טכניקות רקומבינציה (מולקולרית ב) Flashcards

1
Q

באיזה שלבים של מחזור התא תתרחש רקומבינציה הומולוגית לשם תיקון?
במה זה תלוי?

A
- לאחר הכפלת הכרומטידות בשלב 
S
ובשלב
G2
- תלוי בהימצאות כרומטידה אחות המשמשת כתבנית לתיקון
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

איך נקרא החלבון שתפס את קצוות השבר הד-גדילי בתיקון בעזרת מנגנון
NHEJ?

A

Ku

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

תאר/י את שלבי בתיקון במנגנון
NHEJ
(2)

A
  • Ku
    הטרודימרי תופס את קצוות השבר
  • חלבונים נוספים מגויסים לשם החזקה, עיבוד וליגציה של השבר
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

באילו תהליכים תאיים מעורבים חלבוני
Ku?
(3)

A
  • NHEJ
  • רקומבינציה של נוגדנים
    (V(D)J)
  • רקומבינציה ליצירת רצפטורים של תאי
    T
    (TCR)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

מי האנזים האחראי על
strand exchange
בפרוקריוטים?

A

RecA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

מי האנזים האחראי על
strand exchange
באאוקריוטים?

A

Rad51

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

מהו מנגנון הפעילות של
RecA
ודומיו?
(5)

A
- קשירת 
ATP
מעלה את האפיניוט שלו לחד גדיל
- קשירת החד גדיל במנגנון קאופרטיבי
- פלישה לדו-גדיל דנ"א  שמשמת כתבנית וחיפוש אחר זיווג בסיסים
- יצירת הטרודופלקס עם חלבון
- הידרוליזת
ATP
ושחרור
RecA
ליצירת הטרודופלקס לבד ותיקון
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

RecA

הוא חלבון ממשפחת ה-

A

ATPase

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

כיצד
RecA
מחזיק את החד-גדיל בשלב הראשוני של פעילותו?

A

מחזיק כל 3 נוקלאוטידים כאיל הם מצויים בזיווג גדילים רק שהשךד הפוספו-סוכרי מתוח ולא מסובב

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q
למה משמשת הידרוליזת 
ATP
ל
ADP
במנגנון הפעולה של
RecA?
A

לשחרורו מההטרודופלקס שנוצר

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

לעתים נוצר שבר חד-גדילי במזלג השכפול. באיזה מנגנון הוא מתוקן?

A

רקומבינציה הומולוגית

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

מה המבנה של

Rad52?

A

מבנה טבעתי המורכב מ11 תת יחידות

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

מה תפקידו של
Rad52?
(2)

A
  • הטענת
    Rad51
    על החד-גדיל המיועד לתיקון ע”י רקומבינציה הומולוגית
  • שחזור הדופלקסים בסוף הרקומבינציה ההומולוגית
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

למה קשור

BRCA1?

A

קשור לבקרה על העיבוד הראשוני של קצוות השבר הדו-גדילי ברקומבינציה הומולוגית

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

למה קשור

BRCA2?

A

מיקום
Rad51
במקום הדרוש תיקון ע”י רקומבינציה הומולוגית
ועיכובו כשאינו נדרש

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

מה משמש כתבנית לרקומבינציה ההומולוגית המיוטית?

A

הכרומוזום ההומולוג

17
Q

מה משמש כתבנית לרקומבינציה הומולוגית לשם תיקון נזקי דנ”א?

A

הכרומטידה האחות

18
Q

אלו חלבונים אחראים על יצירת השבר הדו-גדילי ברקומביניציה המיוטית?

A
  • Spo11

- Mre11

19
Q

מה עושה

Spo11?

A

מבצע התקפה נוקלאופילית על פוספט במול’ הדנ”א ליצירת שבר ונשאר קשור אליו

20
Q

מה עושה

Mre11?

A

מעבד את קצוות השבר שיצר
Spo11
(מוציא אותו גם)

21
Q

מהן שתי האופציות הקיימות לסיום תהליך הרקומבינציה המיוטית?

A
1. עם
crossover
2. ללא 
crossover
(נוצרים פאצ'ים)
22
Q

כיצד מתבצע
crossover
של מידע גנטי ברקומבינציה המיוטית?

A

לאחר התיקון נוצר צומת הולידיי כפול.

הליגציה של הסטרנדים שתוקנו מתבצעת לפני ניתוקם לדופלקסים

23
Q

מיהו האנזים האחראי על הביקוע של צומת הולידיי?

A

רזולבאז
(RuvC
בחיידקים)

24
Q

מהו תהליך ה
branch migration
ולמה הוא משמש?

A
  • נדידת נקודת ההסתעפות של צומת הולידיי

- משמש להגדלת ההטרודופלקס ובהתאם הגדלת האזורים שיעברו שחלוף

25
Q

החלבונים האחראים על ה
branch migration
עושים שימוש באנרגיה שמקורה מ-

A

ATP

לשם יעילות התהליך

26
Q

מיהם החלבונים האחראים על ה
branch migration
בחיידקים?

A
  • RuvA
  • שני
    RuvB
27
Q

מה המבנה של

RuvA?

A

טטרמר, ללא יכולת

ATPase

28
Q

מה המבנה של

RuvB?

A

הקסמר בעל יכולת

ATPase.

29
Q

על מה אחראי החלבון

RuvA?

A

על הכוונת תנועת הגדילים אחד על השני ובהתאם הכוונת תנועת ה

branch migration

30
Q

מה תפקידו של

RuvB?

A

ההליקאז המשתמש ב
ATP
בשביל תהליך ה
branch migration

31
Q

מדוע מתרחשת תופעת ה

gene conversion?

A
תהליך ה
branch migration
יוצר אזור הטרודופלקס נרחב עם אחוז קטן של
mismatch. זה גורם לגיוס מערכת
MMR
שתתקן את הזיווגים השגויים הללו, לקבלת
loss of hetreozigosity
באזורים הללו
32
Q

מה הבסיס ל

gene conversion?

A

גיוס מערכת
MMR
שתתקן באופן אקראי את המיסמאצ’ים המופיעים באזור ההטרודופלקס

33
Q

מהו

gene conversion?

A

אזורים בהם, מתוך 4 תוצרי המיוזה הצפויים (2 אבהי ו2 אמהי)
נוצרים 3 מהורה אחד ורק 1 מההורה השני

(סטייה מתוצרי המיוזה הצפויים)