הרצאה 3

Question 1

באיזה שלב התאים הם

totipotent?

מתי התאים הופכים ל

pluripotent?

לאיזה סוג התאים שהיו ב

inner cell mass

יכולים להתחלק?

מהן שלוש ששכבות הנבט, ובגסות, למה כל אחת מהן הופכת?

Answer 1

Question 2

אילו תאי גזע יש בבוגרים? למה הם יכולים להתמיין? איפה הם נמצאים? למה נוכל לגרוםלהםלהתמיין במעבדה?

Answer 2

Question 3

מהי שושלת התאים?

איזה שלבים היא כוללת?

תאר כל שלב

Answer 3

Question 4

מהם

instructive factors?

מהם

extrinsic factors?

על מה הם משפיעים?

Answer 4

Question 5

כמה קומבינציות שונות של תאים יכולים לתת שלוש פקטורי שעתוק בעלי שני מצבים - פועל ולא פועל?

Answer 5

Question 6

מהו המנגנון העיקר של בקרת הביטוי הגנטי?

Answer 6

שעתוק זה המנגנון העיקרי בבקרת ביטוי גנטי. אבל יש גם בקרה פוסט-שעתוק כמו ייצוא

mRNA

splicing

תרגום חלבונים, עיבוד ומודיפיקציות פוסט-תרגומיות .

Question 7

מהן איזורי ציס ומהם איזורי טראנס?

Answer 7

Question 8

מי הם פקטורי השעתוק הכלליים שקיימים בתא, שנמצאים לצורך שעתוק של דנא? איפה הם מתחברים ביחס לאיזור תחילת השעתוק?

מה זה

enhancer?

מה מתחבר אליהם? אקטיבטורים או רפרסורים?

Answer 8

Question 9

האם פקטור שעתוק מסויים חייב להיות רק אקטיבטור או רק רפרסור?

איך נקרא פקטור שעתוק שיכול להיות גם וגם?

Answer 9

פקטור שעתוק שיכול להיות גם וגם נקרא פקטור שעתוק פליאוטרופי

Question 10

מה הקונספט שמנים להעביר לנו בתמונה?

Answer 10

Question 11

מהו

feed forward mechanism?

איזה תא אנחנו מכירים שעובד בצורה הזו?

Answer 11

Question 12

מה ניתן לומר על הביטוי של הגן

even skipped?

איך הוא מתבטא בהתחלה ואיך בהמשך? מה מאפשר את השינוי הזה?

Answer 12

Question 13

מהו קוד ההיסטונים? איזה סוג בקרה הוא עושה?

מה עושה היסטון אצטילאז?

מה עושה היסטון אצטילז טרנספראז וקינאזות?

מה עושה היסטון מתילאז טרנספראז?

Answer 13

Question 14

לפני שיש התמיינות של תאים נצפה לראות הרבה הטרוכרומטין או הרבה כרומטין פתוח?

Answer 14

בהתחלה, כשהתאים עוד לא התמיינו זה מצב דיפולט של הטרו-כרומטין, וכדי שתהיה
התמיינות צריך לפתוח את ההטרו-כרומטין .

Question 16

מהו הניסוי שעשו בתרנגולים שהוכיח את הקשר בין מבנה הכרומטין לביטוי הגן?

Answer 16

Question 17

מה זה

positive autoregulation?

איך זה עובד בתא שריר (באופן כללי, לא ספציפי)

Answer 17

Question 18

מה הקשר בין פקטרוים חיצוניים לפקטורים פנימיים שמשפיעים על שעתוק של גנים?

Answer 18

Question 19

איזה סוג תאים רואים בכל שלב של התמונה?

מה גורם למעבר משלב 1 לשלב 2? מה התאים מפסיקים לעשות במעבר הזה?

Answer 19

Question 20

מה יקרה אם נחבר תא שריר של עכבר לתא לתא כבד של אדם? מה המשמעות של התוצאה?

Answer 20

Question 21

תאר את הניסויים בעזרתם גילו את הגן

MyoD

Answer 21

Question 22

איך נקראת משפחת החלבונים אליה שייך החלבון

MyoD?

איזה עוד חלבונים המשפחה מכילה?

באיזה אופן החלבונים עובדים? (לבד? ביחד? בדימר עם חלבון אחר?)

Answer 22

Question 23

מה התמונה באה להדגים?

Answer 23

מה שצבוע בכחול בתמונה זה כמות ביטוי של הגן

MyoD.

ניתן לראות שיש הרבה ממנו בסומיטים, ושהוא מתחיל לנדוד לכיוון הבטן ולכיוון הגפה העליונה התחתונה. אלו איזורים בהם אנחנו יודעים שאמוריםלהתפתח שרירים

Question 24

עם מי חלבוני ה

MyoD

יודעים להקשר כדימר? איזה חלק בחלבון

MyoD

נקשר לדנא? מה בתכונות החלבון מאפשר זאת? איזה חלק שלו מאפשר לו להקשר כדימר לחלבון הנוסף אליו הוא נקשר?

איך נקרא הרצף דנא אליו נקשר

MyoD?

איזה נוקלאוטידים הוא מכיל?

באיזה תאים מתבטאים החלבונים איתם

MyoD

עובד כדימר?

איזה חלבונים מהווים אקטיבטורים לפעילות של

MyoD

ואיזה חלבונים עובדים כרפרסורים? איך עובדים הרפרסורים האלה?

Answer 24

Question 25

מאיזה חלק בעובר נוצרים על שרירי השלד מהצוואר מטה?

Answer 25

מהסומיטים

Question 26

איפה נמצאים הסומיטים? כשנלך לאיזה כיוון נקבל סומיטים יותר בוגרים? לכיוון הראש או הרגל? חלוקה לאיזה שתי קבוצות עובר הסומיט? מה נוצר מכל קבוצה? באיזה אופן הקבוצה השנייה נודדת ביחס לראשונה? (מעליה? מתחתיה?)

Answer 26

Question 27

1

Answer 27

Neural tube

Question 28

2

Answer 28

Epaxial dermomyotome

Question 29

3

Answer 29

Dermomyotome

Question 30

4

Answer 30

Myotome

Question 31

5

Answer 31

Hypaxial dermomyotome

Question 32

6

Answer 32

Mygrating myogenic progenitor cells

Question 33

7

Answer 33

pre muscle mass

Question 34

8

Answer 34

Limb

Question 35

9

Answer 35

Sclerotome

Question 36

10

Answer 36

Notochord

Question 37

באיזה איזור בסומיט מתבטא MyoD? איזה שרירים יווצרו מאיזור זה? באיזה איזור בסומיט מתבטא Myf-5? איזה שרירים יווצרו מאיזור זה? מתי מתבטא MRF4? מתי מתבטא Myogenibn?

Answer 37

MyoD: expressed in hypaxial (limbs, abdominal) myotome כלומר ייצור את שרירי הגפה והבטן Myf-5: expressed in epaxial (back) myotome כלומר ייצור את שרירי הגב MRF-4: expresed as myoblasts differentiate into myotubes and myofibers כלומר הוא מתבטא בשלב מאוחר יותר, בשלב הדיפרנציאציה של המיובלסטים Myogenin: expresed as myoblasts differentiate into myotubes and myofibers גם הוא מתבטא בשלב מאוחר יותר. מצורפת תמונה

Question 38

מוסתרים סיגנלים שהולכים למקומות שונים בסומיט. מהם הסיגנלים? 1

Answer 38

BMP4 noggin

Question 39

מוסתרים סיגנלים שהולכים למקומות שונים בסומיט. מהם הסיגנלים? 2

Answer 39

Wnt

Question 40

מוסתרים סיגנלים שהולכים למקומות שונים בסומיט. מהם הסיגנלים? 3

Answer 40

Shh

Question 41

לאיזה איזור של הסומיט הולך הסיגנל Wnt למה הוא גורם? מי מוציא את הסיגנל? מי מוציא את הסיגנל Shh לאן הוא הולך ואיך הוא משפיע? מי מפעילאת הסיגנל BMP לאן הוא הולך ועל מה משפיע?

Answer 41

לא כתוב אבל הלטרל מזודרם מוציא BMP4

Question 42

מהם השלבים השונים של התמיינות שריר שלד? איזה גונים פועלים בכל שלב?

Answer 42

הבהרה: MyoD, MyF5 הם גנים שנמצאים במיובלסטים. ברגע שמסירים מהאיזור את הפקטורי גידול, התאים המיובלסטים יפסיקו להתחלק ויתחילו להתמיין לתאי שריר של ממש. אז יבואו לידי ביטוי גנים כמו Myogenin Mrf4

Question 43

מה נקבל אם נעשה נוקאאוט ל MyoD בלבד? ל MyF5 בלבד? לשניהם? מה יקרה אם יעשו נוקאאוט למיוגנין?

Answer 43

Question 44

מה המנגנון שגורם לכך שכשיש פקטור גדילה אין התקדמות להתמיינות לשריר ושכשאין פקטור גדילה יש התמיינות?

Answer 44

ניתן לראות שכשיש פקטור גדילה FGF מופעל הקומפלקס CyclinD1-Cdk4 שגורם לפרוליפרציה ועוצר את MyoD מלקדם התמיינות. כשמרחיקים את פקטור הגדילה העיכוב של מיוד מפסיק, הוא גם מוביל להתמיינות, וגם מפעיל את החלבון p21 שמונע גדילה

Question 45

האם MyoD ו Myogenin מתחברים לאותו איזור בדנא? האם יש להם את אותם חלקים? על מה אחראי כל אחד מהגנים?

Answer 45

Question 46

מה יש בחלבון MyoD שאין בחלבון myogenin?

Answer 46

היסטדין ציסטאין והליקס 3, כפי שניתן לראות בתמונה

Question 47

מה התפקיד של החלקים היסטידין ציסטאין והליקס 3 במיוד?

Answer 47

הם מביאים חלבונים שמשפיעים על מבנה הכרומטין: Histone acetylreansferase הוא עושה הצטליציה של היסטונים וגורם לפתיחת הכרומטין למיוג'נין אין את החלקים האלה ולכן הוא לא משפיע על מבנה הכרומטין.

Question 48

מהם הקומפלקסים Swi/snf? למי הם יכולים להתחבר?

Answer 48

הם יכולים להתחבר רק למיוד ולא למיוג'נין. זה קומפלקס שבאמצעות אנרגיית ATP יכול לפתוח כרומטין

Question 49

למי מיוד קשור במיובלסט, שמונע ממנו לפעול? למי הוא קשור בהיעדר פקטור גדילה?

Answer 49

במיובלסט, כשיש פקטורי גדילה באיזור, הוא קשור לקומפלסקס HDAC שמעכב אותו. בהיעדר פקטורי גדילה HDAC עובר לציטופלזמה, ואז מיוד נקשר ל HAT שמסוגל לעשות אצטילציה להיסטונים ולרווח את הדנא.

Question 50

איך נראה אתר הקישור של myoblast ושל myogenin מה יכולת הקשירה של מיוד אליו במיובלסט? איך הוא בסוף מצליח להקשר אליו? מתי מיוג'נין יוכל להתבטא?

Answer 50

Question 51

מיוד נקשר ל25,000 אתרים בגנום אך משפיע רק על 1900 גנים. למה?

Answer 51

Question 52

מהו המנגנון feed forward? איך הוא קשור ל MyoD?

Answer 52

Question 53

מהם תאי satellite? למה הם יהפכו בגלל סיגנל? מתי יגיע הסיגנל? איזה פקטורים נראה מופעלים בכל שלב של ההתמיינות שלהם?

Answer 53

אלו תאי גזע יוניפוטנטים שיכולים להפוך לשריר. הם יופעלו בעת פציעה שיש צורך לתקן. השאר בתמונה