Κεφάλαιο 2 Flashcards
Από ποιο ένζυμο καταλύεται η μεταγραφή;
RNA pol
Πόσα είδη RNA pol Υπάρχουν σε ένα ευκαρυωτικό κύτταρο;
3
Ποια είναι τα ρυθμιστικά στοιχεία της μεταγραφής
Υποκινητές και οι μεταγραφικοί παράγοντες
Που βρίσκονται οι υποκινητές;
Βρίσκονται πάντοτε πριν από την αρχή κάθε γονιδίου
Τι είναι οι μεταγραφικοί παράγοντες;
Ειδικές πρωτεΐνες που βοηθούν την RNA πολυμεράση να προσδεθεί στον υποκινητή κάθε γονιδίου που πρόκειται να μεταγραφεί
Ποια είναι τα βήματα της μεταγραφής;
Κατά την έναρξη της μεταγραφής ενός γονιδίου η RNA πολυμεράση προσδένεται στον υποκινητή και προκαλεί τοπικό ξετύλιγμα της διπλής έλικας του DNA. Στη συνέχεια τοποθετεί τα ριβονουκλεοτίδια απέναντι από τα δεοξυριβονουκλεοτίδια της μίας αλυσίδας του DNA Σύμφωνα με τον κανόνα συμπληρωματικότητας των βάσεων όπως και στην αντιγραφή με τη διαφορά ότι εδώ απέναντι από την αδενίνη τοποθετεί το ριβονουκλεοτίδιο που περιέχει ουρακίλη. Η RNA πολυμεράση συνδέει τα ριβονουκλεοτίδια που προστίθενται το ένα μετά το άλλο με 3’-5’ Φωσφοδιεστερικό δεσμό. Η μεταγραφή όπως άλλωστε και η αντιγραφή έχει προσανατολισμό 5’-3’.Η σύνθεση του RNA σταματά στο τέλος του γονιδίου όπου ειδικές αλληλουχίες που ονομάζονται αλληλουχίες λήξης της μεταγραφής επιτρέπουν Την απελευθέρωση του μορίου RNA
Διάφορες αντιγραφής-μεταγραφής
Α. Η αντιγραφή του DNA συμβαίνει καθόλο το μήκος του μορίου ενώ η μεταγραφή μόνο σε ένα τμήμα του , το γονίδιο
Β. Κατά την αντιγραφή κάθε αλυσίδα του DNA αποτελεί καλούπι για τη σύνθεση μίας συμπληρωματικής ενώ στην μεταγραφή ως καλούπι χρησιμοποιείται μόνο μια αλυσίδα
Γ. Από την αντιγραφή παράγονται μόρια DNA, από την μεταγραφή RNA
RNA pol vs DNA pol
-  Η RNA πολυμεράση Αρχίζει τη σύνθεση μιας αλυσίδας νουκλεοτιδίων χωρίς βοήθεια κάτι που η DNA πολυμεράση αδυνατεί και χρειάζεται το Πριμόσωμα
- Η RNA πολυμεράση σπάζει μόνη της τους δεσμούς υδρογόνου μεταξύ των συμπληρωματικών αλυσίδων του DNA ενώ η DNA πολυμεράση χρειάζεται τις DNA ελικάσες για αυτό
- Η RNA πολυμεράση ολοκληρώνει μόνη της τη σύνθεση μιας πολυνουκλεοτιδικής αλυσίδασ ενώ η DNA πολυμεράση χρειάζεται την DNA δεσμάση για να ενώσει τα επιμέρους τμήματα
- Η DNA πολυμεράση Διορθώνει τα λάθη της κάτι που η RNA πολυμεράση δεν επιτυγχάνει
Πως γίνεται και η μετάφραση του mRNA στα προκαρυωτικά κύτταρα Αρχίζει πριν ολοκληρωθεί η μεταγραφή του;
Τα προκαρυωτικά κύτταρα δεν διαθέτουν πυρηνική μεμβράνη
Τι είναι τα εσώνια;
Ενδιάμεσα αλληλουχίες που δεν μεταφράζονται
Τι είναι τα εξώνια;
Αλληλουχίες που μεταφράζονται
Πως γίνεται το πρόδρομο mRNA Λειτουργικό
Με ωρίμανση
Πως δημιουργείται το πρόδρομο mRNA
Όταν ένα γονίδιο που περιέχει Εσώνια μεταγράφετε
Τι συμβαίνει κατά τη διαδικασία της ωρίμανσης
Τα εσώνια κόβονται από μικρά ριβονουκλεοπρωτεϊνικά σωματίδια και απομακρύνονται
Πες μου τα πάντα για τα Ριβονουκλεοπρωτεϊνικά σωματίδια
Αποτελούνται από snRNA Και πρωτεΐνες και λειτουργούν ως ένζυμά καθώς κόβουν τα εσώνια και συρράπτουν τα εξώνια μεταξύ τους
Είναι ο μηχανισμός μεταγραφής ο ίδιος για όλα τα μόρια mRNA?
Ναι
Παραδείγματα σωματιδίων
1: Ριβοσώματα
2: Ριβονουκλεοπρωτεϊνικά σωματίδια
3: νουκλεοσώματα
Παραδείγματα οργανιδίων
- Πυρήνας
- Μιτοχόνδριο
- Χλωροπλάστες
Ποια Ένζυμα Συνδέουν νουκλεοτίδια με 3’-5’ Φωσφοδιεστερικό Δεσμό;
- πριμόσωμα
- DNA pol
- DNA δεσμάση
- επιδιορθωτικά ένζυμα
- αντίστροφη μεταγραφάση
- RNA pol
- ριβονουκλεοπρωτεϊνικά σωματίδια
Το ώριμο mRNA έχει Περιοχές που δεν μεταφράζονται σε αμινοξέα Οι οποίες είναι οι
5’-3’ Αμετάφραστες περιοχές
Που μεταφέρεται το ώριμο mRNA?
Στο κυτταρόπλασμά και συγκεκριμένα στο Ριβόσωμα
Τι ονομάζεται Γενετικός κώδικας;
Η αντιστοίχιση των τριπλετών αζωτούχων βάσεων του mRNA με τα αμινοξέα που συνδέονται σε πολυπεπτιδική αλυσίδα κατά τη μετάφραση
Ποια τμήματα DNA μεταγράφονται αλλά δεν μεταφράζονται;
- Εσώνια
- Οι 5’-3’ αμετάφραστες περιοχές συμπεριλαμβανομένου και του κωδικόνιου λήξης
- Τα γονίδια που μεταγράφονται σε tRNA, snRNA και rRNA
Χαρακτηριστικά γενετικού κώδικα
- Ο γενετικός κώδικας είναι κώδικας τριπλέτας, δηλαδή μια τριάδα νουκλεοτιδίων η οποία ονομάζεται κωδικόνιο , που κωδικοποιεί ένα αμινοξύ
- ο κώδικας είναι συνεχής , διότι το mRNA διαβάζεται συνεχώς ανά τρία νουκλεοτίδια χωρίς να παραλείπεται κάποιο από αυτά
- Ο γενετικός κώδικας είναι μη επικαλυπτόμενος , διότι κάθε νουκλεοτίδιο ανήκει σε ένα μόνο κωδικόνιο
- Ο γενετικός κώδικας είναι σχεδόν καθολικός. Όλοι οργανισμοί έχουν τον ίδιο γενετικό κώδικα αυτό σημαίνει ότι το mRNA από οποιοδήποτε οργανισμό μπορεί να μεταφραστεί σε εκχυλίσματα φυτικών , ζωικών ή βακτηριακών κυττάρων in vitro και να παράγει την ίδια πρωτεΐνη
- Ο γενετικός κώδικας είναι εκφυλισμένος καθώς με εξαίρεση δύο αμινοξέα(τρυπτοφάνη και μεθειονίνη) Τα υπόλοιπα κωδικοποιούνται από δύο μέχρι έξι διαφορετικά κωδικόνια. Τα κωδικωνια που κωδικοποιούν το ίδιο αμινοξύ ονομάζονται συνώνυμα
- Ο γενετικός κώδικας έχει ένα κωδικόνιο έναρξης και τρία κωδικώνια λήξης. Το κωδικώνιο έναρξης σε όλους τους οργανισμούς είναι το AUG και κωδικοποιεί το αμινοξύ μεθειονίνη.Τα κωδικόνια ληξης ειναι τα UGA, UAA , UAG η παρουσία των οποίων στο μόριο του mRNA οδηγεί στον τερματισμό σύνθεσης της πολυπεπτιδικής αλυσίδας