פרק 10.2 - פרומוטורים Flashcards
מה הוא פרומוטור קלאס-2?
וממה הוא מורכב - לפרט על החלקים שלו
פרומוטור קלאס 2 הוא פרומוטור המזוהה על ידי פול2
פירוט מהאפסטרים עד הדאון סטרים:
BRE-
אלמנט שנמצא בחלק הכי אפסטרים של הפרומוטור ואליו נקשרים פקטור השעתוק הכללי טי-אף-2-בי
TATA
נמצא כ 30 בסיסים לפני תחילת השעתוק
דאון סטרים לתחילת השעתוק קיימים אתרי בקרה נוספים:
DCE,DPE , MTE
איך זה הגיוני שיש רצפי בקרה שהם אחרי תחילת השעתוק?
זה הגיוני מכיוון שרנא של אקריוטים מכיל אזורים
שהם לא מתורגמים
5’ UTR
איפה סביר שנמצא אזורי
DPE
?
הספר מציין עובדה שפרומוטורים המכילים
אזורי
DPE
נמצאים בעיקר בפרומוטורים שאין להם
TATA
**לא תמיד
איך הרצף
TATA
משפיע על חוזק הפרומוטור?
הוא גורם לשעתוק מוגבר - ונמצא הרבה בגנים שדורשים שעתוק תמידי
מה הם רצפי קלאס-1?
פרומוטורים המשמשים בעיקר את הפול-1
לשעתוק רנא ריבוזומלי
איך קוראים לרצף הפרומוטור שלהם?
והיכן הוא ממוקם
לרצף שלהם קוראים
UPE - upstream promotor element
נמצא בערך בין
-156 ו -107
לפני תחילת השעתוק
רצף נוסף נקרא
CORE
והוא נמצא בין מינוס 45 לפלוס 20 מתחילת השעתוק
מה הם ההבדלים בין פרומוטורים של קלאס-3 ?
יש שלושה סוגי פרומוטורים - בהתאם לגן שהפול-3 משעתק
התמונה מפרטת את ההבדלים -
יש הרבה חפירות בספר על הפרומוטורים האלו, ויש שם המון מידע שנראה לי לא כזה קריטי, והוא סתם יורד לפרטים חסרי טעם
באילו גנים לרוב אין רצפי
TATA?
בגנים שהם
house-keeping genes
או בגנים שמתבטאים בצורה שונה בהתאם לשלב ההתפחותי
מה הם רצפי
GC
מה תפקידם, והיכן מופיעים?
הם רצפים שנמצאים בגנים שהם חסרי
TATA
ותפקידם הוא לפצות על החוסר הזה , והם עוזרים להגביר שעתוק
לרוב, הם נמצאים ב
house keeping genes
שהם חסרי רצף
TATA
הספר נותן שלושה גנים שהם ללא
TATA
ומכילים את רצפי ה
GC
בפרומוטור
אילו גנים הם?
גנים שאחראים על סינתזת נוקלאוטידים :
adenine de aminase
thymidylate synthase
dihydrofolate reductase
