[ARN Pol II] Régulation De La Transcription Flashcards
Nucléosome - Chromatine - Chromosome
L’unité de base de la chromatine est le[nucléosome]. Un[nucléosome] est formé de 8 protéines[histones] et [d’environ 150pb d’ADN].
La fibre chromatinienne de 30nm de diamètre a une structure en[solénoïde] de 6[nucléosomes] par tour. Cette fibre s’attache à la matrice nucléaire via des régions riches en A/T formant ainsi des boucles de 40 à 100kb.
La forme relachée de la chromatine est appelée [euchromatine].
La forme plus condensée est appelée[hétérochromatine].
L’ histone H3
a une tête globulaire
a une queue N-terminale flexible
a une queue riche en lysines et arginines
est codée par un gène présent dans un cluster qui se répète en tandem
peut subir des modifications post-traductionnelles.
L’acétylation des histones:
est associée à une structure lâche de la chromatine.
Elle est réalisée sur des lysine par des enzyme appelé “HAT” pour Histone Acétylase.
Les groupements acétyl peuvent être retirés par des “HDAC” (Histone Désacétylase).
L’acétylation supprime la charge positive des lysines ce qui permet une interaction moins forte entre les histone et l’ADN chargé négativement.
Les lysines acétylés permettront également la fixation de protéines à Bromodomaine qui interviendront dans la régulation de la transcription.
Un “Eraser”
désigne une enzyme ôtant une modification d’un acide aminé de la queue Nter des histones
phosphatase
Un “Writer”
désigne une enzyme apportant une modification d’un acide aminé de la queue Nter des histones
kinase
Un “Reader”
désigne une protéine se fixant sur un acide aminé modifié de la queue Nter des histones
Ex : protéine 14-3-3
Des complexes de remodelage de la chromatine
peuvent modifier la chromatine de façon [ATP] dépendante. Ils possèdent des sous-unités à activité [ATPase] et d’autres à activité [hélicase]. Ces complexes peuvent modifier la structure d’un [nucléosome], faire [glisser] un [nucléosome] en [cis] ou en [trans], permettrent la formation de boucles d’[ADN].
Certains complexes provoquent le [relâchement] de la chromatine, d’autres sa [condensation].
Les îlots CpG
Les îlots CpG sont des zones de l’ADN de 500 à 2000 pb plus riche en dinucléotides 5’-CG-3’ (=un C suivi d’un G, CpG-ne pas confondre avec la paire de base C:G).
Ils sont souvent (mais pas exclusivement) localisés au niveau de promoteur de gènes. En particulier on les trouve aux promoteurs des gènes de ménage (housekeeping gene) et associés au promoteurs de certains gènes transcrits de manière tissu-spécifique.
Les C du dinucléotide CpG peuvent être méthylés. L’état de méthylation de l’îlot influence l’activité transcriptionnelle.
Les réponses correctes sont : sont des zones d’ADN plus riche en dinucléotide 5’CG-3’ que la moyenne., se trouvent souvent au niveau des promoteurs de gène de ménage, peuvent se trouver au niveau des promoteurs de gènes à expression tissu-spécifique, peuvent être méthylés sur cytosine
La méthylation des îlots CpG
Les ilots CpG peuvent être méthylés sur les cytosines des dinucléotides CG par des ADN méthyl-transférase.
Une hyperméthylation est associée à un état condensé de la chromatine et à une absence de transcription alors que les ilots CpG situés au niveau des promoteurs des gènes transcrits sont hypométhylés.
La méthylations des ilots CpG comme les modifications des histones constituent des marques épigénétiques.
l’activation de la transcription suite à la liaison d’un ligand à un récepteur couplé à une protéine G
L’enzyme qui phosphoryle → cAPK (ou PKA=Protéine Kinase A) (sous-unités “C”)
L’enzyme qui fabrique de l’AMPc → Adenylyl cyclase (ou Adénylate cyclase)
Le facteur de transcription → CREB
Le Coactivateur → CBP/P300
L’enzyme sur laquelle se fixe l’AMPc → cAPK (ou PKA=Protéine Kinase A) (sous-unités “R”)
L’enzyme qui est activée par la petite protéine G suite à la liaison du ligand → Adenylyl cyclase (ou Adénylate cyclase)
Le récepteur transmembranaire du ligand → Gs protein-coupled receptor (=récepteur couplé aux petites protéines G)
Le module de réponse → CRE
Les récepteurs aux glucocorticoïdes
Les récepteurs aux glucocorticoïdes (GR= Glucocorticoïd Receptor) font partie de la famille des “récepteurs nucléaires” qui sont des facteurs de transcription activés suite à la liaison d’hormones stéroïdennes.
En l’absence d’hormone, les GR liés à la Hsp90 sont localisés dans le cytoplasme. Suite à la liaison de glucocorticoïdes, GR et Hsp90 se dissocient, les GR se dimérisent et migrent dans le noyau où ils pourront activer la transcription de gènes spécifiques possédant des “GRE” (Glucocorticoïd Responsive Element) dans leur promoteur. Cette activation passe par le recrutement de coactivateurs dont CBP/p300.
