Brainscape's Knowledge GenomeTM

Browse over 1 million classes created by top students, professors, publishers, and experts.


See full index

Técnicas y herramientas > P4: Diseño de oligos para PCR > Flashcards

P4: Diseño de oligos para PCR Flashcards

1
Q

¿Qué son los nucleótidos?

A

Los monómeros de los ácidos nucleicos

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Menciona los dos tipos de ácidos nucléicos

A
  1. ADN
  2. ARN
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Función de la ADN polimerasa

A

Síntesis de ADN

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Menciona los 3 procesos necesarios para la síntesis de proteínas

A
  1. Replicación
  2. Transcripción
  3. Traducción
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

¿Qué es la replicación del ADN?

A

Proceso por el cual una molécula de ADN doble cadena es copiada para producir dos moléculas de DNA idénticas.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

¿Por qué se dice que la replicación del ADN es un proceso semiconservativo?

A

Porque se conserva una hebra vieja de ADN para sintetizar una nueva

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

¿Dónde se lleva a cabo la replicación del ADN?

A

en el núcleo

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

¿Qué es la transcripción?

A

Proceso por el cual se utiliza como molde una hebra de DNA para sintetizar una molécula de RNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

¿Dónde se lleva a cabo la transcripción?

A

En en núcleo

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

¿Qué es la traducción?

A

Proceso por el cual se utiliza una molécula de RNA para sintetizar una proteína.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

¿Dónde se lleva a cabo la traducción?

A

En citoplasma. Es el único proceso que no ocurre en el núcleo celular.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Menciona los tres componentes de un nucleótido.

A
  1. Base nitrogenada (A, T, G, C U)
  2. Azúcar (desoxirribosa o ribosa)
  3. Grupo fosfato
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

¿A qué se le conoce como nucleósido?

A

base nitrogenada + azúcar

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

¿Qué diferencía al nucleótido del nucleósido?

A

El grupo fosfato (el nucleótido si lo tiene, el nucleósido solo es la base nitrogenada + azúcar)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

¿A qué carbonos nos referimos al decir “prima”?

A

A los carbonos del azúcar (desoxirribosa o ribosa)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

¿Por qué se le llama ‘prima’ a los carbonos del azúcar del nucleótido?

A

Se hace así para evitar confusiones con los de la base nitrogenada.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

¿Qué se encuentra unido al carbono 1 prima del azúcar?

A

la base nitrogenada

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

¿Qué hay en el carbono 2 prima del azúcar?

A

grupo HO (si es ribosa) y H si es desoxirribosa.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

¿Qué se encuentra unido al carbono 5 prima del azúcar?

A

Un grupo fosfato.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

¿Qué son los DNTPs?

A

Nucleótidos que sirven para generar las nuevas cadenas de ADN.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

¿En qué carbono del azúcar se encuentra la gran diferencia entre el ADN y el ARN?

A

En el carbono 2 prima. Ahí se encuentra un OH o H, para ver si es ARN o ADN respectivamente.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

Si tengo un OH en el carbono 2 prima de mi azúcar, ¿qué acido nucléico es?

A

ARN -porque el azúcar es ribosa-

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

Si tengo un H en el carbono 2 prima del azúcar, ¿qué ácido nucléico es?

A

ADN porque es desoxirribosa el azúcar.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

¿Con cuántos puentes de hidrógeno se encuentran unidos la A y T?

A

Dos.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
Q

¿Cuántos puentes de hidrógeno unen a la G y C?

A

Tres puentes de hidrógeno.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
26
Q

¿Cómo se unen las dos hebras de ADN?

A

Por puentes de hidrógeno entre las bases nitrogenadas (2 o 3, depende que bases sean)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
27
Q

¿Cómo se encuentran unidos nucleótido - nucleótido?

A

por enlaces covalentes.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
28
Q

¿Cómo puedes separar las dos hebras de ADN?

A

Subiendo la temperatura. Pues así se rompen los puentes de hidrógeno que unen a las bases nitrogenadas.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
29
Q

¿Cómo se rompen los enlaces covalentes que unen a los nucleótidos?

A

Sólo por enzimas porque las uniones son muy fuertes.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
30
Q

¿Qué es la hibridación in situ?

A

Uso de sondas con fluoróforos para identificación.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
31
Q

¿Qué son las sondas usadas en la hibridación in situ?

A

Secuencia complementaria para el ARNm que queremos poner en evidencia.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
32
Q

¿Qué necesitamos para que un gen se exprese?

A

que se transcriba

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
33
Q

Explica el principio de la electroforesis.

A

Los ácidos nucléicos tienen carga negativa, entonces al aplicar un campo eléctrico van a migrar hacia el polo positivo. Los pequeños migrarán más rápido que los grandes y por eso veremos bandas distintas que corresponden a los pb.

34
Q

V / F
Los ácidos nucléicos tienen la capacidad de absorber luz UV.

A

Verdadero. Es por ello que podemos verlos en el espectrofotómetro.

35
Q

Longitud de onda que los ácidos nucléicos absorben mejor.

A

260 nanómetros.

36
Q

¿Por qué los ácidos nucleicos son capaces de absorber luz UV?

A

Por los anillos de las bases nitrogenadas.

37
Q

¿Cómo puedes saber la pureza de un ácido nucléico con el espectrofotómetro?

A

Dividiendo las densidades ópticas (DO) de la muestra a los 260 nm / 280 nm.

38
Q

¿Qué resultado deberíamos obtener de una muestra pura al dividir DO 260 nm / DO 280 nm?

A
  1. Entre más alejados del 2, más contaminada está nuestra muestra.
39
Q

¿Por qué el resultado 2 indica una buena pureza de un ácido nucléicon en el espetrofotómetro?

A

Porque la absorbancia a 260 nm es casi el doble que a 280 nm.

40
Q

¿En qué dirección se da la síntesis de ADN?

A

Siempre es 5’ — 3’

41
Q

¿Qué enzima se encarga de la síntesis de ADN?

A

ADN polimerasa

42
Q

¿Cómo es la estructura del ADN?

A

Doble cadena en sentidos antiparalelos.

43
Q

Requisitos para sintetizar ADN.

A
  1. ADN polimerasa
  2. Cadena molde
  3. Origenes de replicación
44
Q

¿Qué es un origen de replicación?

A

Sitio donde la ADN polimerasa va a comenzar a sintetizar el ADN.

45
Q

¿Las dos hebras de ADN al replicarlo se sintetizan de manera continua?

A

No, una si es de manera continua pero otra se replica en fragmentos -cada fragmento necesita su primer-

46
Q

Una hebra de ADN se replica en fragmentos, ¿qué enzima se encarga de unirlos?

A

ADN ligasa.

47
Q

¿Qué es un oligo / primer/ sebador?

A

Fragmento de ARN sintetizado por otra enzima que va a indicar el lugar a la ADN polimerasa desde donde va a comenzar a sintetizar.

48
Q

¿En qué dirección se sintetiza el ARN?

A

5’—- 3’

49
Q

¿A qué se le llama amplicón?

A

Fragmento de ADN amplificado por la reacción en cadena de la polimerasa (PCR

50
Q

¿A qué nos referimos con self- dimmers?

A

A que la cadena es capaz de complementarse entre ella, como que se enrolla sobre sí misma.

51
Q

¿Qué es un primer?

A

Molécula de ácido nucléico con una alta afinidad por un blanco específico.

52
Q

¿Cuál es el tamaño ideal que debe tener un oligo?

A

18 a 24 pb.

53
Q

V / F

Los oligos deben tener T de fusión similar.

A

Verdadero.
Deben tener máximo 1°C de diferencia.

54
Q

¿Qué fórmula se utiliza para calcular la T de fusión de los oligos?

A

Fórmula de Wallace.

55
Q

Utilidad de la Fórmula de Wallace.

A

Cálculo de la Tm de los oligos.

56
Q

¿Qué toma en cuenta la fórmula de Wallace para calcular la Tm de un oligo?

A

La cantidad de A + T y las G + C.

57
Q

¿Cuál es la T de fusión aproximada que deben tener los oligos?

A

~ 60 °C

58
Q

Los oligos deben ser _______, es decir, que tengan una secuencia única en el molde de ADN que se requiere amplificar.

A

especificos

59
Q

¿A qué nos referimos con complementariedad de los oligos?

A

Capacidad que tengan para formar homodímeros, heterodímeros o hairspines.

60
Q

¿Cuándo se forma un heterodimero?

A

Cuando un oligo sentido se une con antisentido

61
Q

¿Cuándo se forma un homodimero?

A

Cuando un oligo sentido se une con otro sentido. O un antisentido con otro antisentido.

62
Q

¿Cuándo se dice que el oligo forma un hairspin?

A

Cuando se plieg asobre sí mismo.

63
Q

¿Qué porcentaje de G/C debe tener un oligo?

A

45% al 55% para que haya distribución homogénea de las bases, porque eso influye en la Tm.

64
Q

V / F

En el diseño de oligos se debe incluir mínimo un residuo de G o C en las últimas 5 bases de ambos extremos.

A

Verdadero. Pero cuando mucho que sean 2.
Se hace con el fin de dar estabilidad.

65
Q

¿Por qué es necesario incluir al mneos un residuo de G o C en las últimas 5 bases de los extremos de los oligos?

A

para dar estabilidad

66
Q

¿Cuántos oligos son necesarios para la replicación del ADN?

A

Mínimo dos: uno forward y otro reverse.

67
Q

¿Cómo se diseña el oligo sentido?

A

Transcribiendo la secuencia 5’ — 3’directamente.

68
Q

¿A qué hebra se pega el oligo sentido?

A

A la complementaria

69
Q

¿Cómo se diseña el oligo reverse?

A

Escribiendo la cadena complementaria de la hebra original, despues invertir el sentido.

70
Q

¿A qué hebra de ADN se pega el oligo reverse?

A

a la hebra original.

71
Q

Entre _______ sean los amplicones, más eficientes serán las amplificaciones

A

menor (tamaño)

72
Q

¿En que nos podemos basar para ver si un oligo es buena opción?

A

en su Tm, entre mayor sea

73
Q

6 requisitos para diseñar un oligo.

A
  1. Tamaño entre 18-24 pb-
  2. T de fusión entre 55 - 58 °C.
  3. Especificidad
  4. Formación de estructuras secundarias.
  5. 45 - 55% de G/C
  6. Extremos con G o C
74
Q

¿Qué importancia tiene evitar la formación de dímeros de oligos?

A

Evitar que puedan competir con la amplificación del producto deseado.

75
Q

¿Cómo se le llama a cuando el oligo se une a su secuencia complementaria?

A

hibridación in situ :)

76
Q

¿Cuánta diferencia de bases debe haber máximo entre los dos oligos?

A

Máximo 3 bases de diferencia.

77
Q

El tamaño del oligo es _______ a la eficiencia de hibridación.

A

Proporcional.

Entre más grande sea el oligo, mas ineficiente será la reacción.

78
Q

¿A qué nos referimos con que un oligo debe ser específico?

A

A que debemos elegir oligos que tengan una secuencia única en el molde de ADN que queremos amplificar.

79
Q

¿Por qué no debe haber sitios ricos en A / T en el oligo?

A

Porque son inestables y pueden hacer menor la eficiencia de amplificación.

80
Q

¿Qué cadena se usa como molde para la replicación?

A

La cadena original (codificante)

81
Q

Importancia del MgCl2 en la PCR

A

Es un cofactor necesario para la actividad enzimática de las DNA polimerasas

Técnicas y herramientas (9 decks)

Brainscape helps you reach your goals faster, through stronger study habits.
© 2024 Bold Learning Solutions. Terms and Conditions