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JCBCM > BCM 1503 Intra 2 Cours 1 > Flashcards

BCM 1503 Intra 2 Cours 1 Flashcards

1
Q

Quelle est la définition de l’ADN génomique?

A

ADN complet dans les plasmides ou chromosomes. Peut posséder des introns.

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Q

Qu’est-ce que le processus pour transformer l’ADN génomique en ADNc ou ARNm?

A

l’épissage (alternatif)

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3
Q

qu’est-ce que le paradoxe de la valeur-C?

A

La quantité de matériel génétique dans un génome haploïde ne corollaire pas à la complexité de l’espèce.

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4
Q

Quel est le pourcentage de gènes uniques dans le génome humain?

A

3%

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5
Q

Quel est le pourcentage de gènes dupliqués dans le génome humain?

A

> 50%

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6
Q

Qu’est-ce que l’unité de mesure “nt”?

A

Nombre de nucléotides.

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7
Q

Quelle est la taille moyenne d’un ARN post-épissage.

A

1000 nt

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8
Q

Est-ce qu’un ARNm va toujours être exprimé de la même manière?

A

Non, cela dépendra du tissu dans lequel il ce trouve. Aussi, l’épissage alternatif peut différer ce qui créera des isoformes à partir d’un seul gène.

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9
Q

Qu’est-ce qu’un vecteur chimérique?

A

Il s’agit de l’ADN exogène que l’on veut introduire dans un plasmide.

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10
Q

Comment isole-t-on des espèces bactériennes génétiquement modifiées.

A

Sur gélose on crée un milieu sélectif qui ne permet qu’aux bactéries génétiquement modifiées de survivre.

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11
Q

Nomme 3 techniques permettant de déterminer la nature de l’ADN exogène ayant été introduit dans le matériel génétique d’une bactérie.

A
  1. enzymes de restrictions
  2. séquençage de l’ADN
  3. hybridation moléculaire
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12
Q

Quelle algorithme d’NCBI doit-on utiliser pour comparer de l’ADN à du matériel génétique?

A

Blastn

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13
Q

Quelle algorithme d’NCBI doit-on utiliser pour comparer de l’ADN à des protéines?

A

Blastx

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14
Q

Quelle algorithme d’NCBI doit-on utiliser pour comparer des protéines à des protéines?

A

tblastp

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15
Q

Quelle algorithme d’NCBI doit-on utiliser pour comparer des protéines à du matériel génétique?

A

tblastn

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16
Q

Comment peut-on trouver des informations sur les fonctions des protéines? (4)

A

Dans NCBI:
1. Conserved domains
2. OMIM
3. PubMed
4. Gene

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17
Q

Comment peut-on déterminer les fonctions d’une protéine seulement avec une séquence génétique?

A

Certaines protéines de différentes espèces, ou exprimées par différents gènes vont avoir une séquence génétique codant pour certains acides aminés spécifiques qui sont fortement liés aux fonctions de la protéine. (généralement le site actif) Si une autre protéine connu possède le même site actif, il y a de fortes chances que les fonctions de cette nouvelle protéine soient similaire.

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18
Q

Quels sont les désoxyribonucléotides et a quoi servent-ils?

A

Ils servent à la synthèse de l’ADN
- dATP
- dGTP
- dCTP
- dTTP

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19
Q

Quels sont les ribonucléotides et a quoi servent-ils?

A

Il servent à
- la synthèse de l’ARN
- la régulation de voie métaboliques (ATP, GTP)
- Signalisation hormonale (AMPc, GTPc)
- Co-enzymes (adénine)
Les ribonucléotides sont
- ATP
- GTP
- CTP
- UTP

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20
Q

Quel carbone du ribose peut être déshydroxylé?

A

le deuxième

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21
Q

Quel carbone du ribose porte la base azoté?

A

le premier

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22
Q

Quels carbones du ribose porte les liens ester phosphate?

A

le troisième et le cinquième

23
Q

Quelles sont les 3 manière de synthétiser des nucléotides?

A
  1. dégradation des ARN et ADN
  2. La récupération de bases libres par liaison PRPP (wtf is that?)
  3. métabolisme
24
Q

Qu’est-ce que la structure Watson-Crick?

A

l’ADN double brin photographier au rayons X par Rosalind Franklin

25
Q

Quelles sont les paires de bases Watson-Crick?

A

Les paires de bases:
Deux ponts H A-T
Trois ponts H G-C

26
Q

Qu’est-ce qu’un pas d’hélice?

A

La distance entre les ribose où l’hélice fait un 360º.

27
Q

Qu’est-ce qu’un sillon?

A

l’angle entre les carbone1 des riboses de bases azotés complémentaires, qui donne le positionnement des hélices de l’ADN.

28
Q

Comment sont les sillons d’un ADN-B?

A

Sillons asymétriques, donc sillon majeur et mineur

29
Q

Comment sont placer les brins d’ADN en forme bicaténaire? (5’-3’)

A

Anti-parallèle

30
Q

Comment sont placées les bases par rapport à l’axe de l’hélice?

A

perpendiculairement

31
Q

Quand est-ce que l’on retrouve de l’ADN A?

A

Dans des milieu moins humide. (sporulation)
Les paires de bases sont inclinées de 20º par rapport à l’ADN B. Cette angle amplifie fortement les sillons majeur et mineurs que l’on observe dans l’ADN B.

32
Q

A quoi servirait la forme Z de l’ADN?

A

Peut servir à modifier l’expression génétique. Elle est aussi la seul que ses pas d’hélices sont à gauche.

33
Q

Comment l’ADN Z devient gauche lors du changement de conformation?

A

Les paires de bases font une rotation de 180º selon leur axe de liaison.

34
Q

Quelle conformation porte les bases dans la double hélice, par rapport à leur lien avec le ribose?

A

Elle est anti dans l’ADN B et A (ponts H qui vont s’éloigner du ribose)
Elle est syn dans l’ADN Z

35
Q

Quel trait de la structure de l’ADN permet l’interaction avec les protéines?

A

Les sillons exposent la bases azotées. La spécificité des séquences permet aussi une reconnaissance spécifique des protéines.

36
Q

Qu’est-ce que TBP-ADN?

A

Une protéine qui a comme rôle d’élargir un sillon mineur. Elle reconnait la séquence TATA et plie l’ADN d’environ 80º.

37
Q

Quels sont les ARN non-codant et quels sont leur rôle? (3)

A
  1. ARNr et ARNt sont des co-facteur à la traduction
  2. miARN et longARN sont des régulateurs post-transcriptionnels et qui régule la traduction
  3. Riboxymes ont des propriétés catalytiques
38
Q

Quelle structure porte les codons?

A

ARNm

39
Q

Quelle structure porte l’anti-codon?

A

ARNt

40
Q

Quelles sont les 3 structures simples brins entre les sections doubles brins dans l’ARN?

A
  1. Tiges/Boucles
  2. Hernis
  3. Boucles
41
Q

Qu’est-ce que la structure qui peut former les structures simple brin naissant des sections doubles brins de l’ARN?

A

Des pseudo-noeuds

42
Q

Quelles nouvelles paires de base peut être formé dans l’ARN, mais pas dans l’ADN? (2)

A
  1. Paires (T)U:G
  2. Paires U:A:U
43
Q

Qu’est-ce qu’une tétraboucle?

A

Une boucle à 4 cycles que l’on observe chez l’ARN. Les bases sont empilées les unes sur les autres pour stabiliser une structure particuliaire.

44
Q

A quelle structure ressemble à l’ARN double brin?

A

L’ADN A

45
Q

Comment appelle-t-on une protéine composé d’ARN et d’une protéine?

A

Des complexes ribonucléoprotéiques

46
Q

Que retrouve-t-on à l’extrémité 3” des ARNt?

A

Une section simple brin où est attaché l’acide aminé

47
Q

Comment est positionné l’anti-codon par rapport au codon?

A

anti-parallèle
5’—3’
3’—5’

48
Q

Comment les sARN peuvent affecter la traduction en s’attachant à l’extrémité 5’ de l’ARNm?

A

Ils peuvent activer la traduction si le site de reconnaissance est masqué par une formation double brin de l’ARNm. Le sARN complémentaire à la section double brin permettra la libération du site de reconnaissance.

Si l’ARN est simple brin un sARN complémentaire peut venir bloquer le site actif.

49
Q

Qu’est-ce qui contrôle l’expression génétique responsable de réguler la division cellulaire?

A

Des mi-ARNs

50
Q

Quel miARN est en déficits dans une tumeur?

A

Le miARN qui inhibent des oncogènes

51
Q

Quel ligand utilise les ribocommutateurs?

A

SAM

52
Q

Est-ce qu’un ARNm peut être régulateur?

A

Hypothétiquement peut-être que oui. Avec des sections d’ARN complémentaires à celui d’un autre ARNm il possèderait peut-être la capacité à inhiber la traduction comme les miARN.

53
Q

Comment la localisation de traduction est contrôlé dans des cellules?

A

Par transport contrôlé de l’ARN via le cytosquelette

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