ביוכימיה שאלות

Question 1

? מסמל PKb מה ערך גבוה או נמוך של

Answer 1

יותר קרוב ל-0 כך הבסיס חזק יותר PKb ככל ש

Question 2

?חומצה חזקה מצריכה ריכוז גבוה של בסיס כידי למסור פרוטון

?חומצה חזקה היא חומצה שמיועדת למסירת פרוטון

?קבוע שיווי משקל של חומצה חזקה גבוה או נמוך מחומצה חלשה

Answer 2

הסבר בשקופית המצורפת

Question 3

?האם קשר פפטידי הוא קשר יחיד מסוג סיגמא

Answer 3

קשר פפטידי הוא קשר יחיד מסוג סיגמא

Question 4

האם אינטראקציות בין תתי היחידות מיוצבות ע”י יון ברזל

Answer 4

שמצויה בכל אחד מהיחידות ולא בין היחידות Heme-לא נכון ,הברזל מצוי בקבוצת ה

מכאן שלברזל אין תפקיד בייצוב המבנה הרבעוני של ההמוגלובין

האינטראקציות בין היחידות הם בעיקר הידרופוביות

הקשרים השולטים בייצוב המבנה הרבעוני הם בעיקר קשרים הידרופוביים הסיבה לכך היא שעל מנת שבסביבה המימית של התא יוכלו תת היחידות להישאר מחוברות , הן חייבות ליצור לעצמן סביבה שונה .אינטראקציות הידרופוביות מאפשרות את ההפרדה הזאת . אם האינטראקציות העיקריות היו קשרי מימן או קשרים יוניים , תת היחידות היו מתפרקות בשל מגע עם מים

אין זה אומר שלא קיימים גם קשרי מימן וקשרים יוניים , אך החשיבות שלהם היא בעיקר בייצוב המצבים השונים של חלבון כאשר הוא קושר או לא קושר חמצן

Question 5

?ממה מורכב פרוטופירין ומה הוא מרכיב

Answer 5

. HEME פרוטופירין היא חומר מוצא ליצירת

פרוטופירין הוא חומר אורגני במבנה טבעתי

חומר מוצא לפרוטופירין היא החומצה האמינית גליצין

ארבע פרוטופירינים יוצרים קבוצת “הם” כל קבוצת “הם” קושרת ברזל

בהמוגלובין של יש 4 יחידות חלבוניות בכל אחת מיהם קבוצת “הם” וברזל

Question 6

מה מעלה ומה מוריד את האפיניות לחמצן של ההמוגלובין

Answer 6

תשובה מצורפת

Question 7

?האם לאוקסידורדוקטאזות יש פעילות משותפת עם ליאזות

Answer 7

אנזימים שהם אוקסידורדוקטאזות לפעמים הם בעלי פעילות משולבת עם ליאז . חלק גדול מהליאזות מזרזות ריאקציות מסוג חמצון חיזור , לכן ניתן לשייך אותם למשפחת אוקסידורדוקטאזות.

Question 8

מה עושיפ הליגאזות? כ

והאם כל הליגאזות מחברות מולקולות אחת לשניה

ATP האם הליגאזות צורכות

Answer 8

ליגאזות היא משפחת אנזימים היוצרים קשרים קוולנטיים שונים. דנ”א ליגאז הוא אנזים ליגאז ספציפי המיועד לחיבור מולקולות דנ”א

משפחת דנ”א ליגאז וסינתתאז הם דוגמאות לכך ATP ליגאזות בד”כ מנצלות

Question 9

?לאיזו משפחה דהידרוגנאזות שייכות

Answer 9

דהידרוגנאזות שייכות למשפחת הליאזות וגם למשפחת האוקסידורדוקטאזות

Question 10

?מה מתאר טריאדה קטליטית

Answer 10

פתח קובץ

Question 11

?אנזימים הטרוטרופיים , מה גורם האקטיבטור

Answer 11

אנזימים הטרוטרופיים , האקטיבטור גורם לגרף להפוך ליותר היפרבולי

Question 12

?היכן מיוצר אדרנלין

Answer 12

אדרנלין הוא הורמון קטבולי המיוצר בבלוטת האדרנל ולא בלבלב

Question 13

?בתסיסה כוהלית NADH למה נועד שימוש ב

Answer 13

תפתח תמונה

Question 14

?מה התהליך שהלבלב מרגיש את הגלוקוז בדם

?מה מתרחש בתא

Answer 14

המכניס גלוקוז לתוך תאי הבטא GLUT2 בלבלב ישנו טרנספורטר לגלוקוז הנקרא

בלבלב . הגלוקוז שנכנס לתאי הלבלב עובר תהליך הגליקוליזה ומעגל החומצה

כאשר נוצרת כמות מסוימת של.ATP הציטרית -וגורם ליצירה מוגברת של

שמסמנת ללבלב שבדם ישנה כמות גבוה של סוכר ATP

שנוצר גורם לסגירה של תעלות אשלגן -שהוא יון בעל מטען חיובי ATP ה

לכן התא עובר דה פולריזציה נטען במטען חיובי -נטען במטען חיובי

ER לעומת הסביבה החוץ תאית שלו .דה פולריזציה גורמת ליציאה של סידן מה

וגם לפתיחה של תעלות סידן בתא ,מה שגורם לדה פולריזציה גדולה אף יותר

רמות הסידן הגבוהות גורמות לאקסוציטוזה של אינסולין בעזרת וסיקולות

משמשות יעד לטיפול תרופתי ATP תעלות האשלגן התלויות בנוכחות

בסוכרת מסוג 2 . ע”י תרופה הנקשרת לתת יחידה מסוימת במשאבת האשלגן

וגורמת לסגירת המשאבה וכתוצאה מכך שיחרור אינסולין

Question 15

איך אינסולין וגלוקגון משפיעים ומושפעים על מצב רעב ויצירת גלוקוז

Answer 15

בכבד אינסולין מקדם את הכנסת הגלוקוז לכבד והפיכתו לגליקוגן

ברקמת שומן אינסולין מגרה את יצור השומן מגלוקוז ואיחסונו בתאי שומן

באדיפוציטים

לסיכום אינסולין גורם לסוכר עודף בדם להיכנס לרקמות ולאחסנו בצורות שונות

גלוקגון גורם לפירוק גליקוגן בכבד לגלוקוז ויצירת גלוקוז על ידי גלוקונאוגנזה מחומצות אמינו , גליצרול ואוקסלואצטאט

Question 16

? מהם מיהם Counter regulators

? האם גלוקגון הוא הומון אנגוקריני או הורמון אקסוקריני

?הרצפטורים לגלוקגון היכן נמצאים

?ולעומתם הרצפטורים לאדרנלין

Answer 16

הם המתנגדים לאינסולין Counter regulators

גלוקגון , אדרנלין,כורטיזול

גלוקגון הוא הומון אנגוקריני כמו כל הורמון אחר

הרצפטורים לגלוקגון מצויים בכבד , קליטה של גלוקגון ברצפטורים לגלוקגון

בכבד תגרום לפירוק של גליקוגן לדוגמא

אדרנלין להבדיל הרצפטורים שלו נמצאים גם על הכבד וגם על השריר

Question 17

?GLUT4 על אילו תאים נמצא

? הוא טרנספורטר או תעלה GLUT4

Answer 17

הוא טרנספורטר של גלוקוז המצוי בתאי שריר וגם ברקמות אדיפליות-_GLUT4_

הוא טרנספורטר לא תעלה-GLUT4

Answer 18

המצטבר בזמן רעב או סטרס AMP הוא אנזים המשופעל מרמות גבוהות של AMPK

גופני או בעקבות הורמוני רעב

לדוגמא , רמות נמוכות של לפטין .מכיוון שהאנזים פועל כאשר יש חוסר באנרגיה

הפעילות שלו תיהיה דיכוי של תהליכים דורשי אנרגיה והפעלת תהליכים של

פירוק חומצות שומן והגברת טרנספורטר של גלוקוז וגליקוליזה

Question 19

?סקווסטריזציה לגרעין לאנזימים ציטוזוליים מי האנזים שעובר תהליך כזה

Answer 19

גלוקוקינאז בכבד עובר סקווסטריזציה לגרעין בזמן רעב

ChREBP גלוקוז שנכנס לכבד מפעיל פקטור שעתוק שנקרא

פקטור זה נכנס לגרעין ומייצר גנים הקשורים למטבוליזם של סוכר

לגרעין .פקטור זה גורם לשעתוק FOXO1 אינסולין גורם לכניסה של פקטור הנקרא

של חלבונים הקשורים למטבוליזם של סוכרים

Question 20

?איך גלוקוקינאז מבוקר בכבד

?מה משפיע על שעתוק של האנזים גלוקוקינאז

?מה קורה לפירובט קינאז בנוכחות גלוקגון

Answer 20

בכבד :כאשר יש רמות גבוהות של פרוקטוז 6 פוספט

האנזים גלוקוקינאז עובר צימוד לחלבון רגולטורי ששומר אותו בגרעין

עד אשר רמות גלוקוז גבוהות שגורם לשחרור גלוקוקינאז מהכבד

AMP מה שמשפיע על הגברת שעתוק של גלוקוקינאז: כמות גדולה של

כיווץ מוגבר של השריר,צריכה של גלוקוז

בנוכחות גלוקגון PKa בכבד : פירובט קינאז עובר זרחונים ע”י

או אנדרנלין

Question 21

? מכמה יחידות מורכב PFK1

Answer 21

של אי קולי מורכב מ -4 יחידות זהות לחלוטין Pfk1

לכל יחידה יש אתר קטליטי משלה

Question 22

?B1 נגזרת של TPP חוסר בויטמין

Answer 22

מחלחת ברי ברי

במבוגרים מדובר בדימנציה מוקדמת ובעיות זיכרון

Question 23

קוולנטית PDH קינאז יודע לעקב את האנזים PDH האנזים

?קינאז PDH מה משפעל אלוסטרית את

?קינאז PDH מי היחידה שעוברת זרחון ע”י

Answer 23

ATP האנזים מעוכב אלוסטרית ע”י ריכוז גבוה של

חשוב להבין שיש הגיון מאחורי הקטיבציה והעיכוב של קינאז זה

זה סממן למאגרי אנרגיה גדולים ATP כאשר התא מייצר הרבה

והוא מסמן להפסיק את פעילות ATP לכן לתא אין צורך ביצור עודף של

PDH הקומפלקס

שמסמנים רמות NAD+ ו AMP כאשר לתא יש מחסור באנרגיה יעלו רמות

ATP נמוכות של אנרגיה בתא ויפעילו את הקומפלקס על מנת לייצר עוד

וגורם לה להיות לא פעילה_. E1 מזרחן את היחידה PDH kinase_

Question 25

? A ממה מורכב קואנזים

Answer 25

חומצה פנטאונית

אדנוזין

מרקפתואתיל אמין

Question 26

?האם ביקרבונט שנכנס במעקף הראשון יוצא כקרבוקסיל עוד באותו תהליך

Answer 26

בתהליך גלוקונאוגנזה במעקף הראשון אנזים 10 של גלוקונאוגנזה

כאשר מתחבר ביקרבונט לפירובט קרבוקסיל נכנס למולקולה האנזים הוא

pyruvate carboxylase

בהמשך התהליך של המעקף אותו קרבוקסיל יוצא החוצה ע”י האנזים

pepcarboxykinase

Question 27

מסמנים את הפחמן הכהלי של לקטאט בצורה רדיאקטיבית

?אילו פחמנים יהיו מסומנים רדיאוקטיבית על גלוקוז אם עושים גלוקונאוגנזה

Answer 27

מולקולת לקטאט מורכבת מ-3 פחמנים . על פחמן 1 יש מתיל

הפחמן האמצעי הוא כהלי ,הפחמן השלישי קרבוקסילי

אם מסמנים רדיאוקטיבית את הפחמן הכהלי ,קרי פחמן אמצעי ונבצע גלוקונאוגנזה

למולקולת לקטאט נראה בהתחלה את פירובט מסומן על הפחמן הקרבונילי

על הגלוקוז עצמו הפחמנים שיהיו מסומנים הם 2 ו 5

הפחמן הכהלי של לקטאט הוא תוצר חיזור של הפחמן הקרבונילי של פירובט והוא #

הפחמן האמצעי

שימו לב הפחמן הקרבוקסילי של פירובט הוא למעשה פחמן 3 או 4 של גלוקוז#

Question 28

? מפעיל FOXO1 את מי פקטור שעתוק

? FOXO1 מי מדכא את

Answer 28

זהו פקטור שעתוק של 2 אנזימים השיכים למסלול גלוקונאוגנזה-FOXO1-Glucose 6-phosphatase, Pep carboxykinase

מדוכא ע”י אינסולין בדרך הבאה -FOXO1

כתוצאה מרמות גבוהות של גלוקוז איסולין נקשר לרצפטור שלו בתא

וגורמים FOXO1 אשר מזרחנים את AKT שהוא גם PKb המפעיל בתורו את

לו לעבור פירוק בפרוטאזום

Question 29

מאילו מולקולות טרנספורטרים מעבירים

?T1

?T2

?T3

?GLUT2

Answer 29

ER מכניס גלוקוז 6 פוספט ל -T1 טרנספורטר

מוציא גלוקוז חופשי לציטוזול-T2 טרנספורטר

מוציא את הפוספט של הגלוקוז חזרה-T3 טרנספורטר

ER האנזים גלוקוז 6 פוספטאז נמצא על ממברנה ה

נמצא על הממברנה הפלזמתית של תאי כבד-GLUT2

Question 30

?תאר את תפקיד הביוטין

?לאיזה חומצה אמינית הוא קשור

?מה הקשר שלו לפחמן הדו חמצני

Answer 30

משתמשים בביוטין בין היתר בגליקונאוגנזה שם

ביוטין קשור קוולנטית לחומצת אמינו ליזין בקשר אמידי

B7 ביוטין נגזר מויטמין

פירובאט קרבוקסילז , האנזים אשר מבצע את המעקף הראשון בגלוקונאוגנזה

ישנה חומצה אמינית ליזין המחוברת בקשר אמידי לביוטין

השלב הראשון : בתגובה זו נעשה באתר קטליטי הראשון של האנזים שם ביקרבונט

אחד ATP נהפך לפחמן דו חמצני על חשבון

הפחמן הדו חמצני מגיב עם הביוטין ונקשר אליו קוולנטית

הזרוע שמרכיבה את הביוטין מעבירה את הפחמן הדו חמצני הקשור אליה קוולנטית

לאתר מס’ 2 באנזים ,שם הפחמן הדו חמצני משוחרר ומגיב עם פירובט

חשוב: תפקיד הזרוע של הביוטין היא לשאת את הפחמן הדו חמצני בין שני אתרים קטליטיים באנזים

Question 31

? מאיזה פחמן של גלוקוז או פרוקטוז נוצר הפחמן הקרבוקסילי של פירובט

Answer 31

כשנלך בתרשים הגלוקונאוגנזה אחורה , ניתן לראות שהפחמן הקרבוקסילי של

פירובט מומר להיות או פחמן 4 או פחמן 3 במולקולת הגלוקוז או הפרוקטוז

העניין נעוץ בדרך שבה מתפרק הפרוקטוז במקור לגליצראלדהיד ולדהידרוקסי אצטון

פחמנים 3 ו 4 הופכים בהתאמה להיות פחמן מ”ס 1 של המולקולות תוצרי הפירוק האלדולי ומשם יומרו להיות הפחמן הקרבוקסילי של פירובט

פחמנים

פחמן 1 של גלוקוז-הופך לפחמן מתילי מספר 3 של פירובט

פחמן 2 של גלוקוז-הופך לפחמן קרבונילי מספר 2 של פירובט

פחמן 3 של גלוקוז-הופך לפחמן קרבוקסילי מספר 1 של פירובט

פחמן 4 של גלוקוז-הופך לפחמן קרבוקסילי מספר 1 של פירובט

פחמן 5 של גלוקוז-הופך לפחמן קרבונילי מספר 2 של פירובט

פחמן 6 של גלוקוז-הופך לפחמן מתילי מספר 3 של פירובט

Question 32

?איך משפיע סידן על גליקוגן

?ובאיזה צורה הוא מבקר

?מה עושה גלוקוז חופשי בשריר

?מה עושה גלוקוז 6 פוספאט בכבד

Answer 32

סידן בשריר משמש כבקר אלוסטרי המגביר את פירוק הליקוגן

שמזרחן את האנזים,phosphorylase b kinase סידן נקשר לאנזים

שהוא הגירסה הפחות פעילה ועל ידי כך הופך אותו ל phosphorylase b

שהוא הגירסה היותר פעילה נשים לב שפוספורילאז נקשר phosphorylase a

לקינאז המזרחן את האנזים ולא לאנזים עצמו

גלוקוז חופשי בשריר מדכא פירוק גליקוגן הרעיון הוא שאם יש מספיק גליקוגן אין

צורך לפרק עוד

?האם גלוקוז 6 פוספט בכבד מדכא בניית גליקוגן

!לא הפוך

גלוקוז 6 פוספאט מסמל לנו שגלוקוקינאז עבד (להזכירכם גלוקוקינאז

עובד בריכוזים גבוהים של גלוקוז, והוא מעין סנסור לרמת הגלוקוז בדם)ץ

אם הוא עבד זה אומר שאנחנו במצב של שובע , שיש מספיק גלוקוז

מכאן זה אומר שאנחנו רוצים לאגור את הגלוקוז בגליקוגן ולא לדכא את בניית הגליקוגן

Question 33

של גליקוגן de-branching שאנזים

Answer 33

יש פעילות של בניה של קשר אלפא1-4 בלבד de-branching לאנזים

אבל הוא יודע לשבור שני סוגי קשרים אלפא 1-4 ואלפא 1-6

שובר אלפא 1-4 branching אנזים

יוצר קשר אלפא 1-6

Question 34

?איפה יש במיטוכונדריה זרחון ברמת סובסטראט

Answer 34

במעגל קרבס