ביותא ב Flashcards
במה דומה ובמה שונה הפרוקסיזום מהמיטוכונדריה והכלורופלסט?
דמיון- עושה תהליכי חמצון רבים, יודע לשכפל את עצמו
שוני- ממברנה אחת ולא 2, חסם גנום עצמאי וריבוזומים
מהיכן נובע שמו של הפרוקסיזום?
מהתהליכים אותם הוא מקיים- שימוש בחמצן אטמוספרי כדי לחמצן תרכובות אורגניות, כשהתוצר הוא בין היתר מי חמצן (פרוקסיד)- מייצר מי חמצן באופן אינטנסיב
מהו האנזים אוראט אוקסידאז?
נמצא בפרוקסיזום, עושה שימוש בחומצה אורית שממנה נקבל פרוטון ואוראט. הפרוקסיזום יחמצן אותה שוב על יגי אורט אוקסידאז וכך נפטר מעודפי חמצן.
מה תפקידו של האנזים קטלאז ?
מנצל את מי החמצן בטכניקה שנקראית פראוקסידציה כדי לחמצן סובסטרטים כמו חומצה פומרית, פורמאלדהיד ואלכוהול.
חשוב בכליה שם מחמצנים ולקולות רעיליות כך שלא יגיעו לדם- כמו חמצון אלכוהול לפורמאלדהיד.
בנוסף- כשיש הרבה מי חמצן האנזים הופך מי חמצן למים- לוקח עוד שני פרוטונים ממולקולה אורגנית והופך את המי חמצן למים
אילו תהליכים מתקיימים בפרוקסיזום?
א.פרוקסידציה- שימוש במולקולה אורגנית וחמצן ליצירת מי חמצן.
ב. חמצון בטא- ביונקים גם במיטו’ וגם בפרוקסיזום- בפרוקסיזום חש מסועפות וארוכות, בשמרים וצמחים חמצון הבטא קורה רק בפרוקסיזום.
ג. הריאקציה הראשונה של יצירת פלזמלוגן שהוא פוספוליפיד בנפוץ במיאלין. לכן נזקים בפרוקסיזום יובילו לנזקים נוירולוגיים חמורים.
ד. סילוק מי חמצן כשהם מצטברים בפרוקסיזום- הפיכתם לחמצן אטמוספרי ומים.
ה. חמצון אלפא
מהו מבנה הפלזמלוגן? מהו ריכוזו במיאלין?
מהווה 90 אחוזים מהפוספוליפידים במיאלין
מבנהו: ראש פולרי אתנול אמין, פוספט (כי הוא פוספוליפיד) וקשר אתרי דרכו מחובר שומן כוהלי (ולא חש!)
חסר מטען
מה מקור הממברנה של הפרוקסיזום?
או מהנצה של הפרוקסיזום ל2, או מהאי אר.
מהו הגליאוקסוזום?
פרוקסיזום מומחה בצמחים שמקיים את מעגל הגליאוקסילט- נמצא בזרעי צמחים וממיר אצטיל קו איי לסוכר. 2 אצטיל קו איי מתחברים ליצירת סוקסינט, שיוצא לציטוזול ומשמש לבנית גלוקוז.
כיצד חלבונים מגיעים אל הפרוקסיזום?
מהציטוזול:
מכילים סיגנל של 3 חא בקצה הקרבוקסילי- סיגנל סרין ליזין לאוצין. לחלקם יש רצף בקצה האמיני אך מדובר במקרה פחות נפוץ.
תהליך הכניסה עצמו מתווך עי פרוקסינים ואייטיפי. 6 פרוקסינים על ממברנת הפרוקסיזום מאפשרים כניסת קומפלקסים אוליגומרים תוך שמירה על המבנה המרחבי שלהם.
שימוש בסיגנל סי טרמינאלי- חלבון פקס 5 מזהה את הסיגנל בחלבון בקצה הקרבוקסילי שמתורגם בציטוזול, ומלווה אותו לפרוקסיזום. פקס 7 מזהה את הסיגנל בציטוזול מהקצה האמיני הפחות נפוץ.
החלבונים קודם יתקפלו למבנה התפקודי שלהם ואז יעברו לציטוזול. פקס 5 יתעגן לממברנת הפרוקסיזום בעזרת חלבוני פקס נוספים שנמצאים על הממברנה. פקס 5 נדחק לממברנה ומשחרר לתוך הלומן את החלבון הפרוקסיזומלי.
כדי למחזר את רצפטור פקס 5, פקס 4 מגיע עם יוביקוויטין עליו ומעביר אותו לפקס 5 שמעוגן לממברנה. פקס 1 ו6 יעזרו לחלץ את הפקס עם היוביקוויטילציה עליו מהממברנה
מהאיאר:
פקס 3 מתעגן לממברנת האיאר, בעזרת חלבון סק 61.
ביחד עם פקס 3 ו15 הוזיקולה שעתידה להתאחות אל הפרוקסיזום מניצה וזאת יחד עם פקס 19 הציטוזולי.
וזיקולות הפרקורסר של הפרוקסיזום מתאחות אחת לשניה או לפרוקסיזומים קיימים.
מה היא זלווגר סינדרום?
מחלה מולדת בה יש פגיעה קשה בשלמות הפרוקסיזום או בהעברת חלבונים אליו.
למשל מוטציה בפקס 5 תגרום לפרוקסיזום ריק. פגיעה בפקס 7 שהוא מזהה את הקצה האמיני תוביל למחלה קלה. האיברים שנפגעים הם המוח, הכליות, והכבד. ימותו זמן קצר לאחר הלידה
איך נקרא פנים האיאר?
ציסטרנל ספייס
ER מה תפקידיו של ה?
א. בעל תפקיד מרכזי בביוסינתזה של ליפידים וחלבונים
ב. אתר מרכזי לאגירת סידן.
ג. האתר המרכזי לביוסינתזה של כלל החלבונים חוצי הממברנה (עם יוצא דופן שהוא חלבוני ממברנת המיטו’) ושל כמעט כל הליפידים שמרכיבים את הממברנוץ של האברונים בתא.
ד. מייצר את מרבית הליפידים עבור מיטוכונדריה ופרוקסיזום.
ה. כלל החלבונים שצריכים להיות במערכת החיצונית- גולג’י, איאר, ליזוזום/אנדוזו וממברנת התא לשכבה החוץ תאית מיוצרים אל חלל האיאר.
באילו סוגי תאים נמצא אי אר חלק גדול יחסית?
תאים המתמחים במטבוליזם של ליפידים, כולסטרול או הורמונים סטרואידים- באיאר החלק הם יהיו את מרבית האנזימים שמעורבים בסינתזת כולסטרול/סטרואידים.
בתאי כבד- באיאר החלק הם מרכיבים את רכיבי הליפופרוטאינים- כאשר האנזימים שבעיקר אחראיים ליצירת המרכיב הליפידי נמצאים על ממברנת האיאר.
בתאי הכבד בממברנת האיאר החלק יש גם אנזימים שאחראיים על דה טוקסיפיקציה של תרכובות אורגניות ותרופות, ביניהם סיפ450 שהופכים תרכובות אורגניות למסיסות במים כדי להפרישן בשתן.
האם ישנה תמיד הפרדה מוחלטת בין החלק למחוספס?
לא
ישנם איזורים שהם גם וגם
כיצד מפרקים את האיאר לצורך מחקר?
הומוגנציה של תאים- עי כוח מכני.
שברי האיאר יתארגנו לוזיקולות שחלקן חלקות וחלקן מחוספסות- נקראות מיקרוזומים.
מיקרוזומים אלו שומרים על תכונות האיאר ומקיימים אותם תהליכים. לאחר ההומוגנציה קל להפריד את המיקרוזומים- על ידי סנדימנטציה בגרדיאנט של סוכרוז נפריד בין חלק למחוספס על ידי צנטריפוגה- כשהחלק יצוף והמחוספס ישקע.
מה הסיגנל סיקוונס אל האיאר?
עשרים חא, מתוכן לפחות 8 הידרופוביות, ממוקם בקצה האמיני של החלבון.
ממה מורכב החלקיק SRP?
תת יחידות חלבוניות- 6, ומולקולת רנא קטנה.
החלקיק היונקי הוא בעל מבנה דמוי מתג
כיצד חלקיק אסארפי יכול להקשר למגוון רחב של סיגנלים?
בזכות הכיס ההידרופובי של חלקיק האסארפי שנוצר ממס חא מתיונין.
מתיונין בעלת שייר אר לא מסועף אבל גמיש- מקנה לכיס פלסטיות רבה בנוגע לזיהוי הסיגנל בתנאי שהוא הידרופובי.
היכן נוצר הSRP?
בגרעינון- שם קורת ההרכבה בין הרנא לחלבונים
SRP מה מנגנון הפעולה של?
חלבון מתחיל להתרגם בציטוזול- מתרגם את רצף הסיגנל- החלקיק מזהה את הסיגנל וקושר אותו תוך שהוא עוטף את הריבוזום וחוסם את אתר הקישור לפקטורי האלונגציה- כך שהתרגום נעצר. החלקיק נושא את הריבוזום שנעצר בו השעתוק אל ממברנת האיאר, שם הוא פוגש ברצפטור שקושר אסארפי ומאפשר לחלבון להגיע לטראנסלוקטור. הידרוליזה של ג’יטיפי על האסארפי והרצפטור שלו, תגרום לפתיחת הטרנסלוקטור והחדרת הסיגנל אליו תוך שיחרור החלקיק שיעבור מיחזור ויוכל ללכת לקשור חלבון אחר
לאן תלך מולקולת המרנא לאחר תרגומה אל הלומן של האיאר?
היא תשאר בסמוך לממברנה כי באאוקריוטים ישנו פוליזום שכל הזמן ימשיך לתרגם אותה אל האי אר
מהו המבנה ואופן הפעולה של תעלת הטראנסלוקייטור באיאר?
ראשית, קומפלקס הטרנסלוקייטור פלוס החלבונים שלה באאוקריה נקרא טרנסלוקון
הליבה של הטראנסלוקייטור זה חלבון סק61 שמורכב מ3 תת יחידות- אלפא בטא וגמא שהן מאוד שמורות באבולוציה.
לתעלה יש פלאג- שזה כמו פקק שחוסם אותה לכל זמן שבו אין פפטיד שצריך לעבור דרכה. הפלאג הוא מבנה אלפא הליקס עם חא הידרופוביות. כדי שיפתח צריך שינוי במבנה המרחבי שמושג הודות להידרוליזת ג’יטיפי על האסארפי והרצפטור שלו.
מבנה הטרסלוקייטור מאפשר גם אינט של הפפטטיד עם הממברנה מהצד.
חיתוך סיגנל הפפטיד עי סיגנל פפטידז מאפשר לסיגנל להפלט אל הממברנה ולהיות מפורק עי פרוטאזות.
כיצד מועברים חלבונים פוסט טרנזליישן אל האיאר?
לאחר תרגום החלבונים בציטוזול הם מוחזקים על ידי צפרונים כדי שלא יתקפלו. חלבון שהוא אייטיפיאז והומולוגי להייצ’אספי 70 נקרא ביפ. ביפ נמצא מהצד של הלומן של האיאר, ומושך את החלבון פנימה תוך היצמדות אליו כשהוא מבצבץ מהטראנסלוקון והשינוי במבנה המרחבי ופעולת המשיכה נעשית הודות להידרוליזה של אייטיפי.
תעלת הטרנסלוקון שממנה עובר החלבון בפוסט טרנזליישן נעזרת בחלבונים סק 62,63,71,72
איזה מנגנון חיידקי דומה לפוסט טרנזליישן שמתבצע באיאר?
הפרשת חלבונים החוצה מהתא לאחר שתורגמו לחלוטין בציטוזול.
החיידקים משתמשים בחלבון סק איי, שהוא אייטיפיאז ונמצא בציטוזול. הידרוליזת אייטיפי גורמת לסק איי לדחוף חתיכה של הפפטיד לתעלה- הפוך מביפ, התעלה הומולוגית לסק 61 ונקראת סק וואי.
איזה מנגנון מונע מחלבונים שאינם רצויים לעבור תרגום אל האי אר?
הזיהוי הכפול- בתחילה זיהוי הסיגנל עי האסאר פי ולאחר מכן זיהוי עי תעלת הטרנסלוקון.
כיצד פועל מנגנון אינטגרציה של חלבונים חוצי ממברנה פעם אחת אל ממברנת האיאר?
מדובר בקו טרנזליישנל- החלבון מזוהה עי חלקיק האסארפי. החלבון מגיע ואז תעלת הטרנסלוקון מזהה את הרצף של הסטארט טרנספר.
ישנם 3 סוגי העברה.
א. רצף הסיגנל בקצה האמיני משמש כסטארט טרנספר, שעובר ביקוע עי סיגנל פפטידז. בהמשך הפפטיד יופיע רצף הידרופובי סטופ טרנספר שיפלט מהתעלה אל הממברנה וינעץ שם כשרצף הסטופ ישמש בהליקס חוצה ממברנה.
ב. הסטרט טרנספר הוא גם סטופ טרנספר ומופיע באמצע השרשרת הפפטידית, כך שאמצע הפפטיד מתחיל את המעבר מהתעלה ונתקע, וקצה אמיני בציטוזול וקרבוקסילי בלומן.
ג. אותו דבר כמו ב רק שהקרבוקסילי בציטוזול והאמיני בלומן.
מה שקובע אם מדובר בב או ג אלו המטענים סביב ההליקס. הציטוזול שלילי ביחס לאיאר שעמוס יוני סידן.
כיצד פועל מנגנון אינטגרציה של חלבונים חוצי מס פעמים אל ממברנת האיאר?
בחלבונים אלון יש מס רב של רצפי התחלה ועצירה- שתלויים בקונטקסט בו הם נמצאים ולא ברצף עצמו.
החלקיק אסארפי סורק את הפפטיד מהקצה האמיני עד החלק ההידרופובי הראשון. לאחר התחלת הטרנסלוקציה, הטראנסלוקון יזהה את הרצף ההידרופובי הבא שישמש כסטופ ויפלוט אותו אל הממברנה וכן הלאה.
ההטענה על האי אר אינה מאפיין של החלבון אלא של אופן ההטענה על האיאר.
כמובן שהאוריינטציה של רצף הסטארט הראשון תלויה במטענים.
tail anchored כיצד מוטענים על האיאר חלבוני?
החלבון מתורגם כולו בציטוזול. לאחר יציאתו יש לו סיגנל אמיני של 20 חא הידרופוביות שאותם מזהה חלבון פרה טרגטינג קומפלקס. את הפרה טרגטינג מזהה חלבון גט 3, שהוא אייטיפיאז וכאשר הוא קושר אייטיפי הוא דימר ויכול לקשור את החלבון במקום הפרה טרגטינג. הוא מביא את החלבון לחלבוני גט 1 וגט 2 שנמצאים על ממברנת האי אר, ומעגנים את הקצה הקרבוקסילי של החלבון בממברנה- חלבון גט 3 משתחרר תוך הידרוליזה של אייטיפי לאיידיפי ופוספט והופך למונומרים.
ERכיצד מסומנים חלבונים שהם “דיירי קבע” ב?
er retention signal הם בעלי סיגנל הכולל 4 חא בקצה הקרבוקסילי שמסמן אותם ונקרא
דוגמאות לחלבונים תושבי קבע באיאר?
PDI- תפקידו לחמצן שיירי תיול של ציסטאינים ליצירת קשרים די סולפידיים בתוך הלומן.
מרבית שיירי הציסטאין בלומן יהיו מחומצנים.
הצ’פרון ביפ- שמסייע למשוך חלבונים דרך סק 61. מונע אגרגציה של חלבונים ומונע מהם לעזוב את האיאר ולהגיע לגולג’י כי הוא מסומן בסיגנל דיירי קבע.
מה אחוז החלבונים שיעברו אן-גליקוזילציה באיאר?
כ50 אחוזים מהחלבונים שנכנסים לאיאר
מה תפקידו של האנזים אוליגו סאכריל טרנספראז?
יושב על ממברנת האיאר סמוך לכל טרנסלוקון, ועושה גליקוזילציה על הקצה האמיני על גבי שייר אספרגין.
לא כל שייר אספרגין עובר גליקוזילציה- הוא צריך להיות בקונטקסט מסוים. באמצע רצף הפפטיד: N X S/T
כשאיקס יעולה להיות כל חא חוץ מפרולין. סיגנל נקסט
האוליגוסכריד נמצא מעוגן לממברנה, ובתהליך אנזימטי של שלב אחד עי האוליגוסכריל טרנספראז הוא מועבר לשייר האספרגין- האנ’ ליצירת הקשר נמצאת בקשר הפירופוספט- ממש הצד שמעוגן לממברנה על גבי דוליכול פוספט.
איזה גליקוזילציות עוברים חלבונים גרעיניים וציטוזולים?
n-acetyl-glucose amine הם נושאים עליהם
שמחובר לשיירי סרין ותראונין.
האם מתרחשות עוד גליקוזילציות חוץ מסוג אן גליקוזילציה באיאר?
O כן, גליקוזילציות מסוג
על שיירי סרין ותראונין- תהליך שמתחיל באיאר וממשיך בגולג’י.
כיצד נבנה האוליגוסכריד לפני שמועבר בשלמותו באן גליקוזילציה?
התהליך מתחיל בציטוזול ועושה שימוש במונומרים של גלוקוז מאנוז וגלוקנאק כשהם מאוקטבים- יודיפי מאקטב גלוקוז וגלוקנאק וג’ידיפי מאקטב מאנוז.
בציטוזול, שם התהליך מתחיל- מנוצל נוקלאוטיד סיטיפי כדי לזרחן דוליכול, ורק כשמגיעים ל7 מונומרים- 2 גלוקנק ו5 מאנוז- העץ המתהווה עושה פליפפלופ ומתהפך לתוך חלל האיאר- שם הסינתזה ממשיכה עד ל14 שיירי סוכר.
בכדי לבקר קיפול נכון של החלבון, יוסרו באי אר 3 גלוקוזים קיצוניים פלוס מאנוז.
מהם חלבוני קלנקסין וקלרטיקולין?
שני חלבונים תלויי סידן- לקטינים= חלבונים קושרי גלוקוז
צ’פרוני איאר שאחראיים על בקרת קיפול החלבונים באיאר נקשרים לאוליגוסכרידים על חלבונים שאינם מקופלים כראוי ומחזיקים אותם באיאר- מונעים אגרגציה של חלבונים שאינם מקופלים.
קלנקסין וקלרטיקולין בעלי אותו תפקוד, רק שקלנקסין חלבון ממברנלי וקלרטיקולין הוא חלבון מסיס.
ERכיצד משפיעה גליקוזילציה מסוג אן על בקרת קיפול החלבונים ב?
בקצה האוליגורסכריד של האן גליקוזילציה יש שלושה גלוקוזים. גליקוזילאז חותך את שתי מולקולות הגלוקוז האחרונות ונותרת מולקולה אחת. קלנקסין/קלרטיקולין יודעים להקשר לגלוקוז בודד, יקשרו וימנעו את יציאת החלבון מהאיאר.
הגלוקוז האחרון נחתך תוך כדי הקישור לקלנקסין ומגיע לחלבון גליקוזיל טרנספראז שידע לזהות האם קופל כראוי או שלא. אם לא קופל כראוי- הוא “יסמן” אותו באן גליקוזילציה של תוספת של הגלוקוז הבודד תוך שימוש ביודיפי גלוקוז.
כעת שוב הוא יפגוש בקלנקסין או קלרטיקולין שישאירו אותו באיאר וחוזר חלילה.
ERP57איך משפיע על קיפול החלבונים באיאר הצפרון ?
הוא משתף פעולה עם קלנקסין וקלרטיקולין, וגם הוא משאיר את החלבון שלא קופל באיאר-קלנקסין וקלרטיקולין מעבירים אליו את החלבון והוא נקשר לציסטאינים- הוא יודע לזהות קבוצות סולפדריל חופשיות- מה שמצביע על קשר דיסולפידי לא שלם.
בנוסף, הצפרונים מסתירים את סיגנל היציאה מהאיאר לציטוזול של החלבונים.
כיצד מסומן חלבון מהאיאר לפירוק?
חלבונים מהאיאר שלא הצליחו להתקפל יוצאים חזרה לציטוזול שם יפורקו בפרוטאוזומים.
האן גליקוזילציה משמשת כטיימר. חלבון מאנוזדאז בעל פעילות איטית וחותך מאנוז. חלבוני שמתקפלים לאט מדי- המאנוזידאז יצליח לחתוך מהם מאנוז והם יטורגטו על ידי לקטינים שיוציאו אותם מהתא לפירוק. חלבונים שמתקפלים מהר ויוצאים- לא יספיקו להחתך.
כיצד חלבון שסומן לפירוק באיאר יצא לציטוזול?
ראשית, הלקטינים מזהים את האוליגוסכריד שנחתך על ידי המאנוזידאז. אל הלקטינים מצטרפים צפרונים ואנזימי דיסולפיד איזומרז שמתירים קשרים דיסולפידיים. כל הקומפלקס הנל סוחב את החלבון הלינארי אל קומפלקס טראנסלוקציה. בפתח הציטוזולי של הקומפלקס ממתין אנזים 3אי שיסמן בפוליוביקוויטין את החלבון שיוצא מהתעלה.
n glycnate .גם בצד הציטוזולי ישנו חלבון אייאייאיי אייטיפיאז שמושך את החלבון דרך התעלה תוך הידרוליזת אייטיפי.
הוא חלבון שמסיר את כל שרשרת האוליגוסכריד. והחלבון המסומן בפוליוביקוויטין יעבור במהרה לפרוטאוזום.
מדוע על התא לייצר עודף גדול של חלבונים?
כיוון שרבים מהם לא יצליחו להתקפל כראוי וישלחו לפירוק.
מה מנגנון המחלה של ציסטיק פיברוזיס?
זוהי מחלה תורשתית רצסיבית שנובעת מפגיעה בתעלות כלור. החלבון המוטנטי מזוהה כלא תקין באיאר ונשלח לפירוק- אעפ שאם היה מגיע לתעלה היה מתפקד כרגיל. המחלה נגרמת בגלל מנכנון קיפול החלבונים הקפדני באיאר.
UNFOLDED PROTEIN RESPONSE מה היא תגובת?
לאור הצטברות חלבונים רבים שאינם מקופלים כראוי באי אר תגובה זו תופעל, ותגרום ל:
שעתוק מוגבר של גנים המקודדים לחלבונים שמוציאים את החלבון לציטוזול שם יפורק
שעתוק מוגבר של חלבונים שמקודדים לצאפרוני איאר
חלבונים שמסייעים להגדיל את קיבולת קיפול החלבונים של האיאר.
UNFOLDED PROTEIN RESPONSE כיצד מעוררים חלבונים שלא קופלו כראוי את תגובת ?
ישנם מספר מסלולים.
IRE1:
רצפטור דימרי אינטרגלי, המזהה מתוך האיאר חלבון שגוי, יוצר דימר וזרחון הדדי ובעצם יוצר זרחונים בצד הציטוזולי באזור שנקרא ריבונוקלאז דומיין. הדטמיין עושה רגולציה לספלייסינג של מרנא, וגורם לספליסינג- חותך בשני אתרים מרנא ומוציא אינטרון- שני האקסונים שנותרו עוברים ליגציה. נוצר מראנ שמקודד לאקטיב טרנסקריפשיין רגולטורי פרוטאין, שנכנס לגרעין שם מאקטב שיעתוק גנים שיוצרים צ’פרונים נוספים.
PERK:
רצפטור דימרי אינטגרלי שמצדו של תוך האיאר נקשר אליו חלבון שלא קופל כראוי, שגורר תגובה של זרחון בצד הציטוזולי, שמעכב פקטורי איניציאציה של תרגום, מה שגורם להפחתה בכמות החלבונים המיוצרים ולכן גם בכמות החלבונים שאינם מקופלים. בנוסף הזרחון הזה, לאור עיכוב פקטור איניציאציית התרגום, ישנם חלבונים אחרים שמשועתקים בעדיפות ואחד מהם הוא פקטור שעתוק שמשעתק חלבונים שקשורים לתגובת החלבונים הלא מקופלים.
6ATF:
מונומר- חלבון איאר טרנסממברנלי. כשנקשר אליו מהצד של האיאר חלבון לא מקופל, הרצפטור הזה מופעל ועובר לממברנת הגולג’י, שם יעבור ביקוע פרוטאליטי, הדומיין הציטוזולי ישוחרר ויעבור לגרעין שם יעודד שעתוק של חלבונים שקשורים לתגובת אי קיפול חלבונים באיאר.
GPI כיצד מתבצע עיגון חלבונים דרך?
מדובר בחלבונים שיתעגנו לממברנת האיאר ועתידים להיות מעוגנים לממברנה הפלזמטית ופונים לחוץ התא כשהם מחוברים לגליקוזיל פוספטידיל אינוזיטול.
חלבונים אלו עוברים קו טרנסליישן לאיאר, והקצה הקרבוקסילי שלהם הידרופובי ומשמש כסטופ טרנספר. הוא נפלט החוצה מתעלת הטרנסלוקון וננעץ בממברנה. בהמשך, תתבצע התקפה נוקלאופילית על הקרבוניל שנמצא בין החלבון לקצה הסטופ טרנספר הנעוץ בממברנה בקשר פפטידי, על ידי הקצה האמיני של הפוספוליפיד ג’יפיאיי. האזור ההידרופובי מבוקע ונשאר נעוץ בממברנה, ואחכ יפורק עי פרוטאזות. כך החלבון הופך להיות מעוגן לג’יפיאיי.
מה הקשר בין גליקופרוטאינים לפרזיטי טריפוזונומה? (מחלת השינה האפריקאית)
הפרזיטים משתמשים בחלבונים מעוגנים לג’יפיאיי כדי לכסות את הממברנות שלהם, כך שמערכת החיסון לא תוכל לזהות אותם. הם מחליפים דפוסי גליקופרוטאינים כל בערך 100 מחזורי שכפול כך שמערכת החיסון לא תוכל לזהות אותם.
GPI היכן ניתן למצוא בשכיחות גבוהה חלבוני?
LIPID RAFTSב
היכן נוצרים מרבית הליפידים בתא?
על ממברנת האיאר
מיוצרים על העלעל הציטוזולי
CTP באיזה תהליך נעשה שימוש ב?
בסינתזה של פוספטידיל כולין- המקור לפוספט בראש של הפוספוליפיד
כיצד מיוצר פוספטידיל כולין?
ראשית, מגיעה חומצת שומן מהציטוזול כאשר היא קשורה לחלבון קושר חש- בוא מטעים אותה על העלעל החיצוני של האיאר.
חומצת השומן תשופעל על ידי קו אנזים איי- צורך אייטיפי שהופך לאיימפי. כשיש שתי חש משופעלות אחת ליד השניה, מגיע פוספוגליצרול שמתחבר אליהן הודות לאנרגיה שקיימת בקשר התיואסטרי עם הקו איי שישתחרר לציטוזול. פוספטאז מסיר פוספט מהפוספוגליצרול. מגיע סיטיפי כולין- שהוא בעצם עם 3 פוספטים, משץחרר סיאםפי ומתחבר פוספוכולין אל הראש של הגליצרול.
כיצד האיאר מייצר ממברנות?
לאחר שהאיאר סינתז פוספוליפידים שונים ובראשם פוספטידיל כולין עג הממברנה החיצונית, ממברנת האיאר תרצה להגיע לשומ ותבצע זאת באמצעות פליפ פלופ נרחב עי סקראמבלז, שאינו צורך אנרגיה, עד להגעה לממברנה יחסית סימטרית בשני העלעלים.
אילו טרנספורטרים פועלים בממברנת התא?
פליפאז- מעביר בדרך פוספוליפידים בעלי קבוצות אמינו חופשיות בראש הפולרי- כמו פוספטידיל סרין- יעבירו מהסביבה הציטוזולית אל הסביבה הפנימית, כשדרך הפעולה היא של משאבת פי טייפ= שעוברת זרחון תוך כדי הפעולה.
פלופאז- מבפנים החוצה. דורשת אייטיפי.
סקרמבלאז- באיאר הוא פועל בצורה אקסטנסיבית, אך בממברנת התא הוא לא פעיל כלל חו. מכאשר משופעל למטרה ספציפית.
מה הם תפקידי האיאר?
סינתזת פוספוליפידים, ייצור ממברנות, סינתזת כולסטרול, ביוסינתזה של צרמיד- שנוצר על ידי דחיסה של חש לחומצה אמינית סרין.
לאילו אברונים מייצר האיאר ממברנות?
לכל חברי מע ההפרשה- גולג’י, ליזוזום, ממברנה פלזמטית. את ממברנות הגרעין (מהווה המשך ישיר שלהן). המיטוכונדריה מסנתזת חלק מהליפידים שלה בעצמה, אבל עושה שימוש בפרוקורסרים שמגיעים מהאיאר.
מה הוא מסלול ההפרשה מהתא?
מהאיאר מועברות מולקולות חלבון לגולגי ומשם לממברנה הפלסמטית או דרך האנדוזומים לליזוזומים.
מה הוא המסלול האנדוציטי- הכניסה אל התא?
מולקולות נבלעות בוסיקולות אנדוציטיות שמקורן בממברנה הפלזמטית ומועברות לאנדוזומים המוקדמים ומשם לליזוזומים. מולקולות רבות מהאנדוזום המוקדם ממוחזרות לממברנת התא.
חלק מהמולקולות האנדוציטיות יכולות לעבור מהאנדוזומים לגולג’י ומשם לאיאר.
מה הם חלבוני מעטפת?
חלבונים העוטפים את הוזיקולה מרגע שמניצה מהממברנה לציטוזול עד לרגע האיחוי עם ממברנת המטרה.
החלבונים מהווים מעין כלוב סביב הוזיקולה, מטרתם לייצב את הוזיקולה בזמן שהיא נוצרת ועד שמגיעה ליעדה.
קלתרין- חלבון מעטפת של מע’ ההפרשה המאוחרת, נא אל ומהממברנה ובין מדורי הגולג’י והאנדוזומים.
COP-
שייכים למע’ ההפרשה המוקדמת, מהאיאר אל הגולג’י ולהיפך.
קופ 1- מהגולג’י לאיאר.
קופ 2- מהאיאר לגולג’י.
מהו תהליך יצירת וזיקולות עטופות קלתרין?
רצפטור שנעוץ בממברנה קולט מטען מהצד הציטוזולי. לאחר קשירתו למטען הוא מגייס חלבונים מתאמים- למשל החלבון 2אייפי מגייס את קלתרין שמתחילים בביצוע ההנצה של הוזיקולה. כדי לחתוך את הצוואר צריך חלבונים שמעקמים את הממברנה וחותכים את הצוואר- בשביל עיקום והרמת הממברנה יש צורך בחלבונים מסוג ממבריין בנדינג פרוטאין, BARשמכילים דומיין.
החיתוך עצמו של הוסיקולה מהממברנה מתבצע הודות לפעילות חלבונים מסיסים וביניהם דינמין.
לאחר ניתוק מוחלט של הוסיקולה, היא מאבדת את הציפוי- בגלל שפיפ פוספטז עושה הידרוליזה לפוספוליפידים ולכן הקשר לחלבון המתאם נחלש.
צ’פרוני הייצאספי 70 יגויסו ויבצעו הידרוליזה של אייטיפי- הם מתפקדים כאנקואוטד אייטיפיאז- כך הוזיקולה תשאר ערומה לגמרי.
מהו מבנה הקלתרין?
הקסמר- בנוי 3 יח’ כבדות- משושה ו3 יח’ קלות- מחומשים. יחד הן יוצרות את מבנה הטריסקליון. טריסקליונים של קלתרין מתאספים למסגרת דמוית סל או כלוב של משושים, מחומשים או משובעים.
תפקיד השרשראות הקלות: להתחבר לשלד האקטין- מה שמסייע ליצור כוח להנצת הממברנה ותנועת הוזיקולה. בנוסף, פוספורילציה על השרשראות הקלות מבקרת את הרכבת ציפוי הקלתרין.
אתרי האן טרמינל של הטריסקליון יקשרו לחלבון המתאים בפנים.
לקלתרין יש יכולת של סלף אסמבלי.
מהו תפקיד החלבונים המתאמים?
ראשית, חלבונים אלו הם ספציפיים, חלקם טטרמרים וחלקם מונומרים. הם קושרים מצד אחד את הקארגו רצפטורז ומצד שני את הקלתרין. זאת אומרת שהם פעילים רק מחוץ לתא.
AP2 כיצד פועל חלבון מתאם ?
החלבון אייפי2 הוא בעל 4 תת יח- אלפא, בטא,2 סיגמא2 ומיו2.
PIP(4,5)P2 הוא עושה אינטרקציה עם פוספואינוזיטיד על הממברנה הציטוזולית
סהכ אייפי2 קושר 4 מולקולות פיפ.
הקישור של אייפי2 עם הפוספואינוזיטיד גורם לו לחשוף את אתר הקישור לרצפטורי המטען- על ידי מיו 2 וסיגמא2.
קישור של אייפי2 לרצפטור יוצר קינק בממברנה שמעודד קישור אייפי2 נוספים- זה בעצם תהליך שעובר הגברה עצמית. כשקלתרין נקשר לאייפי 2 זה יוביל להנצת וסיקולות.
כמה אחוזים מהפוספוליפידים בממברנה מהווים הפוספואינוזיטידים?
פחות מ10 אחוזים
מה תפקידם של הפוספואינוזיטידים בתא?
היכן מיוצרים?
מיוצרים באיאר
בעלי תפקידים רגולטוריים: קביעת המיקום והתזמון של הולכת וזיקולות בתא- לפי זרחון ודה זרחון ניתן לגרום לחלבונים שונים לזהות את הפי או הפיפ בהתאם לצרכי התא
תפקיד חשוב בהולכת אותות
תפקיד חשוב באנדוציטוזה ואקסוציטוזה
תפקיד במחזור התא
מה הוא מבנה הפוספואינוזיטידים?
נגזרת של פוספטידיל אינוזיטול- גליצרול, 2 חש, ראש פולרי של פוספט, אינוזיטול. הם עוברים זרחון ודה זרחון על ידי פי , קינאזות ופי פוספטזות שספציפיים לכל מדור. הזרחון נעשה על אחת, 2 או 3 מקבוצות ההידרוקסיל על הפוספטידיל אינוזיטול. הזרחון השונה נותן בעצם אפיון שונה לפוספטידיל אינוזיטול פוספט.
התפלגות הפיפים שונה מאיברון לאברון ומאזור לאזור- יכולים להגדיר אזורים בממברנה.
BAR מהם חלבוני?
חלבונים קושרי ממברנה מסוג חלבונים מכופפי ממברנה, בעלי דומיין בר. הם עושים אינט’ אלקטרוסטטיות עם הראשים הפולריים של הממברנה.
מסייעים לאנדוציטוזה תלוית קלתרין- מעצבים את הממברנה על מנת לאפשר את הנצת הוזיקולה.
היקשרות חלבוני בר לממברנה יוצרת משוב חיובי של חלבונים אלו ובכך שנקשר חלבון אחד זה יגרום לאחרים לבוא.
לחלבוני הבר יש הליקסים אמפיפיליים שמעודדים את עקמומיות הממברנה לאחר שהם מוחדרים לצד הציטוזולי.
הם בנויים כדימר המתארגן לצורת קוילד קויל. בעלי אזורים חיוביים ולכן יעדיפו אינט’ עם ראשים שליליים בממברנה.
מהו מנגנון הצביטה של הוזיקולה מהממברנה?
עם התקדמות יצירת הוזיקולה עטופת הקלתרין, חלבונים ציטופלזמטיים ובראשם דינמין מגיעים לצוואר הוסיקולה. לדינמין PI(4,5)P2 יש דומיין קושר
שמחבר אותו לממברנה ודומיין ג’יטיפירז שעושה הידרוליזה לג’יטיפי ומבקר את קצב צביטת הוזיקולות.
הצביטה עצמה נעשית עי דינמין וחלבונים אחרים שהוא מגייס שאחראיים על כיפוף הממברנה והם מעקמים את מבנה הדו שכבה או משנים את הרכב הליפידים בה.
מהו תפקיד הדינמין הספציפי בצביטת הוזיקולות?
מולקולות דינמין רבות יוצרות מבנה ספירלי בצוואר הוסיקולה. הם מגייסים עוד חלבונים ויחד איתם מערערים את יציבות הדו שכבה. ללא דינמין תהליך אנדוציטוזה מתווכת קלתרין בדרוזופילה למשל נפסק לחלוטין והוזיקולות לא הצליחו להתמחזר.
כיצד מתבצע הסרת הציפוי מהוזיקולות?
לאחר צביטת הוסיקולה היא מאבדת מהר את ציפוי הקלתרין שלה.
זה נובע מהעובד שפיפ פוספטז נארז בתוך הוזיקולה, ומדלל את מאגר הפיפ(4,5)2 - וזה מחליש את הקשר של הקלתרין עם החלבון המתאם.
בנוסף, צפרוני הייצ’אספי70 משמשים כאנקואוטינג אייטיפיאז ומשתמשים באנ’ הידרוליזת האייטיפי כדי לקלף את הציפוי קלתרין.
חלבון האוקסילין שנמצא על הוזיקולות, מהווה מעין טיימר שמאתחל את פעילות האייטיפיאז.
כיצד פועל תהליך יצירת הוסיקולות על ידי חלבוני ג’י מונומרים?
כיצד פועל המנגנון של סר 1?
מנגנוני הנצת ממברנות באמצעות חלבוני ג’יטיפיאז ניתן למצוא בממברנות מצופות קלתרין באנדוזומים, ובגולג’י ובאיאר בוסיקולות מצופות קופ 1 ו2
החלבון ג’י שפועל בהולכת הוסיקולות מהאיאר אל הגולג’י יחד עם חלבוני קופ 2 הוא חלבון סר1.
כשסר 1 קושר ג’ידיפי, הוא מסיס בציטוזול. סר1 ג’ף יושב על ממברנת האיאר, והוא משחלף את סר 1 שכעת יקשור ג’יטיפי, וכתוצאה מכך ישנה קונפורמציה, יחשוף סליל אמפיפילי, ויצמד במצב פעיל לממברנה.
כאשר מגיע חלבון שצריך להיות מופרש אל הגולג’י ונקשר לרצפטור, מצטרפים אל סר 1 מהצד הציטוזולי (מחוץ לאי אר) חלבוני קופ 2- על סר אחד מתיישב סק23 ואת הצד החיצוני של הרצפטור תופס סק 24- והם נוגעים אחד בשני.
מעליהם, שכבה נוספת של קופ 2- סק 13 ו31 מצטרפים ויחד הם מניצים את הוזיקולה.
