1-Génétique Flashcards
(109 cards)
1
Q
Quelle est la différence entre une mutation et un SNV (single nucleotide variation)
A
SNV: Délétion/Insertion d’un nucléotide
Mutation: Changement d’un a.a ou décalage du cadre de lecture. C’est un changement qui cause un problème. Effet biologique délétère.
Un SNV peut mener à une mutation, mais pas toujours le cas.
2
Q
Décris les différents types de mutation.
A
Faux-sens: changement d’a.a dans la protéine (pas toujours pathogène.
Non-sens: Engendre codon stop et terminaison précoce de la protéine.
Même-sens (silencieux):
Décalant le cadre de lecture = GRANDE MODIFICATION
Délétion ou duplication d’un exon.
3
Q
Quels facteurs peuvent influer la pénétrance?
A
Âge Sexe Dosage allèle Mutation Environnement etc.
4
Q
Quels sont les mécanismes de transmission?
A
- Anomalie chromosomique
- Hérédité mendélienne
- Autosomique dominant
- Auto récéssif
- Lié à l’X
- Transmission mitochondriale
- Hérédité complexe.
5
Q
Qu’est-ce qu’un locus?
A
Segment d’ADN qui occupe une position précise sur un chromosome
6
Q
Qu’est-ce qu’un Haplotype?
A
Types d’allèles à un locus sur un chromosome. C,est la forme spécifique du gène à cet endroit là.
7
Q
Qu’est-ce qu’un allèle?
A
Variants d’un même gène.
- sauvage: + fréquent
- Mutant ou variant
8
Q
Qu’est-ce qu’un polymorphisme?
A
C,est la caractéristique d’un locus qui n,est pas pathogène, mais unique à différentes personnes .
9
Q
Qu’est-ce que l’hétérogénéité génétique?
A
Caractère d’une maladie héréditaire dans laquelle différentes anomalies des segments d’A.D.N. présents dans les chromosomes peuvent conduire à une même pathologie.
10
Q
Qu’est-ce que l’hétérogénéité génétique Allélique?
A
Plusieurs alléles au meme locus
Plusieurs gènes pour une meme maladie.
11
Q
Qu’est-ce que l’hétérogénéité génétique clinique?
A
Plusieurs phénotypes au meme locus.
12
Q
Qu’est-ce qu’une maladie monogénique?
A
Désordre déterminé par les allèles à un locus unique. 1 gène, 1 maladie.
13
Q
Quelles formes peuvement prendre les maladies monogéniques?
A
Homozygote: Allèles identiques
Hétérozygote: Allèles différents
Hétérozygote composé: présence de 2 allèles mutants différents.
Hémizygote: Homme avec 1 allèle anormal pour un gène situé sur le X.
14
Q
Qu’est-ce que la pénétrance?
A
Loi du tout ou rien (on l’exprime ou on l’exprime pas). Chaque personne qui a un gène va l’exprimer.
15
Q
Qu’est-ce que la pénétrance incomplète?
A
Fraction d’individu avec génotype anormal qui n’ont aucun signe ou sx d’une maladie. (qqn qui n’exprime pas son allèle dominant), ses parents et ses enfants sont porteurs de la maladie.
16
Q
Qu’est-ce que l’expressivité variable?
A
T’as une mutation , mais tu l’exprimes à différents degrés pour différents traits.
Différences dans le type, la sévérité ou l’âge d’apparition des traits phénotypiques.
17
Q
Qu’est-ce que le caractère autosomique récessif?
A
- Atteint les 2 sexes également
- Affecte 1 seule génération, souvent dans une meme fratrie
- parents de la personne atteinte sont porteurs symptomatiques d’un allèle mutant
- Risque d’être atteint = 1/4
- Risque d’être porteur asymptomatique non-atteint = 2/3
18
Q
Quelles sont les particularités des autosomiques récessifs?
A
- Fréquence des hétérozygotes
- Ethnicité
- Consanguinité parentale
- Hétérogénéité génétique.
19
Q
Quelle est la forme de l’équilibre de Hardy-Weinberg et à quoi sert-elle?
A
p2 + q2 + 2 pq = 1
p2 = fréquence AA q2 = fréquence aa 2pq = fréquence Aa
Fréquence des hétérozygotes
A= allèle normal
a = allèle muté
20
Q
Que fait la consanguinité?
A
Augmente les chances qu’on porte un allèle récessif. Les gens qui sont par exemple cousins, ont plus de chances de porter la même allèle mutante, donc plus de chance de transmettre le même gène à leur génération.
21
Q
Le syndrome de Treacher-Collins possède quel mode de transmission?
A
Autosomique dominant.(personnes atteintes à chaque génération)
22
Q
Décris la transmission autosomique dominante?
A
- Générations successives ou multigénération atteints
- H+F = atteints + transmetteurs
- Homme atteint peut avoir garçon atteint.
- membres non affectés n’ont pas d’enfants atteints
- personne atteinte a un Risque de transmission de 1/2 !
23
Q
Quels sont les mécanismes de dominance?
A
- Mutation créant une perte de fonction
- haploinsuffisance
- d’une protéine requise - Mutation amenant un gain de fonction
- dosage génique accru
- Expression altérée ARNm
- Activité protéique accrue
- Effet-dominant négatif
- Altérations toxiques
- Nouvelle fonction protéique
- Récessif avec effet dominant.
24
Q
Quelles sont les particularités des autosomique dominants.
A
- Nouvelles mutations (pas reçu de ses parents, c’est nouveau, mais c’est dominant)
- Pénétrante réduite
- Expressivité variable
- Mosaique
- Phénocopie
- Anticipation
25
Qu'est-ce que la mosaïque?
```
Dépend du moment où ça survient.
Étendue dépend de:
- prolifération
- migration
- survie des ¢
dans lesquelles la mutation a eu lieu spontanément durant le développement embryonnaire.
```
Mutation pas présente dans toutes les ¢ de notre corps.
26
Qu'est-ce qu'une phénocopie?
Fait comme la maladie génétique, mais causé par un facteur environnemental.
27
Qu'est-ce que l'anticipation?
Fait qu'une condition génétique s'aggrave d'une génération à l'autre.
28
La dystrophie musculaire de Duchenne est une conséquence de quel mode de transmission?
X récessif
Chez les garçons surtout. (Mères porteurses qui donnes leur X muté à leur garçon)
Aucune transmission Male to male car père donne son Y.
Si père porteur, donne le X muté à toutes ses filles (seront toutes porteuses)
29
Décris le mode de transmission lié à l'X récessif.
+ fréquent chez les garçons.
- femmes hétérozygotes non atteintes, degré variable
- Homme transmet la mutation à toutes ses filles
- Homme transmet PAS à ses garçons
- Nouvelle mutation chez individus atteints.
30
À quel moment et comment le X est-il inactivé?
Après l'embryogénèse.
Elle se fait au hasard (la plupart du temps)
mais peut favoriser l'inactivation d'un X muté!
Différents mécanismes, c'est pas toujours le fruit du hasard.
TOUJOURS LE MM X qui est INACTIVÉ, mais ça prend +ieurs divisions cellulaires pour décider.
31
Décris le trinucléotide repeat disorders.
Les parents peuvent avoir un ADN normal, + plusieurs séquences de CGG, transmettre à leur enfant un ADN avec plus de CGG, qui sont normaux, qui eux transmettent à leur enfant encore plus de CGG = cas une mutation !.
32
Quelles maladies découlent de la répétition de trinucléotides?
```
Maladie Huntington
Dystrophie myotonique
Ataxie spinocérébrale
Haw River sx
X-Fragile
FRAXE
Maladie de Kennedy
```
33
Quel gène est affecté dans le syndrome du X fragile?
(gène FMR1)
34
Quel type d'hérédité est non-mendélienne?
Hérédité mitochondriale.
35
Décris l'hérédité mitochondriale.
- Milliers / ¢
- Source de maladies génétiques
- Origine maternel ! (car cytoplasme de l'ovocyte!)
- production d'É cellulaire
- Génome mitochondrial (ADN)
- Code différent du code nucléaire
- très petit (16 kb)
- Réplication rapide
- Taux de mutation élevé
- 37 gènes (13 codants pour la chaine respiratoire)
- 22 ARNt et 2 ARNr
- TRÈS RARE. touche neuro, coeur, foie, reins, etc
- Sévère! (MELAS, Myopathie, Neuropathie optique de Leber)
36
Qu'est-ce que l'hétéroplasmie?
composante du cytoplasme différente.
| Phénomène présent dans la méiose pour la formation d'ovocytes (mitochondries mutées sont réparties aléatoirement)
37
Que transmet une femme homoplasmique?
Mutation à tous ses enfants
38
Que transmet un homme homoplasmique?
Rien !
39
Que transmet une femme hétéroplasmique pour une mutation ponctuelle ou délétion?
Tous les enfants auront mutation mais à des niveaux variables
40
Que transmet une femme hétéroplasmique pour une délétion?
non transmise
41
Comment se transmettent les mitochondries mutantes?
-Varie d'un tissu à l'autre = variabilité phénotypique.
42
Est-ce que les maladies mitochondriales peuvent être de transmission mendélienne?
Oui, si elles proviennent du génome nucléaire.
43
Décris l'hérédité multifactorielle.
Prédisposition génétiques qui peuvent interagir avec l'environnement (fumer, bouger, stress, etc)
44
Anomalies génétiques sans changements du code génétique.
Désordres épigénétiques.
45
Quels sont les différents désordres épigénétiques?
Méthylation (inhibe gène)
46
Différence entre syndrome de Prader-Willi et Angelman?
Délétion provient du père (PW) et de la mère (Angel) du chromosome 15. Ca fait pas la meme chose.
47
Qu'est-ce que l'empreinte génomique?
Parent écrit un petit mot. Régulation de l'expression des gènes selon le sexe. le gène qui subit l'empreinte ne sera pas exprimé.
C'est péri-conceptuel
48
À quoi correspondent p et q dans le chromosome?
p: petit bras
q: long bras
49
Comment sont subdivisés les chromosomes?
Régions > Bandes > Sous-bandes
50
Décris Del22q11.2
Délétion
chromosome 22
bras long région 1 de la bande 1, sous-bandes 2.
C'est le code postal des chromosomes
51
Que retrouve-t-on dans un rapport de cytogénétique?
```
INdication
nombre de ¢ comptées (ex: minimum 10)
Nombre de ¢ caryotypées (ex: 5)
Niveau de résolution (ex: 550)
Formule chromosomique (ex: 46,XY)
COnclusion (ex: normal)
```
52
Quelles sont les techniques cytogénétique?
Coloration des chromosomes à partir de caryotypes de ¢ en division.
- Lymphocytes
- Amniocytes (pour dx prénatal)
- Myélocytes (leucémies)
- Fibroblastes (biopsie, autopsie)
PAS SUR GR CAR PAS DE NOYAU**
53
Décris la résolution du caryotype.
Plus elle est élevée, plus y'a de sous-bandes.
- minimum 550 bandes pour clientèle pédiatrique
- Amniocentèse = 400 bandes. (insuffisant pour détecter retard mental)
54
Caryotypage: chromosomes placés selon leur taille. Vrai ou Faux?
FAUX. chromosome 21 est le + petit que le 22 . Mais c'est globalement le cas.
55
Qu'est-ce qu'un chromosome acrocentrique?
pas de gène sur le bras court (13-14-15-21-22)
56
Pourquoi trisomie 21 est viable?
Car moins grand débalancement (+ petit chromosome)
57
Quels sont les 2 types d'anomalies chromosomiques?
Nombre et structure.
Nombre : différent de 46. (normal = disomie)
- Trisomie
- Monosomie
Structure:
- translocation
- Délétions
- Duplications
58
Quelle est l'incidence des anomalies chromosomiques?
Fausse couche 1er trimestre: 50%
Retard léger-moyen : 4%
Retard moyen-sévère: 13%
Malformations majeures: 4-8%
59
Qu'est-ce que la non-disjonction?
Chromosomes homologues ou Chromatides soeurs qui restent ensemble lors de la ségrégation. Engendre un gamete trisomique + 1 gamète monosomique.
60
Quand peut-il y avoir non-disjonction?
Méiose I : non disjonction des chromosomes homologues
| Méiose II: non disjonction des chromatides soeurs.
61
Que peut-causer la trisomie 21?
non-disjonction
62
Quelle est la seule monosomie viable?
Syndrome de Turner : Manque 1 X
63
Quelle trisomie est souvent découverte par hasard?
XYY
64
Combien de chromosomes ont un caryotype triploïde?
69 chromosomes.
65
Quelles anomalies de structure engendrent des conséquences?
Avec un réarrangement chromosomique DÉSÉQUILIBRÉ ( Perte ou gain de matériel)
66
Quelles sont les différentes anomalies de structure de translocation et leur risque de déséquilibre? Décris les.
TRANSLOCATION RÉCIPROQUE:
- Risque de déséquilibre lors de la transmission
- Équilibré car toute l'info est là
- Échange de fragments entre 2 chromosomes non-homologues.
- fréquent = 1:400
TRANSLOCATION ROBERTSONNIENNE
- 1:1000 (fréquent)
- Chromosomes acrocentriques
- Risque lors transmission: trisomie.
67
Quelles sont les différentes anomalies de structure de délétion et leur risque de déséquilibre? Décris les.
DÉLÉTION INTERSTITIELLE:
- perte de matériel = déséquilibre
DÉLÉTION TERMINALE:
- perte matérielle = déséquilibre
68
Quelles sont les différentes anomalies de structure de duplication et leur risque de déséquilibre? Décris les.
rare
| Matériel génétique de trop. = déséquilibre
69
Quelles sont les différentes anomalies de structure d'insertion et leur risque de déséquilibre? Décris les.
Rare
Risque déséquilibre lors de transmission.
ÉChange de matériel
70
Quelles sont les différentes anomalies de structure d'isochromosome et leur risque de déséquilibre? Décris les.
Perte d'un bout de chromosome et gagner de celui qui reste. = Déséquilibre.
71
Quelles sont les différentes anomalies de structure d'inversion paracentrique et leur risque de déséquilibre? Décris les.
Casse en 2, flippe et se ressoud. Dépend où c'est cassé;
milieu d'un gène: Gène ne fonctionne plus
Déséquilibre lorsque transmis
72
Quelles sont les différentes anomalies de structure d'inversion péricentrique et leur risque de déséquilibre? Décris les.
Risque déséquilibre lorsque transmis.
Autour du centromère
73
Quelles sont les différentes anomalies de structure d'anneau et leur risque de déséquilibre? Décris les.
télomères se coupent et bouts de chromosome se rejoignent. Perte de matériel
74
Décris de quoi a l'air du chromosome lors d'un X-fragile?
Bouts de chromosomes à moitié attachés. Expansion de trinucléotides au niveau de l'ADN.
75
Pour quelles raisons on prescrit une analyse des chromosomes?
- Suspection d'un syndrome d'anomalie
- Ambiguité sexuelle
- Retard mental
- Retard développement
- Morts-nés
- Femmes aménorhée
etc.
76
Qu'est-ce que la technique FISH?
FLuorescent in situ hybridation: petits marqueurs d'ADN qui se collent sur des fragments de chromosome.
Utilisé pour dépister la trisomie 21 (36h avant d'avoir la réponse!)
Toute sorte de sondes:
- Gène-spécifique (détecte microdélétion invisible en cytogénétique usuelle)
- Centromère
- Télomère
- Chromosome au complet.
77
Comment détecte-on le syndrome de Prader-willi et Angelman?
Méthylation (test moléculaire et non cytogénétique) tube EDTA
Par FISH = moins précis
78
Quelles sont les utilités des sondes centromériques?
- Détecter Chromosomes remaniés difficilement
| - Détecter mosaicisme
79
Quelles sont les utilités des peintures chromosomiques?
Identification de translocations complexes.
80
Quelles sont les utilités du FISH?
- Dx des syndromes microdélétionnels
- Réarrangements complexes
- Cytogénétique prénatale (rapide)
81
Qu'est-ce que l'hybridation génomique comparée sur matrice?
FISH x 100 000 !
Divise le génome en millers de fragments et d'en mesurer les gains et les pertes.
* Automatisable
* Émergence rapide
* Analyse de tous les sx délétions
* pas besoin de culture ¢
AUTRES NOMS:
- Micropuces d'ADN
- CGH
- Microarray
82
Qu'est-ce qu'une micropuce à ADN?
plaquette de verre sur laquelle on met l'ADN.Code génétique se retrouve au complet sur la plaquette. (ex: chaque page du livre est collée sur la plaquette)
83
Qu'est-ce qu'une hybridation génomique comparative?
Contrôle l'ADN (vert) à celle de 1000-2000 patients (ADN contrôle= rouge)
84
Qu'est-ce que l'analyse de CGH sur micropuce?
Somme des ratios de fluorescence.
Selon la personne.
Vert = Gène augmenté (ex: duplication)
Rouge = gène absent (ex: délétion)
Jaune = NORMAL
85
Quelle est la 1ere ligne d'examen du retard mental, des malformations multiples et de l'autisme?
Micro-puces
86
Que ne détectent pas les micro-puces?
LES RÉARANGEMENTS ÉQUILIBRÉS
- Translocations
- Inversion
- pas utile lors de fausses couches multiples.
87
Quels sont les différents tests de génétique moléculaire?
- Isolation de l'ADN
- Analyse mendélienne
- Analyse de la taille des fragments de restriction
- Variation de taille des séquences répétées.
- Tests ADN judiciaire.
- PCR : multiplication d'un segment d'ADN d'intérêt (Tacpolymérase)
- Hybridation avec sonde spécifique à allèle muté/normal (pour mutation connue)
- Séquençage de L'ADN (+ fluorescence)
88
Quels sont les tests dx possibles en prénatal?
- Transcervical chorionique villus shampooing
- Transabdominal chorionic villus sampling (CVS)
- Amniocentèse
Tous suivi d'une culture ¢
89
Quelles sont les limites des tests génétiques?
- Fiabilité =/= 100%
- ne révèle pas un état clinique
- mutations pas toujours décelables
- Considérations éthiques et sociales.
90
Quel est le promoteur de la transcription?
boite TATA
91
Quelles sont les enzymes de la fourche de réplication et quel est leur rôle?
```
Hélicase: sépare les 2 brins D'ADN (ATP)
SSBP ou Gyrase: enrobe simple brin
Primase: Amorces ARN
Topoisomérase: élimine surenroulement
ADN pol III: AJoute nucléotides
```
92
Quelles enzymes éliminent la brèche d'ARN dans la réplication?
RNaseH: dégrade les ARN
Exonucléase : enlève dernier ribonucléotide
Pol I: Rempli la brèche d'ADN
Ligase: répare la césure.
93
Quel est le mode de réparation commun?
Excision-resynthèse: désamination, dépurination, 8-oxo-deoxyguanosine, erreur ADNpol III
94
Que fait-on lors d'une cassure bicaténaire?
Recombinaison homologue.
95
Décris les enzymes de transcription. + stades
ARN pol II: ADN en ARNm
ARN pol I: gènes pour ARNr
ARN pol III: gènes pour ARNt
INITIATION: Promoteur Boite TATA + séquence initiation
ÉLONGATION: ARN pol déroule, réassocie, dissocie ARN, corrige, catalyse liaison nucléotides
TERMINAISON: ARNpré-m + Coiffe 5' +Épissage+ Queue poly-A (empeche dégradation, recyclage ribosomes)
MODIFICATIONS CHIMIQUES:
- Méthylation
- Pseudoridylation (liens H qui stabilisent l'ARNm)
96
Où a lieu la traduction?
Cytoplasme
97
Quelles sont les modifications post-traductionnelles principales?
Peptidase (RE) enlève 20-30 a.a (en N-terminal)
Glycolisation (augmente résistance)
Protéase (facultatif) pour rendre protéine fonctionnelle (glucagon + insuline)
Protéines chaperonnes = 3D
Ubiquitine: lie les pas bonnes protéines qui seront reconnues par protéasomes.
98
Décris le promoteur alternatif.
Promoteur spécifique à un tissu (1er exon + terminaison qui lui sont spécifiques)
99
Décris l'enhancer.
Partie du gène, régulent le taux de transcription.
Amont ou Aval du promoteur
100
Décris les éléments de réponse.
Sites de liaison pour facteurs, séquence de nucléotides qui stimulent ou diminuent l'expression de certains gènes selon des hormones.
101
Décris les facteurs de transcription.
protéines qui reconnaissent le promoteur. activent ou répriment la transcription.
ex: TBP lie TATA box
102
Quels sont les différents types de mutation et leurs conséquences?
Mutations génomiques: aneuploïdie (nombre anormal de chromosomes)
- mort, cancer
Mutations chromosomiques:
- affectent structure
- mort, infertilité
Mutations géniques
- modifications chimiques d'une paire de base.
103
Qu'est-ce que la Thalassémie?
Biosynthèse anormale des chaines de globine.
104
Quel mode de transmission caractérise les hémoglobinopathies ?
Autosomique récessif
105
Décris l'a-thalassémie.
foetus + adulte
Atteint gène 16 (4 allèles codent pour a1 et a2)
Incapable de lier O2
Mutation affecte 25% des chaines a.
106
Décris B-thalassémie.
Précipitation chaines a (tétramère a) = destruction de la membrane de l'érythrocyte = hémolyse. Sévérité = quantité de chaines a en excès.
Détecter après naissance (quand B-globine remplace G-globine)
B-thalam homozygote = anémie sévère. + retard croissance,jaunisse musculaire,
tx = transfusions + chélation de Fer.
B-thalam hétérozygote = mineure
Mutation affecte 50% des chaines B
107
Décris la déficience en a1 antitrypsine + tabagisme.
maladie autosomique récessive associée à MPOC et/ou cirrhose du foie.
a1 antitrypsine:
- synthétisée par FOIE
- circule dans sang.
- inhibe l'élastase (élasticité du tissu pulm.)
- protège alvéoles d'enzymes puissants libérées par GB lors de réactions immunitaires
Dysfonction: (absence de a1 AT)
- élastase augmente et réduit élasticité = emphysème
- destruction des alvéoles
TABAC:
augmente immunité = libération d'enzymes qui empêchent l'inhibitiion de l'élastase par a1-AT
Augmente déficience en a1 AT.
108
Décris la fibrose kystique.
Maladie génétique mortelle autosomique récessive
```
Touche appareil digestif + poumons
Accumulation de mucus =
- diminue éimination bactéries.
- congestion bronches
- difficulté dans digestion aliments (obstruction des conduits pancréatiques)
```
Mutation gène de la protéine CFTR (chro. 7)
CFTR: forme canal ionique au Cl- (entre dans ¢)
- engendre entrée de Na+ + Eau par osmose = globalement ¢ = épaississement du mucus extra¢.
- moins de Cl- dans mucus = augmente viscosité.
Infections bactériennes
109
Décris hypercholestérolémie familiale.
Autosomique dominante
Augmentation [chol] sanguin (surtout LDL)
Mutation sur gène codant pour RÉCEPTEURS DU LDL
Mutation enzyme qui d.grade les récepteurs
Récepteur ne reconnait pas Apolipnotéine B (se lie sur LDL pour reconnaissance par récepteurs)
