ENCODE Flashcards

1
Q

Método adecuado para proteínas que forman el cromatosoma y que se asocian con el ADN en regiones o dominios extensos

A

ChIP-seq para histonas

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2
Q

Método adecuado para proteínas que se espera se unan en puntos delimitados, como secuencias de ADN definidas o configuraciones de cromatina específicas y sirven como reguladoras de la transcripción

A

ChIP-seq para fractores de transcripción

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3
Q

Metodología para experimentos diseñados específicamente para recopilar información sobre bibliotecas de ARN mensajero donde el tamaño de inserción promedio es superior a 200 bases

A

ARN-seq total

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4
Q

Metodología relacionada con transposasas y secuenciación en sitios abiertos de cromatina en todo el genoma

A

ATAC-seq

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5
Q

Metodología que se utiliza para investigar los patrones de metilación del ADN con detalle para cada base del ADN

A

WGB-seq

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6
Q

Es utilizada para el análisis y recuento de ARN pequeños

A

Conteos de miARN

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7
Q

Estudio para caracterizar secuencias de proteínas de unión a ARN (RBP) y sus puntos de unión

A

ARN Bind-N-Seq

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8
Q

Es un enfoque de secuenciación diseñado para identificar sitios de inicio de transcripción (TSS) con resolución al detalle de pares de bases, cuantificar su expresión y caracterizar sus transcritos

A

RAMPAGE / CAGE

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9
Q

Metodología utilizada para el estudio relacionado con el empalme alternativo, así como para caracterizar las isoformas en todo el transcriptoma y su cuantificación

A

Lectura larga de ARN

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10
Q

Es una versión mejorada del ensayo de inmunoprecipitación y se utiliza para identificar los sitios de unión de las proteínas de unión al ARN

A

e-CLIP

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