chapitre 12 Flashcards

1
Q

Que découvre Friedrich Miescher(biologiste suisse) en 1869

A

Il découvre dans le noyau de cellules une substance inconnue riche en azote et en phosphore qu’il baptise “nucléine”

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

il existe acide nucléique correspond à deux types de polymères linéaires constitués de nuclétoides, lesquels?

A

ADN et ARN

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

acides nucléiques sont composés de

A

unités de construction: nucléosides et nucléotides

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Quels acides nucléiques sont des médiateurs chimiques

A

Nucléoside (adénosine) et nucléotide (AMPc)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

quel acide nucléique Source d’énergie

A

Nucléotides

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

quels acides nucléiques jouent un rôle de cofacteur dans les réactions enzymatiques

A

Nucléotides et dinucléotides

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Quels acides nucléques jouent rôle catalytique à la manière d’enzymes

A

ribozymes (ex: une des espèces d’ARN dans le ribosome)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

quel acide nucléique joue le rôle de gardienne des caractères héréditaires

A

ADN

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

quel acide nucléique joue le rôle dans l’expression des caractères héréditaires

A

ARN

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

que sont les nucléotides par rapport au nucléosides

A

les nucléotides sont des esters phosphoriques de nucléosides (on les appelle “Nucléosides phosphate”

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

nucléoside formé de quoi et lié par quoi

A

formé d’une base azotée et d’une ose
lié par un lien B-N-glycosidique

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

dans les acides nucléiques, l’ose est sous forme…

A

furanose et toujours de la configuration anomériques B

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

ADN et ARN diffèrent au niveau de…

A

l’ose (ribose ou désoxyribose)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

les ribonucléotides sont les unités de construction des

A

acides ribonucléiques (ARN)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

les désoxyribonucléotides sont les monomères

A

acides désoxyribonucléiques (ADN)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

les bases azotées sont des molécules…

A

hétérocyclique (cycles composés d’atomes de carbone et d’azote)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

une purine est formée de quoi?

A

fusion d’un cycle pyrimidine et d’un cycle imidazole

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

existent-il plus de 5 bases azotées?

A

oui, il existe les “bases rares” ou les “bases mineures” retrouvé parfois dans l’ADN, mais surtout dans l’ARN (formé par modifications chimiques ex: la méthylation)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

quels sont la propriétés des bases azotées?

A

-bases faibles (accepte protons en milieu acide) (pas chargée à pH physiologique)
-structures planes
-insolubles dans l’eau
-forment des liens hydrogène
-absorbent les UV à 620 nm (bases azotés = molécules aromatiques)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

liaison B-N-glycosidique entre..

A

C1 (carbone anomérique de l’ose) et la base azotée

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

dans les nucléosides et leurs dérives.es, le nombre prime (ex: 4’) fait référence à

A

la position des Carbones de l’ose

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

la liaison glycosidique est de quel type selon si c’est une purine ou une pyrimidine

A

Pyrimidine: N1
Purine: N9

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

nucléosides ou bases azotée qui est le plus solubles dans l’eau?

A

nucléosides parce que les groupements hydroxyles de l’ose augmentent la solubilité de la molécule

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

Nomenclature:base azotée vs nucléoside
adénine

A

adénosine

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
Q

Nomenclature ARN:base azotée vs nucléoside
guanine

A

guanosine

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
26
Q

Nomenclature ARN:base azotée vs nucléoside
cytosine

A

cytidine

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
27
Q

Nomenclature ARN:base azotée vs nucléoside
uracil

A

uridine

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
28
Q

Nomenclature ARN:base azotée vs nucléoside
thymine

A

thymidine

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
29
Q

Nomenclature: Nucléoside: cytidine en ADN

A

désoxycytidine

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
30
Q

liens esters phosphoriques se forment entre quoi

A

entre l’acide phosphorique et l’un des groupements hydroxyde de l’ose

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
31
Q

le ribose peut être phosphorylé en positions …

A

2’, 3’ et 5’

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
32
Q

le désoxyribose peut être phosphorylé en positions …

A

3’ et 5’ (la position 2’ ne portent plus de gr, hydroxyle

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
33
Q

Vrai ou faux: pour les nucléotides libres, les liens phosphoester en 5’ dominent

A

Vrai

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
34
Q

AMPc est un ribose ou un désoxyribose

A

ribose

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
35
Q

quel composé a le même groupement phosphate forme 2 liens esters phosphoriques avec 2 hydroxyles d’un même nucléotides

A

AMPc en est un exemple (même gr. phosphate est liés au gr. hydroxyde en 3’ et en 5’ de l’ose

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
36
Q

les gr. phosphate d’un nucléotide sont liés entre eux par des liens…. (nommer leur particularité)

A

anhydride phosphorique (très riche en énergie)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
37
Q

nucléotide est nommé selon…

A

le nucléoside dont il dérive, suivi de la position phosphorylée et du nombre de groupement phosphate.
(ex: adénosine 5’-monophosphate)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
38
Q

que veut dire NMP, NDP, NTP

A

N= nucléotides (peu importe la base qu’il contient)
le N peut être remplacé par la première lettre de la base lorsque l’on veut être plus spécifique (AMP = adénosine monophosphate)
dAMP en présence d’un désoryribonuclétide

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
39
Q

Caractéristiques des nucléotides

A

-soluble dans l’eau (contiennent plusieurs gr. ioniques et polaires)
-à cause des bases azotées (absorption des UV)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
39
Q

Caractéristiques des nucléotides

A

-soluble dans l’eau (contiennent plusieurs gr. ioniques et polaires)
-à cause des bases azotées (absorption des UV)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
40
Q

combien de nucléotide dans un oligonucléotide

A

entre 10 et 50

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
41
Q

combien de nucléotides dans un polynucléotide

A

plus de 50

42
Q

lien entre les dinucléotides

A

lien entre les positions 5’ de chaque ose

43
Q

comment sont lié les polynucléotides

A

liaisons phosphodiester 3’ - 5’

44
Q

que cré la formation de plusieurs liens phosphodiesters successifs?

A

résulte un polymère linéaire

45
Q

nucléoside, nucléotides à l’état libre ainsi que les dinucléotides et leurs dérivés remplissent des rôles de

A

coenzyme**
médiateur chimique
source d’énergie

46
Q

différence entre le NAD+ et le NADP+

A

le groupement hydroxyde à la position 2’ de l’AMP n’est pas phosphoré dans le NAD+, alors qu’il l’est dans le NADP+.

47
Q

charge nette duNAD+ et du NADP+ est comment

A

négative

48
Q

que veut dire le + dans NAD+ et NADP+

A

charge locale de la base rare nicotinamide

49
Q

les formes oxydées de NAD et NADP peuvent accepter

A

2 électrons et un proton supplémentaire sur la base nicotinamide (les formules réduites résultantes sont appelées NADH et NADPH

50
Q

de quoi est formé la coenzyme A

A

-nucléotide (3’-phosphoadénosine diphosphate)
-panthoténate
-2-mercaptoéthylamine

51
Q

comment obtient-on un groupement acyle?

A

groupement fonctionnel obtenu en enlevant l’hydroxyde d’un acide carboxylique, comme une acide gras.

52
Q

quels sont les 2 médiateurs chimiques et leur rôles

A

-AMPc (second messager intracellulaire)

-adénosine (nucléoside qui agit comme hormone dans la régulation du sommeil)

si le niveau d’adénosine augmente, le sommeil se fait ressentir
caféine bloque les récepteurs neuronaux de l’adénosine

53
Q

combien de lien anhydride phosphate dans l’ATP

A

2

54
Q

Comment les NTP (ATP) stockent l’énergie

A

sous forme de liaison covalence

55
Q

est-ce que l’ADN est toujours le support d’information génétique?

A

non, parfois chez certains virus, c’est ARN qui joue ce rôle

56
Q

ADN dans quoi chez les eucaryotes?

A

dans le noyau,
mitochondries
chloroplaste

57
Q

Vrai ou faux: ADN correspond au jeu haploïde des chromosomes chez les organismes diploïdes

A

vrai

58
Q

Quels ADN comprend le génome eucaryote

A

seulement l’ADN du noyau
pas l’ADNmitochondrial et ADNchloroplastique

59
Q

vrai ou faux: le génome de toutes les cellules est composé d’ADN double brin

A

vrai,
ceux de certains virus sont composés d’ARN

60
Q

la structure hélicoïdale de l’ADN présente une petit et grand sillon à la surface

A

vrai

61
Q

les bases azotées sont liés par quel type de lien

A

liaison hydrogène

62
Q

taille du génome chez les virus vs chez les eucaryotes (EN GÉNÉRAL)

A

virus: quelques milliers (kb)
eucaryotes: plusieurs centaines de milliers Mb (10^6)

63
Q

taille du génome Escherichia coli

A

4,6 Mb

64
Q

taille du génome humain

A

3 200 Mb (10^6)

65
Q

vrai ou faux: la taille du génome n’est pas nécessairement proportionnelle à la complexité d’un organisme

A

vrai (plante harbacée Paris Japonica) a un génome qui est près de 50 fois celui du génome humain

66
Q

DÉNATURATION (bris de quel liens)
et comment est-elle provoquée?

A

-liens H et interactions hydrophobes
-peut être provoquée in vitro

67
Q

quels agents utilisé pour séparer les brins (dénaturation)

A

chaleur
pH élevé
agent chaotropique (urée)

68
Q

c’est quoi l’effet hyperchrome ou l’hyperchromicité?

A

lorsque la température de la solution d’ADN est augmentée jusqu’au point d’ébullition, l’absorbance augmente fortement. (courbe sigmoïde = courbe de fusion montre que la dénaturation est un processus hautement coopératif)

bases de ADN double brin absorbent environ 40% moins de UV que les bases de ADN simple. Empilement des bases à l’intérieur de la double hélice diminue leur capacité à absorber des UV

69
Q

intérieur de la doucle hélice est hydrophobe ou hydrophile

A

hydrophobe (base azotée à l’intérieur)

70
Q

lien H à l’intérieur de la double hélice sont plus stables que ceux en milieu aqueu, pourquoi?

A

ils sont à l’intérieur de la zone hydrophobe (plus d’énergie est nécessaire pour briser le lien entre les premières bases puisque la structure est stable) un fois brisée, l’intérieur est plus accessible aux molécules d’eau, ce qui facilite la rupture des liens adjacents.

71
Q

Tm correspond à quoi?

A

température de fusion (elle correspond à la moitié de l’augmentation d’absorbante observée) ou temp pour laquelle 50% de l’ADN est dénaturé

72
Q

effet d’un nombre élevé de G et C sur la température de fusion Tm?

A

température de fusion est plus élevée à cause des nombreux liens H

73
Q

est-ce que les brins d’ADN se séparent complètement dans les cellules

A

non, jamais complètement (ADN en ARN = séparation locale des brins ou dénaturation locale)

74
Q

vrai ou faux: plus facile de séparé les brins plus riches en C et G qu’en A et T

A

Faux

75
Q

possible de renaturer brin qui a été complètement dénaturé?

A

Oui, refroidissement LENT
(trop vite= structure désordonné et non spécifique)

76
Q

c’est quoi le dogme central?

A

il décrit le flux de l’information génétique dans la cellule (ADN-ARN-Protéine)

77
Q

dans le code génétique, il y a des triplets de nucléotides appelés

A

codons

78
Q

le code génétique est universel, sauf de rares exceptions

A

vrai, le même pour tous les êtres vivants et les virus

79
Q

combien de codons possibles

A

64 (4x4x4), 61 spécifient les 20 aa standards ou protéogéniques

80
Q

pourquoi dit-on que le code génétique est dégénéré?

A

puisque plus d’un codon peuvent coder pour le même acide aminé

81
Q

synonyme de codon STOP?

A

codon de terminaison ou codon de non-sens

82
Q

différence de taille entre ARN et ADN

A

ARN est beaucoup plus courte (quelques dizaines à quelques milliers de nucléotides)

83
Q

% des 3 types d’ARN

A

ARNr 80%
ARNt 15%
ARNm 3%

84
Q

ribosome composé de quoi

A

ARNr + protéine (complexes nucléoprotéiques)

85
Q

ARNr avec une activité catalytique se nomme?

A

ribozyme

86
Q

Où sont les ribosomes?

A

dans le cytosol

87
Q

ARNt font quoi?

A

interprètent le code génétique, se lient au aa et les acheminent aux ARNm localisé sur les ribosomes

88
Q

comment se nomment les ARNt différents qui peuvent porter le même acide aminé

A

ARNt isoaccepteurs

89
Q

2%= petit ARNs c’est quoi?

A

groupe hétérogène comprenant plusieurs types d’ARN (ARNsno, ARNmicro, ARNsi, ARNpi)
ils ne sont pas codants

90
Q

quel ARN est codant

A

seulement ARNm est traduit en protéines

91
Q

roles des ARNs

A

-modification et maturation d’autres ARN
-régulation de l’expression génétique
-role de défense (protège les cellules contre les infections virales)

92
Q

qui a résout la structure secondaire hélicoïdale de l’ADN?

A

Francis Crick et James Watson en 1962, prix Nobel de médecine (avec Rosalind Franklin= auteure diffraction rayons X

93
Q

extrémité 5’ se lie avec

A

l’extrémité 3’-OH de l’autre brin

94
Q

quel ADN correspond au modèle Watson et Crick

A

ADN-B

95
Q

empilement des bases planes le plus près possible stabiliser par quoi?

A

forces de Van derWalls sont maximales (bases inaccessible aux molécules d’eau)

96
Q

liens H où?

A

entre les bases
entre le squelette sucres-phosphateset le milieu aqueux (assure solubilité de l’ADN)

97
Q

charges négatives des phosphate sont neutralisé par

A

interaction ionique avec des ions magnésium en solution (permet d’éviter la répulsion)

98
Q

les liens anhydride phosphorique sont quel type de lien?

A

covalent (les NTP (nucléoside triphosphate) stocké l’énergiesous forme de lien covalent)

99
Q

est-ce que c’est toujours l’ADN qui est le support de l’information génétique?

A

non, ARN chez certains virus

100
Q

vrai ou faux: les séquences d’ARN ne sont jamais produites à partir d’une matrice protéique

A

vrai

101
Q

est-ce que l’ARN peut avoir des régions hélicoïdales?

A

oui, cela confère une structure 3D précise à certains types d’ARN. ces régions en double hélice se forment à l’aide de liaisons H intracaténaires

102
Q

comment se nomme les ARNt qui portent le même acide aminé.

A

ARNt isoaccepteurs

103
Q

Pour les polynucléotides de 3 résidus et plus: les résidus sont réunis par des liaisons phosphodiester 3’ - 5.

MAIS, pour plusieurs dinucléotides,

A

le lien est de type 5’-5’. C’est le cas du dinucléotide le plus important dans le métabolisme (le NAD). Vous pouvez d’ailleurs voir la structure du NAD dans la capsule 12.2 diapositive 6.