Final - Cours 7 - Les compartiments cellulaires

Question 1

comment sont délimités les différents compartiments de la cellule eucaryote

Answer 1

des membranes

Question 2

où débute la synthèse protéique (traduction)

Answer 2

cytoplasme

Question 3

v ou f, les protéines travaillent toutes dans le cytoplasme puisque c’est là où elles sont produites

Answer 3

faux, suite à la traduction, elles doivent trouver leur chemin vers leur lieu de travail

Question 4

4 façons pour les protéines de trouver leur lieu de travail suite à leur synthèse dans le cytoplasme

Answer 4

pore : gros complexe protéique (CPN)
une membrane : RER, peroxysome
deux membranes : mitochondrie et chloroplaste
sortir de la cellule (voie de sécrétion)

Question 5

3 choses qu’il faut pour organiser les protéines dans la cellule

Answer 5

énergie (transport actif)
étiquette (peptide signal et parfois sucre)
destination (récepteur)

Question 6

les organites diffèrent en quoi

Answer 6

nombre de membranes qui les entourent

Question 7

le nombre de membranes qui entourent les organites impacte quoi

Answer 7

le type de mécanisme de passage des protéines vers ces organites

Question 8

composition de l’enveloppe nucléaire

Answer 8

deux membranes (interne et externe) + espace intermembranaire

Question 9

l’espace intermembranaire de l’enveloppe nucléaire est en continuité avec quoi

Answer 9

lumière RER

Question 10

que permettent les pores nucléaires

Answer 10

continuité entre nucléoplasme (intérieur du noyau) et le cytoplasme

Question 11

v ou f, toutes les protéines peuvent passer par les pores nucléaires

Answer 11

faux, seulement les protéines autorisées (sous certaines conditions)

Question 12

hypothèse sur la formation du noyau - même hypothèse qui donne naissance au RE

Answer 12

invagination de la membrane plasmique

Question 13

composé de nombreuses protéines appelées nucléoporines qui forment des structures poreuses dans la membrane nucléaire.

Answer 13

complexe du pore nucléaire

Question 14

décris le transport nucléaire à travers les pores nucléaires

Answer 14

bidirectionnel

Question 15

qu’est-ce qui peut faire varier la taille de l’ouverture des pores nucléaires

Answer 15

centre protéique

Question 16

décris les différents modes de transport des protéines en fonction de leur diamètre par les pores nucléaires

Answer 16

petites protéines (9nm de diamètre et moins) passent par le pore par diffusion simple

grosses molécules 9-40nm (grosses protéines et sous-unités ribosomales) peuvent passer par le pore, mais nécessitent de l’énergie (transport actif) pour agrandir d’avantage l’ouverture du pore

Question 17

nécessaire pour entrer dans le noyau par transport actif

Answer 17

signal de localisation nucléaire (SLN)

Question 18

décris le SLN

Answer 18

petit peptide caractérisé par une forte charge positive située quelque part dans la protéine (KKKRK : lys,lys,lys,arg,lys)

Question 19

nécessaire pour sortir du noyau

Answer 19

Signal d’exportation nucléaire (SEN)

Question 20

décris le SEN

Answer 20

hélice alpha amphiphile comportant plusieurs résidus leucine sur sa partie hydrophobe (ex. LXLXXLXL)

Question 21

Récepteurs de signaux nucléaires

Answer 21

karyophérines - lient de SLN (karyophérines importines) ou le SEN (karyophérine exportines)

Question 22

rôle des karyophérines

Answer 22

récepteurs de signaux nucléaires
se lient au SLN ou au SEN
transportent les protéines à travers le pore nucléaire

Question 23

deux sites de liaisons de la karyophérine

Answer 23

un pour le signal (SEN ou SLN)

un pour la Ran-GTP (GTPase monomérique de la famille Ras : protéines G impliquées dans la régulation de nombreuses voies de signalisation cellulaires)

Question 24

décris le CPN

Answer 24

structure modulaire construite à partir des nucléoporines (Nups)

Question 25

Décris les différentes structures du CPN

Answer 25

Question 26

deux conformations des protéines RAS

Answer 26

RAS-GTP et RAS-GDP

Question 27

la structure RAS-GTP interagit avec d’autres protéins (karyophérines dans ce cas) et a une activité de GTPase en présence de quelle protéine

Answer 27

GAP (la Ran-GTP est hydrolysée en Ran-GDP par l’action de la Ran GTPase activating protein (RanGAP))

Question 28

lorsque la GEF agit en stimulant l’échange du GDP pour le GTP, quel est l’effet sur la protéine G

Answer 28

activation (change GDP pour GTP)

Question 29

Ran est le seul membre de la famille RAS v ou f

Answer 29

faux, plusieurs
EF-Tu, EF-G = traduction
Ran = transport dans le noyau
Rab, Arf, Sar = transport vésiculaire

Question 30

comment se lie la Ran-GTP à la karyophérine

Answer 30

via le phosphate gamma du GTP (3e phosphate)

Question 31

v ou f, les importines (karyophérines importations) lient Ran-GTP et SLN en même temps

Answer 31

faux, les deux liaisons sont mutuellement exclusives, ou l’un ou l’autre

Question 32

la proportion de Ran-GTP et de Ran-GDP dépend de quoi

Answer 32

activités de GAP (hydrolyse de GTP) et GEF (facteur d’échange)

Question 33

explique le cycle de transport nucléocytoplasmique régulé par Ran (importine)

Answer 33

liaison Ran-GDP/importine
signal NLS
formation du complexe Ran-GDP/importine/protéine
- entrée dans le noyau
dissociation de Ran-GDP du complexe trinaire à cause de GEF
liaison de Ran-GTP à l’importine + protéine
libération de la protéine cargo
- sortie de Ran-GTP + importine vers le cytoplasme
hydrolyse de Ran-GTP en Ran-GDP dans le cytoplasme
dissociation de Ran-GTP + importine
liaison de Ran-GDP à l’importine et NOUVEAU CYCLE

Question 34

Ran-GDP est favorisée où

Answer 34

cytoplasme

Question 35

Ran-GTP est favorisée où

Answer 35

noyau

Question 36

les exportines lient le signal SEN et quelle Ran en même temps ?

Answer 36

Ran-GTP

Question 37

explique le cycle de transport nucléocytoplasmique régulé par Ran (exportine)

Answer 37

liaison de Ran-GTP et protéine SEN à la karyophérine dans le noyau
-passage dans le pore et sortie du noyau
hydrolyse de Ran-GTP en GDP par GAP
changement conformationnel de la karyophérine
libération de la protéine

Question 38

v ou f, les karyophérines exportines n’utilisent pas GEF

Answer 38

vrai
Contrairement aux importines qui nécessitent un facteur d’échange nucléaire (GEF) pour favoriser le retour de Ran-GDP au noyau, les exportines n’utilisent pas un GEF spécifique pour libérer Ran-GDP/échanger contre Ran-GTP

Question 39

4 modèles qui représentent des voies alternatives de transport

Answer 39

modèle de diffusion-rétention
modèle du facteur de transport
modèle de séquence signal
modèle médié par une vésicule

Question 40

voie alternative qui implique l’importine 16 (protéine tronquée de la karyophérine) et qui ne fait pas intervenir Ran

Answer 40

modèle de séquence signal

Question 41

explique le modèle médié par la vésicule

Answer 41

membrane externe forme une vésicule, prend la protéine à transporter et la transporte dans l’espace intermemb

pas d’utilisation de pore nucléaire pour la diffusion de la protéine dans la membrane

Question 42

voie alternative : le complexe protéine-karyophérine passe par le CPN en utilisant un long lieur non structuré

Answer 42

modèle du facteur de transport

Question 43

explique le modèle de diffusion-rétention

Answer 43

diffusion libre et bidirectionnelle entre les membranes nucléaires internes et externes à travers les pores périphériques

Question 44

dans le modèle de diffusion-rétention, l’accumulation de la protéine au niveau de la membrane interne est due à quoi

Answer 44

l’attachement par la chromatine (ADN + protéines associées dans le noyau) et/ou les lamines (protéines de la membrane interne du noyau )