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MCB2979-Bactériologie générale 1 > Cours 7 : Les bactériophages > Flashcards

Cours 7 : Les bactériophages Flashcards

1
Q

Vrai ou faux. Tous les phages possèdent leur matériel génétique sous la forme linéaire?

A

Faux. Il peut être linéaire ou circulaire.

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Q

Si l’on observe une plage de lyse claire sur une gélose, observe-t-on l’action des phages tempérés ou des phages virulents?

A

Des phages virulents.

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3
Q

Quelles sont les 5 étapes pour l’attachement du phage T4?

A 
1. Arrivée
2, Fixation
3. Contraction 
4. Pénétration/percement
5. Injection de l'ADN
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4
Q

Vrai ou faux. L’interaction entre le fibre de la queue du phage T4 et le LPS de la surface bactérienne est très élevée.

A

Faux. Elle est faible.

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Q

Vrai ou faux. L’interaction entre les fibres courtes du phage T4 et les structure de surface de la membrane externe d’une bactérie est très forte et irréversible.

A

Vrai.

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6
Q

Vrai ou faux. La queue du phage T4 pénètre la membrane plasmique de la bactérie.

A

Faux. Il pénètre la membrane externe et le cytosquelette, mais pas la membrane plasmique.

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7
Q

Quelle protéine aide l’entrée de l’ADN phagique T4 à travers la membrane plasmique?

A

La protéine pilote.

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8
Q 
Sous quelle forme est l'ADN du phage T4?
a) linéaire
b) circulaire
et
c)monocaténaire
d)bicaténaire
A

a) linéaire
et
d) monocaténaire

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9
Q 
Sous quelle forme se trouve l'ADN du phage M13? 
a)linéaire
b)circulaire
et
c)monocaténaire
d)bicaténaire
A

b) circulaire
et
c) monocaténaire

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10
Q

Comment l’ADN du phage M13 est-il introduit dans les bactéries?

A

Via un pilus F.

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11
Q

Vrai ou faux. Le phage M13 tue toujours les cellules bactériennes qu’elle infecte?

A

Faux. Les nouvelles particules de phages sont assemblées et libérées sans que la cellule ne soit tuée. Le phage M13 ralentit davantage la croissance des bactéries.

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12
Q 
Sous quelle forme se trouve l'ADN du phage phiX174?
a)linéaire
b)circulaire
et
c)monocaténaire
d)bicaténaire
A

b) circulaire
et
c) monocaténaire

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13
Q

Comment répliquer l’extrémité du génome linéaire du phage T7?

A

Avec des séquences répétées aux extrémités

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14
Q

Comment répliquer l’extrémité du génome linéaire du phage phi-29?

A

Avec une protéine terminale

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15
Q

À quoi sert la protéine terminale lors de la réplication de l’ADN linéaire du phage phi-29?

A

Elle sert d’amorce pour une nouvelle ronde de réplication.

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16
Q

Grâce à quel enzyme peut se faire la réplication de l’ADN linéaire du phage phi-29?

A

ADN polymérase phagique.

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17
Q

À quelle extrémité de l’ADN linéaire du phage phi-29 se trouve la protéine terminale?

A

À l’extrémité 5’.

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18
Q

Vrai ou faux. L’ADN du phage T4 est redondant aux extrémités.

A

Vrai.

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19
Q

Quels sont les deux stades de la réplication de l’ADN du phage T4?

A

Stade 1 : réplication à des origines spécifiques

Stade 2: Déplacement des brins d’ADN par la recombinaison

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20
Q

Vrai ou faux. Le phage T4 ne voit jamais son génome grandir en taille durant le processus d’infection.

A

Faux. Après l’infection, la tête du phage contient 103% de la taille d’un génome.

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21
Q

Qu’utilise le phage T4 pour former des concatènes?

A

La recombinaison.

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22
Q

Comment la réplication du phage lambda se fait-elle? (par quel mécanismes?)

A

Thêta et à cercle roulante.

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23
Q

Quelle protéines sont présentes dans le phage lambda pour initier la réplication de type thêta?

A

Protéines O et P.

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24
Q

Quelles protéines sont présentes dans le phage lambda pour initier la réplication à cercle roulant?

A

Protéine Gam et une endonucléase phagique.

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25
Q

Quel classe d’ARN doit être transcrite pour la biosynthèse des composants structurales du phage T7?

a) classe I
b) classe II
c) classe III

A

c) classe III

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26
Q

Quelle classe d’ARN doit être transcrite pour utiliser l’ARN polymérase d’E.coli dans la production de gènes précoces?

a) classe I
b) classe II
c) classe III

A

a) classe I

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27
Q

Quelle classe d’ARN doit être transcrite pour utiliser l’ARN polymérase de T7 pour fabriquer le gènes impliqués dans le métabolisme de l’ADN?

a) classe I
b) classe II
c) classe III

A

b) classe II

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28
Q

Expliquez la phase d’absorption du phage lambda à la surface de la bactérie. Quelles protéines phagiques et bactériennes sont impliquées?

A

La protéine J phagique s’attache à la protéine LamB d’E.coli. Attachement spécifique de la protéine J à une structure spécifique à la surface bactérienne.

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29
Q

Quelle protéine bactérienne de la membrane interne aide l’entrée dans la membrane de l’ADN phagique de lambda?

A

La protéine PtsM.

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30
Q

Pourquoi l’ADN phagique de lambda a-t-il tendance à se circulariser une fois dans le cytoplasme de la bactérie?

A

Pour éviter d’être dégradé par des endonucléases.

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31
Q

Quel mode de réplication est associé à un cycle lytique chez le phage lambda?

A

Circulation à cercle roulant.

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32
Q

Sous quelle forme se trouve le génome lambda lorsqu’il est encapsulé dans les phages?

A

Sous forme linéaire.

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33
Q

Sous quelle forme se trouve le génome de lambda lorsqu’il se trouve dans le cytoplasme de la bactérie?

A

Sous forme circulaire.

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34
Q

Vrai ou faux. La majorité des cellules infectées par le phage lambda entrent dans un cycle lysogénique.

A

Faux. >90% entrent dans un cycle lytique.

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35
Q

Pour déterminer si lambda entre dans un cycle lytique ou lysogénique, il y a compétition entre deux répresseurs. Quels sont-ils?

A

cI et Cro

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36
Q

Si le répresseur cI gagne sur le répresseur Cro, le phage lambda entre-t-il dans le cycle lytique ou lysogénique?

A

Cycle lysogénique

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37
Q

Si le répresseur Cro gagne sur le répresseur cI, le phage lambda entre-t-il dans le cycle lytique ou lysogénique?

A

Cycle lytique.

38
Q

Vrai ou faux. Les facteurs environnementaux influencent CII.

A

Vrai,

39
Q

À des hautes concentrations de CI, cI est-il activé ou inhibé?

A

inhibé.

40
Q

Vrai ou faux. Cro inhibe le promoteur de cI.

A

Vrai.

41
Q

À partir de quel gène est synthétisé Cro?

et cI?

A

Cro : PL

cI: PR

42
Q

Vrai ou faux. Si CII est inactivé, le cycle lytique arrête.

A

Faux. Il commence. C’est la synthèse de CI qui est inhibée.

43
Q

Pour commencer la synthèse, Cro doit se fixer sur quels sites?

A

OL et OR

44
Q

S’il y a une carence de nutriments, est-ce le cycle lytique ou lysogénique qui est favorisé?

A

Lysogénique.

45
Q

Dans le cycle du phage mu, si ner s’attache à l’opérateur O, qu’est ce qui se passe?

A

La synthèse de c est réprimée, et la cellule entre dans un cycle lytique.

46
Q

Dans le cycle du phage mu, si c s’attache à l’opérateur O, qu’est ce qui se passe?

A

PnerAB est bloqué, et la cellule deviens lysogène.

47
Q

Quel type de transposition est utilisé dans l’intégration et la réplication du génome du phage mu?

A

Transposition réplicative.

48
Q

Que détermine l’orientation de la région G chez le phage mu?

A

L’infection de différentes espèces bactériennes.

49
Q

La région G chez le phage mu code pour quelles protéines?

A

Les protéines de la queue, responsables pour l’attachement du phage à la LPS bactérienne.

50
Q

L’inversion de la région G chez le phage mu est catalysée par l’action de quelle protéine? Dans quelle catégorie se trouve cette protéine?

A

Sous l’action de la protéine Gin, qui est une série recombinase.

51
Q

Qu’est ce que la transduction?

A

Transfert d’ADN chromosomique par les particules phagiques.

52
Q

Comment appelle-t-on le type de transduction où n’importe quel région chromosomique peut être transférée?

A

Transduction généralisée.

53
Q

Quelle est la première étape d’infection?

A

L’adsorption.

54
Q

Quels sont les 3 systèmes de prévention de l’adsorption?

A
  1. Blocage des récepteurs phagiques
  2. Production d’une matrice extracellulaire
  3. Production des inhibiteurs compétitifs.
55
Q

Vrai ou faux. Les bactéries sont capables de produire des protéines capable de cacher ou masquer les récepteurs phagiques.

A

Vrai.

56
Q

Quelle protéine d’E.coli bloque le récepteur de ferrichrome FhuA, site d’attachement pour certains phages comme T1, T5 et phi80?

A

Protéine Llp (lipoprotéine)

57
Q

Quelle protéine d’E.coli est la cible de certains phages de types T?

A

La protéine OmpA

58
Q

Comment se nomment les enzymes phagiques qui sont capable de dégrader l’EPS?

A

La polysaccharide lyase ou polysaccharide hydrolase.

59
Q

2 bactéries sont capables de produire de l’alginate. Quelles sont-elles?

A

Pseudomonas et Acetobacter.

60
Q

Quels phages de Pseudomonas sont capables de produire une enzyme qui dégrade l’alginase?
Comment se nomme cet enzyme?

A

Phages F116, phi GH4

Alginate lyase.

61
Q

Les protéines Sie sont produites par quel type de phage?

A

Phage tempéré (prophages)

62
Q

Vrai ou faux. Le phage T4 dégrade le peptidoglycane durant l’infection

A

Vrai.

63
Q

Quelles protéines sont produites par le phage T4 pour bloquer la translocation d’ADN des autres phages?

A

Imm et Sp

64
Q

Comment se nomme l’enzyme qui modifie l’ADN de l’hôte contre l’action de l’enzyme de restriction dans les système R/M?

A

Enzyme de modification (méthylase)

65
Q

Le phage T4 peut modifier son génome par la production de quelle molécule dans le système R/M?

A

hydroxyméthylcytosine (HMC)

66
Q

Dans le système CRISPR-CAS, à quoi sert la partie ARN?

A

À la reconnaissance

67
Q

Dans le système CRISPER-CAS, à quoi sert la partie protéine?

A

Au clivage

68
Q

Vrai ou faux. Le système Abi tue les cellules infectées.

A

Vrai

69
Q

Quel système Abi est trouvé chez E.coli?

A

Système Rex

70
Q

Quel type de bactérie contient plusieurs systèmes Abi?

A

Les bactéries lactiques

71
Q

Dans le système Abi chez E.coli, quelle molécule Rex est associée avec les membranes? RexA ou RexB?

A

RexB

72
Q

Combien de Rex A sont nécessaires pour activer 1 RexB dans le système Abi chez E.coli?

A

2 RexA sont nécessaires.

73
Q

Vrai ou faux. Les introns, rétrons et intéines dérangent le produit de la séquence codante dans laquelle ils sont insérées.

A

Faux. Il ne le dérangent pas.

74
Q

Vrai ou faux. Les introns peuvent faire des réactions d’autoépissage en absence de protéines.

A

Vrai

75
Q

Les introns de groupe I sont retrouvés chez les phages de quelles bactéries?

A

E.coli et B.subtilis

76
Q

La motilité des introns de groupe I est catalysée par quelle enzyme?

A

homing endonucléases

77
Q

Chez quels organismes/structures sont retrouvés les introns de groupe II?

A

eubactéries, archaebactéries,, mitochondries et chloroplastes

78
Q

Dans quel type de réaction sont impliqués les introns de groupe II?

A

Dans les réactions d’épissage in vivo.

79
Q

Le domaine IV des introns de groupe II peut coder pour quoi?

A

Un ORF

80
Q

L’ORF dans les introns de groupe II est impliqué dans quoi?

A

La mobilité

81
Q

L’ORF possède 3 domaines, qui codent tous pour un enzyme.

Quels sont ces domaines, et quelle est leur fonction?

A

RT : Transcriptase
inverse Zn : endonucléase
X : maturase

82
Q

Quelle type de réactions permet l’insertion à des sites aléatoires des introns de groupe II?

A

Retrotransposition.

83
Q

Dans les deux types de réactions de mobilité des introns de groupe II, quelle est la plus fréquente?

A

Le retrohoming.

84
Q

Comment est synthétisée la partie ADN des rétrons?

A

Par réaction de la transcriptase inverse, codée par le rétron.

85
Q

Les rétrons ont été originalement trouvées chez quelle espèces bactérienne?

A

Myxococcus

86
Q

Vrai ou faux. Les rétrons ne sont pas trouvés chez E.Coli

A

Faux

87
Q

Pour quoi codent les rétrons, et quelle molécule est formée?

A

ARN, ADN et transcriptase inverse.

La molécule formée se nomme msDNA

88
Q

Chez quel organisme a-t-on découvert les intéines?

On peut les trouver aussi chez quelle espèce?

A

Découvert chez les levures, mais présente également chez les eubactéries.

89
Q

Vrai ou faux. Les extéines sont identiques entres-elles.

A

Faux. Elles ne possèdent aucune similarité.

90
Q

Vrai ou faux. Plusieurs régions sont conservées chez les intéines.

A

Vrai

91
Q

Quelles régions sont conservées chez les intéines? (3)

A
  1. Partie C-terminale : His-Asn
  2. Séquence des homing endonucléase trouvés chez les introns du groupe I
  3. Les intéines peuvent catalyser leur mobilité comme les introns

MCB2979-Bactériologie générale 1 (12 decks)

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