4 paskaita Flashcards

1
Q

Kas pasižymi hisotnų acetiltransferazės aktyvumu

A

Gcn5p, mielių transkripcijos aktyviklis

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

kas pasižymi histonų deacetilazės aktyvumu

A

Rpd3p, transkripcijos slopiklis

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

kaip veikia potransliacijnės histonų baltymų modifikacijos

A

hisotnai po transliacijos yra modifikuojami prijungiant prie jų aminorūgščių liekanų įvairias chemines grupes, baltymus

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

kam histonų modifikacijos daro įtaką

A
  • histonų sąveikai su DNR nukleosomoje
  • sąveikai tarp nukleosomų
  • histonų sąveikai su kitais baltymais, kurie valdo chromatino veiklą
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

kokios yra modifikacijų pasekmės

A
  • suardoma sąveika tarp nukleosomų, chromatinas tampa lengviau prieinamas
  • modifikacijas atpažįsta nehistoniniai baltymai
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

kas yra modifikuojami ląstelėje

A
  • šerdiniai histonai
  • šerdinių histonų variantai
  • jungties histonai
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

kas dažniausiai acetilinama histonuose

A

lizino e-amino grupė

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

ką liudija chromatino imunoišsodinimo eksperimentai

A

kad acetilinti histonai yra aktyviai transkribuojamuose chromatino regionuose

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

kas acetilina histonų lizino aminorūgščių liekanas

A

histonų acetiltransferazės, HAT

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

kas deacetilina aminorūgščių liekanas

A

histonų deacetilazės, HDAC

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

kur acetilinamas H3

A

H3 lizinas 14

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

kur acetilinamas H4

A

H4 lizinas 8 ir 16

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

kokių a.r. liekanos metilinamos histonuose

A

lizino ir arginino

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

kas metilina histonus

A

histonų metiltransferazės, HMT

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

kaip metiltransferazės metilina histonus

A

perneša metilgrupę nuo S-adenozilmetionino ant aminorūgšties

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

kokie fermentai demetilina histonus

A

demetilazės

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

kokios a.r. yra fosforilinamos

A

serino, tirozino, treonino
(jų hidroksi grupė)

18
Q

kas fosforilina histonus

A

kinazės

19
Q

kas panaikina fosforilinimą

A

fosfatazės

20
Q

kas yra krotonilinama

A

jungties histonų lizinai

21
Q

ką žymi “kcr”

A

aktyvius promotorius ir stipriklius

22
Q

kokiu ryšiu ubikvitinas prijungiamas prie histonų lizino

A

izopeptidiniu ryšiu

23
Q

kuomet vyksta poliubikvitilinimas

A

kai prijungiamos kelios ubikvitino molekulės

24
Q

ką daro Rad6

A

jungia ubikvitiną prie H2B K123. Ši modifikacija skatina histono H3 metilinimą K4 ir K79 padėtyse

25
Q

kas dažniausiai ribozilinama

A

aspartato ir glutamato y karboksigrupės

26
Q

kas vykdo ADP ribozilinimą

A
  • MART – mono ADP riboziltransferazės
  • PARP – poli (ADP) polimerazės
27
Q

kas yra ADP ribozės donoras

A

NAD+

28
Q

histonų kodo hipotezė

A

tam tikra modifikacija tam tikrame histone gali daryti įtaką tos pačios aminorūgšties arba kitso aminorūgšties modifikacijai tame pačiame ar kitame histone

29
Q

kas atpažįsta histonų modifikacijų kombinacijas

A

baltymų kompleksai, kurie turi įvairių atpažinimo domenų

30
Q

kokie yra histonų modifikacijas atpažįstančių baltymų domenai ir su kuo jie sąveikauja

A
  • bromodomenas, sąveikauja su acetilinta Lys liekana
  • chromodomenas, sąveikauja su metilinta Lys liekana
31
Q

kas atpažįsta metilintus lizinus

A

baltymai, turintys chromodomeną

32
Q

kas užtikrina nukleosomų dinamiškumą

A

chromatiną pertvarkantys baltymų kompleksai

33
Q

kas yra chromatiną pertvarkantys kompleksai

A

nuo ATP priklausomos DNR translokazės, prisijungiančios prie tam tikros vietos histonų oktamere ir keičiančios DNR padėtį jo atžvilgiu

34
Q

kokiais būdais pertvarkomas chromatinas

A
  • histonų oktameras gali slysti išilgai DNR
  • gali kisti atstumas tarp histonų oktamerų
  • hisotnų oktameras gali būti išstumtas iš nukleosomos
35
Q

kaip veikia INO80

A

nukleosomų redagavimas pakeičiant H2A-H2B ir H2A.Z-H2B dimerus

36
Q

ką daro ISWI ur CDH

A

nukleosomų brendimas ir susirinkimas

37
Q

Ką daro SWI/SNF

A

nukleosomų išsidėstymas - lemia prieinamumą, nukleosomų išmetimas ir dimerų atskyrimas

38
Q

kaip SWI/SNF lemia nukleosomų pašalinimą

A
  • DNR paslenkama nukleosoma arba dėl susidariusios įtampos pašalinama
  • DNR nukleosomos susiduria ir viena iš jų pašalinama
39
Q

ką daro ISWI

A

vykdo chromatino reguliaciją, kuri lemia DNR translokaciją ir tikslią nukleosomų padėtį

40
Q

ką daro SWR1C

A

pakeičia kanoninius histonus nekanoniniais

41
Q

ką daro INO80

A

pakeičia struktūrą arba įtraukia/pašalina alternatyvius histonus