Bio Cell Examen 1 Flashcards

1
Q

Quels sont les 5 techniques de microscopie

A
  • Microscopie Optique (regular)
  • Microscopie à Epifluorescence
  • Microscopie Confocale
  • Microscopie électronique à transmission
  • Microscopie électronique à balayage
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Q

C’est quoi la visualisation en contraste de phase

A
  • Les cellules sont transparentes so, ça permet de mieux voir les organites et tout ça
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3
Q

C’est quoi la visualisation en contraste interférentiel

A

Permet de voir en 3D

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4
Q

3 types de microscopes

A
  • Optique
  • Électronique
  • Atomique (pas important)
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5
Q

Å = angstrom = x nm

A

1/10 nm

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6
Q

Pourquoi les cellules sont si petites?

A
  • Un seul noyau contenant l’information (gènes)
    (Diffusion de molécules à travers son cytoplasme)
  • Rapport surface / volume optimal
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7
Q

Quelle sorte de cellule pourrait atteindre le volume le plus grand: une cellule aplatie ou une cellule sphérique?

A
  • La cellule aplati car, il a une distance de diffusion entre l’extracellulaire et le sein de la cellule (organites) est moins importante donc, les nutriments peuvent les atteindre plus facilement.
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8
Q

C’est quoi la Microscopie à epifluorescence

A

Observation de composantes de cellules vivantes avec des fluorochromes comme le GFP et le immunofluorescence (avec 2 anticorps).

-Utilise les rayons UV pour refleter le fluorescence

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9
Q

C’est quoi la Microscopie confocale (3 caractéristiques)

A
  • Source de lumière : laser,
  • plus claire et précise que le Microscopie à epifluorescence
  • peut produire des images 3D
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10
Q

Texas Red (rouge) detecte quoi?

A

Actine F

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11
Q

BODIPY FL (vert) detecte quoi?

A

Microtubules

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12
Q

DAPI (Bleu) detecte quoi?

A

Noyau

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13
Q

Microscopie électronique à transmission 1 avantage et 1 désavantage:

A

avantage
- électrons au lieu de lumière BEST RESOLUTION

désavantage
- Besoin un vide!

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14
Q

Microscopie électronique à balayage

A

comme le transmission mais seule la surface est observée (2D)

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15
Q

Types de visualisation par microscopie électronique:

A
  • Coloration négative au phototungstate de potassium
    (like when a bus drives over a puddle and it hits someone but their shape on the wall behind them remains)
  • Augmentation du contraste par ombrage par le chrome
    (application de chrome d’un coté de l’affaire qui fait un ombrage effect)
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16
Q

Role de l’anticorps secondaire (immunofluorescence)

A
  • Amplifie le fluorescence
    et
  • Spécifique à l’anticorps primaire.
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17
Q

Important to know
Préparation des échantillons de microscopie optique (4 étapes):

A

Fixation –> Inclusion –> Coupe –> Coloration

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18
Q

Théorie cellulaire (Theodor Schwann) (4 aspects):

A
  • Tous les organismes sont composés d’une ou plusieurs cellules.
  • La cellule est l’unité structural de la vie.
  • Les cellules ne peuvent provenir que de la division d’une cellule préexistante.
  • La plupart des organismes sont unicellulaires.
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19
Q

Niveaux d’organisation cellulaire et moléculaire (9)

A
  • Atomes
  • Molécules
  • Polymères
  • Complexes
  • Organites
  • Cellules
  • Tissus
  • Organes
  • Organisme

(the way I remember it is thatits abbreviation is AMPc octo-o)

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20
Q

Apoptose : Mort cellulaire programmée caractérisée par…(4)

A
  • Isolement de la cellule (fermeture des jonctions communicantes)
  • Perte d’intégrité membranaire
  • Condensation et fragmentation de l’ADN
  • Dissipation du potentiel mitochondrial
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21
Q

La voie intrinsèque de l’apoptose est activée lorsque…

A

la cellule est endommagée:

ex:
- Dommages à l’ADN
- Modification du statut d’oxydo-réduction de la cellule
- Accumulation de protéines mal conformées
- Membrane perméable
- Prolifération importante après une infection virale.

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22
Q

La voie extrinsèque de l’apoptose est activée par:

A
  • L’activation de récepteurs d’apoptose
  • L’absence de signaux de survie ou de divisions (facteurs de croissance)
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23
Q

Propriétés fondamentales des cellules (11) :

A
  1. La vie
  2. La mort
  3. La complexité et l’organisation
  4. Les cellules possèdent un programme génétique
  5. Les cellules sont capables de se reproduire
  6. Les cellules acquièrent et utilisent de l’énergie
  7. Les cellules effectuent différentes réactions chimiques
  8. Les cellules sont capables d’activités mécaniques
  9. Les cellules peuvent répondre à des stimuli
  10. Les cellules sont capables d’autorégulation
  11. Les cellules évoluent (différenciation)
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24
Q

caractéristiques unique aux procaryotes (3):

A

o Absence de compactage des chromosomes (et pas d’introns)
o Absence d’organites membranaires
o Les plus diversifiées

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25
Q

caractéristiques unique aux eucaryotes (3):

A

o Présence d’organites qui ont des membranes
o Présesnce de Chromosomes
o Présence d’Introns et d’Exons

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26
Q

Deux grandes classes des cellules

A
  • Eucaryotes
  • Procaryotes
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27
Q
  • Caractèristiques commun aux cellules procaryotes et eucaryotes (6):
A

o Membrane plasmique semblable
o Code génétique (ADN) identique
o Mécanismes de transcription et de traduction semblables
o Voies métaboliques communes
o Utilisation de l’ATP pour stocker de l’énergie
o Mêmes mécanismes de photosynthèse

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28
Q

Comment est-ce que la présence du noyau va ajouter une sélectivité pour l’entrée et la sortie du noyau

A
  • Entrée : les facteurs de transcriptions
    Ex : on veut inhiber la transcription donc, il ne laisse pas entrer ces Facteurs de Transcriptions
  • Sortie : l’ARNm qui va aller au ribosome.
    Ex : « mistake ARN » ne va pas aller directement au Ribosome, on peut le dégrader avant qu’il est traduit.
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29
Q

Eubactéries definition

A

Renferme les procaryotes autres que les archéobactéries

-caractérisées par une paroi de peptidoglycane.

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30
Q

Nommez les 4 similarités des eucaryotes et les archéobactéries

A
  • Leur structure
  • Leur métabolisme
  • Présence d’introns dans l’ADN
  • Présence d’ARN polymérases plus complexes que celles des bactéries
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31
Q

Les archéobactéries (Également des procaryotes) 3 Caractèristiques:

A
  • Extrêmophiles
    - Méthanogènes, halophiles, Acidophiles, Thermophiles
  • Présence de lipides membranaires particuliers (tétraéthers)
  • les archéobactéries sont dépourvues d’organites.
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32
Q

Cellules animales vs végétales

  • quelles sont les organites que l’autre n’a pas:
A

Animale:
- Centrioles

Végétale:
- Paroi cellulaire
-Chloroplastes
- Vacuole centrale

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33
Q

Les chloroplastes caractéristiques (3):

A
  • Accomplissent la photosynthèse: captent l’énergie de la lumière du soleil pour en faire des molécules de sucre
  • Libèrent de l’O2
  • Contiennent leur propre ADN
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34
Q

Appareil de Golgi rôle:

A
  • Reçoit et modifie les molécules synthétisées dans le RE
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35
Q

Réticulum endoplasmique rôle:

A
  • Lieu de production de la plupart des constituants de la membrane plasmique et des matériaux exportés hors de la cellule
  • RER porte des ribosomes
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36
Q

Cytoplasme vs Cytosol

A
  • Cytoplasme inclut les organites
  • Cytosol = Liquide intracellulaire sans organites
37
Q

Composantes de la Cytosquelette (3)

A
  • Filaments d’actine
  • Microtubules
  • Filaments intermédiaires
38
Q

La fuseau mitotique est formé de __________

A

microtubules

39
Q

Culture Cellulaire 2 types:

A
  • Culture primaire
  • Lignée cellulaire
40
Q
  • C’est quoi la Culture primaire
A

o Culture de cellules obtenue directement à partir de l’organisme

41
Q
  • C’est quoi la Lignée cellulaire
A

o Cellules immortalisées pouvant être maintenues en culture durant une longue période
 Cellules HeLa

42
Q

C’est quoi une cellule HeLa

A

cellule qui est utilisé le plus commun, (immortalisé)

43
Q

1 avantage et 1 désavantage des cellules de culture primaire

A
  • Avantage: Propriétés plus représentatives de cellules normales
  • Désavantage: Temps de culture limité à quelques jours. (Quantités limitées.)
44
Q

1 avantage et 1 désavantage des cellules de lignée cellulaire

A
  • Désavantage: Caryotype / phénotype souvent anormal
  • Avantage: passage illimité (Passage=dilution, plus de passage, plus de différences du phénotype though.)
45
Q

l’évolution des organismes pluricellulaires formés de cellules spécialisées est un résultat de la _____________

A

différenciation cellulaire

46
Q

Les virus - caractèristiques (4):

A
  • Non-vivant
  • Incapable de métabolisme
  • Structure : virion
    o Assemblage de macromolécules (protéines, ARN, ADN)
    o Le matériel génétique est entouré d’une capsule protéique (capside)
  • Chaque virus possède à sa surface une protéine capable de se lier à un composant membranaire particulier : Spécificité
47
Q

Types de virus

A
  • Bactériophage(complexe)
  • VIH
  • Adénovirus (simple)
48
Q

Deux types d’infection virale et leurs caractèristiques:

A

(((Les infections peuvent avoir à la fois une phase intégrative et une phase lytique)))

  • Infection lytique (lyse)
    o Le virus réoriente l’activité de la cellule
     Fabrication et assemblage des composantes virales
    o Lyse de la cellule pour libérer les virions
  • Infection intégrative (intègre)
    o L’infection ne provoque pas la mort de la cellule
     Insère son ADN dans celle de l’hôte: Provirus
    o Un agent stimulant peut induire la fabrication de virus et la lyse de la cellule
    o Les virus produits peuvent être libérés par bourgeonnement
    o Perte de contrôle de la croissance et de la division cellulaire: Cancer
49
Q

Utilité de l’infection intégrative en recherche

A

Permet d’introduire des gènes étrangers dans des cellules humaines
-Traitement de maladies par thérapie génique (dopage génétique)

50
Q

étapes de la centrifugation différentiel (7)

A

-centrifuge à low speed
-remplace surnageant
-centrifuge à medium speed
-remplace surnageant
-centrifuge à high speed
-remplace surnageant
-centrifuge à fucking high speed

cela donne une culot pas mal pur

(voir diapo 68 du premier powerpoint)

51
Q

C’est quoi la Cytométrie en flux
et
qu’est-ce qu’il permet de mesurer (2 choses):

A
  • Les cellules en suspension défilent devant un faisceau laser

o Permet de mesurer la taille et la réfringence des cellules grâce à la diffusion de la lumière
o Mesurer l’émission de lumière par des fluorochromes préalablement fixés à certaines composantes cellulaires.

52
Q

Utilités de la cytométrie en flux (3):

A
  • Les possibilités d’analyses de différents paramètres
    o Analyse d’événements rares (1/1000)
  • Analyses sur des cellules vivantes
  • Triage de cellules en fonction de leurs propriétés à
53
Q

7 fonctions de la membrane

A
  1. Perméabilité sélective
  2. Transport de solutés
  3. Transfert d’information (hormones)
  4. Communication/Interactions entre cellules
  5. Transduction d’énergie (Mitochondrie, Chloroplaste)
  6. Séquestration des enzymes digestives
  7. Site de localisation d’enzymes
54
Q

3 types de lipides sur la membrane :

A
  • Phospholipides (phosphadityl-choline)
  • Glycolipides
  • Cholestérol
55
Q

Amphipatiques meaning:

A

Régions hydrophiles et hydrophobes

56
Q

phospholipide anatomie

A

tête = PO4
queue AGras

57
Q

Micelle:

A

monocouche de phospholipides

58
Q

Liposome :

A
  • Vésicules sphériques remplies de liquide (bicouche lipidique)
  • Plusieurs applications en recherche (on peut ajouter des médicaments
59
Q

2 Facteurs qui influencent les la fluidité de la membrane :

A

1.+ saturé = - fluide
o Plus le niveau d’insaturation est élevé, plus basse est la T° de fusion (transition).
o Plus la longueur des acides gras est courte, plus basse est la T° de transition

2.[ Cholestérol] :
o Plus la teneur en cholestérol ↑
 plus la fluidité membranaire ↓
* plus la perméabilité de la membrane ↓

60
Q

composition en lipides du feuillet interne et externe de la membrane:

A

Feuillet externe :
- Glycolipides

Feuillet interne:
- Phosphatidylsérine
- Phosphatidylinositol

61
Q

lorsque des nouveaux phosholipides sont ajoutés à la face externe de la cellule, qu’est-ce qui arrive

A

L’enzyme flippase va apporter la moitié à la face interne pour égaliser la taille des deux faces.

62
Q

C’est quoi un radeau lipidique?

A

Microdomaines formés d’une accumulation de cholestérol et sphingolipides

63
Q

4 types de protéines membranaires :

A
  • Transporteurs Ex. Pompe Na+/K+
  • Ancrage Ex. Intégrines
  • Récepteurs Ex. PDGFR
  • Enzymes Ex. Adényl-cyclase
64
Q

Trois classes de protéines membranaires:

A
  1. Protéines intrinsèques (transmembranaires, Amphipathiques)
    - 20-30% de toutes les protéines codées par la cellule
  2. Protéines périphériques
    - Unies par liaisons non covalentes aux têtes polaires de la bicouche et/ou protéines intrinsèques - Côté cytoplasmique ou extracellulaire
  3. Protéines ancrées aux lipides
    - Unies par covalence à un groupement lipidique
    - Côté cytoplasmique ou extracellulaire
65
Q

exemples de structures qui sont des protéines membranaires intrinsèques (2):

A
  • Canaux ou transporteurs
  • Agents de transfert d’électrons
66
Q

Les protéines membranaires intrinsèques sont
a. hydrophiles
b. hydrophobes
ou
c. amphipathiques

A

c. amphipathiques

67
Q

exemples de structures qui sont des protéines membranaires périphériques (3):

A
  • Protéines d’ancrage
  • Enzymes
  • Facteurs de transmission de signaux
68
Q

Les protéines membranaires ancrées aux lipides sont souvent lié à la membrane via un court oligosaccharide uni à un (__1__)

ou lié par une ou plusieurs (__2__ )

A
  1. GPI (glycophosphatidylinositol) encastré dans le feuillet externe de la membrane.
  2. chaînes hydrocarbonées
69
Q

Role de la squelette membranaire

A
  • Maintient la forme
  • Formation d’un réseau hexagonal ou pentagonal qui limite les mouvements des protéines intrinsèques
70
Q

Composition de la squelette membranaire :

A

Spectrine attachée par liaisons covalentes à une protéine
périphérique: L’ankyrine

L’ankyrine est unie par liaisons non covalentes à la bande 3

71
Q

c’est quoi la forme de la squelette membranaire de l’érythrocyte?

A

hexagonal

72
Q

Modes de déplacement des protéines intrinsèques (6):

A
  1. Diffusion au hasard
  2. Immobilisée par interaction avec le squelette membranaire
  3. Direction déterminée par son interaction avec une protéine de la surface cytosolique
  4. Limité par d’autres protéines intrinsèques
  5. Limité par des barrières de protéines
  6. Freinée par des matériaux extracellulaires

… just check diapo 29 of “2. Membrane plasmique H23” for pictures, it’ll help.

73
Q

Ordre de perméabilité selon le type de molécule

A

Passent la membrane:

  • petites molécules hydrophobes (O2, CO2, N2, benzène)
  • petites molécules non-chargés (H2O, glycérol, éthanol)

Besoin d’un pompe/canal pour passer pas le membrane:

  • Grandes molécules non-chargés (acide aminées, glucose, nucléosides)
  • Ions (H+, Na+, HCO3-, K+, Ca2+, Cl-, Mg2+)
74
Q

Ordonne en fonction de la perméabilité de la membrane cellulaire

Eau, CO2, Hormones peptidique, glucose, Ca2+, ARN, Éthanol

A

CO2,
Éthanol,
Eau,
glucose,
Ca2+,
ARN,
Hormones peptidique

75
Q

Deux voies de diffusion (4 sous-types):

A

Passive: (Dans le sens du gradient de concentration)
1. Diffusion à travers la bicouche
2. Diffusion à travers un canal protéique
3. Diffusion facilité (transporteur)

Active:
(Dépense d’énergie (hydrolyse ATP) pour transporter les molécules contre un gradient de concentration)
4. Transport actif (transporteur)

76
Q

Facteurs qui influence la diffusion:

A
  • D’une région de forte concentration à une région de faible concentration
  • Il faut aussi tenir compte de la charge des composés
    (face externe +, face interne - )
    • Mêmes charges: Répulsion
    • Charges opposées: Attraction
  • Perméablilité de la composé envers la membrane
77
Q

Deux gradients transmembranaires:

A
  • Chimique: Différences de concentration
  • Électrique: Différences entre les charges
78
Q

utilité de la microscopie oculaire

A

its cheap

79
Q

utilité de la microscopie à épifluorescence

A

permet l’observation des cellules vivantes
( ex: noyau et protéines du cytosquelette)

80
Q

utilité de la microscopie confocale

A

Possibilité de construire des
images en 3D

81
Q

utilité de la microscopie électronique à transmission

A

permet une très grande résolution

82
Q

utilité de la technique du cryofracture d’une cellulue avant de l’observer par microscopie électroniqe

A

pour bien voir les organites d’une cellule.

…Kinda like if you cut open an avocado. The seed in the middle is still very observable in 3D because it wasn’t cut with the rest of the avocado.

83
Q

décrit l’étape 1.la fixation

(préparation des échantillons de microscopie optique))

A

Elle permet d’immobiliser et de conserver l’échantillon dans le temps, dans un état proche du vivant

84
Q

décrit l’étape 2. l’inclusion

(préparation des échantillons de microscopie optique))

A

Elle consiste à rigidifier l’échantillon

85
Q

décrit l’étape 3. la coupe

(préparation des échantillons de microscopie optique))

A

on coupe l’échantillon (soit avec une lame fine ou la cryofracture)

86
Q

décrit l’étape 4.la coloration

(préparation des échantillons de microscopie optique))

A

La coloration permet d’accentuer les contrastes afin de reconnaître et de différencier des éléments constitutifs du matériel biologique

ex: colortation négative aveg tungstate de potassium ou contraste avec l’ombrage de chrome

87
Q

pourquoi utilise-t-on une laser pour la microscopie confocale?

A

La microscopie confocale utilise un laser pour exciter les fluorophores

88
Q

quelle type de lumière est-ce qui va exciter les fluorophores lors de la microscopie à épifluorescence

A

Il absorbe la lumière UV invisible et il libère une partie de l’énergie sous forme de lumière visible

89
Q

Pourquoi la microscopie électronique a une plus grande résolution?

A

Les électrons ont une longueur d’onde beaucoup plus courte que la lumière visible. Dans l’équation de la résolution, le longueur d’onde est inversement proportionnelle au résolution.