L'électrophorèse

Question 1

Prédire les propriétés physico-chimiques du sodium dodécyl sulfate (SDS)

Answer 1

Molécule amphiphile
Longue chaîne aliphatique hydrophobe
Tête chargée négativement hydrophile
Le SDS est un détergent anionique

Question 2

Comment agit le SDS?

Answer 2

Casse toutes les liaisons non covalentes dans les protéines par compétition:
* liaisons hydrophobes (interaction avec queue hydrophobe du SDS)
* liaisons ioniques (interaction avec la charge du sulfate)
* liaisons hydrogène (interaction avec les oxygènes du SDS, accepteurs de liaisons hydrogène)

Question 3

Qu’est-ce que l’électrophorèse?

Answer 3

C’est une technique fondée sur le déplacement de molécules chargées sous l’effet d’un champ électrique
- support: gel de polyacrylamide

Question 4

Les molécules sont elles chargées?

Answer 4

Oui, les protéines sont chargées de par la présence de fonctions acides et basiques sur les chaines latérales de certains résidus
La charge totale des protéines
dépend de leur composition en
résidus acides ou basiques.

-
l
l
l
+

Question 5

Qu’arrive après la dénaturation des protéines par les SDS?

Answer 5

Après dénaturation des protéines par le SDS, ce détergent reste associé très
fortement aux protéines.
* En moyenne une molécule de SDS s’associe à deux résidus
–>Rapport du nombre de molécules de SDS (donc de charges -) par rapport au nombre de résidus fait que la protéine est globalement chargée
négativement quel que soit la nature des acides aminés qui la composent

Question 6

Quel est le seul problème de la SDS? Comment est-il résolu?

Answer 6

Ne desestabilise pas les pont de disulfure entre résidus cystéines

Cela est résolu par la réduction. des ponts de disulfure par le beta mercahepéthanol

Question 7

Qu’ont en commun les résidus Glu et Asp ?

Answer 7

Charge négative

Question 8

Charge de Ser et Lys

Answer 8

Ser non chargée et Lys chargé +