leucine

A

hydrophobes, aliphatiques

55
Q

C’est quoi les propriétés physico-chimiques de la lysine

A

hydrophobe, polaire chargé positivement

56
Q

C’est quoi les propriétés physico-chimiques de la méthionine

A

hydrophobe

57
Q

C’est quoi les propriétés physico-chimiques de la phénylalanine

A

hydrophobe, aromatiques

58
Q

C’est quoi les propriétés physico-chimiques de la proline

A

petit

59
Q

C’est quoi les propriétés physico-chimiques de la sérine

A

petit, polaire

60
Q

C’est quoi les propriétés physico-chimiques de la thréonine

A

hydrophobe, petit, polaire

61
Q

C’est quoi les propriétés physico-chimiques de la tryptophane

A

hydrophobe, aromatiques, polaire

62
Q

C’est quoi les propriétés physico-chimiques de la tyrosine

A

hydrophobe, aromatiques, polaire

63
Q

C’est quoi les propriétés physico-chimiques de la valine

A

hydrophobe, aliphatiques, petit

64
Q

C’est quoi le point isolélectrique (ISO)

A

Le point isolélectrique est le le point ou le pH auquel l’acide aminé a une charge nette de 0

65
Q

Pourquoi il y deux ou plus de groupes ionisables

A

Il y a 2 ou plus groupes ionisables, puisqu’il y a la fonction carboxyle et la fonction amine.

66
Q

Que font K1, K2 et KR

A

K1: constante de dissociation pour la fonction carboxylique
K2: constante de dissociation pour la fonction amine.
KR: constante de dissociation pour la chaine latérale

67
Q

Qu’elle est la formule de l’équation de Henderson-Hasselbalch

A

K = [A-][H+] / [HA]
[H+] = K [HA]/[A-]
log[H+] = logK + log([HA]/[A-]) - log[H+] = pH (par définition)
- logK = pK (par définition)
pH = pK – log([HA]/[A-])
pH = pK + log ([A-]/[HA]

68
Q

Que fait la loi d’Henderson-Hasselbalch

A

elle permet de determiner le pH à partir des concentrations de l’acide et de sa base conjugée et le ratio des formes ioniques de l’acide aminé à un pH donné

69
Q

Qu’est ce qui arrive quand la concentration de la forme protonée et non-protonées est identique

A

le pH de la solution égale 0

70
Q

C’est quoi l’équation pour calculer le point isolélectrique

A

avec la moyenne des pK à droite et à gauche du point isoléctrique
(pK1+pK2)/2

71
Q

Qu’est ce qu’une liaison peptidique

A

liaison entre une fonction amine et un carboxyle qui relache une molécule d’eau

72
Q

Comment ce fait la nomenclature des dipeptides

A

on remplace le suffix -ine par -yl et on garde ine pour le dernier acide aminé

73
Q

comment ce fais la nomenclature du tryptophane dans les dipeptides

A

tryptophyl-

74
Q

comment ce fais la nomenclature du glutamate dans les dipeptides

A

glutamyl

75
Q

comment ce fais la nomenclature du glutamin dans les dipeptides

A

glutaminyl

76
Q

comment ce fais la nomenclature du asparte dans les dipeptides

A

aspartyl

77
Q

comment ce fais la nomenclature du asparagine dans les dipeptides

A

asparaginyl

78
Q

C’est quoi le carbone Phi et Psi

A

Phi carbone à côté de l’amine
psi carbone à côté du carboxyl

79
Q

Qu’est ce qui arrive quand phi et psi son du même côté

A

sa forme une configuration cis

80
Q

Qu’est ce qui arrive quand phi et psi son de côté opposé

A

sa forme une configuration trans

81
Q

Qu’est ce qui est special de la configuration trans

A

la configuration trans est énergétiquement favorable, à cause de l’ecombrement stérique entre les chaines latérales de la configuration cis. Configuration trans est plus stable sauf pour la proline.

82
Q

qu’est ce que la structure primaire des protéines

A

La structure primaire est la séquence des acides aminés

83
Q

qu’est ce que la structure secondaire des protéines

A

Les structures secondaires est le repliement local adopté d’une séquence. entre hélice alpha et feuillet beta. structure est formé par le squelette protéique

84
Q

Comment est ce que les hélice alpha se stabilise.

A

Ils sont stabilisé par des ponts alpha entre c=o et n-h

85
Q

Quand est ce que l’hélice alpha est adoptée

A

elle est adopté lorsque la torsion autour de psi = -47 et phi = -57

86
Q

Comment ce fait les ponts hydrogènes des feuillets B

A

elles se font entre la paire d’électrons de l’atome d’oxygène d’un lien peptidique et l’hydrogène sur un autre feuillet

87
Q

qu’est ce que la structure tertiaire des protéines

A

la structure tertiaire est le repliement global adopté la protéine

88
Q

Qu’est ce que l’élément clé de la structure tertiaire

A

l’intéraction hydrophobe

89
Q

Qu’est ce que l’intéraction la plus forte des structures tertiaires

A

le pont disulfure entre deux cystéines car ceci est un lien covalent

90
Q

c’est quoi l’hierachie des forces d’intéractions

A

covalente > ionique > hydrogène > van der Waals

91
Q

Où est situé la kératine

A

elle est situé dans une couches superficielles de l’épiderme, poils, cheveux et ongles

92
Q

de quoi est constitué la kératine

A

la kératine est constitué de deux hélices alpha

93
Q

Où est situé la soie

A

la soie est stockée sous une forme soluble dans des glandes du vers à soie, puis est converti en une structure fibrillaire insoluble

94
Q

de quoi la est constituée la soie

A

elle est constituée de chaînes bêta antiparallèles formant des feuillets

origine biochem (2 decks)

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