Microbio - Micro-organismes ** COMPLET ** Flashcards

1
Q

Comment sont classés les micro-organismes? (8)

A
  • Domaine
  • Règne
  • Embranchement
  • Classe
  • Ordre
  • Famille
  • Genre
  • Espèce
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2
Q

Donnez l’exemple d’E. Coli

  • Domaine
  • Genre
  • Espèce
  • Souche
A
  • Domaine : Bacteria.
  • Genre : Escherichia
  • Espèce : Coli
  • Souche : Sakai (sérotype O157:H7)
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3
Q

Quels sont les 3 domaines de la vie?

A
  • Bacteria.
  • Archaea.
  • Eucarya.
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4
Q

Types cellulaires : Que sont les 3 types cellulaires?

A
  • Procaryotes.
  • Eucaryotes.
  • Archées.
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5
Q

Donnez les principales caractéristiques du domaine bacteria.

  • Quels types de cellules (2 caractéristiques).
  • Taille.
  • Est ce que ce domaine contient des pathogènes?
A
  • Cellules procaryotes / Cellules unicellulaires.
  • Ordre du micromètre.
  • Majorité des espèces de bactéries ne sont pas pathogènes.
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6
Q

Donnez les principales caractéristiques du domaine Archea.

  • Cellule.
  • Est ce que ce domaine contient des pathogènes?
A
  • Cellules procaryotes.

- Pas d’archée pathogène.

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7
Q

Donnez les principales caractéristiques du domaine Eucarya.

  • Qui la composent?
  • Quels sont les principaux micro-organismes qui le composent?
  • Est ce que ce domaine contient des pathogènes?
A
  • Cellules eucaryotes / uni ou pluricellulaires.
  • Mycètes, protozoaires.
  • Oui.
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8
Q

Que sont les cellules procaryotes? Qui sont-ils?

A
  • Cellule simple.
  • Pas de noyau.
  • Un seul chromosome libre.
  • -» Bactéries.
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9
Q

Que sont les cellules eucaryotes ? Qui sont-ils?

A
  • Cellule complexe.
  • Avec noyau.
  • Plusieurs chromosomes.
  • -» Cellules humaines/animales/végétales, protozoaires.
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10
Q

Que sont les archées?

Quels sont leurs caractéristiques particulières au niveau morphologique?

A
  • Cellules qui ressemblent aux procaryotes

- Lipides membranaires uniques, paroi chimiquement différente et une composition particulière des ribosomes.

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11
Q

Archées :

Quels sont des caractéristiques uniques des archées?

A
  • Peuvent être des organismes méthanogènes (producteurs de méthanes).
  • Inclut des bactéries halophiles extrêmes (milieux salés).
  • Inclut des bactéries thermophiles extrêmes (sources chaudes).
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12
Q

Comment sont divisés le domaine eucarya? Donnez les différents exemples.

A
  • En règnes.

- -» Protistes, mycètes, plantes, animaux.

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13
Q

Comment sont divisés le domaine procaryotes?

A

En embranchements.

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14
Q

Terminologie :

Qu’est-ce que le 1er mot? Qu’est-ce que le 2e mot?
Lequel des deux commencent par une majuscule?

A
  • 1e mot : Genre (majuscule)

- 2e mot : Espèce (minuscule).

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15
Q

Est-ce que les bactéries d’une même espèce sont complètement identiques?

A

Non –» le terme de souche désigne chaque isolat.

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16
Q

Qui est inclut dans les micro-organismes (4) ?

A
  • Bactéries.
  • Virus.
  • Mycètes.
  • Protozoaires.
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17
Q

Donnez 5 caractéristiques des micro-organismes.

A
  • Très petite taille.
  • Unicellulaire.
  • Inclut les procaryotes et eucaryotes.
  • Ont un potentiel métabolique (sauf virus).
  • Capable de se reproduire de façon autonome (sauf virus).
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18
Q

Est-ce que les virus appartiennent à un domaine ou un règne?

A

Non.

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19
Q

Virus : Pourquoi sont-ils si spéciaux? (3 caractéristiques).

A
  • Acellulaire.
  • Non vivant.
  • Réplication semi-autonome : Ils doivent infecter une cellule hôte qui va assurer leur réplication.
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20
Q

Que sont les prions?

Que passe-t-il quand ils entrent en contact avec les protéines N de l’hôte?

A
  • Protéines qui ont une conformation anormale.

- Réaction en chaîne –» accumulation de protéines anormales –» atteintes du SNC avec le temps.

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21
Q

Qu’est-ce que le génotype?

Qu’est-ce que le phénotype?

A

Génotype : Caractéristiques génétiques des microbes.

Phénotype : Caractéristiques observables qui découlent du génotype (ex : morphologie, fonction).

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22
Q

En pratique clinique, que visent les techniques de laboratoires? Donnez 4 exemples de techniques.

A
  • Identification des micro-organismes.
  1. Morphologiques.
  2. Biochimiques
  3. Sérologiques.
  4. Génétiques.
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23
Q

Qui sont les plus gros : les procaryotes ou les eucaryotes?

A

Eucaryotes.

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24
Q

Où retrouve-t-on les micro-organismes?

A

Partout ! Ils sont omniprésents.

  • Air, eau, sol, tissu animaux, végétaux.
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25
Q

Quels sont des moyens que les micro-organismes ont développés pour se procurer l’énergie nécessaire à leurs activités vitales?

A

1- Respiration.
2- Photosynthèse.
3- Fermentation.
4- Dégradation de produits organiques.

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26
Q

Quel est le groupe le plus abondant d’être vivant?

A

Les micro-organismes.

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27
Q

Combien de cellules humains contient l’être humain?

Combien contient de cellules micro-organismes?

A

10^13

10^14

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28
Q
Que sont les bactéries?
Comment est la structure cellulaire?
Est-ce qu'il y a de l'ADN et l'ARN?
Comment est la réplication?
Quelle sorte de microscope sont utilisés?
A
  • Organismes procaryotes.
  • Pas d’organelles complexes.
  • Possède de l’ADN et l’ARN.
  • Réplication autonome.
  • Visibles en microscopie optique.
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29
Q
Que sont les virus?
Est-ce qu'il y a de l'ADN et l'ARN?
Comment est la réplication?
Qu'est-ce la capside?
Quelle sorte de microscope sont utilisés?
A
  • Organisme acellulaire non-vivant.
  • ADN OU ARN (jamais les deux en même temps).
  • Réplication semi-autonome.
  • Structure protéique entoure le matériel génétique.
  • Microscope électronique.
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30
Q

Que sont les mycètes?
Comment est la structure cellulaire?
Qu’est-ce qui est leur source d’énergie/nutriments?
Nommez les 2 types de mycètes.

A
  • Organismes eucaryotes.
  • Structure cellulaire + complexe que bactéries.
  • Matière organique en décomposition.
  • Levures / moissisures.
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31
Q

Classez les micro-organismes en fonction de leur taille : Mycètes, Virus, Bactéries

A

Mycètes > Bactéries > Virus.

32
Q

Mycètes :

Que sont les levures?
À quoi contribue-t-elle?
Peuvent-elles causer des infections chez l’humain?

A
  • Mycètes unicellulaires.
  • Revalorisation des déchets agricoles/industriels + rôle-clé dans l’industrie alimentaire.
  • Oui.
33
Q

Mycètes :

Que sont les moisissures?
Quels sont leur utilités?
Peuvent-elles causer des infections chez l’humaine?

A
  • Champignons multicellulaires.
  • Industrie alimentaire / pharmaceutique.
  • Oui via libération de toxines dangereuses.
34
Q

Que sont les protozoaires?
Où les retrouve-t-on?
Comment agissent-ils?
Est-ce qu’ils peuvent causer des infections?

A
  • Microorganismes eucaryotes.
  • Eau, sols humides, intérieur d’un organisme.
  • Entité autonome ou parasitaire.
  • Oui –» ex : toxoplasmose, malaria, dysenterie amibienne.
35
Q

Que sont les enveloppes bactériennes ?

A

Différentes structures qui entourent les cellules bactériennes.

36
Q

Enveloppe bactérienne :

  • Qu’est-ce que la capsule?
  • Est-elle indispensable à la survie des bactéries?
  • Quel est son rôle?
A
  • Enveloppe visqueuse à la surface de certaines bactéries.
  • Non.
  • Protection contre la phagocytose par les cellules immunitaires ET favorise l’adhésion des bactéries aux cellules épithéliales.
37
Q

Enveloppe bactérienne :

  • Qu’est-ce le glycocalyx?
  • Quel est son rôle?
A
  • Feutrage extra cellulaire qui est plus irrégulier que la capsule.
  • Faciliter l’adhésion des bactéries aux surfaces et l’adhésion entre les bactéries.
38
Q

Enveloppe bactérienne :

  • Qu’est-ce que la paroi cellulaire?
  • Quel est son rôle?
  • Quel sont les deux structures de paroi cellulaire?
  • Que contient la paroi cellulaire?
  • Comment s’appelle les LPS dans la membrane externe?
  • Est ce que les ATB ciblent plus facilement les gram négatif ou les gram positif?
A
  • Enveloppe semi-rigide.
  • Donner de la structure aux bactéries.
  • Gram + / Gram -
  • Gram + = peptidoglycan épais / Gram - = peptidoglycan mince + membrane externe avec des LPS.
  • Antigène O.
  • Gram positif.
39
Q

Enveloppe bactérienne :

  • Qu’est-ce que la membrane cytoplasmique?
  • Quel est son rôle?
  • Comment effectue-t-elle son rôle?
A
  • Paroi mince qui est faite d’une bicouche de phospholipides + protéines mobiles.
  • Barrière osmotique qui régulent les ions et les substances nutritives.
  • Par pénétration sélective de certaines substances.
40
Q

Constituants internes : Qui sont-ils?

A

Cytoplasme, ribosomes, matériel génétique.

41
Q

Qu’est-ce que le cytoplasme?

A

Fluide qui contient les ribosomes et l’appareil nucléaire.

42
Q

Que font les ribosomes?

A

Synthèse des protéines.

43
Q

Comment est le matériel génétique des bactéries?

A

ADN double brin sans membrane nucléaire.

44
Q

Que sont les plasmides (matériel génétique) ?

A

ADN extra-chromosomique qui codent pour des propriétés facilitant la survie.

45
Q

Qui est l’antigène K?

Qui est l’antigène H?

A
  • K = Capsule.

- H = Flagelles.

46
Q

À quoi servent les flagelles?

Sont-ils visibles au microscope?

A
  • Ils assurent la mobilité des bactéries.

- Oui avec une coloration spéciale.

47
Q

Qui possèdent des pili?

À quoi servent les pili?

A
  • Les bactéries gram nég.

- Fixer les bactéries aux surfaces.

48
Q

Nommer 1 type particulier de pili.
À quoi servent-ils?
Comment s’appelle ce phénomène?

A
  • Pili sexuels.
  • Transfert unilatéral de matériel génétique entre bactéries.
  • Conjugaison.
49
Q

Spores :

Quel est le rôle des spores bactériennes?

A
  • Les spores permettent aux bactéries de survivre dans des conditions défavorables –» le matériel génétique et les éléments vitaux à la survie sont stockés.
50
Q

Spores bactériennes :

Quel est le processus déclenché lorsque les conditions sont défavorables?
Quelle est le processus déclenché lors que les conditions redeviennent favorables?

A
  • Sporulation.

- Germination (spore reprend sa forme végétative).

51
Q

Spores bactériennes :

Quels bactéries peuvent faire des endospores?

A

Gram nég –» Bacillus et Clostridium.

52
Q

Spores des mycètes :

Est-ce que les spores des mycètes ont aussi un rôle de survie?

A

Non. Rôle de reproduction et dispersion.

53
Q

Nommez 4 maladies par des bactéries sporulées.

A

Gangrène (clostridium)
Tétanos (clostridium)
Botulisme (clostridium)
Anthrax (bacillus)

54
Q

Trier les composantes :

Paroi cellulaire, membrane plasmique, pili, spore, chromosome, flagelles, cytoplasme, plasmide, ribosomes, capsule.

A. Obligatoires
B. Facultatives

A
Paroi cellulaire - A
Membrane plasmique - A
Pili - B
Spore - B
Chromosome - A
Flagelles - B
Cytoplasme - A
Plasmide - B
Ribosomes - A
Capsule - B
55
Q

Nommez 4 morphologies bactériennes

A

1- Bâtonnets (bacilles)

  1. Sphères (cocci)
  2. Entre-deux (coccobacilles)
  3. Virgules (vibrio).
56
Q

Est-ce que les bactéries sont toujours isolée ?

A

Non.

  • Isolée.
  • Paires (diplocoques).
  • Chaînettes (streptoccoques).
57
Q

Quelles sont les caractéristiques observables possibles d’une colonie bactérienne? (6).

A
1- Forme.
2- Élévation.
3- Bordure.
4- Surface.
5- Opacité.
6- Pigmentation
58
Q

À quoi sert une coloration simple?

Donnez 3 exemples

A
  • Faire ressortir les cellules en entier.

- Méthylène, Crystal violet, safranine.

59
Q

Nommez les 5 étapes de la coloration de Gram

A
  1. Fixation des cellules à la lame.
  2. Coloration primaire avec Crystal violet –» cells seront bleues.
  3. Application d’iode pour donner des formes moléculaires + grosses.
  4. Décoloration à l’alcool –» gram + = bleu / gram - = transparent.
  5. Double vérification avec safranine –» gram + = bleu / gram nég = rose.
60
Q

À quoi sert la coloration de gram?

A

Diviser les bactéries en deux grands groupes et mieux orienter la sélection des ATB à utiliser.

61
Q

Quels bactéries réagissent mal à la coloration de gram?

Quel colorant est utilisé?

A
  • Mycobactéries.

- Ziehl-Neelsen.

62
Q

Quel est le microscope traditionnel?

Nommez 1 désavantage.

A
  • Microscope optique en champ clair.

- En absence de colorations, difficile de voir les cellules bactériennes translucides.

63
Q

À quoi sert le microscope optique à fond noir?

A

À voir les cellules qui peuvent être difficilement colorées.

64
Q

Qu’est-ce que le microscope électronique?

Est-ce que ce microscope est bcp utilisé en microbiologie?

A
  • Microscope très sophistiqué –» l’échantillon observé sera traversé par un faisceau d’électron mobile.
  • Non. Davantage utilisé en pathologie.
65
Q

À quoi servent les tests biochimiques (phénotypiques) ?

A

À identifier les bactéries une fois leur croissance obtenue.

66
Q

Tests biochimiques

Qu’est-ce les labos de bactériologie clinique utilisent de nos jours? Qu’est-ce que cette technique donne comme info?

A
  • Microplaquettes de 96 puits avec plusieurs réactifs.
  • Un code chiffrés (grâce une analyse informatique) qui correspond à caractéristiques phénotypiques spécifiques –» identification des espèces bactériennes.
67
Q

Test immunologiques (test phénotypique) : ELISA

  • Qu’est-ce que cette technique?
  • Combien d’anticorps sont utilisés?
  • Pourquoi appelle-t-on cette méthode le « sandwich »
  • Quelle est l’utilité de la méthode sandwich?
A
  • Technique d’identification qui utilisent des Ac spécifiques.
  • 2
  • L’antigène est pris entre un Ac de capture et un Ac de détection.
  • Double reconnaissance de l’antigène et augmentation de la spécificité du test.
68
Q

Test génotypique - Séquençage de l’ADN

Quel est son avantage?
Quel est son désavantage?

A
  • Résultat uniforme d’un labo à l’autre ET il existe des bases de données publiques fiables.
  • Trop long et trop complexe pour labo médical.
69
Q

Test génotypique - Dx moléculaire par TAAN

Quel est condition pour faire ce test?
Si cet condition est rempli, que se passe-t-il?

A
  • Une séquence génétique particulière doit déjà avoir été identifié dans une espèce bactérienne.
  • L’outil génétique sera capable de détecter l’espèce dans un échantillon.
70
Q

Combien de temps prennent les méthodes phénotypiques?

A

Entre 48 et 64h.

71
Q

Combien de temps prennent les méthodes génotypiques?

A
  • Environ quelques heures.

- Toutefois, environ 1 ou 2 jours avant le résultat soit communiqué.

72
Q

Qu’est-ce qu’un virus nu? Qu’est-ce qu’un virus enveloppé?

A

Enveloppé : Vole une partie de la membrane de l’hôte.

Nu : Ne vole pas une partie de la membrane de l’hôte.

73
Q

Les solutions hydro alcoolisés ciblent davantage quel type de virus?

A

Ceux avec une bicouche lipidique (donc les virus enveloppés).

74
Q

Nommez les 3 enzymes impliqués dans les rétrovrus (ex : VIH) + leurs fonctions

A

Transcriptase inverse : Transcrit l’ARN viral en ADN.
Intégrase : Intègre l’ADN viral à l’ADN de l’hôte.
Protéase : Favorise la maturation des protéines virale.

75
Q

Nommez l’enzyme important des virus influenzae + fonction

A

Neuraminidase : Contribue au relargage des virus hors des cellules –» pourra donc aller infecter d’autres cellules.