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MCB 602 > Actinomycètes > Flashcards

Actinomycètes Flashcards

1
Q

Quels sont les deux groupes principaux d’actinomycètes?

A

Nocardioformes
sporoactinomycètes

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Q

Selon quels principes les actinomycètes peuvent êtres organisés?

A

composition de parois cell (sucres)
caractère morphologique
biologie moléculaire

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Q

Où pouvons-nous les retrouver?

A

sol
compost et fumier
nourriture
eau
bouches et dents, intestins d’insectes
pathogène opportuniste

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4
Q

Par quoi leur distribution est assurée?

A

eau
air
insectes

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5
Q

Quels sont les rôles de actinomycètes dans le sol?

A

-structure le sol
-crée un cycle de carbone et azote (décomposition en minéralisation des plantes et animaux)
-dégrader des substrats (cellulose, lignine, chitine, kératine) par la production d’enzymes
-Produit la géosmine

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6
Q

Pourquoi les actinomycètes sont capable de coloniser les sols sec de la rhizosphère?

A

Parce qu’ils la colonisent sous leur forme mycéliale et produise des antibiotiques au détriment des autres qui ont besoin d’eau pour se déplacer

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7
Q

Que retrouve-t-on dans le fumier et le composte pour eux?
Quels types s’y développent?

A
  1. nutriments organiques en quantité élevée, humidité, aérobie, pH neutre-alcalin
    2, les actinomycètes qui utilisent la matières organiques. Thermophile.
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8
Q

Quels sont leurs impacts dans la nourriture?

A

Décomposition de grains et pâture mal entreposés et exposés à l’humidité. Les spore = allergies et maladies

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9
Q

Quels sont leurs rôles dans l’eau?

A

décompose les hydrocarbure

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10
Q

Ils sont haplo ou diploïdes?

A

haplo

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11
Q

Pourcentage G-C?

A

69-73%

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12
Q

Quel problème le %G-C peut avoir en bio mol?

A

Utilisation des codons différente = problème de spécificité lors des PCR
Complique le design d’amorces

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13
Q

Quels est la forme du chromosome?

A

linéaire

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14
Q

Pourquoi les facteurs de transcriptions sont différents des autres bactéries?

A

utilisation enzymatique des codons est différente

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15
Q

Quels sont les 2 gènes importants dans le dévelopement?

A

bld et whi

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16
Q

Quel est le rôle du gène bld?

A

formation et fonctionnement du mycélium aérien

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17
Q

Quel est le rôle du gène whi?

A

développement des spores matures

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18
Q

À quoi servent leurs plasmides?

A

fertilité et motilité

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19
Q

taille des plasmides?

A

4-100 kb

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20
Q

Comment se fait la conjugaison?

A

par un processus de fusion d’hyphes

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21
Q

Gram?

A

+

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22
Q

Motile?

A

non

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23
Q

composition de la membrane cytoplasmique et paroi cell

A

peptidolycane et polysacc

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24
Q

quels sont les 2 types cellulaires spécialisés?

A

mycélium de substrat
mycélium aérien

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25
Q

Le mycélium peu être coenocytique ou avec septation. Qu’est-ce que la septation et quels sont les 2 types de septums?

A

Septation: paroi trasnversale qui délimite les compartiments ou les spores
Simple paroi interne ou double paroi interne

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26
Q

Décrire le mycélium primaire (de substrat)

A

-tube de germination issu de la spore
-ancré dans le support solide des nutriments
-croissance apicale

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27
Q

Décrire le mycélium aérien

A

-hyphes dressées sur le mycélium primaire
-plus épais et moins ramifié
-pigmenté
-plus riche en ADN
-structure de fonction inconnue (conidiophore)

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28
Q

Pourquoi on doit éviter les agrégats dans le fermenteur?

A

À l’échelle agrégat, il y a plus de stress cellulaire, moins d’O2 et moins de nutriments.
Cause la mort cellulaire ou la production de métabolites secondaires et quorum sensing = perte de contrôle

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29
Q

Cycle de vie

A

p.10

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30
Q

Quels sont les 2 principaux groupes de spores?

A

exospore
endospore

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31
Q

Quelles sont les fonctions des spores?

A

résistances aux conditions environnementales difficile (température, qualité de l’eau, oxygène, nutriments)
Reproduction asexuée

32
Q

De quoi dépend la viabilité des spores?

A

leur nature et l’espèce

33
Q

Comment sont générés les exospores?

A

par la septation d’hyphes existants, puis séparation des éléments obtenus

34
Q

Quels sont les 2 types de sporulation exogène?

A

fragmentation d’hyphes AVEC ou SANS enveloppe

35
Q

Les exospores ont des pigments?

A

oui

36
Q

Quels sont les rôles du tréhalose dans les spores?

A

Résistance et dormance
Fournit l’énergie pour que la spore se développe en hyphes

37
Q

De quelle façon on peut activer un exospore?

A

Heat Shock 5 min à 50 degré

38
Q

Que requiert la germination d’une spore?

A

nutriments exogènes, eau et Ca2+

39
Q

Quel est le problème avec la germination en fermenteur? Pourquoi? Comment on y remédie?

A

Les actinomycètes ne germent pas tous en même temps au cas où les conditions environnementales changeraient rapidement. On y remédie en faisant un heat shock.

40
Q

Pourquoi la viabilité est à prendre en considération?

A

Pour la standardisation de l’inoculum et la conservation de la souche

41
Q

Où sont formés les endospores?

A

Dans le cytoplasme de l’hyphe

42
Q

Par quel type sont produits les endospores?

A

Thermophiles

43
Q

La dormance des endospores est constitutive. Comment peuvent-elles être activés?

A

Choc thermique de 55 degrés, maintenues pendant 48h à 20 degrés pour se développer

44
Q

Quels sont les facteurs contrôlant la sporulation?

A

Les nutriments: plus il y a de nutriments, plus le mycélium est grand. Milieu carencé = mycélium végétatif vers aérien puis spores.
Facteurs externes: carence en nutriments, en O2, eau, température
Facteurs intrinsèques: gènes chromosomiques ou plasmidiques, facteurs de régulation de la sporulation (antibio)

45
Q

Est-ce que Streptomyces sporule bien en culture submergée?

A

Non

46
Q

Comment on peut induire la sporulation de Streptomyces en culture submergée?

A

Induction avec des paramètres nutritionnels (carence d’amoniaque et de phosphate)

47
Q

Quelles sont les différences entre une culture solide et liquide?

A

Différence structurelle et sensibilité au lysozyme (plus élevé pour liquide)

48
Q

Quelles sont les similitudes entre une culture solide et liquide?

A

L’utilisation du tréhalose
protéines
germination

49
Q

Dans les milieux submergés, qu’est-ce qui n’est pas indispensables à la sporulation?

A

La production d’antibio et de protéases
Mais la sporulation influence la production

50
Q

Source de carbone et d’azote?

A

glucose, sucrose, thréalose
acides aminés, protéines, sels

51
Q

Autres sources de nutriments?

A

Hydrocarbures (alcanes et terpènes)
azote non aromatique (nitriles)
composés aromatiques (phénols et stérols)

52
Q

Nommer des métabolites secondaires utiles.

A

antibiotiques
insecticides
herbicides
antiparasitaires
fongicides
substances antitumorales
immunosuppresseurs
hypocholestérolémiants

53
Q

À quoi est associé la production de métabolites secondaires?

A

La différentiation aériennes des hyphes après la croissance

54
Q

Pourquoi le m.o. produit des anitbios?

A

Procure un avantage sélectif.

55
Q

Comment le m.o. se protège de l’antibio produit?

A

Altération de la perméabilité et modification de la cible cellulaire
Rétroinhibition ou dégradation d’enzymes de biosynthèse

56
Q

Quels sont les facteurs de régulation des métabolites secondaires?

A

gènes bld
ppGpp synthase
Trop de phosphate inorganique
facteur A
facteur PI
protéines SARP

57
Q

Gène bld?

A

synthèse des métabolites secondaires

58
Q

ppGpp synthase?

A

influence la transcription des gènes

59
Q

Trop de phosphate inorganique?

A

empêche la synthèse structurelle de plusieurs métabolites secondaires

60
Q

Que permet le facteur A?

A

libère le promoteur de adpA lorsque lié à ArpA. Expression de adpA = active strR qui permet la production de streptomycine

61
Q

facteur PI?

A

déclenche la production d’antifongique

62
Q

protéines SARP?

A

régulent la voies biosynthétiques des métabolites secondaires

63
Q

Combien retrouve-t-on de voies principales pour le métabolisme des substrats carbonés?

A

une demi-douzaine

64
Q

Quel est le premier m.o. qui a produit la chlorotétracycline?

A

Streptomyces aureofaciens

65
Q

À partir de quoi la tétracycline est faite?

A

Glucose → acétyl-coA → malonyl-coA → intermédiaire de TET → TET

66
Q

Quelle est la corrélation entre la production de TET et le catabolisme des sucres?

A

Plus le taux de la glycolyse est bas, plus la production de TET et la voie des VPP augmentent.

67
Q

Selon quels principes les souches sont sélectionnées pour la prod de TET?

A

-Épreuve de diffusion en gélose
-Sélection de souches pour contrer la résistance aux antibios

68
Q

Qu’est-ce que l’épreuve de diffusion en gélose?

A

Sélectionner les souches qui produisent les plus grandes zones d’inhibition sur un tapis bactérien (pcq elles produisent +++ d’antibio)

69
Q

Pourquoi et comment sélectionner des souches pour contrer la résistance aux antibio?

A

On met notre souche sur une gélose + antibio ensemencée de bactéries résistantes à l’antibio.
Si des zones d’inhibitions sont présentes = notre souche produit, exemple, un inhibiteur de b-lactamase :)

70
Q

Pourquoi fait-on une préfermentation lors de la prod de TET?

A

Pour éviter les dérapages lors de la germination des spores. Entraîne moins de perte si tel est le cas.
Permet de rétrécir la phase de latence.
Optimisation de l’effort

71
Q

Combien de temps dur la prod de TET?

A

65h

72
Q

Durant les 6-12h premières heures de TET, qu’est-ce qu’on veut? Quel est LE paramètre important?

A

Produire de la biomasse

Forte présence d’O2

73
Q

Que cause l’excès de phosphate pour la prod de TET?

A

Réprime

74
Q

Quel problème cause l’excès de chlore provenant de la liqueur de maïs?

A

Produit de la chloroTET

75
Q

Comment réduire le chlore dans le milieu?

A

-Résine d’échange d’ions
-Substances halogènes qui inhibe l’incorporation du chlore
-Mieux: Mutant incapable de faire chloroTET

76
Q

Comment obtenir des analogues de tétracycline plus stables chimiquement?

A

Avec un mutant de S. aureofaciens avec un système de méthylation compromis au niveau de la biosynthèse

MCB 602 (9 decks)

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