גוטליב Flashcards

(131 cards)

1
Q

חיזור כפול של חומצה פולית יוצר

A

חומצה

THF

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

DHFR

A

מחזר חומצה פולית פעמיים ליצירת

THF ACID

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

THF

מקבל פחמן בד”כ מ

ואיך

A

סרין

SMHT

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

10 formyl THF

הוא

A

המקור של הפחמן ליצירת נוקלאוטידים

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Methotrexate

A

אנאלוג של חומצה פולית, ההבדל הוא בתוספת של מתיל על חנקן 10, הוא מעכב את

GART

שמעביר את הפחמן מ

N10-formyl THF

ב-2 שלבים של סינתזת פורינים

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Pemetrexed

A

מולקולה חדשה שמחליפה את

Methotrexate

ובנוסף לעיכוב של פורינים, מעכבת גם סינתזה של תימידין שהוא פירימידין

מעכבת

DHFR

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Fluorouracil

A

מעכב תימידין סינתז

מדמה פירימידין, אז אין מתילציה של

dUMP - dTMP

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Mycophenolate

A

תרופה שמעכבת יצירת

GMP

מ

IMP

ומראה את הקשר בין חיסון לסרטן

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

וירוסים כמו הרפס - שיטה להתמודדות איתם

A

הם עושים תהליך כמו פורין סלווג’ לפירימידינים, אז אפשר לטרגט את זה

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

DHODHi

A

אנזים מגביל קצב בתהליך של סינתזת פירימידינים אז הוא משמש כמטרה לפיתוח תרופות לסרטן

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

RNR

A

הופך אוקסי לדיאוקסי

UDP -> dUDP

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Hydroxyurea

A

מעכב של

RNR

לא מאפשר מעכב מנוקלאוטיד אוקסי לדיאוקסי

RNA - DNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Antifolates

A

תרופות שמתערבות בשימוש בחומצה פולית בסינתזת דנ”א

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

תימידין סינתז

A

עושה מתילציה של

dUMP -> dTMP

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Gemcitabine

A

אנאלוג של הנוקלאוזיד פירימידין

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Aminopterin

A
  • המולק’ הראשונה שזוהתה כמעכבת תאים סרטניים בלוקמיה, דומה לחומצה פולית. גורמת להרבה תופעות לואי
  • הוחלפה ב
  • Methotrexate
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

איך מסתנזים מתיונין

A

אנחנו לא יודעים לסנתז מתיונין, הומוציסטאין מגיע ממתיונין, והוא מאבד את המתיל שלו כחלק מבקרה אפיגנטית

הוא מולקולה טוקסית ולכן החזרתו למתיונין הכרחית

המתיל יתחבר ל

THF

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

SHMT

A

הופך סרין לגליצין ומצמד את

THF (tetrahydrofolic)

לפחמן נוסף

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

החזרה למרכז של 3 המעגלים (תימידין, מתיונין, פורין) היא בזכות

A

סרין שהופך לגליצין בזכות

SMHT

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

שלב קובע מהירות בסינתזת סרין

A

3-phosphoglycerate -> 3PHHP

(PHGDH)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

PHGDH

A

פוספוגליצרט דהידרוגנאז

אנזים קובע קצב בסינתזת סרין, הוא עושה את השלב הראשון

יש ייצור יתר שלו במספר סוגי סרטן ומייצרים מעכבים כנגדו

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

סרין מתפרק ל

וההבדל הוא

A

לגליצין

מורידים פחמן אחד

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

אנזים לפירוק סרין בציטוזול

A

SHMT1

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

אנזים לפירוק סרין במיטוכונדריה

A

SHMT2

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
SHMT
Serine hydroxymethyltransferase יש 1 בציטוזול שני במיטוכונדריה
26
במיטוכונדריה, סרין
הופכת לגליצין ע"י SMHT2 ונוצר 5,10-methylene THF
27
5,10-methylene THF במיטוכונדריה יכול להפוך ל
formate ולצאת לציטוזול ליצירת 10 formyl-THF
28
סרין בציטוזול
יכולה להפוך לגליצין ע"י SMHT1 ויווצר 5,10-methylene THF
29
5,10-methylene THF בציטוזול
יכול לצאת למסלול ליצירת תימידין
30
מקור ה 5,10-methylene THF
סרין
31
סרין מעביר פחמן ל.. ליצירת
פולאט ליצירת 5,10 methylene-THF
32
מאיפה יכול להגיע סרין
מהמזון, או להיות מיוצר מגלוקוז
33
מה היתרון של גליקוליזה
לא תלוי בנוכחות של חמצן
34
Hexokinase
הופך גלוקוז ל G6P השלב הראשון בגליקוליזה, שלב של התחייבות לתהליך, נועד לדחוף את ריאקציית הכניסה של גלוקוז לתאים קדימה כי אין טרנספורט אקטיבי. יש צריכה של ATP בריאקציה והיא חד כיוונית
35
PFK
פוספופרוקטוקינאז, שלב 3 של גליקוליזה F6P הופך ל F-1,6-BP בתגובה שדורשת ATP זו תגובה דו-כיוונית - האנזים יכול לתפקד כקינאז ולהוסיף פוספאז, או כפרוקטוז ביספוספטאז ולהוריד פוספט. זה השלב קובע הקצב של גליקוליזה
36
Aldolase
מפרק את F-1,6,BP ל GAP+DHAP
37
PGK
פוספוגליצרט קינאז 1,3-phosphoglycerate -\> 3-phosphoglycerate + ATP ייצור של אנרגיה
38
Pyruvate kinase
שלב 10 בגליקוליזה, הופכים PEP -\> pyruvate יוצרים ATP
39
GAPDH
מוסיף פוספט חופשי, חומר אנאורגני, ל GAP שהוא חומר אורגני. ריאקציית חמצון - דהידרוגנאז. נוצר גם NADH
40
גלוקוז, במקום ללכת לגליקוליזה יכול ללכת ל
להפוך ל G6P ולהיכנס ל PPP ליצירת R5P + פד"ח תהליך שיוצר פחות ATP
41
F6P יכול ללכת ל
PPP לא חמצוני או לייצור סוכרים שישמשו למודיפיקציות חלבונים - גליקוזילציה hexosamine biosynthesis
42
DHAP יכולה
להפוך ל GAP ע"י TIM או להפוך ל Glycerol-3-P שישמש ליצירת טריגליצרידים ופוספוליפידים
43
כשמסתנזים סרין משלב מסוים בגליקוליזה, מה ההשלכות
במקום מולקולת גלוקוז שתהפוך ל-2 ATP יהיה רק אחד 3-phosphoglycerate (PHGDH) -\> serine
44
פירובט יכול
להיכנס למעגל קרבס, או לעבור טרנס-אמינציה ולהפוך לאלנין
45
איך ניצור אלנין
פירובט בטרנס אמינציה - גלוטמט יתרום חנקן לפירובט לייצור אלנין
46
פירובט הולך ל
נוצר בגליקוליזה, נכנס למיטוכונדריה, מאבד פחמן לפד"ח ומייצר שני פחמנים על coA לקבלת Acetyl-CoA
47
כמה פחמנים יש לציטרט
6
48
כמה פחמנים יש לאוקסלואצטט
4
49
כמה פחמנים יש לאצטיל קואיי
2
50
איך יוצרים ציטרט
אוקסלואצטט (4 פחמנים) חובר לאצטיל קואיי (2 פחמנים) ונוצר ציטרט
51
ציטרט הופך ל.. ע"י
איזוציטרט ע"י אקוניתז עדיין 6 פחמנים
52
מאיזוציטרט
איזוציטרט דהידרוגנאז לאלפא קטוגלוטרט, מאבדים פחמן נשארים עם חמישה
53
מאלפא קטוגלוטרט
אלפא קטוגלוטרט דהידרוגנאז, מאבדים פחמן נשארים עם ארבעה, נוצר Succinyl coA
54
מכל הדהידרוגנאזים של קרבס שמייצרים NADH מי מיוחד
Malate DH כי מייצרים אצלו NADH אבל לא מאבדים פחמן לעומת ה-2 האחרים
55
Succinate dehydrogenase
Succinate -\> fumarate מייצרים FADH2
56
באיזה שלב של קרבס מיוצר GTP
Succinyl CoA -\> Succinate Substrate level phosphorylation
57
בשרשרת מעבר האלקטרונים, הפוספורילציה היא
לא Substrate level phosphorylation
58
Substrate level phosphorylation
ייצור ATP ברמת הסובסטרט, בצימוד של ריאקציות אנזימתיות
59
בהיפוקסיה, מה יקרה במיטוכונדריה
יצטבר NADH כי השרשרת החמצונית לא תעבוד, ולא תצליח לייצר ATP
60
הצטברות של NADH גורמת ל
ירידה ב NAD+ שגורמת לעיכוב של TCA זה גם יגרום לעליה של NADH בציטוזול, ולעצירה של האנזים GAPDH
61
על מנת להמשיך בגליקוליזה בתנאי היפוקסיה, מה עושים
פירובט מחוזר ללקטט ע"י LDH בתגובה שיוצרת NAD+
62
בתגובה להיפוקסיה, ייצור של לקטט יהיה בקצב של
GADPH על כל מולקולת גלוקוז יווצרו 2 פירובטים, שיהפכו ל-2 לקטט בתגובה שיוצרת שני NAD+ שישמשו את GADPH בהוספה של פוספט ל GAP תוך חיזור של NAD+ פעמיים על כל גלוקוז
63
מה קורה ללקטט
יוצא לדם, לכבד, ואז עובר חמצון בחזרה לפירובט בכבד הוא יכול לשמש להפקת אנרגיה, ברקמות אין מה לעשות עם לקטט
64
אפקט פסטר
ככל שכמות החמצן יותר נמוכה, כך יש יותר גליקוליזה הסיבה היא שבתנאי היפוקסיה נעשה הרבה גליקוליזה כדי לייצר אנרגיה, ובנשימה אירובית על כל "סיבוב" נצליח לייצר יותר אנרגיה
65
כשיש חמצן וגם הרבה גלוקוז
חמצן = גליקוליזה תרד הרבה גלוקוז = תעלה
66
אפקט וורבורג
תאים סרטניים לא עונים לאפקט פסטר של עליה בגליקוליזה רק בהיפוקסיה הם מייצרים לקטט גם לא בהיפוקסיה
67
fluorodeoxyglucose
עוקבים אחריו ב PET גלוקוז חסר הידרוקסיל עם איזוטופ רדיואקטיבי של פלואור נכנס ביעילות לתאים, עובר זרחון ע"י הקסוקינאז ל FDG-6P שלא יכול להפוך ל F6P וגם לא יכול לצאת מהתאים
68
איברים שצורכים גלוקוז ברמה גבוהה באופן תקין
מוח כבד עיניים כליות
69
מה מקשה עלינו בבדיקת PET
איברים שצורכים גלוקוז ברמה גבוהה באופן תקין - כליות, עיניים, מוח, כבד זה גורם לרעש רקע בבדיקה
70
Pimonidazole
משמשת כסמן לריכוז החמצן בגידול
71
Hydroxyglutarate
מולקולה שניתן לראות בחולי סרטן עם מוטציה בגן אונקוגני שמייצר אותו
72
HIF-α
פקטור השעתוק שמעורב בתהליכים התאיים בהיפוקסיה יש 1-3, הוא חשוב **לייצור אריתרופואטין** שמעודד יצירת תאי דם אדומים, הוא חשוב **להגדלת ווסקולריזציה** של איזורים היפוקסיים בגידול באנגיוגנזה, מפעיל VEGF מעלה גנים שקשורים לגליקוליזה יש לו תפקיד במוות/הישרדות של תאים תפקיד ביצירת גרורות
73
HIF-α בריכוזי חמצן גבוהי
עובר הידרוקסילציה על 2 פרולין, ואז VHL (TS, ubiquitin ligase) יכול להיקשר, לצמד יוביקוויטין ולגרום לדגרגציה
74
HIF-α בהיפוקסיה
מתייצב ולא עובר דגרגציה ע"י הידרוקסילציה וקישור של יוביקוויטין ליגאז נכנס לגרעין, נקשר לפקטורי שעתוק נוספים + לדנ"א במקומות מתאימים
75
ACSS2
קשור ביצירת אצטיל קואיי ישירות דרך אצטט ולא דרך המיטוכונדריה
76
AVASTIN
מעכב אנגיוגנזה, תוקף את VEGF נקרא גם Bevacizumab
77
Sunitinib
מעכב של טירוזין קינאז, תוקף את הרצפטור ל VEGF
78
מה קורה כשנותנים לחולי סרטן מעכבים שמונעים מהם התמודדות עם היפוקסיה
זה גורם להיפוקסיה חריפה יותר בגידול, וגורם לתאים לעבור התאמה מטבולית ולהפוך לאגרסיביים יותר לא תמיד עוזר ניתן בשילוב עם תרופות אחרות כך שנפגע באנגיוגנזה + באדפטציה המטבולית
79
hypoxia activated prodrugs
טיפול בחוסר חמצן טוקסינים שמחוברים לנשא. החומרים הופכים פעילים בתנאים מחזרים (כלומר בסביבת חמצן נמוכה), וכך יש ספציפיות לסביבה ההיפוקסית ולא לתאים המותקפים
80
מעכבים ל HIF
קשה לייצור. קשה לעכב פקטורי שעתוק, יותר קל לעכב אנזימים עם כיסים. כן הצליחו לייצר מעכב לאלפא-2, הוא בניסויים קליניים
81
HPGL צורת הורשה
אוטוזומלית דומיננטית
82
HPGL הייתה ההוכחה ש
התגלית הראשונה שהראתה שיש מצב שבו חוסר בפעילות של זרחון חמצוני יכול לגרום באופן ישיר לסרטן שזה ורבורג בעצם
83
SDH
succinate dehydrogenase Succinate -\> Fumarate במעגל קרבס, וגם קומפלקס 2 בשרשרת מעבר האלקטרונים בנוי מ-4 תת יח
84
סוג המוטציה שגורמת ל HPGL
מוטציה בתת יחידה כלשהי של SDH מסוג Loss of function אחד מהאללים תקין, ובמהלך החיים האלל השני עובר דלישן ואין בכלל אללים תקינים בתאים שיעברו התמרה. אין פעילות של הקומפלקס
85
HLRCC
סינדרום נדיר נטייה לסרטן של תאי שריר חלק, לרוב גידולים שפירים הגן פומרז שהופך פומרט למלט ע"י הידרציה שלו
86
בחולי גליומה מצאו
מוטציה באנזים IDH שהופך איזוציטרט לאלפא קטוגלוטרט אונקוגן
87
בחולי לוקמיה גילו שחלק מהחולים
נושאים את המוטציה ב IDH שהאיזופורם-3 שלו הופך איזוציטרט לאלפא קטוגלוטרט במעגל קרבס בגידולים האיזופורמים שעברו מוטציות הם בעיקר 1 (ציטוזולי) ו-2 (מיטוכונדריאלי) שתלויים בעיקר ב NADP+
88
SDH אונקוגן או דכאן התמרה?
דכאן התמרה
89
IDH דכאן התמרה או אונקוגן
אונקוגן. המוטציה של תת יח' 2-3 שלו היא מסוג Gain of function בכל המקרים נשאר אלל אחד תקין בגידולים
90
VHL
Von Hippel–Lindau tumor suppressor
91
איבוד של VHL גורם ל
פסאודוהיפוקסיה, ואז לאקטיבציה של HIF ולאנגיוגנזה
92
דגרגציה של HIF מושגת ע"י
הידרוקסילציה על פרולין ע"י PHD פרולין הידרוקסילאז
93
Dioxygenase מה עושה
מפצל את O2 ל-2 אטומים - הידרוקסיל ואטום אחד הולך לאלפא קטוגלוטרט
94
oxidative decarboxylation לאלפא קטוגלוטרט
הופך אותו ל Succinate אלפא קטוגלוטרט שימש בתהליך הזה כתורם אלקטרונים משתחרר פד"ח
95
מה הקשר בין SDH ל VHL
SDH - יוצר פומרט מסוצינט VHL - סנסור של חמצן שהוא דכאן התמרה הקשר ביניהם הוא דרך PHD SDH loss of function -\> accumulation of succinate -\> blocks PHD activity -\> אין פירוק של HIF
96
מה המוטציה הנפוכה יותר של SDH בפרא-גנגליומה
SDHB SDHD - נדיר יותר
97
EGLN1
הגן לפרולין הידרוקסילאז PDH
98
EPAS1
מקודד לחלבון HIF2α
99
מוטציות עיקריות שרואים בפרה-גנגליומה
מורשות **SDHB** (LOH) (rare) **SDHD** (LOH) **VHL** (LOH) EGLN (**PHD**, LOH) סומטיות EPAS1 (**HIF2α**, proline-mutation) - can't hydroxylate HIF
100
בניסויים קליניים על פרא-גנגליומות משתמשים ב
HIF2-α inhibitor יעיל במצבים של מוטציות ב VHL / SDH
101
פרולין הידרוקסילאז הוא ממשפחת
Dioxygenase שמפרקים חמצן ל-2 מולקולות נפרדות, הידרוקסיל וסוצינט
102
משפחת ה Dioxygenase איזה עוד תפקיד יש לה
יש בה אנזימים שהם די-מתילאזות - מורידים מתיל מהדנ"א/מהיסטונים ע"י הידרוקסילציה שלו כלומר ההשלכה של חסר ב SDH היא הצטברות של סוצינט (ועיכוב של הדגרגציה של פקטור השעתוק להיפוקסיה) וגם היפר מתילציה על הדנ"א
103
fumarate מעכב של
Dioxygenase - מפרק חמצן Dimethylase - מוריד מתיל מדנ"א/היסטונים ע"י הידרוקסילציה שלו
104
חסר בפומרז
גורם להצטברות של פומרט שלא יכול להפוך למלט פומרט מעכב די-אוקסיגנאז+דימתילאז, וכל זה מונע פירוק של HIF-alpha
105
IDH
איזוציטרט דהידרוגנאז - מאיזוציטרט לאלפא קטוגלוטרט אונקוגן אלפא קטוגלוטרט הופך ל-2-**הידרוקסי**גלוטרט, בעל 5 פחמנים, מעכבת דימתלאזות, לא גורמת לאקטיבציה של HIF
106
מה ההבדל בין succinate fumarate 2 hydroxyglutarate
שלושתן כשמצטברות מעכבות דיאוקסיגנאזות, כשהשתיים הראשונות מעכבות גם פרולין-הידרוקסילאז ומונעות פירוק של HIF וגם מעכבות די-מתילאזות שמסירות מתיל מדנ"א/היסטונים האחרונה מעכבת רק די-מתילאזות
107
Oncometabolites
מטבוליטים שגורמים לתהליכים אונקוגניים. אקטיבציה של HIF בפני עצמה, או היפר-מתילציות בפני עצמן, לא מספיק חזקות כדי לגרום לסרטן
108
מתילציות על ציטוזין בדנ"א
CpG island מתרחשת לרוב באיזור הפרומוטורים, זה חוסם שעתוק
109
איך חוסמים שעתוק במתילציה
מתילציה על ציטוזין ב CpG
110
מתילציות על ליזין בזנב ההיסטונים
דוחס את הכרומוזום, מונע שעתוק
111
אצטילציה של ליזין בזנב ההיסטונים
הכרחית לקישור של פקטורי שעתוק נמנעת לעתים ע"י מתילציה
112
H3 lys4 מתילציה עליו
בשילוב עם אצטילציה על ליזין 9 הגברת שעתוק
113
איך נשיג הגברת שעתוק
מתילציה על H3 lys4 אצטילציה על ליזין 9 של אותו היסטון
114
HMT
היסטון מתיל טרנספראז עושה מתילציה להיסטון משתמש ב SAM (S adenosyl methionine) -\> SAH שבהמשך הופך למתיונין
115
HDMT
היסטון דה-מתילאז, הוא דאוקסיגנאז. משתמש בחמצן + אלפא קטוגלוטרט מייצר סוצינט ופד"ח
116
כדי לעשות מתילציה על היסטון משתמשים ב
HMT + SAM יוצא SAH
117
כדי להוריד מתילציה מהיסטון משתמשים ב
HDMT - היסטון דה-מתילאז חמצן אלפא קטוגלוטרט יוצא פד"ח וסוצינט
118
מתילציה על דנ"א האנזים
DNMT עושה מתילציה לציטוזין
119
TET
אנזים שהוא דה-אוקסיגנאז, עושה הידרוקסילציה למתיל אם למשל עשינו מתלציה לציטוזין - יווצר הידרוקסי-מתיל-ציטוזין הוא עושה עוד 2 ריאקציות של דה-קרבוקסילציה כדי להחזיר לציטוזין
120
הידרוקסילציה של מתיל-ציטוזין לציטוזין תלויה ב
אנזים TET אלפא קטוגלוטרט וחמצן
121
2 hydroxyglutarate מעכב את
הריאקציה של TET להסרת מתיל מציטוזין
122
IDH1
ציטוזולי הופך איזוציטרט לאלפא קטוגלוטרט תוך יצירת NADP+ -\> NADPH
123
IDH2
מיטוכונדריאלי הופך איזוציטרט לאלפא קטוגלוטרט תוך יצירת NADP+ -\> NADPH
124
איזה איזופורם של IDH עובד בקרבס
IDH3 שנמצא במיטוכונדריה NAD+ -\> NADH לעומת האחרים שעושים NADPH
125
אלפא קטוגלוטרט הופך ל 2 hydroxyglutarate בריאקציה
מחזרת ע"י IDH1/2 mutant שמייצרים NADP+
126
TET אונקוגן או דכאן התמרה
דכאן התמרה הוא מוריד מתיל מציטוזין בדנ"א ע"י הידרוקסלציות אם הוא עובר מחיקה הדנ"א נשאר ממותל בציטוזין ולא ניתן לשעתק
127
מוטציות שהתגלו בחולי לוקמיה AML
IDH1/2 (gain of function) / TET (LOH)
128
מה משותף למוטציות שגורמות ל AML
TET - גורם לחוסר יכולת להוריד מתיל מציטוזין IDH - גורם להיווצרות של 2 hydroxyglutarate כך שאין אלפא קטוגלוטרט זמין לפעילות של TET
129
Idhifa (enasidenib)
IDH2\* inhibitor משמש לטיפול ב AML ולא בגליומות כי זה יותר מורכב
130
Tibsovo (ivosidenib)
IDH1\* inhibitor משמש לטיפול ב AML ולא בגליומות כי זה יותר מורכב
131