Isolasi DNA Flashcards

1
Q

DNA yang merupakan material genetik terdiri dari molekul … berupa gula
…, basa nitrogen berupa … yang
dihubungkan oleh gugus … menjadi rantai …

A

nukleotida, pentosa (deoxyribose), adenin, timin, guanin dan sitosin, fosfat, polinukleotida

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Struktur DNA yang merupakan rangkaian
nukleotida memberikan implikasi pada sifat kimia DNA yang akan bermuatan … pada pH
netral seperti yang umumnya ada di dalam sel, sehingga dengan mudah dapat
… dari komponen sel yang lain

A

negatif, dipisahkan/diisolasi DNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Prinsip dalam isolasi DNA adalah … DNA dari
bagian-bagian sel yang lain

A

memisahkan

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Pada isolasi DNA Melisis sel dengan … bertujuan mengeluarkan material DNA dari sel

A

larutan buffer

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Pada isolasi DNA memisahkan molekul DNA dari … dengan …

A

debris sel, sentrifugasi

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Teknik elektroforesis gel digunakan untuk …. Media yang digunakan untuk memisahkan umumnya adalah … Konsentrasi gel yang dipakai
biasanya kisaran …

A

memisahkan fragmen DNA berdasarkan
ukuran fragmen, gel agarosa, 0.8-1%.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Teknik elektroforesis didasarkan pada kemampuan molekul DNA untuk bergerak pada media agarose
bermedan listrik dari kutub … ke kutub ….

A

negatif, positif

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Fragmen yang berukuran kecil akan bergerak lebih … dan lebih … dari kutub …

A

awal, jauh, negatif

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Teknik PCR adalah suatu teknik yang digunakan untuk … secara …

A

memperbanyak fragmen DNA, in vitro

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Teknik ini ditemukan oleh … pada tahun 1983. Dalam teknik ini
digunakan beberapa tahapan yaitu …

A

Kary Mullis, Denaturasi, annealing, ekstension

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Pada praktikum isolasi DNA akan diisolasi DNA yang berasal dari …
dengan metode cepat, yaitu dengan memisahkan isi sel
berupa protein, DNA, RNA, lemak, ribosom dan molekul-molekul kecil lainnya.

A

bawang bombay

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Selanjutnya
DNA akan diendapkan dari larutan suspensi sel menggunakan …

A

alkohol

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Fenomena sel mana yang ditiru oleh Teknik PCR

A

replikasi pada DNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Utas DNA mana dari template DNA yang diamplifikasi

A

sequence DNA target

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Fungsi Primer pada PCR

A

awalan sintesis DNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Apa fungsi enzim DNA polimerase

A

enzim yang melakukan katalisis reaksi
sintesis rantai DNA

17
Q

Pada suhu berapa utas DNA bisa terpisah, dan pada suhu berapa utas DNA bisa
disintesis

A

Denaturasi 95 C, Sintesis Ekstension 75 C

18
Q

Rumus molekul DNA yang terbentuk dari satu molekul DNA yang diamplifikasi
dengan PCR setelah n siklus

A

Y = (2^n – 2n)X

19
Q

Kondisi PCR seperti apa dari simulasi yang anda kerjakan yang menghasilkan produk
paling optimum

A

jumlah siklus 35, dengan suhu denaturasi 94oC, suhu annealing 56oC, suhu
ekstensi 72oC, jumlah plasmid 100 ng, dNTP 0,5 μL, jenis DNA polymerase taq,
polymerase 1 μL, serta dalam waktu (30, 30, 60).

20
Q

Proses PCR dilakukan dalam
suatu mesin … yang bisa diatur perubahan … secara bersiklus.

A

thermocycle, suhunya

21
Q

pemisahan utas DNA satu sama lain. Suhu yang tinggi menyebabkan ikatan
hidrogen terputus sehingga terjadi pemisahan utas ganda DNA menjadi dua utas tunggal.

A

Denaturasi

22
Q

penempelan primer oligonukleotida pada bagian DNA yang sekuennya
homolog.

A

Annealing

23
Q

pembentukan utas DNA baru berdasarkan template DNA dari tiap utas.

A

Ekstension

24
Q

Visualisasi DNA di gel
Fungsi penambahan pewarna (loading dye): sebagai … DNA dan … DNA
pada gel.

DNA akan mengikat pewarna, misalnya … yang menangkap …

A

pemberat, tanda migrasi, Etidium bromida (EtBr), UV

25
Q

Faktor-faktor yang mempengaruhi laju migrasi DNA (3)

A

Ukuran DNA, Kerapatan gel, Kekuatan arus listrik

26
Q

Ukuran DNA -> semakin … DNA akan semakin … bermigrasi

A

kecil, cepat

27
Q

Kerapatan gel -> semakin … gel (semakin … pori-porinya) DNA akan
semakin … bermigrasi (membutuhkan waktu elektroforesis yang lebih …)

A

rapat, kecil, lambat, lama

28
Q

Kekuatan arus listrik yang dialirkan -> semakin … arus, DNA dapat
semakin … bermigrasi (waktu elektroforesis bisa lebih …)

A

tinggi, cepat, singkat

29
Q

Bila DNA akan disimpan, maka setelah DNA diambil lalu dikeringanginkan selanjutnya
dimasukkan ke dalam … dan ditambahkan …

A

microtube, ddH2O