Introduction à la microbiologie de l'environnement cours 3 Flashcards

1
Q

Qu’est-ce qui peut être signe d’interactions microbiennes?
A) Un choc sceptique, un biofilm dans un tuyau de plomb et l’acquisition d’une résistance plasmidique à l’ampiciline dont la souche sauvage est amp-
B) Un choc sceptique, un biofilm dans un tuyau de plomb et la coloration jaune de la gélose Mac conkey
C) Un choc sceptique, la formation de colonies d’une seule espèce d’une taille immense et l’acquisition d’une résistance à l’ampiciline dont la souche sauvage est amp-

A

A) Les chocs sceptiques sont directement reliés à la production de metabolites secondaires (toxines) dû à la compétition bactérienne ou bien la prédation.

Les biofilms sont dû à la coopération de plusieurs micro-organisme. Chacun joue un rôle dans la formation et l’entretient de celui-ci.

L’acquisition d’une résistance plasmidique insinu un mécanisme d’échange de matériel entre deux micro-organismes.

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Q

Vrai ou faux, les microbes communiquent entre eux par la production de divers molécules, des peptides, des auto-inducteurs et même des molécules bactéricides.

A

Vrai!!

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3
Q
Quel terme concorde avec cette définition:"interaction entre les individus de différentes espèces"
A) Microcollaboration
B)Babouvisme
C) Inter-specifique
D) Intra-spécifique
E) Démocratie
A

C) Inter-spécifique

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4
Q
Quelle(s) interaction(s) est/sont de nature positive?
A) amensalisme
B) protocooperation
C) commensalisme
D) competition
E) opéraïsme
A

B) protocooperation

C) commensalism

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5
Q
Quel terme concorde avec cette définition:"interaction entre les individus de la même espèce"
A) Racisme
B) Inter-spécifique
C) Intra-spécifique
D) Sionisme
E) Compétition
A

C) Intra-spécifique

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6
Q
Quelle(s) interaction(s) est/sont de nature négative?
A) prédation
B)  parasitisme
C) amensalism
D) competition
E) toutes ses réponses
A

E) Toutes ses réponses

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7
Q

Vrai ou faux, l’interaction neutralisme consiste à une espèce(1) qui vole les ressources d’une autre espèce(2), mais l’espèce(1) demeure neutre et ne peut compétionner, car elle ne possède pas les moyens biologiques.

A

FAUX

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8
Q

En quoi consiste l’interaction de type neutralisme?

A

Le neutralisme consiste en une quasi absence d’interaction. Souvent les deux espèce n’utilisent pas les mêmes éléments du milieu et ne s’encombre pas en matière d’espace.

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9
Q

Vrai ou faux, le commensalisme engendre des dommages chez l’hôte. L’interaction entre les deux espèces défavorise l’hôte.

A

Faux

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10
Q

Quelle situation représente une interaction de type commensalisme?
A) La bactérie A produit un toxine bactériocide dans le but d’éloigner l’espèce B
B) L’oiseau fait son nid dans un chêne en plein milieu du printemps
C) L’espèce A produit un métabolite qui sert à l’espèce B et l’espèce B produit un métabolite qui sert à l’espèce A.
D) Le phage Mu change, grâce à une invertase, les gène qui lui servent à adhérer à une grande diversité d’espèce bactérienne afin de leur injecter son baggage génétique

A

B) L’oiseau est avantagé par l’arbre qui lui offre un support où faire son nid et une certaine protection, mais cela n’affecte pas l’arbre qui vit sa vie de façon interdependente. C’est du commensalisme

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11
Q

Vrai ou faux, la situation suivante représente une interaction de type ammensalisme: E.coli grâce à son plasmide ColE1 produit de la colicine qui a un effet bactéricide sur les autres espèces ne possédant pas le plasmide.

A

Vrai, l’ammensalisme consiste en la production d’un métabolite toxique qui va désavantager un autre taxon bactérien

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12
Q

Vrai ou faux, le mutualisme est synonyme de synergisme?

A

Vrai

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13
Q

À quel type d’interaction consiste cette situation: Mon petit cactus à été trop arrosé (oups) ce qui a permi le développement de méchantes moisissures qui affaiblissent cactaceae de jour en jour.

A

Le parasitisme

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14
Q

Pourquoi deux espèces microbiennes peuvent-elles être en compétition?

A

Pour les mêmes ressources, la source de carbone et l’espace.

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15
Q
Quelle realtion en obligatoire?
A) La photocoopération 
B) Le commensalisme
C) La prédation
D) Le mutualisme
A

D) Le mutualisme, les deux espèces en relation ne peuvent pas vivre séparés

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16
Q

En quoi consiste le mutualisme?

A

Le mutualisme consiste en une relation bénéfique et réciproque entre deux organismes. Les deux espèces ne peuvent vivre séparément.

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17
Q

Vrai ou faux, il n’existe pas de relation mutualisme incluant les phages?

A

Faux!

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18
Q

Nommez un exemple de relation mutualisme avec un phage. (2 éléments possibles de réponses)

A
  1. Le phage PhageSopEF lorsqu’il infecte Salmonella enterica serovar Typhimurium, il induit la production de nitricoxi desynthase (iNOS), il élargit le répertoire métabolique de la bactérie.
  2. Un phage peut aussi favoriser la production de bactériocines (par la bactérie) qui vont tuer les compétiteurs
    Les phages en retour ont un habitat, car ils sont des parasites intra-cellulaires obligatoires
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19
Q

À quel type de relation appartient le synthrophisme?

A

Le syntrophisme est une sorte de mutualisme

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20
Q

En quoi consiste le synthrophisme?

A

Le syntrophisme est un type specifique de mutualism où deux organismes dependent chacun de facteurs de croissances/metabolites/nutriments produit par l’autre

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21
Q

Vrai ou faux la photocoopération est un type de relation qui rend les organismes dépendant les uns des autres?

A

Faux, le photocoopération n’est pas une relation obligatoire

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22
Q

En quoi consiste la photocoopération?

A

Une relation bénéfique non obligatoire entre deux organismes. Ce type de coopération peut permettre de synthétiser de nouveaux métabolites lorsque les espèces sont en présence l’une de l’autre.

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23
Q

À quel terme concorde cette définition: “mode de signalisation qui se base sur la production de petites molécules ou « autoinducteurs » qui sont produites en phase de croissance bactérienne.”

A) Quorum sensing
B) Ammensalisme
C) Télépathie
D) Conjugaison
E) Langage des signes
A

A) Quorum sensing

24
Q

Qu’est qui cloche dans cette affirmation: Lorsque la bactérie perçoit une molécule auto-inductrice en provenance de la cellule voisine, un régulateur transcriptionnelle permet l’expression des gènes codant pour la luciférase, pour la production de lumière.

A

La bactérie ne reçoit pas une seule molécule auto-inductrice, un seuil de concentration doit être atteint avant de pouvoir intéragir avec des régulateurs.

25
Q

Que signalent les auto-inducteurs?

A

L’état de la croissance et de la densité de population

26
Q

Compléter la phrase: Le quorum sensing peut induire la formation d’un (1), la production de facteur de (2) et la production (3). Le quorum sensing est aussi essentiel pour la (4). Le quorum sensing peut aussi rendre les bactéries (5) ou (6) ou bien induire la (7)

A
  1. biofilm
  2. virulence
  3. d’antibiotiques
  4. conjugaison
  5. compétentes
  6. mobiles
  7. sporulation
27
Q

Chez Virbrio fischeri quel est le rôle luxR?

A

LuxR est un régulateur transcriptionnel qui reçoit les auto-inducteurs AHL et va activer les gènes codant pour la luciférase. Il y a alors de la bioluminescence.

28
Q

Quel est le rôle de luxI chez Vibrio fischeri?

A

LuxI code pour les inducteurs AHL

29
Q

À quel type de realtion concorde cette définition: “Relation dans laquelle 1 organisme est bénéficiaire tandis que l’autre organisme n’est ni favorisé ou defavorisé:”?

A

Au commensalisme

30
Q

Comment se nomme l’organisme bénéficiaire dans la relation de commensalisme?

A

C’est le commensal

31
Q

Comment se nomme l’organisme qui n’est ni favorisé ni défavorisé dans le type de relation commensalisme?

A

C’est le neutral

32
Q

Associez les trois interactions avec le bon type de relation.
A) Dans le colon humain, l’oxygène est utilisé par E.coli qui anaérobie facultative ce qui permet la croissance Bacteroides qui est anaérobie.

B) La production du yoghurt bulgare repose sur l’intéraction entre deux bactéries lactiques thermophiles: Streptococcus thermophilus et Lactobacillus delbrueckii subsp. C’est leur interaction qui permet de créer un métabolite spécial qui donne son goût unique au yogourt.

C) Les cyanobactéries produisent de l’oxygène qui favorise la croissance des bactéries X. Les bactéries X interviennent au niveau de la chaîne de production de la vitamines b12 ce qui favorise la croissance des cyanobactéries.

  1. Photocoopération
  2. Syntrophisme
  3. Commensalisme
A

A-Commensalisme
B-Photocoopération
C- Synthrophisme

33
Q

Microcystis aeruginosa produit une toxine (microcystine) lorsque la population est nombreuse, c’est une molécule de stress. La microcystine est utilisée comme source d’azote par d’autre bactéries (Sphingomonas, Arthrobacter sp, Brevibacterium sp et Rhodococcus). À quel type de relation cela correspond-t-il?

A

Au commensalisme

34
Q

Quelle est la différence entre l’ammensalisme et la prédation?

A

La prédation nécessite un contact physique entre les deux organismes. Même lorsque le prédateur relâche une toxine visant à tuer la proie il doit y être attaché. L’ammensalisme ne nécessite aucun contact. Un microbes peut tuer un autre microbe par production de toxines qui vont diffuser.

35
Q

Un phage qui infecte une bactérie et la tue est considéré une relation de prédation vrai ou faux?

A

Vrai

36
Q

Quel(s) caractéristique(s) convienn(ent) pour décrire la prédation?
A) Une relation importante en ce qui concerne la régulation des populations microbiennes
B) Détermine la structure, la diversité et la dynamique dans les communautés microbiennes
C) Relation bénéfique pour la proie
D) Un organisme, « prédateur », englouti et digère un autre organisme « la proie »
E) Toutes ses réponses

A

A,B,D

37
Q

Quel exemple ne correspond pas à de la prédation?
A) Vampirococcus aspire le cytoplasme hors de la bactérie Chromatium
B) Un bactérie ciliée qui mange une cyanobactérie
C) Toxoplasma gondii cause toxoplasmose chez l’homme
D) Aucun LOLLLL

A

C) C’est un exemple de parasitisme

38
Q

En quoi consiste le parasitisme?

A

Le parasitisme consiste en un organisme bénéficiaire et un hôte qui est endommagé/abimé. Le parasite peut être attaché ou dans l’hôte.

39
Q

En quoi consiste l’ammensalisme?

A

Relation dans laquelle un organisme produit une molécule qui a un effet négatif sur l’autre organisme

40
Q

Vrai ou faux la plupart des bacteriocines vont cibler les souches de la même espèce que l’organisme producteur?

A

Vrai

41
Q

Les bactériocines produites par les organismes vont-ils seulement cibler les individus de la même espèces lorsqu’il s’agit d’une relation ammensalisme?

A

La plupart des bactériocines visent les individus de la même espèce, mais les toxines peuvent diffuser et atteindre d’autres espèces.

42
Q

Quelle situation correspond à de l’ammensalisme?
A) La production d’antibiotique par l’espèce Z qui inhibe la croissance de l’espèce W.
B) Enterobius vermicularis peut être lorsque ingéré s’établit au niveau de l’intestion. Il est responsable de l’oxyurose chez l’homme
C) Le requin peut sentir le sang d’un animal blessé à environ 100m afin d’en faire son prochain repas

A

A)

43
Q

En quoi consiste la compétition?

A

Quand different microorganismesau sein d’une population ou communauté cible la même ressource (physical location/nutrients/…)

44
Q

Adam Smith (1776) évoque sa théorie de la main invisible. En celle-ci consiste?

A

La main invisible évoque la quête du gain personnel bénéficie aux autres. Ex: Un marchand va agir pour son propre profit. Il agit comme s’il était guidé par une main invisible pour produire des biens qui sont désirés par la société. Les gens qui travaillent individuellement profite à la société, contribue au bien commun.

45
Q

Quelle est la théorie de William Lloyd (1883) au sujet des ressources communes?

A

Des individus cherchant des avantages personnelles pourraientt sur-exploiter une ressource commune

46
Q

Garrett Hardin (1968) énonce:”les ressources communes sont utilisées pour le bien individuel à courte terme, mais mauvais pour le groupe sociale à longue terme”. Quels conséquences cela peut-il insinuer?

A
  1. Exploitation de ressources naturelles
  2. La pollution (air, eau, etc.)
  3. La “bombe” de la population
47
Q

La théorie de Garrett Hardin (1968) porte un nom. Lequel?

A

La tragédie des biens communs

48
Q

Quelle stratégie est favorisée dans la nature entre l’égoïsme et la coopération?

A

L’égoïsme est une stratégie évolutionnaire supérieure à la coopération

49
Q

La coopération est-elle un concept absent du règne animaux. Appuyez votre réponse par un exemple.

A

Non, les lionnes chassent en groupe, les abeilles s’organisent selon le principle d’eusocialité qui se définit par une division des tâches, des rôles précis dans la société visant à protéger les générations futures.

50
Q

L’altruisme est-il un concept très répandu dans le règne du vivant et en quoi consiste-t-il?

A

L’altruisme consiste à une amélioration du “fitness” d’un bénéficiaire au coût de soi-même. Il est présent que dans de rares cas.

51
Q

Nommez un exemple d’altruisme dans le monde bactérien (indice biofilm)

A

Dans un biofilm, les bactéries pionnières manquent souvent de nutriments et induisent leur mort pour le bien-être du biofilm. Cela permet au biofilm de prolonger sa vie lors de manque de ressources.

52
Q

Qu’établit la règle d’Hamilton br > c?

A

Le coefficient r donne la probabilité que le bénéficiaire a le même allèle que le donneur. Autrement dit, l’altruisme est plus courant lorsque ca traite d’individus qui sont reliés, proches d’un point de vue génétique. Cela permet aux gènes altruismes de rester dans la population.

53
Q

Comment se nomme le r dans la règle d’Hamilton br > c?

A

Le r est le coefficient de parenté.

54
Q

En quoi consiste le dilemme du prisonnier?

A

Deux personnes sont accusées d’avoir commis un crime soit ils coopèrent (la peine de chacun est réduite de la moitié), soit un dénonce l’autre (l’un écope de l’entièreté de la peine et l’autre est libéré) ou les deux se dénoncent (les deux ont la peine au complet)

55
Q

En quoi le dilemme du prisonnier peut-il être transposé à la vie de tout les jours?

A

La coopération peut être facilement déséquilibrée par cette pensée d’individualisme. C’est un dilemme entre le mutualisme et la tricherie.