blandet genetik

Question 1

Histon modifikation acetylering effekt

Answer 1

Mere aktivt DNA pga løsere pakning (Ac skærmer nødvendige positive ladninger på Lys der normalt fører til øget affinitet ml DNA og histon)

Question 2

Histon modifikation metylering effekt

Answer 2

(TRIMETYLERING) Silencing af DNA

Question 3

Kort hvad forskellen på og betydning af eukromatin og heterokromatin er

Answer 3

Eukromatin: (you are ) AKTIVT DNA, dvs mindre tæt pakket, lysere set i elektron/lysmikroskop
Heterokromatin: mindre aktivt, tættere pakket, mørkere DNA (i mikroskop)

Question 4

Hvordan “fixes” lagging strand efter det er syntetiseret? (pga RNA primere som ikke må blive der)

Answer 4

1) Nuklease: RNAse H spiser primere
2) Repair polymerase (DNA polymerase I) fylder huller ud med DNA
3) DNA ligase laver phosphodiester bindinger mellem 3’ af ‘primerreplacing DNA’ (ikke-udtryk) /nyindsatte DNA og 5’ ende af Okasaki fragmenter

Question 5

Nævn (de) 9 enzymer involveret i DNA replikation (svært spørgsmål)

Answer 5

Helikase
DNA polymerase (I og III)
Single strand binding protein (SSB)
Primase
Nuklease (RNase H)
DNA ligase
Sliding clamp
Clamp loader
Topoisomerase

Question 6

Hvad er/ forklar mismatch repair

Answer 6

Mismatch repair er den mekanisme der bruges til at fixe sjældne fejl der har udslippet DNA polymerasen under replikation. Et mismatch repair kompleks genkender et forkert matchet basepar, identificerer den nye (og derfor forkerte) base i parret (hvordan: lidt af et mysterie) og klipper den ud, sætter rigtig ind og limer backbone sammen igen

Question 7

De to måder at fixe dobbeltstrengsbrud

Answer 7

Nonhomolog end joining: hurtig men uperfekt løsning. De to ender cleanes op (under mistning af enkelte nukleotider) og de ligeres sammen.
Homolog rekombination: Hvis der er intakt homolog DNA kopi af den, vi har brud på, i nærheden (lige efter replikation vil der være det). Der klippes lidt af enden af ene streng af begge stykker (begge 5’ vistnok). Invasion af intakte kopi, forlængning -> overlap til andet stykke. Stykker kan renaturere til hinanden på dette overlapssted og polymerase og ligase kan fikse resten af hulle(t/rne).

Question 8

Blot (w/n/s) til DNA?

Answer 8

Southern blot

Question 9

Blot (w/n/s) til RNA?

Answer 9

northern blot

Question 10

Effekt af depurinering?

Answer 10

(Purin base mistes fra backbone) -> deletion ved næste replikation af den streng der mangler basen

Question 11

Hvad sker der ved deaminering? Hvilke baser bliver til hvilke?

Answer 11

C-> U

5-metyl-C-> T