Mini Teste (T3)

Question 1

Indique a estrutura de um promotor de um gene de eucariota.

Answer 1

• Um promotor é uma região especifica do DNA, localizado antes - a montante - do inicio da transcrição de um gene.
• Esta fora do gene do lado 5’ do DNA
• É uma zona onde se liga a maquinaria de transcrição que permite transcrever o gene em mRNA
• Contem um promotor basal
• Contem outras caixas, outros elementos de regulação

Question 2

Indique a sequencia de eventos do processo de transcrição e os intervenientes principais

Answer 2

O processo de transcrição divide-se em: iniciação, elongação e terminação.

• DNA (gene) a ser transcrito;
• Complexo remodelador da cromatina (para ser possível abrí-la para acessar o DNA);
• RNA polimerase no núcleo;
• Proteínas associadas à RNA polimerase;
• Fatores de transcrição (proteínas reguladores).

Question 3

Porque razão se diz que a RNA pol II participa no processamento do mRNA que ela transcreve.
(slide 43)

Answer 3

Para que se inicie a transcrição a Pol II tem que se libertar do complexo, isto ocorre quando a cauda em C terminal é fosforilada.
No terminal C (CTD) da polimerase estão ligados fatores de splicing, ou seja, proteínas necessárias à remoção do intrões e tambem está ligada a complexos enzimáticos - capping - para a extremidade 5’ e a proteína polimerase de Adeninas, que reconhece na extremidade 3’ e insere a cauda de poli-A no mRNA recém-transcrito.

Question 4

Qual a composição do spliceosoma?

Answer 4

• Rede complexa de RNA e proteínas.
• O núcleo do spliceossomo é formado por pequenos RNAs nucleares (snRNAs) e proteínas associadas a esses RNAs - que juntos formam: snRNPs (pequenas ribonucleoproteínas nucleares) = snRNAs+Proteinas
• Existem cinco snRNPs principais (U1, U2, U4, U5 e U6), cada um dos quais está associado a várias proteínas.

Question 5

De que forma o spliceosoma reconhece as sequências intrónicas que devem ser removidas?

Answer 5

Os snRNPs (pequenas ribonucleoproteínas nucleares) são responsáveis ​​pela identificação e remoção dos íntrons durante o processo de splicing.
Cada snRNP contém um pequeno RNA nuclear (snRNA) associado a proteínas específicas, e esses complexos de RNA-proteína têm sequências complementares às zonas de remoção intrônica dos genes.
Por exemplo, U1 estende a extremidade 5’ do intrão e U2 a extremidade 3’ do intrão.

Question 6

Quais as sequencias canónicas que delimitam um intrão?

Answer 6

• O sinal doadora (GU) no início do intrão 5’
• O sinal de acessibilidade (AG) no final do íntrão 3’
  Canonica: RNA

Question 7

Indica as sequências presentes num promotor para o início da transcrição

Answer 7

Contém sequências importantes como:
- TATA box
- ligação de fatores de transcrição: modulam a atividade do promotor e influenciam a taxa de transcrição
- sítio de iniciação da transcrição, TSS (+1)

Question 8

O que é o promotor proximal ou basal?

Answer 8

Onde se liga a maquinaria de transcrição
Se não se ligar a polimerase não é localizada e não há transcrição. Isso inclui a caixa TATA

Question 9

Para além da caixa TATA dá outros exemplos de caixas

Answer 9

CCAAT box - (-75)
GC box

Question 10

Quais são as fases do processamento de um RNA

Answer 10

• Capping:
• Splicing:
• Poliadenização da extremidade 3’
  Iniciam na elongação

Question 11

Qual a função dos factores de transcrição activadores? Onde se ligam?

Answer 11

Os fatores de transcrição ativadores aumentam a taxa de transcrição de um gene específico, promovendo a expressão genetica.

Ligam-se a enhancers, sequências pequenas da cadeia molde de DNA não muito distantes dos promotores

Question 12

Num gene que codifica uma proteína, existe uma cadeia codante. Qual é a sua função?

Answer 12

Tem o codigo genetico
Corresponde à cadeia complementar da cadeia modelo, correspondendo à similar sequência de transcrito, mas em linguagem de DNA, ou seja, com Timinas em vez de Uracilos.

Question 13

Qual é a função do spliceosoma

Answer 13

Executa o processo de splicing, que envolve a remoção de íntrões do pré-RNA e a união dos exões (segmentos codificantes) para formar o mRNA maduro.

Question 14

Num gene que codifica uma proteína, existe uma uma cadeia modelo. Qual é a sua função?

Answer 14

É aquela que é transcrita para originar o mRNA
Corresponde à fita de DNA que é lida pela RNA polimerase II que lê de 3’—5’, formando um transcrito 5’—3’.

Question 15

Quais são os fatores de transcrição?

Answer 15

Fatores que potenciam a transcrição - Enhanecers
Fatores que silenciam a transcrição - Silencer
Fatores que podem permitir uma moderação na velocidade de transcrição - Insulator

Question 16

Explica a fase de inciação da transcrição

Question 17

Qual a função dos factores de transcrição repressores? Onde se ligam?

Answer 17

Regulam as quantidades da transcrição genetica, impedindo a atividade dos fatores de transcrição ativadores e/ou inibindo a ligação da maquinaria de transcrição ao DNA

Ligam-se a silencers, também pequenas sequências de DNA na cadeia molde.

Question 18

Explica a fase Capping no processamento de um RNA

Answer 18

Inserção de um nucleósido diferente, que estabiliza a extremidade 5’ para que não possa ser degradada pelas enzimas e para que possa ser reconhecida pelo complexo proteico que vai depois transferir do nucleo para o citoplasma

enzima de capping: guaniltransferase

Question 19

Explica a fase Splicing no processamento de um RNA

Answer 19

O splicing ocorre em simultâneo da transcrição com recurso a spliceosomas, removendo as sequências intrónicas do transcrito, sem comprometimento da integridade dos exões.

Question 20

Explica a fase Poliadenização da extremidade 3’ no processamento de um RNA

Answer 20

uma endonuclease reconhece o sinal de poliadenização (algo do género AAUAAA) e faz um corte no transcrito.
Prontamente, a polimerase de Adeninas, que se encontra na cauda C da RNA polimerase II, insere a cauda poli-A na extremidade 3’ do transcrito.