Organisation des génomes & structure des gènes

Question 1

Quels sont les différents types de séquences ?

Answer 1

Séquences répétées :
- ARN régulateurs, ADNt, ADNr, ORF (Open Reading Frame entre 2 STOP)
- les Transposons
- les satellites, minisatellites, microsatellites

Question 2

Déf microsatellite ?

Answer 2

• Motifs de 1 à 10pb répétés en tandems
• répartis à différents endroits ds génome
• excellents marqueurs car polymorphe i.e. car nb de rép différent selon ind.

Question 3

“Cluster” de gènes répétées? Quésako ?

Answer 3

Signifie plusieurs gènes côte à côte répétés en tandem

Question 4

Que sont les Transposons (ou éléments transposables) ?

Answer 4

• Séquences pouvant se dupliquer & se déplacer ds le génome.
• 44% du génome humain
• Classés suivant séquences & mode de transcription
• Sont immobiles auj
• 1 des mécanismes de l’évolution des génomes

Question 5

Les différents types de Transposons ?

Answer 5

• Type I/rétroptransposons (rétrovirus) : transposons à ARN. Mécanisme de copier-coller (pr se dupliquer) utilisant 1 interméd ARN 1 & reverse transcriptase.
• Type II : transposons à ADN. Mécanisme de couper-coller utilisant 1 interméd d’1 copie d’ADN (enz = transposase).

Question 6

Séquences satellites 🤨 ?

Answer 6

• Rép en tandem
• Abondance variable
• N’importe où ds génome
• Classés selon taille du motif répété
• Certaines séquences ont rôle structural

Question 7

Satellites ? 🛰️??? (Mais nonn)

Answer 7

Séquences contenant motif répété >100pb.

Question 8

Minisatellites ? (Qu’est-ce que c’est que ça encore ?)

Answer 8

Séquences contenant motif répété entre 10 & 100pb

Question 9

Quels sont les ARN non codants (i.e. ne code pas pr 1 prot) ?

Answer 9

• ARNr (ribosomique)
• ARNt (de transfert)
• Petits ARN nucléaires (snARN)
• Petites ARN nucléolaires (snoARN)
• MicroARN (miARN)
• Long ARN non codant (lncARN)/transcrit antisens - rôle pas tjs connu

Question 10

ARNr (ribosomique) ??

Answer 10

Rôle ds la TRADUCTION (composants des ribosomes)

Question 11

ARNt (de transfert) ?

Answer 11

Rôle ds la TRADUCTION (adaptateur entre l’AA & l’ARNm)

Question 12

snARN (petits ARN nucléaires) ?

Answer 12

Rôle ds mécanisme d’épissage

Question 13

snoARN (petits ARN nucléolaires)

Answer 13

Rôle ds mécanisme de maturation des ARNr

Question 14

miARN (MicroARN) ?

Answer 14

Rôle ds régulation de l’expression des gènes (contrôle de traduction des ARNm)

Question 15

Qu’est-ce qu’un GÈNE ? 🧬

Answer 15

Séquence nucléotidique permettant synthèse d’1 (ou plusieurs) pdts (ARN ou prot) ayant 1 fonction ds la C.

Question 16

Composition d’un gène ?

Answer 16

• Séquence transcrite
• Séquences régulatrices (promoteur) de la transcription

Question 17

Déf Génome ?

Answer 17

• Ens du matériel génétique
• Totalité de l’info génétique
• Constitué de mlc d’acides nucléiques (ADN ou ARN)
• Structure & organisation globalement identiques pr tous les ind d’1 même espèces.
• Différence de séquence entre ind d’1 même esp : Polymorphisme génétique.

Question 18

Procaryotes ?

Answer 18

Bact : ADN double brin circulaire (nucléoïde, plasmides)

Question 19

Eucaryote ?

Answer 19

• Noyau : ADN double brin linéaire sous forme K.
• Mitochondrie/Chloroplaste : ADN DB circulaire

Question 20

Que doit avoir un vecteur de clonage ?

Answer 20

• Origine de réplication compatible avec l’hôte
• Sites UNIQUES de restriction (“polylinker” ou MCS (“Multiple Cloning Site”))
• Syst de sélection des C ayant reçu plasmide (C transformées) (ex : résistance à antibiotique)
• Syst de sélection des C transformées par 1 vect contant l’insert (=fragment d’ADN à cloner) : plasmide recombiné. (ex : crible blanc-bleu)

Question 21

Banque d’ADN génomique ?? (🏦🧬??)

Answer 21

Collection CLONE CELLULAIRE qui, ds leur ens, contient totalité de l’ADN génomique de l’orga étudié.

Chaque clone = colonie de C contenant 1 vect recombiné constitué d’1 fragment de l’ADN génomique inséré ds vect de clonage adapté à C-hôte

Question 22

Banque d’ADN complémentaire (ADNc) ?

Answer 22

Collection CLONE CELLULAIRE, ds leur ens, continent totalité des ADNc de l’orga étudié.

ADNc = obtenu, grâce à enz transcriptase inverse / reverse transcriptase, à partir d’ARNm (l’ens des séquences codantes)