Virus 3: DNA virus Flashcards

1
Q

Nämn två DNA virus från Baltimore klass II.

A
  1. Parvoviridae

2. Anelloviridae

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Nämn fem DNA virus från Baltimore klass I.

A
  1. Polyomaviridae
  2. Papillomaviridae
  3. Adenoviridae
  4. Herpesviridae
  5. Poxviridae
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Nämn ett DNA virus från Baltimore klass VII.

A

Hepadnaviridae

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Nämn ett DNA virus som använder reverse transkriptase.

A

Hepatit B virus

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Vad sker under tidiga fas av DNA virus livscykel?

A
  1. Modifikation av cellen
  2. Kontroll av cellcykel
  3. Undvikande av antiviralt försvar
  4. Regulatoriska proteiner tillverkas
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Vad sker under DNA replikation av DNA virus?

A

Cellen ställs om för replikation av virusgenomet

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Vad sker under sen fas av DNA virus livscykel?

A
  1. Strukturproteiner tillverkas
  2. Genomet packas in
  3. Ny viruspartikel frisätts
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Nämn tre problem med DNA-replikation för virus.

A
  1. Tillgång till replikationsfaktorer endast i S-fas
  2. Viruset vill ha multipla kopior från varje mall
  3. Replikation av ändar (ej förlora telomerer)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Nämn ett virus med liten genom.

A

Parvovirus

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

När replikerar Parvovirus?

A

Endast under cellens S fas.
Använder cellens maskineri.

Förekommer i blaster

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Nämn 5 karakterisk för Parvovirus.

A
  1. Linjärt
  2. ssDNA
  3. +ve eller -ve polaritet
  4. Ikosahedral kapsid
  5. Utan hölje
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Nämn tre Humana Parvovirus.

A
  1. B19
  2. Bocavirus
  3. Adeno-associerat virus, AAV (Dependovirus)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Vad är B19?

A
  • Humana Parvovirus
  • Erythrovirus (mild anemi)
  • Femte sjukan (slapped cheeks)
  • Fetal hydrops hos foster
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Vad är Bocavirus?

A
  • Humana Parvovirus

- Luftvägs- och tarminfektioner

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Vad är Adeno-associerat virus, AAV (Dependovirus)?

A
  • Humana Parvovirus
  • Behöver hjälparvirus (Adeno- eller herpesvirus)
  • Latens i frånvaro av hjälpfunktion
  • Genterapivektor
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Nämn 6 karakterisk för Adenovirus.

A
  1. Linjärt ds DNA
  2. Stor (35000 bp)
  3. Ikosahedral kapsid
  4. Inget hölje
  5. Kompakt genom med tidiga och sena gener
  6. Eget DNA polymeras
  7. Mycket splitsning
  8. Dereglerad translation
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Nämn minst 3 typer av adenovirus.

A

Typ A - Gastroentrit

Typ B1 - 3, 7, mm - ARDS

Typ B2 - 14 mm. - Urinblåseinfektion

Typ D - 8, 9, 19, 53, 54, mm - Keratokonjunktitvit

18
Q

Nämn ett virus som har egna replikations faktorer.

A

Poxvirus

Har många egna enzymer

19
Q

Nämn 3 karakterisk för poxvirus

A
  1. Har egna enzymer
    (DNA polymeraser, RNA polymeraser, kinaser, transkriptionfaktorer, cap enzymer mm)
  2. Replikerar i cytoplasma
  3. En promotor - en gen, ingen splitsning, inga introner
20
Q

Nämn två virus som orsakar smittkoppor

A

Variola minor och Variola major

Tillhör Orthopoxvirus från Poxviridae familjen.

21
Q

Nämn tre poxvirus hos människan.

A
  1. Molluscum contagiosum (godartad hudtumör)
  2. Apkoppor (Feber, huvudvärk, 5% dödlighet)
  3. Kokoppor (Från kor och katter)
22
Q

När det gäller telomeras borttappning, hur fixar Herpes-, polyoma- och papillomavirus denna problem?

A

Cirkulärt DNA = inga ändar

23
Q

När det gäller telomeras borttappning, hur fixar adeno-, parvo- och poxvirus denna problem?

A

Dessa har linjärt DNA.

Adenovirus = Har en proteinprimer

Parvovirus, poxvirus = Har en DNA-primer

Herpesvirus = Cirkulariserar och har rolling circle replication.

24
Q

Hur skyddar virus med linjärt DNA sina ändar?

A

Cirkulariseras inuti cellen mha cellens replikationssystem

De som är SS kan ha en ögla i änden

DS kan ha kovalent slutna ändar.

25
Q

Hur skapar virus DNA kopior från varje mall?

A

Har egen mall = känner igen virus “origin of replication

26
Q

Vad gör LT under replikation?

A

Binder till viralt DNA, enhancer/ORI

27
Q

Nämn två klinisk viktiga polyomavirus.

A
  1. JC virus (progressive multifocal leukoencefalopati, CNS påverkan)
  2. BK virus (i urin hos friska. Nefropati hos njurtransplanterade)
  3. Merkelcell polyomavirus (2008) (Cancervirus på huden)
28
Q

Nämn minst 3 faktorer som behövs för transkription.

A
  1. dsDNA beroende RNA polymeras (I-III)
  2. Vävnadsspecifik reglering
  3. Generella och specifika TF
  4. Epigenetisk kontroll
  5. Splicing
29
Q

Nämn tre problem som uppkommer hos DNA virus under transkription.

A
  1. Tävla om cellens transkriptionsmaskineri
  2. Reglera epigenetisk kontroll av viral och cellulär transkription
  3. Utnyttja sitt genom maximalt genom alternativ splicing
30
Q

Hur löser virus problemet med cellens transkriptionsmaskineri ?

A
  1. Ha ”extra starka” promotorer
  2. Ha virusproteiner som reglerar transkription
  3. Göra större mängd templat (Större chans att få sitt DNA transkriberat)
31
Q

Hur fixar polyomavirus extra starka promotorer?

A

Virala enhancers

32
Q

Hur fixar Hepatit B virus extra starka promotorer?

A

Har cellspecifika promotorer

33
Q

Hur reglerar adenovirus transkriptionen med virus proteiner?

A

Den modifierar cellens TF

34
Q

Hur reglerar herpesvirus transkriptionen med virus proteiner?

A

Ha egna bindande TF

35
Q

När det gäller “Reglera epigenetisk kontroll av viral och cellulär transkription”, hur gör virus?

A

T.ex latenta Epstein Barr virus packar ner sitt genome och undgår cellens antivirala försvar.

36
Q

Nämn två problem som virus har under translation.

A
  1. Tävla om cellens translationsmaskineri

2. Cellen stänger av translationen som ett antiviralt försvar

37
Q

Hur tävlar virus med cellens maskineri under translation?

A
  1. Virus kan stänga av translation av cellulärt mRNA (adenovirus)
  2. Kan göra cap-oberoende translation av virus-mRNA
  3. Kan skapa selektiv uttransport av virus-mRNA ur kärnan
38
Q

Hur blockerar cellen translation?

A

PKR, protein kinas R, induceras/aktiveras av stress

TF fosforyleras och translation blockeras.

39
Q

Vad gör virus när cellen stänger av translationen? Nämn ex hos adenovirus och poxvirus.

A

Förhindra blockering effekt av PKR

Adenovirus: Blockerar PKR aktivering eller binder PKR

Poxvirus: Skaffar pseudosubstrat

40
Q

Sammanfattning:

Nämn minst fyra karakterisk för DNA virus.

A
  1. Stor storleks variation (3-250 kbp)
  2. Kemisk stabila (kvar i cellen i många år)
  3. Persisterande infektioner (oftast latent)
  4. Använder cellens syntesmaskineri
  5. Genuttryck regleras under transkription och translation
  6. Underkommer immunförsvaret effektivt