Brainscape's Knowledge GenomeTM

Browse over 1 million classes created by top students, professors, publishers, and experts.


See full index

Génétique > Cours 4 - Transcription > Flashcards

Cours 4 - Transcription Flashcards

1
Q

En quoi la transcription est très semblable à la réplication ADN

A

Nécessitent enzymes synthétisent nouveau brin d’acides nucléiques
complémentaires au brin ‘matrice’

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

C’est quoi les 4 différences entre la transcription et la réplication ?

A
  1. Dans transcription: brin constitué de ribonucléotides (ARN)
  2. ARN polymérase: ne requiert pas d’amorce
  3. L’ARN ne reste pas apparié au brin matrice d’ADN : l’enzyme déplace la chaîne naissante
  4. Transcription: moins fidèle que la réplication: 1 erreur/ 10 000 nucléotides
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Pourquoi la transcription se permet de faire plus d’erreur que la réplication?

A

Réplication doit assurer transmission fidèle du matériel génétique aux cellules filles et toute erreur devient permanente dans génome peut avoir conséquences désastreuses

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

V/F: ARN pol en a autant chez eucaryote que procaryote
c’est quoi leur différence ?

A

Faux
Procaryote en ont un
Eucarytote en ont 3

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Pol I fait quoi

A

Transcrit précurseur ARNr

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Pol II fait quoi

A

Code plupart des gènes (tous gènes codant des protéines)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Pol III fait quoi?

A

code ARNt et ARNr 5S

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Vrai ou faux: Les polymérases eucaryotes et procaryote sont très similaire (sous-unité)

A

Vrai

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

C’est quoi un promoteur ?

A

Séquence ADN en amont du gène voulu qui fixe l’ARN polymérase et les facteurs d’initiation requis

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

C’est quoi les 3 étapes de l’initiation de la transcription

A
  1. Formation complexe fermé (ADN = double-brin)
    2: Formation complexe ouvert (ADN = simple-brin)
    3: Polymérase démarre transcription: détachement du promoteur
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

V/F: La transcription initial est efficace.
pourquoi vrai ou pourquoi faux ?

A

Faux.
Elle n’est pas efficace.
Font des petites séquences (10nucléotide)
Synthèse abortive (Qui ne parvient pas au terme de son développement.)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

La ARN pol a besoin de quel cofacteur

A

Magnésium

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

c’est quelle phase si ARN pol fait + 10 nucléotide ?

A

Élongation

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Rôle ARN pol ? (4)

A
  1. Déroule ADN devant elle
  2. Réassocie brins derrière complexe
  3. Dissocie chaine ARN de la matrice durant progression
  4. Corrige erreurs potentielles
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

L’ARN polymérase minimale, ça veut dire quoi ?

A

chez bactérie, minimum 5 sous-unité (2 alpha, 2 beta, 1 omega) (peut initier transcription n’importe où sur l’ADN in vitro)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

V/f: L’ARN polymérase minimale peut initier transcription partout sur l’ADN (pas promoteur spécifique)

A

Vrai in vitro mais pas in vivo

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Comment pouvons-nous rendre l’ARN pol minimale spécifique aux promoteurs ?

A

En ajoutant 6e facteur d’initiation: σ

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

c’est quoi holoenzyme de l’ARN polymérase chez les bactéries

A

ARN pol minimale (2 alpha, 2 beta, 1 omega) + σ

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

Chez E. coli c’est quoi lefacteur σ prédominant

A

σ70

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

Quel séquence consensus est reconnu par σ70

A

-10 et -35

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

Pourquoi dit-on que -10 et -35 est une séquence consensus ?

A

Parce que σ70 reconnait plusieurs séquence différente, mais -10 et -35 est la plus fréquente. De ce fait, c’est la séquence consensus.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

C’est quoi les promoteurs forts (initiation transcription + élevé)?

A

Les séquences qui sont les plus proche du consensus

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

c’est quoi exactement la séquence consensus?

A

TTGACA (-35) et TATAAT (-10)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

Quel élément de plus ont les prometteurs puissants

A

élément UP

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
Q

c’est quoi un élément UP ?

A

augmente la liaison polymérase et permet interaction spécifique supplémentaire Enzyme/ADN (ARNr)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
26
Q

Que ce passes-t-il si certains promoteurs σ70: pas élément -35

A

ils ont un élément -10 + long (ex.galactose)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
27
Q

L’Élément discriminateur est placer ou?

A

en avant de -10

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
28
Q

σ70 est divisé en combien de région?

A

4 régions

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
29
Q

Les régions 2 et 4 de σ70 font quoi?

A

Reconnaissent -10 et -35

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
30
Q

La région 4 de σ70 fait quoi?

A

porte 2 hélices formant motif hélice-coude-hélice (domaine liaison ADN)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
31
Q

Dans la région 4 de σ70, il y a 2 hélices. Elles font quoi?

A

1ère hélice: grand sillon ADN élément -35
2ème hélice: située en travers au dessus du sillon:
établit contacts avec squelette ADN

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
32
Q

Élément -10 est reconnu par quel région de σ70 ?

A

région 2

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
33
Q

La region 3 de σ70, elle fait quoi?

A

Reconnait élément -10 allongé lorsque présente

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
34
Q

Élément ‘discriminateur’ (lorsque présent) est reconnu par quoi dans σ70?

A

région 1.2

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
35
Q

l’Élément UP est reconnu par quoi?

A

Pas reconnu par une hélice σ mais par domaine C-terminal de sous-unité α de polymérase ( αCTD)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
36
Q

c’est quoi le pont flexible (pont protéique flexible) ?

A

Pont qui relie αCTD relié à αNTD

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
37
Q

La transition en complexe ouvert implique des modifications de quel type ?

A

structurales dans l’ARN polymérase et le promoteur

(isomérique)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
38
Q

Le complexe fermé est-il réversible ?

A

Oui

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
39
Q

Le passage du complexe fermer à ouvert est-il réversible ?

A

Non

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
40
Q

Le passage du complexe fermer à ouvert nécessite quoi?

A

1.modification structurale de l’enzyme 2. séparation brins ADN

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
41
Q

La séparation de l’ADN par le complexe expose le brin matrice et un brin sens. À quoi sert le brin sens ?

A

Rien

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
42
Q

Quand c’es écrit -11 ou +11, les - ou + servent à quoi

A

Dire si avant ou après le gène

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
43
Q

La modification structurale de la polymérase + σ70 de fermer à ouvert implique quel type de modification

A

Isomérisation (pas ATP utilisé)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
44
Q

ADN polymérase comporte combien de canaux ? et qu’est-ce qu’il font ?

A

1 Canal d’entrée des NTPs au centre actif
1 Canal de sortie de l’ARN
3 autres canaux permettent l’entrée et sortie de l’ADN

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
45
Q

C’est quoi les deux changements structuraux saisissants observés dans l’ADN polymérase chez la bactérie

A
  1. fermeture machoire (double hélice maintenue fermement)
  2. Déplacement région N-terminale σ
    - Dans complexe fermé: σ1.1 dans foyer catalytique
    - Dans complexe ouvert: lorsque sépare ADN σ1.1 est expulsé (déplacé)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
46
Q

Dans les canaux de l’ADN polymérase, que ce passe-t-il avec le Brin sens

A

quitte le centre actif par le canal NT

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
47
Q

Dans les canaux de l’ADN polymérase, que ce passe-t-il avec le Brin matrice ?

A

suit parcours passant par centre catalytique puis canal brin matrice (T)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
48
Q

ADN se sépare en quelle position et se referme en laquelle?

A

+3 et -11

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
49
Q

V/f: ARN polymérase a besoin d’une amorce

A

Faux

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
50
Q

c’est quoi le mécanisme d’action de la transcription?

A

1er ribonucléotide amené au site actif + maintenu stable sur la matrice
2e NTP présenté pour permettre à la polymérisation de se dérouler

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
51
Q

après la synthèse abortive, c’est quoi les modes de déplacement (3) du site actif de l’enzyme sur matrice ADN?

A

Pas certain, mais 3 modèles expliquerait
1. excursion transitoire
2. Chenille
3. Compression *

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
52
Q

c’est quoi le modèle d’ « excursion transitoire » :

A

Cycles translocation ARN polymérase avant/arrière

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
53
Q

c’est quoi le modèle de compression

A

ADN en avant tiré et replié à l’intérieur de l’enzyme
ADN s’y accumule (boucles simple brin)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
54
Q

c’est quoi le modèle « inchworming »

A

Existerait élément flexible qui
Permet au module (site actif) de se déplacer vers l’avant en synthétisant un court transcrit avant de se
rétracter dans le corps de l’enzyme (promoteur)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
55
Q

Parmis les modèles du déplacement de la Pol sur l’ADN, laquelle est retenue?

A

Modèle de compression

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
56
Q

La phase d’élongation commence quand ?

A

Lorsque Polymérase va se libérer du promoteur

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
57
Q

Polymérase va se libérer du promoteur à parti de quand ?

A

lorsque polymérase fait plus de 10 nucléotide

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
58
Q

Que ce passes-t-il avec l’ARN naissant ?

A

ne peut pas rester contenu dans région où il s’hybride à l’ADN donc commence à s’insérer dans le canal de sortie ARN

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
59
Q

La libération du promoteur implique de briser quoi?

A

des interactions polymérase-promoteur et noyau de la polymérase-σ

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
60
Q

Que fait le linker3/4 ?

A

mime ARN chargé négativement occupe le canal de sortie en attendant la phase d’élongation. après: sort.
Relie la région 3 et la région 4

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
61
Q

À quoi sert σ dans la pol

A

Reconnaissance

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
62
Q

éjection de la région 3/4: fait quoi?

A

Baisse force de liaison de σ à l’enzyme = σ se décroche complexe d’élongation

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
63
Q

Quel processus fournit énergie requise pour la polymérase de: i) rompre interactions polymérase-promoteur et ii) libérer noyau de l’enzyme du facteur σ

A

L’empilement de l’ADN dans l’enzyme est inversé lors de la libération du promoteur = ADN est donc ré-enroulé

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
64
Q

V/f: Les ARN polymérases bactériennes et eucaryotes sont très semblables

A

Vrai

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
65
Q

V/f: Un cycle de transcription comprend 3 phases distinctes: initiation, élongation et
terminaison.

A

Vrai

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
66
Q

V/f: Chez les eucaryotes, le complexe d’initiation de la transcription est constitué de plusieurs protéines (polymérases + FGTs)

A

Vrai

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
67
Q

V/f: La queue CTD de la polymérase permet de transporter des protéines requises
à toutes les étapes de la transcription d’un gène

A

Vrai

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
68
Q

V/f: Les polymérases Pol I et Pol III fonctionnent de manière similaire à Pol II mais transcrivent dès gènes qui leurs sont propres

A

Vrai

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
69
Q

Coté énergie, la méthode compression permet de quoi?

A

entrepose+mobilise énergie durant l’initiation transcription

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
70
Q

la Libération énergie permet de faire quoi sur l’ADN pol?

A

permet polymérase détacher du promoteur + séparer σ de l’enzyme (qui devient inutle à ce moment)

71
Q

En phase d’élongation, la matrice et le transcrit sont à l’interieur ou à l’extérieur de l’ADN pol

A

intérieur

72
Q

La taille de la bulle ( quantité ADN associés dans l’ADN pol ) est toujours la même pendant la phase d’élongation

A

Vrai

73
Q

c’est quoi les deux fonctions correctrices de l’ARN pol pendant la phase d’élongation?

A
  1. pyrophospholytique
    -> catalyse le retrait d’un ribonucléotide incorrect lors de l’incorporation (PPi) d’un autre nucléotide
    (ne ralentit pas)
  2. hydrolytique
    -> Enzyme recule un ou plusieurs nucléotides et clive ARN
    (rallonge)
74
Q

Si l’ARN pol est bloqué, que faut-il faire ?

A

Il faut l’enlever de la matrice car ça peut être catastrophique

75
Q

pourquoi l’arret de l’ARN pol peut être catastrophique ?

A

bloque les autres polymérase de faire la transcription des gènes

76
Q

À quoi sert le TRCF ?

A
  1. Lie ADN double brin en amont (derrière) polymérase et pousse l’ARN pol vers l’avant
  2. permet la réparation des dommages: recrute enzymes de réparation
77
Q

Lorsque la TRCF entre en collision avec l’ARN pol, que peut-il arriver ?

A
  1. sois reprend élongation ou
  2. se dissocie complexe ternaire
    (ARN pol/ADN matrice/ARN transcrit)
78
Q

c’est quoi une séquence ‘‘terminateur’’ ?

A

séquence conduisent polymérase en élongation à se dissocier ADN et à libérer l’ARN

comme une lettre disant d’arreter

79
Q

Les bactéries ont 2 types de terminateur, lesquels ?

A

1er : Rho-dépendant : nécessite protéine Rho pour provoquer terminaison
2ème : Rho-indépendant : provoque terminaison sans autres facteurs

80
Q

C’est quoi les caractéristique de l’anneau RHO :
1. se fixe à quoi? (séquence cible)
2. se fixe ou?
3. ATPase ou non ATPase ?

A
  1. ’ARN simple-brin dès qu’il sort de ARNpol
  2. près de fin gène (site rut)
  3. ATPase
81
Q

qu’est-ce qu’il y a de spéciale avec RHO et sa liaison à l’ARN

A

Rho induit terminaison uniquement des transcrits en cours de transcription à la fin d’un gène

82
Q

ARN pol est plus ou moins rapide que RHO?

A

+ vite

l’ARN pol fait des pauses pour permettre à RHO de le rattraper

83
Q

C’est quoi les hypothèses du mode d’action de RHO ?

A
  1. RHO pousse ARN pol vers l’avant
  2. RHO arracherais ARN de la pol (sépare ARN de l’ADN)
  3. RHO induirait un changement de conformation
    de la polymérase
84
Q

Synonyme de terminateur Rho-indépendant

A

Terminateurs intrinsèques

85
Q

c’est quoi les deux éléments de séquence du terminateur RHO-indépendant ?

TRÈS IMPORTANT À SAVOIR

RHO-indépendant fonctionne sur quoi?

A

1.Courte séquence répétée inversée
2. paires de bases A-T

-> fonctionne sur ARN( pas ADN)

86
Q

La courte séquence répétée inversé du termianteur RHO-indépendant sert à quoi?

A

Structure tige-boucle

87
Q

La forme Tige-boucle du RHO-indépendant se passe ou?

Comment ça termine la transcription?

A

dans ARN pol

-> désorganise le complexe d’élongation par changement de conformation = terminaison

88
Q

La forme épingle à cheveux du RHO indépendant fonctionne efficacement uniquement si quoi?

A

uniquement si elle est suivie
par une série de bases T (U dans l’ARN)

(parce que pare de base A-T )

89
Q

C’est quoi la différence entre polymérase bactérienne et eucaryote ?

A

bactérie : une seule polymérase et besoin d’un seul facteur initiateur (sigma)

eucaryote: en a 3 (pol I, II, III) et besoin plusieurs facteurs initiateur (facteur généraux de transcription (FGT))

90
Q

FGT sert à quoi? (3)

A
  1. Accomplissent les mêmes fonctions que σ dans transcription bactérienne
  2. Aident Pol II à se fixer au promoteur + séparer brins ADN
  3. Aident Pol II détacher promoteur et engager élongation
91
Q

Les FGT ont besoin de 3 facteurs supplémentaires. C’est quoi?

A

i) Protéines régulatrices liant ADN (facteurs de transcription/régulateurs) TRÈS IMP.

ii) Complexe « Médiateur » (grappe raisin)

iii) Enzymes modification de la chromatine

92
Q

Quelle Pol est la plus importante ?

A

Pol II

93
Q

c’est quoi un promoteur minimal

A

plus petit ensemble d’éléments de séquence nécessaire pour assurer l’initiation de la transcription par la machinerie de Pol II IN VITRO

94
Q

c’est quoi le promoteur minimal pour POL II ? (in vitro)

A
  1. Élément reconnu par TFIIB (BRE)
  2. Élément TATA (similaire tige boucle bactérie)
  3. initiateur Inr
  4. Élément après le promoteur (DCE, DPE, MTE )
95
Q

Avant le promoteur, il y a d’autre séquence requise pour la transcription IN VIVO. c’est quoi?

A

BRE, TATA, Inr, DCE, DPE, MTE + séquence régulatrice

96
Q

Quelles sont les séquences régulatrices du promoteur minimal Pol II

A
  1. élément proximaux du promoteur (très proche)
  2. séquence activatrice en avant (UAS) -> peut être très loin
  3. Les « enhancers » ou amplificateurs (avant ou après)
  4. D’autres éléments (« silencers », éléments frontière et isolateurs) -> bloque la transcription
97
Q

Quelles sont les deux étapes pour libérer le promoteur qui est absent chez les bactéries ?

A
  1. Hydrolyse d’ATP
    (en + de hydrolyse ATP pour fusion ADN par TFIIH)
  2. Phosphorylation de la Pol II
98
Q

C’est quoi le complexe de préinitiation (PIC) ?

A

ensemble des FGT + pol II lié au promoteur.

Ils sont formé dans un ordre très précis

99
Q

Quelle est l’ordre de la formation de PIC ?

A
  1. TBP reconnait boîte TATA
  2. ajout TFIID
  3. ajout TFIIA
  4. ajout TFIIB
  5. ajout TFIIF-polymérase (presque imp. des séparer)
  6. ajout TFIIE
  7. AJout TFIIH
100
Q

c’est quoi qui compose TFIID ?

A

Complexe de sous-unités comprenant:
TBP (‘TATA binding protein’) + TAFs (‘TBP Associated Factors’)

101
Q

Que fait le complexe TBP-TATA?

A

fournit plateforme pour attirer sur
le promoteur d’autres FGTs + pol II

102
Q

Quelle TFII_ qui hydrolyse l’ATP ?

A

TFIIH
(activité hélicase qui stimule déroulement ADN)

103
Q

qu’est-ce qui est phosphorylé dans la pol II pour libéré le promoteur ? à quoi sert la phosphorylation?

A
  • La queue c-terminal ( CTD)
  • aide la pol II à se défaire de la plupart des FGT
104
Q

V/f: CTD est très court

A

Faux. très longue répétition de séquence
Tyr-Ser-Pro-Thr-Ser-Pro-Ser

105
Q

V/f: Promoteur peut posséder la boite TATA et un élément DPE

A

Faux. un ou l’autre.

106
Q

Pourquoi dit-on que TBP a un comportement inhabituel ?

A

utilise une large région constitué d’un feuillet beta pour reconnaitre le ptit sillon de la boite TATA

Inhabituel parce que habituellement protéine utilise hélice a et grand sillon

107
Q

Pourquoi c’est inhabituel pour la TBP de reconnaitre le petit sillon?

A

petit sillon = moins riche en information

108
Q

Comment fonctionne TBP sur la boite TATA vu qu’il reconnait le petit sillon?

A

Il déforme localement l’ADN = élargit le sillon le rendent avec une configuration plane + pli ADN 80 degré

109
Q

Comment TBP est-il spécifique ?

A

dépend chaines latérales de 2 résidus phénylalanine = s’intercalent entre les paires de bases aux extrémités TATA

Va préférée les séquences A-T, car plus facile à déformer (moins de pont H)

110
Q

C’est quoi TAF ?

A

un FGT

111
Q

TBP se lie à combien de TAF ?

A

10

112
Q

Que fait les TAF ?

A

se lien à l’ADN un peu comme les histones

113
Q

ou se retrouvent les TAF ?

A

dans le complexe TFIID
+
associé à des enzymes de modification d’histone (complexe SAGA dans les levures)

114
Q

Quelle TAF se lient au promoteur

A

TAF42 et TAF62

115
Q

c’est quoi TFIID ?

A

association TBP + environs 10 TAF

116
Q

TFIIA interagit avec quoi? il fait quoi?

A

Complexe TBP-TFIID (il le stabilise)

117
Q

c’est quoi les fonctions de TFIIA ?

A
  • élimine interaction de répresseurs avec TBP qui empêchent formation du complexe d’initiation (PIC)
  • Agit comme co-activateur pour certains
    activateurs
118
Q

V/f: TFIIA interagit avec l’ADN

A

Faux.

avec TBP

incapable de lier l’ADN

119
Q

TFIIB interagit avec quoi?

A

Complexe TBP-TFIID-TFIIA

120
Q

TFIIA ou TFIIB qui est capable de lier l’ADN ?

A

TFIIB
(contact avec l’ADN et TBP)

121
Q

TFIIB peut être en contacte avec quoi?

A

TBP
ADN
en amont BRE
en aval TATA
POL II (en complexe preinitiation)

122
Q

À quoi sert TFIIB ?

A

Fait le lien entre la boite TATA et la Pol II

123
Q

ou est TFIIB?

A

canal de sortie ARN et gorge site actif de polymérase

124
Q

TBP fait partie quelle complexe initiation
de la transcription ?

A

TFIID

125
Q

TFIIF fait quoi?

A
  1. La liaison de POL II-TFIIF stabilise le complexe ADN-TBP-TFIIB

=nécessaire avant l’arrivé de TFIIE et TFIIH

  1. contribuerait maintenir enroulement serré ADN autour complexe preinitiation
126
Q

Dans quelle ordre arrive les TFII dans le complexe dinitiation de la transcription?

A
  1. TFIID (TBP-TAFs)
  2. TFIIA
    3.TFIIB
  3. TFIIF+polymérase
  4. TFIIE
    6.TFIIH
127
Q

À quoi sert TFIIE ?

A

recrute et régule TFIIH

128
Q

À quoi sert TFIIH ?

**Il est important **

A
  • contrôle transition complexe préinitiation (fermé) au complexe ouvert (dépendant de l’ATP)
  • fusion du promoteur et dans le détachement de PolII du promoteur
  • réparation ADN
  • activité hélicase
129
Q

Quel FGT est le plus gros et le plus complexe ?

A

TFIIH

130
Q

c’est quoi l’activité de la TFIIH ?

A

activité ATPase et activité protéine kinase

131
Q

Le médiateur est en contact ou pas avec la polymérase ?

A

En contact

132
Q

La régulation de la transcription est régulé par quoi?

A
  • Protéines régulatrices
  • Complexe Médiateur
  • Enzyme de modification des nucléosomes
133
Q

Le médiateur facilite l’initiation en régulant quoi?

A

activité CTD kinase de TFIIH

134
Q

Pourquoi il existe différentes formes de Médiateurs ?

A

Pour la régulation de différents groupes de gènes

135
Q

V/f: Médiateur a plusieurs sous-unité

A

Vrai (environs 20)

136
Q

Que ce passes-t-il lorsque Pol II libérée promoteur et initie transcription

A

passe en mode élongation

137
Q

Lorsque c’est la phase élongation, il se passe quoi avec les FGT et le médiateur ?

A

Se débarrasse de la plupart et les remplaces par des facteurs d’élongation (comme TFIIS et hSPT5)

138
Q

qu’est-ce qui est nécessaire pour la maturation de l’ADN. ?

A

enzyme recruté sur la CTD de la Pol II

139
Q

les enzymes impliqué à la maturation de l’ADN Préfèrent la forme phosphorylée ou non phosphorylée de CTD

A

phosphorylée

140
Q

CTD de pol II est ou et est courte ou longue ?

A

Canal de sortie et très longue

141
Q

Pourquoi la CTD de pol II est longue ?

A

Permet CTD de lier plusieurs composants
machinerie élongation + maturation: les
met en contact avec ARN

142
Q

Kinase P-TEFb, elle fait quoi?

A

avec la pol II elle est Important dans stimulation l’élongation

-> Phosphoryle résidu Ser 2 répétitions CTD
-> recrute, phosphoryle + active autre protéine : TAT-SF1 (autre facteur d’élongation)

143
Q

c’est quoi ‘‘la famille ELL’’ ?

A

Une classe de facteur d’élongation

144
Q

Que font les facteurs ELL ?

A

Suppriment arrêts temporaires de l’enzyme = Améliore processivité de Pol II

145
Q

TFIIS fait quoi?

A

rôle dans la stimulation de l’élongation: facteur d’élongation
- diminue le temps de pause de Pol II sur séquences qui ralentissent sa progression
- vérification des nucléotides si ok (élimine base incorrect par hydrolyse)
- Stimule activité RNase de la Pol II ( capable de revenir en arrière pour vérifier)

(comparable à la correction hydrolytique GRE chez bactéries)

146
Q

ARN eucaryote subit modifications quand ?

A

avant exportation du noyau + traduction

147
Q

Le facteur FACT c’est quoi?

A

Hétérodimère de 2 protéines très conservées : Spt16 et SSRP1

148
Q

Le facteur FACT il fait quoi? c’est quoi son mode d’action?

A

Il démantele les nucléosomes en enlevant un dimère H2A/H2B mais aussi les réassemblee en réinsérant dimère après

-> Spt16: lie à H2A/H2B
-> SSRP1 lie tétramère H3/H4
-> FACT extrait 1 dimère H2A/H2B
= Permet à Pol II passer ce nucléosome

FACT: possède aussi activité chaperon d’histone
Devant Pol II en transcription :
-> Permet réinsérer H2A/H2B dans héxamère d’histones derrière Pol II

149
Q

Que voulons-nous dire quand on dit que FACT possède une activité chaperon d’histone ?

A

lui permet de réinsérer H2A/H2B dans héxamère d’histones derrière Pol II

150
Q

Une fois transcrit, ARN eucaryote doit subir différentes modifications avant d’être exporté du
noyau pour être traduit, lesquelles ?

A
  1. Formation de la coiffe à l’extrémité 5’
  2. Épissage de l’ARN
  3. Polyadénylation à l’extrémité 3’ (ajout)
151
Q

c’est quoi la formation de la coiffe 5’ ?

A

Ajout guanine (G) méthylée à extrémité 5’ ARN des qu’il sort du canal de sortie

152
Q

Quelles sont les 3 étapes enzymatiques lors de la formation e la coiffe

A

1ère étape : groupe phosphate est retiré de l’extrémité 5’ ARN
2ème étape : ajout nucléotide GMP
3ème étape : méthylation du GMP

153
Q

Que ce passe-t-il Après ajout de la coiffe

A

Déphosphorylation Ser5 du CTD: dissociation machinerie assemblage coiffe

+

Phosphorylation Ser2 du CTD: assemblage de machinerie épissage

154
Q

Rôles de la coiffe ?

A

-Stabilise ARNm (protège ribonucléases) = + imp,
-Export ARNm dans cytoplasme
-Recrutement ribosome

155
Q

à quoi sert polyadénylation 3’ ?

A
  1. Clivage de ARNm
  2. Ajout grand nb de résidus adénine à son extrémité 3’
  3. Dégradation de l’ARN encore associé à l’ARN Pol II
  4. Terminaison de la transcription
156
Q

Comment fonctionne la polyadénylation 3’ ?

A

Stimule transfert enzymes de polyadénylation du CTD à l’ARN lorsque la Pol II atteint la fin d’un gène et rencontre séquence spécifique (AATAAA)

157
Q

Quel signaux stimulent transfert CPSF et CstF à ARN

A

Signaux Poly-A

158
Q

Lorsque l’ARN est clivé, c’est CPSF ou CstF qui reste sur l’ARN ?

A

CPSF

159
Q

CPSF fait quoi après le clivage?

A
  1. CPSF: recrute Poly-A-polymérase
  2. Ajoute ≈200 A au extrémité 3’ ARN clivé
  3. Recrutement des PABP
  4. Export ARNm mature au cytoplasme

(Poly-A-polymérae a abesoin ATP)

159
Q

V/f: Pol II s’arrete direct après clivage de l’ARN

A

Faux.

on pense qu’Il se déplace sur matrice produisant 2ème molécule ARN

160
Q

c’est quoi le modèle de terminaison de la torpille

A

Extrémité libre 2ème ARN est dépourvue d’une coiffe et elle est reconnu par RNase (Rat1/Xrn2)

= très processive et dégrade rapidement ARN 5’/3’ donc rattrape la Pol II en transcription

-> pousserait Pol II vers avant et/ou arracherait transcrit naissant

161
Q

c’est quoi le Modèle de la terminaison: allostérique

A

dépendrait modification structurale Pol II = Réduit caractère processif Pol II = terminaison spontanée

-> Provoquée par transfert enzymes modifiant ARN (CPSF et CstF) de queue CTD Pol II à ARN

162
Q

L’initiation de la transcription se déroule à un endroit bien précis des gènes, ou ?

A

promoteur

163
Q

V/f: Les polymérases Pol I et Pol III fonctionnent de manière similaire à Pol II mais transcrivent dès gènes qui leurs sont propres

A

vrai

164
Q

La queue CTD de la polymérase permet de quoi?

A

transporter des protéines requises
à toutes les étapes de la transcription d’un gène

165
Q

V/f: Pol I codent des ARN spécialisés et non des protéines

A

vrai

166
Q

V/f: TBP est seulement dans la pol II

A

Faux. pol I, pol II et pol III

167
Q

Pol I code quoi?

A

précurseur des ARNr

168
Q

Promoteur ARNr constitué de 2 parties, lesquelles ?

A

Promoteur central + Élément de contrôle amont (UCE)

169
Q

C’est quoi les deux autres facteurs requis pour initiation de pol I

A

SL1 : comprend TBP + 3 TAFs spécifiques
(fixe promoteur central, mais requiert UBF pour liaison)
UBF : lie UCE qui recrute SL1 = stimule transcription en recrutant Pol I

170
Q

Promoteurs Pol III existent sous différentes formes, lesquelles ?

A
  • Certains contiennent boîte A et boîte B séparées par court élément
  • D’autres portent boîte A et boîte C
  • D’autres portent boîte TATA seulement
171
Q

Vrai ou faux -> Transcription par Pol III nécessite des FTGs

A

Vrai.

172
Q

Quelle est le mode d’action de la Pol III

A

TFIIIB et TFIIIC (gènes ARNt)
TFIIIB, TFIIIC et TFIIIA (gène ARNr 5S)

TFIIIC se lie dans région du promoteur
Attire TFIIIB sur! ADN juste en amont du site d’initiation
Recrute ensuite Pol III au site d’initiation
Pol III utilise TBP inclus dans TFIIIB

173
Q

est-ce que le modèle torpille et allostérique peut co-exister ?

A

Vrai

Génétique (6 decks)

Brainscape helps you reach your goals faster, through stronger study habits.
© 2024 Bold Learning Solutions. Terms and Conditions