2-Chromatographie Flashcards

(31 cards)

1
Q

les propriétés communément utilisées pour effectuer le fractionnement sont

A
  • les interactions ioniques (Chromatographie par échange d’ions)
  • la taille (Chromatographie par gel-filtration)
  • la spécificité (Chromatographie d’affinité)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

un échangeur de cations…

A

porte des groupes chargés négativement (R-) et lierait

des cations de manière réversible

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

l’affinité avec laquelle une protéine se lie à un échangeur d’ions dépend de

A
  • du pH de la solution

- de la nature et des concentrations des autres ions en solution

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

les échangeurs utilisés en chromatographie des protéines dépendent de deux
caractéristiques importantes:

A
  • La nature de leur matrice.
  • Le type de groupement fonctionnel utilisé pour favoriser
    l’attachement de la protéine
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

les matrices utilisées en chromatographie sont…

A

des polymères insolubles

préparés sous formes de billes, appelées familièrement résines

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

les polymères le plus souvent utilisés sont…

A

des polysaccharides comme le cellulose

ou des dérivés du cellulose, de l’agarose ou autres polymères

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

échangeur fort…

A

reste

pleinement chargé entre pH ~ 3 et ~ 10

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

QAE

A

amine quaternaire - (N+ pKa ~ 9.5) à échangeur anionique fort

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

sulfonates

A

échangeur cationique fort.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

DEAE

A

amine tertiaire - partiellement chargé à partir de pH 7 à 8 à
échangeur anionique faible.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

CM

A

carboxyméthyle - pleinement chargé à partir de pH 4.5 à échangeur
cationique faible.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

protéines se lient aux échangeurs par…

A

des forces électrostatiques

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

plus l’affinité de liaison d’une protéine pour l’échangeur est forte, plus la migration est…

A

lente

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

procédé d’élution fractionnée

A

un tampon de

concentration saline supérieure au tampon de lavage

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

procédé d’élution par gradient

A

les gradients de sels sont le moyen le plus souvent utilisés afin d’éluer les
protéines adsorbées sur l’échangeur

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Sels utilisés pour former des gradients

17
Q

chromatographie par gel-filtration sépare les molécule par…

A

taille et forme

18
Q

Les principes de cette méthode: (3)

A

1- phase stationnaire (résine) xonsiste en un résau de polymères réticulé possédant des pores
2- pores dans les billes du gel laisse rentrer des petites molécules (limite d’exclusion)
3- protéines qui pénètrent pas dans les pores traversent la colonne plus vite

19
Q

matrices sont faites à partir de quoi…

A

polymères insolubles à base de polysaccharides comme:

le dextrane, l’agarose ou le polyacrylamide

20
Q

la porosité des gels dépend de…

A

la masse moléculaire du polymère
et
nombre de liaisons entre molécules du polymères

21
Q

qu’est ce que le volume d’élution?

A

volume de solvant nécéssaire pour éluer la protéine après son dépôt sur la colonne

22
Q

Volume total de la colonne= ?

A

Vt= Vx + Vo
Vx: Volume occupé par les billes
Vo: Volume mort

23
Q

membranes (saran wrap) utilisés pour la dialyse sont fait de…

A

cellophane (cellulose)

24
Q

sous divisons de filtration moléculaire…

A

filtration moléculaire—-> dialyse—–> centrifugation sur colonne filtre

25
chromatographie d'affinité
ligand qui lie avec protéine d'intérêt
26
comment récupérer la protéine dans une chromatographie d'affinité?
- ajout d'excès de ligand libre - changer pH - changer force ionique et,ou la température
27
Kd de l'interation ligand-matrice doit varier entre...
10-4 M et 10-10M et ne doit pas interférer dans l'interaction protéine-ligand
28
quantité de protéine retenue dépand de (3)...
- du KD' ( trop faible si plus grand que 10-4M) - concentration de protéine dans l'extrait - degré de liaison du ligand à la matrice
29
matrice utilisée pour la chromatographie d'affinité doit être ... (3)
- chimiquement inerte - avoir uhe grande porosité - présenter de nombreux groupements fonctionnels
30
liaison entre matrice d'agarose et ligand se fait en deux temps...
1. réaction de l'agarose avec du bromure du cyanogène, qui produit un intermédiaire activé et stable 2. ligand réagit avec le l'agarose activé pour donner un produit lié par covalence
31
Détection des protéines lors de l'élution d'une colonne chromatographique
1) absorption des protéines dans l'UV 2) essai colorimétrique 3) essai enzymatique 4) détection de la protéine sur gel SDS-Page 5) détection avec anti-corps