Mini Teste (T8) Flashcards
Quais as semelhanças entre a maneira como foi decifrada a pedra roseta e o genoma humano?
Tal como para decifrar a pedra roseta foi necessário perceber outros idiomas para se perceber a escrita egípcia, para se perceber o funcionamento genoma humano foi necessário compreender várias formas de análise do genoma nomeadamente a sua sequenciação, mas também a análise do seu transcritoma, proteoma, metaboloma…
Identifique os DNAs nao codificantes que conhece
- Elementos de regulação
- Intrões
- Sequencias repetitivas
- Transposões
- Elementos virais
- Telomeros
- Centrómeros
- ncRNAs
Qual a estrutura e função dos microRNAs (RNA não codificantes)
Os microRNAs são uma categoria de pequenos RNAs não codificantes, com cerca de 19 a 25 nucleótidos.
São transcritos de genes maiores pela polimerase II que sofrem um complexo processamento, no núcleo e citoplasma.
Os genes de microRNAs podem estar inseridos em intrões de genes que codificam para proteína ou em exões.
Em muitos casos, são transcritos adjacentes uns aos outros, mas após processamento são então separados, em identidades com funções independentes.
Estes miRNAs são reguladores pós-transcricionais, por ligação à extremidade 3’ UTR do transcrito alvo. Estão presentes em todas as espécies até agora analisadas.
Descreva os mecanismos de transcrição e processamento do miRNA, no nucleo
Os genes do miRNA são transcritos no núcleo formando, inicialmente, um transcrito inicial com diversos loops denominado pri-miRNA.
Estas estruturas em gancho são reconhecidas pela DROSHA, uma RNAse III com atividade endonucleásica com proteínas associadas, que cliva essas estruturas tornando o pri-miRNA em pré-miRNA, uma estrutura precursora do miRNA.
O pré-miRNA é exportado para o citoplasma através dos poros nucleares por um complexo com Exportina 5 e RanGTP (que obtém a energia necessária exigida para esta exportação).
Descreva o mecanismo de ação de um microRNA
O microRNA atua de duas formas distintas:
* Se a sua complementaridade com o mRNA transcrito for perfeita, o mRNA é degradado por clivagem endonucleótica;
* Se a complementaridade não for completa, existe repressão traducional, com recurso ao P-body que permite a repressão sem degradação do mRNA que pode vir a ser traduzido.
Não esquecendo que o microRNA se liga à região 3’UTR do transcrito de mRNA.
Qual a importância das variantes genéticas? De que forma é que podem afetar o processamento do RNA?
A variante genética é uma alteração permanente num gene (que, anteriormente, se chamava de mutação, mas mudou-se o termo pois nem todas as mudanças no DNA são causadoras de doença).
As variantes genéticas podem afetar múltiplos passos do processamento do RNA e da dinâmica do mRNA, como no Splicing, processamento da extremidade 3’, na estrutura e estabilidade do mRNA, na tradução eficiente e na regulação por proteínas de ligação ao RNA e por microRNAs.
Defina Edição do RNA
A edição do RNA define-se como a alteração da identidade de nucleótidos em moléculas de RNA de tal modo que a informação codificada seja diferente da obtida pela transcrição do gene correspondente.
Descreva os dois tipos principais de edição do RNA
- Edição por alteração química de nucleótidos individuais: trata-se de mutações pontuais:
o Citosina deaminase: converte a Citosina do RNA num Uracilo (caso menos comum que a Adenosina deaminase)
o Adenosina deaminases (ADARs): convertem a Adenosina (A ) em Inosina (I) que é lida pelo ribossoma como uma Guanina. Têm efeito não só nas zonas codificantes como também em intrões e zonas UTR.
- Edição através de inserção/deleção: existe remoção ou inserção de nucleótidos mediada por moléculas de RNA, os RNAs guias, que se emparelham regiões do mRNA-alvo com alguma homologia servindo de molde para a edição.
Descreva um exemplo de edição do RNA e suas consequências na produção das proteínas correspondentes.
Um exemplo de edição do RNA é um caso de edição mediado por ADARs, de um mRNA codifica para o um fator de transcrição GL1. Em tecidos normais, este mRNA não é editado; em tecidos tumorais é editado, modificando a sua interação com proteínas reguladoras e a sua interação com genes alvo.
Descreva os mecanismos de transcrição e processamento do miRNA, no citoplasma
No citoplasma, o pré-miRNA é processado DICER, também uma RNAse III, que corta uma última estrutura em gancho e torna o miRNA num duplex.
O agora duplex de miRNA sofre clivagem das ligações de hidrogénio existindo desenrolamento da cadeia e formação de duas cadeias:
- uma cadeia matura
- uma cadeia complementar (que sofre degradação).
A cadeia matura é reconhecida pelo complexo RISC que induz os silenciamentos dos mRNAs, ou por repressão da tradução ou por degradação completa do mRNA-alvo.
