Forelæsning 2 Flashcards
Hvad fandt Carl Woese ud af?
Fandt ud af at rRNA kan bruges som en phylogen markør - bruges til at artsbestemme fordi dette RNA er meget konserveret.
Fakta om Ribosomet:
1) Findes i alle organismer
2) 70S i bakterier, 80 i Eukaryoter
3) består af to subunits - 30/50 i bakterier
4) rRNA er med til at bestemme om der er tale om bakterie eller eukaryot.
Velkendte phyla af bakterier:
1) Proteobakterier
2) Firmicutes
3) Actinobakterier
4) Bacteroider
5) Spirochetes
6) Cyanobakterier
Proetobakterier typer:
- Alphaproteobakterier
- Betaproteobakterier
- Gammeproteobakterier fx E. Coli
- Deltaproteobakterier (sulfat og jernreducerende)
- Epsilonproteobakterier (mikroaerophile)
Gram positive bakterier:
Firmicutes
Actinobakterier
“Faste actinfilamenter”
Gram negative bakterier:
Bakteroider
Spirocheter
Proteobakterier (generelt)
Cyanobakterier - oxygen photosyntese
Hvad kenddetegner spirocheter?
De har endoflaggel og er proptrækkerformede.
Forskellige slags arcaea:
Euryarcaeota - methanogene
Crenarchaeota - sulfur afhængige thermophile
Thaumarchaeota - ammonium-oxidizing
Hvad er the great plate count anomaly, og hvad kan den skyldes?
At bakteriekulturer når de vokser på medium udgør mindre end 1 % af hvad der ville være i neturligt habitat. Kan skyldes:
- Forkert medie
- Døde celler
- vi mangler at forstå diversitet
Hvad fandt Norm Pace ud af?
En metode hvorpå man kan finde hvilke bakterier der er i en bestemt prøve ved at bestemme rRNA sekvens.
The great expansion:
Hurtig sekventering af genomer har gjort det muligt at bestemme genomer på bakterier som ikke kan kultiveres - eksplosion i antal af phylum.
