RNA Export, euka. Translation

Question 1

was wird beim Nukleo-cytoplasmatischen Transport in welche Richtung transportiert?

Answer 1

raus:
- mRNA
-tRNA
- prä-mRNA
- prä-Ribosomen
- snRNA

rein:
- ribosomale Proteine
- snRNP
- nuclear proteins

Question 2

Aufbau des Kernporenkomplexes (NPC)

Answer 2

aus 3 Haupstrukturen:
- äußere Kernmembran
- innere Kernmembran
- zentrale Pore => Nucleoporine
- ermöglichen den Transport von Molekülen zw. Cytoplasma und Kern
- verbinden innere und äußere Membran

Question 3

Welche Qualitätskontrollen für eine mRNA gibt es?

Answer 3

• müssen vor Export prozessiert sein => 5´capping, 3´poly-Adenylierung, Spleißen
  => werden daher auf diese Eigenschaften gecheckt

Question 4

Minimalwissen: Nukleolus, rRNAs

Answer 4

1. rRNAs werden im Nukleolus transkribiert und (von
   snoRNPs) prozessiert
   a) endonukleolytische Schnitte
   b) Basenmodifikationen
2. Der Nukleolus kommt durch einen flüssig-flüssig
   Phasenübergang zustande => Nukleolus ist flüssiges Tröpfchen in anderen Flüssigkeit, dem Nukleoplasma
3. rRNAs zeigen ausgedehnte Selbstfaltungen

Question 5

Initiation der Translation

Answer 5

eukar.:
- Initiator-tRNA ist eine tRNA^Met, die Methion trägt und nicht formyliert ist
- Startcodon auf mRNA ist meistens vom 5´Ende aus erstes AUG Basentriplett
- Kozak-Sequenz: Konsens aus den am häufigsten vorkommenden Nukleinbasen in unmittelbarer Nähe des Startcodons AUG auf der mRNA
- 40S-Untereinheit bindet an 5´Cap der mRNA => bildet zusammen mit Initiator-tRNA Präinitiationskomplex
- Präinitiationskomplex läuft in 3´Richtung und sucht AUG
- dann bindet sich tRNA^Met an Codons der mRNA
- wenn große 60S-Untereinheit gebunden wurde, beginnt Translationsvorgang
proka.:
- kleine 30S-Untereinheit bildet zusammen mit Initiationsfaktoren 1 und 3 Komplex
- Initiator-tRNA^fMET (Formylmethionin) bindet an Startcodon AUG
- 16S-rRNA der kleinen Untereinheit erkennt Shine-Dalgarno-Sequenz auf mRNA => wenige Nukleotide stromabwärts befindet sich Startcodon

Question 6

Unterschiede Poka. und Euka. Translation

Answer 6

• Proka.: sind polycistronisch => enthalten mehrere offene Leserahmen, ein mRNA Molekül kann mehrere verschiedene Gene codieren; jedes ORF wird von Ribosom erkannt und in ein Protein übersetzt
• Euka.: sind monocystronisch => jedes Gen enthält nur einen ORF, der in ein einziges Protein übersetzt wird, beginnen immer an 5´Cap

Question 7

was ist der mRNA Ringschluss in Eukaryoten

Answer 7

• 5´Cap Ende interagiert mit Poly A Schwanz => dabei kommt es zum Ringschluss der RNA

Question 8

wie wird die Genauigkeit der Translation gewährleistet?

Answer 8

• Ribosom kann keine fehlbeladene tRNAs erkennen
  Funktion von 16S rRNA:
• verifiziert Codon-Antikodon-Interaktion
• erkennt G:C oder A:U Paarung

Funktion von EF-Tu:
- verifiziert Codon-Antikodon-Interaktion
- EF-Tu-GTP interagiert erst nach korrekter tRNA-Bindung in der A-Stelle mit Faktorenbindungsstelle