F8 klassificering av mikroorganismer

Question 1

teori om hur liv började

Answer 1

• “mineralporer” under havsytan med konstant miljö, mycket energi (H2, H2S)
• RNA bara från början
• sedan kom proteiner, kan göra mer än RNA
• sedan DNA = mer stabilt
• lipidbilager bildas => en cell som kan spridas till andra miljöer => fler organismer bildas

Question 2

syresättning av atmosfären stegvis

Answer 2

1. syre börjar bildas i haven men binds av t.ex. Fe2+
2. hav mättat på syre => O2 läcker ut till land
3. O2 binder till landsmassa
4. landsmassa mättat på O2 => läcker ut i atmosfär
   - aerob respiration och O2 -> O3 (ozon) skydd mot UV-ljus

Question 3

endosymbiontteorin

Answer 3

= att eukaryot cell med cellkärna äter upp en bakterie och lever i symbios, men efter långt tag blir det en organell
- t.ex. mitokondrie, kloroplast (replikerar sig självständigt, cirkulärt DNA osv)

Question 4

primär vs sekundär endosymbios

Answer 4

• primär = eukaryot cell tar upp prokaryot cell och de lever i symbios
• sekundär = eukaryot cell tar upp annan eukaryot cell som redan har genomgått primär endosymbios

Question 5

vad driver evolution?

Answer 5

• mutationer
• genduplikationer
• rekombination
• genetisk drift = slumpmässig ändring i generna

Question 6

varför används lilla rubenhetens rRNA för att se hur många förändringar som skett mellan två arter?

Answer 6

ju fler mutationer mellan två arter desto längre tid mellan dem
1. universell förekomst
2. samma funktion hos alla
3. essentiell => få mutationer tillåts => långsam utveckling så kan beräkna lång tid
4. tillräckligt lång gen/mycket info

Question 7

homologa gener

Answer 7

gener från samma förfader/ursprung

Question 8

ortologa gener

Answer 8

homologa gener som fortfarande har samma funktion

Question 9

paraloga gener

Answer 9

homologa gener som inte längre har samma funktion

Question 10

systematik

Answer 10

studien av diversitet av organismer och deras relationer
- länkar ihop fylogeni och taxonomi

Question 11

fylogeni

Answer 11

släktskap, RNA-sekvenser

Question 12

taxonomi

Answer 12

fenotypiskt (metabolism, utseende osv) och genotypiskt

Question 13

hierarkisk taxonomi

Answer 13

domän, rike, stam osv…
- svårt för prokaryoter, måste gå bara på sekvenser

Question 14

prokaryot art?

Answer 14

• måste ha >97% likhet i 16S rRNA-sekvens med andra av samma art (allra oftast)

Question 15

klinisk klassificering om ej tid till lång utredning

Answer 15

bestämma:
1. morfologiska karaktärsdrag
- storlek, form, färg osv
2. fysiologiska + biokemiska
- förhållande till syre, T, jäsning osv
3. antigen
- förmåga att inducera antikroppar och patogen förmåga
4. känslighet för antibiotika