Mycoses Flashcards

1
Q

Défintion

  • micromycètes
  • macromycètes
A

micromycètes
= levures et moisissures

macromycètes
= champignons macro
= Sporophores/Candisophores visibles

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2
Q

Caractéristiques mycètes

A
  • Organismes eucaryotes
  • Sans chlorophylle
  • Porteurs de spores
  • Nutrition par absorption et utilisent le carbone organique (Hétérotrophes)
  • Reproduction souvent asexuée, rarement sexuée
  • Leur paroi cellulaire contient typiquement de la chitine et des glucanes
  • Elles sont pour la plupart saprophytiques
  • moins de 0.5 % sont reconnus pathogènes
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3
Q

Mycose - définition

A
  • infections fongiques touchant les animaux (dont l’Homme)

- peuvent être superficielles, profondes ou systémiques

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4
Q

Mycologie médicale - définition

A

discipline distincte de la microbiologie médicale qui consiste à
isoler et à caractériser des champignons pathogènes dans le but de caractériser l’origine mycologique ou non d’une pathologie

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5
Q

Histoire de la Mycologie médicale

  • Époque d’Hippocrate
  • Moyen âge en Europe
A
  • Hippocrates: le père de la médecine, avait identifié des sujets atteints du muguet (Candida albicans)
  • Moyen âge en Europe:
    des enfants infectés par Trichophyton schoenleinii
    (dermatophyte-Tinea)- Champignon attaquant le cuir chevelu, la peau lisse
    et les ongles
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6
Q

Histoire de la mycologie médicale

  • 20ième siècle
A

– Éclosion de Sporothrix schenckii (infections sous-cutanée) chez 3000 travailleurs miniers en
Afrique du Sud (1941-1944)

– 2ème guère mondiale: apparition de zones endémiques aux USA (Histoplasma capsulatum,
agent de l’Histoplasmose)

– Ère de la suppression immunitaire et des mycoses opportunistes nosocomiales (Candidoses et aspergilloses):

  • Chimiothérapie (traitement du cancer)
  • Maintenance des greffons (immunosuppression)
  • VIH/SIDA (1981-)
  • Maladies auto-immunitaires (Arthrite, Psoriasis, sclérose en plaques, M. inflammatoires
    chroniques de l’intestin: Maladie de Crohn et rectocolite hémorragique)
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7
Q

Histoire de la mycologie médicale

  • 21ième siècle
A
  • Développement des tests de diagnostiques: tests de mise en culture spécifiques, tests de susceptibilités aux agents antimicrobiens, identification moléculaires (séquençage de gènes ou de séquences d’ADN: ADN ribosomal et ITS)
  • Développement d’antifongiques: Azoles et échinocandines
  • Avancés dans la compréhension du pouvoir pathogène fongique
    – Fungal Genome Initiative: séquençage de plusieurs génomes de champignons pathogènes
    de l’Homme.
    – Génomique fonctionnelle fongique: Analyse de transcriptomes, de proteomes, secrétomes
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8
Q

3 façons de classer les pathogènes fongiques

A
  • Critères morphologiques
  • Taxonomie et phylogénie
  • Manifestations cliniques (sites d’infection)
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9
Q

Classification morphologique des mycètes

A

= Basée sur la forme de la croissance végétative on distingue trois types de
morphologies

- Levures 
(Forme levuriforme)
- Moisissures 
(champignons filamenteux)
- Champignons dimorphiques 
(différencient à la fois des filaments et des levures)
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10
Q

Classification morphologique: Levures

  • complexité
  • reproduction
  • Nom donné aux levures pathogènes humains
A
  • forme la + simple
  • se multiplie par bourgeonnement (Saccharomyces cerevisiae) ou par fission (Schizosaccharomyces pombe)
  • levures pathogènes humains sont désignées par blastoconidies
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11
Q

Classification morphologique: moisissures

A
  • cell filamenteuses et cylindriques reliées bout à bout
  • cell de moisissures
    = hyphe
  • avec ou sans septum
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12
Q

Mycélium

A

= masse de hyphes

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13
Q

Classification morpho: Pseudohyphes

A
  • Morphologie associée aux levures et distincte
    de la forme levure et la forme hyphale
  • Cellules levuriformes allongées et attachées
    (en forme de collier)
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14
Q

Classification morpho: champignons dimorphiques

caractéristiques + 2 exemples de champignons pathos de ce type

A
  • Le dimorphisme est une caractéristique de plusieurs champignons pathogènes comme Blastomyces et Histoplasma
  • Filamenteux à ~ 25°C (dans l’environnement/sol)
    Levures à 37°C température corporelle
    (ATTENTION pas le contraire)
  • caractéristique d’identification de ces champignons au laboratoire.
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15
Q

Classification taxonomique

A
  • dépend de la présence/absence de reproduction sexuée (méiose) et des caractères morphologiques (présence de septum, cycle de vie et physiologie)
  • utilise la phylogénie moléculaire/génétique
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16
Q

Pourquoi la classification taxonomique est-elle importante pour le clinicien microbiologiste? (2)

A
  • Susceptibilité aux agents antifongiques

- Pouvoir pathogène et transmissibilité

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17
Q

Divisions de la classification taxonomique (5)

A

RÈGNE
fungi

SOUS-RÈGNE
dikarya

DIVISION
Ascomycètes
Basidioomycètes
Glomeromycota

ORDRE
Mucorale
Entomophtorale

GENRE
Candida, Aspergillus,
Cryptococcus, Malassezia
Mucor, Conidiobolus

**VOIR DIAPO 11

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18
Q

Classification taxonimique: Ascomycètes

  • % des champignons connus
  • type morpho/apparence
  • reproduction
  • identification au labo
  • exemples
A
  • Représentent 75% des champignons connus
  • Levures ou filamenteux
  • Reproduction sexuée (ascospores) ou asexuée par bourgeonnement
    (blastospores/levures) ou par production de spores (conidies)
  • Identifiés aux laboratoires cliniques par leurs propagules ou par tests génétiques dans le cas d’espèces qui ont une croissance lente ou inexistante.
  • Exemples : Candida albicans, Aspergillus fumigatus, Fusarium, Penicillium, Alternaria, Blastomyces, Histoplasma,
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19
Q

Classification taxonomique: Basidiomycètes

  • reproduction
  • apparence
  • exemples
A
  • Reproduction sexuée par formation des basidiospores (basidium) ou des conidies.
  • Apparences: levures, filaments, capsules.
  • Exemples : Cryptococcus neoformans, C. gattii, Schisophyllum commune, Trichosporon, Malassezia pachydermatis
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20
Q

Classification taxonomique: Mucorales

  • c’est quoi
  • nom des cell
  • reproduction
  • exemples
A
  • Forme primitive des champignons
  • Cellules coenocytiques
  • Formation de zygospores
  • Exemples : Mucor spp, Rhizopus, Lichtheimia, Apophysomyce
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21
Q

Classification basée sur la pathogénèse

  • basée sur quoi
  • types (5)
A

= basée sur les sites d’infections primaires

  • Mycoses superficielles
  • Mycoses cutanées
  • Infections opportunistes systémiques
  • Mycoses sous-cutanées
  • Mycoses endémiques
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22
Q

Sites d’infections primaires: Mycoses superficielles

  • c’est quoi
  • un exemple
  • nom du mycète causant l’exemple
A

= problème surtout cosmétique

  • Tinea versicolor : Infection de la couche supérieure morte kératinisée de l’épiderme
  • Infections causées par Malassezia
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23
Q

Sites d’infections primaires:
Mycoses cutanées

  • causées par quoi?
  • infections touchant quoi?
A
  • Causées par des Dermatophytes
  • Infections touchant la peau, les cheveux et les ongles
  • Trichophyton tonsurans > T. rubrum > T. interdigitale >
    Microsporum canis
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24
Q

Sites d’infections primaires:
Mycoses opportunistes systémiques

  • infections de quoi?
  • infections par qui?
  • infections touchant qui?
A
  • Infections de tous les organes
  • par des champignons environnementaux (Aspergillus fumigatus), ou des endosymbiontes commensaux/Mycobiota (Candida albicans)
  • Infections touchant des patients dont le système immunitaire est compromis:
  • – Porteurs de VIH
  • – Patients immunosupprimés: transplantation d’organes, Chimiothérapies …
  • – Nouveaux nés, femmes enceintes, …
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25
Q

Les mycoses opportunistes systémiques peuvent-elles toucher des personnes saines?

A

oui

comme certains cas de champignons dimorphiques

26
Q

Sites d’infections primaires: mycoses sous-cutanées

  • causées comment?
  • causées par qui?
A
  • Mycoses d’implantations (suite à des piqûres ou des traumatismes transcutanés)
  • Causées par des champignons mélanisés
  • Exemples: Sporothrix schenckii et Madurella mycetomatis
27
Q

Sites d’infections primaires: mycoses endémiques

  • caractéristique
  • causent quoi?
A
  • Champignons ayant une répartition géographique restreinte.
  • Causant majoritairement des infections pulmonaires qui peuvent évoluer en infections
    systémiques.
28
Q

3 exemples de mycoses endémiques qui peuvent s’attraper ici

A
  • histoplasmose
  • Cryptococcus gatii
  • Blastomycose
29
Q

Quelques facteurs de risques à mycoses invasives (3)

A
transplantation
MPOC
cancer
diabète
HIV
30
Q

Composantes d’une cell fongique à levure (7)

A
  • Noyau avec membrane nucléaire
  • Cytoplasme
  • Mitochondrie
  • Vacuole
  • Réseau de transport vésiculaire : Réticulum
    endoplasmique et Golgi
  • Membrane plasmique
  • Paroi cellulaire
31
Q

Composantes d’une cell fongique à hyphe (10)
+ savoir les reconnaitre sur une photo (diapo 17)

  • paroi est comment?
  • noyau est comment?
  • 3 structures qu’il n’y a pas dans les cell de levures
A
1- Septum avec le pore septal
2- Corps de Voronine (Woronin body)
3- Noyau avec nucléole
4- Réticulum endoplasmique
5- Mitochondrie
6- Membrane plasmique
7-Paroi cellulaire avec 3 couches:
Interne (chitine), intermédiaire (glucane)
et externe (mannane)
8- Vacuole
9- Golgi
10- Spitzenkorper
32
Q

Quelle est la caractéristique de la membrane plasmique des cell fongiques?

A

présence d’érgosterol

cholestérol fongique

33
Q

Ergostérol

A
  • Stérol spécifique des champignons et de certains protozoaires et absent
    chez les cellules animales
  • Constituant de la membrane
  • Contribue à la régulation de sa fluidité
34
Q

Différentes couches de la paroi cell de la cellule fongique

A

COUCHE EXTERNE

  • mannanes
  • protéines pariétales

COUCHE INTERMÉDIAIRE
- glucane

COUCHE INTERNE
-chitine

35
Q

En plus des différentes couches de la paroi, qu’est-ce qu’il est possible de retrouver aussi dans la paroi? Quels champignons sont impliqués?

A

mélanine

chez certains champignons filamenteux
aspergillus, altermaria

36
Q

Paroi cell: Chitine

  • c’est quoi
  • % chitine dans paroi levures
  • % chitine dans paroi champignons filamenteux
A

Microfibres insoluble du poly ß-(1→ 4)-N -acetylglucosamine polymère associés aux glucanes

2% = levures

6% = champignons filamenteux

37
Q

Paroi cell: Glucanes

% masse de la paroi

A

58-60% de la masse de la paroi

38
Q

Paroi cell: caractéristiques des mannanes

A
  • Hémi-cellulose
  • Composants majeurs des protéines pariétales (38–40% de la masse de la paroi)
  • Antigène majeure de C. albicans
39
Q

Paroi cell: protéines pariétales

  • c’est quoi
  • fonctions
A

protéines GPI associées à la chitine et au glucan

fonctions:
adhésines (attachement à l’hôte), biogénèse de la paroi

40
Q

Différentes parois cell fongiques

voir diapo 19

A

voir diapo 19

41
Q

Mycoses à l’étude (5)

A
Aspergillus sp
Cryptococcus
Blastomyces
Paracoccidioides sp
Candida sp
42
Q

Aspergillus sp - Formes possibles (4)

A
  • Aspergillomes pulmonaire et cérébrale
  • Aspergilloses pulmonaires chroniques
  • Infections superficielles : Sinus, otomycose (oreille), onychomycosis (ongles)
  • Allergies
43
Q

Cryptococcus

  • conséquences (3)
  • atteint qui? (2)
A
  • Cryptococcus gattii
  • Lésions cérébrales et pulmonaires, et Méningites
  • Sujets sains et immunosuprimés
44
Q

Blastomyces

  • sévérité
  • conséquences (3)
A
  • Blastomyces dermatitidis
  • Infection fatale
  • Infections pulmonaires, lésions dermiques et
    ostéomyélite
45
Q

Paracoccidioides sp

  • conséquences (2)
A
  • Infection pulmonaire

- Enflement des ganglions lymphatiques

46
Q

Candida sp - Épidémio

A
  • plusieurs types dont C. Albicans
  • 4ième maladie nosocomiale la + commune
    (associée à la contamination des instruments médicaux)
  • morbidité et mortalité ++chez immunosupprimés
  • hospitalisation couteuse
47
Q

À quoi est associée la virulence des C.albicans? Expliquez.

A

La virulence de C. albicans est associée à son dimorphisme:

  • Hyphes (37 degrés) dédiés à l’invasion et la colonisation des organes.
  • Levures (30 degrés) associées à la dissémination de C. albicans.
48
Q

Autre forme possible de C.albicans

A

nouvelle forme commensale retrouvée dans les intestins

49
Q

4 façons de dx les mycoses

A
- Caractéristiques morphologiques :
Apparence en milieu de culture
- Examen microscopique: Patho-histologie
- Diagnostique moléculaire: ADN, PCR, séquençage
- Diagnostique sérologique: Anticorps
50
Q

3 types de thérapies fongiques + explication de chaque

A
  • Chimique : Trois grandes classes de molécules sont utilisées incluant les azoles,
    les échinochandines et les polyènes.
  • Immuno-modulation: Vaccination (essais cliniques en cours pour un vaccin contre les
    vaginoses fongiques causées par Candida albicans et C. glabrata.
  • Immunothérapie: stimulation des défenses immunitaires contre les pathogènes fongiques
51
Q

Thérapies antifongiques chimiques: azoles

  • utilisation
  • mode d’action
  • utilisée contre quoi
  • classes
A
  • Les antifongiques les plus utilisés.
  • Fongistatiques
    (ne tue pas mais inhibe la croissance)
  • Utilisés contres des infections systémiques et superficielles
  • Différentes sous-classes:
  • – 1,2,3-Triazoles (Fluconazoles, itraconazole)
  • – Imidazole (ketoconazole, Clotrimazole)
52
Q

Azoles

  • cible cellulaire
  • cible moléculaire
A
  • Cible cellulaire: membrane plasmique
  • Cible moléculaire: Les azoles inhibent la
    biosynthèse de l’Ergosterol.
53
Q

Thérapies antifongiques chimiques: Échinocandines

  • utilisation
  • mode d’action
  • utilisée contre quoi
  • classes
  • Exemple de mycète populaire traité avec celui-ci
A
  • Antifongiques administrés par intraveineuse.
  • Fongicides.
  • Utilisés contres des infections systémiques graves.
  • Différent molécules:
  • – Caspofungin (Cancidas-Merck): Contre C. albicans, Aspergillus
  • – Micafungin (Mycamine, Astellas Pharma): Contre C. albicans
  • – Anidulafungin (Eraxis, Pfizer): Contre C. albicans
54
Q

Échinocandines

  • cible cellulaire
  • cible moléculaire
A
  • Cible cellulaire: Paroi cellulaire

- Cible moléculaire: Inhibent la biosynthèse des glucanes

55
Q

Thérapies antifongiques chimiques: Polyènes - Amphotéricine B

  • utilisation
  • mode d’action
  • utilisée contre quoi
  • classes
A
  • Antifongiques administrés par intraveineuse ou par voie orale.
  • Fongistatiques/Fongicides (concentration-dépendante)
  • Toxiques, mais la formulation sous forme de liposome (AmBisome) réduit sa toxicité.
  • Spectre antifongique large:
  • —Aspergillus fumigatus
  • — Candida albicsans, C. glabrata, C. krusei, C. lusitaniae
  • — Cryptococcus neoformans
  • — Fusarium oxysporum
56
Q

Pourquoi la découverte/création d’antifongique est difficle?

A

comme les cell des mycètes ressemblent bcp aux cell des humains, il est difficile de trouver des thérapies qui ne sont pas toxiques pour l’humain

57
Q

Polyènes

  • cible cellulaire
  • cible moléculaire
A
  • Cible cellulaire: membrane plasmique
  • Cible moléculaire: Les polyènes inhibent la biosynthèse de l’Ergosterol et forment des pores qui fragilisent la membrane
58
Q

5 limites des thérapies fongiques

A
  • Toxicité pour toutes les molécules connues
    Pourquoi?
    Ressemblance des cibles thérapeutiques due à la nature eucaryotique des cellules humaines et fongiques
  • Les échinochandines sont insolubles.
  • Nature fongistatique de certaines molécules (azoles): Problème de récurrence et résistance.
  • Perte d’efficacité dans certaines niches acides (vagin et abcès)
  • RESISTANCE
59
Q

Résistances naturelles aux antifongiques est souvent du à quoi?

A

Biofilm

  • Mode de vie sessile (attaché) liée à la contamination des dispositifs médicaux (Cathéters, Prothèses, Pacemakers)
  • Levures, hyphes et pseudohyphes emballés
    dans une matrice polysaccharidique qui
    donne au biofilm une structure en 3D.
  • Résistance à toutes les molécules : ~ 1000x
    comparée aux cellules planktoniques
60
Q

Tous les champignons sont-ils sensibles aux antifongiques?

A

non

ex: Candida krusei et C. auris (à tout), C. glabrata (azoles)

61
Q

Résistances cliniques aux antifongiques

3 mécanismes

A
  • Altération de la cible (Modifications génétiques)
  • Altération de transport: Hyper-activation des transporteurs d’efflux ABC- et MFS
  • —ABC (ATP Binding Cassette) exigent de l’ATP pour l’efflux de drogues.
  • — MFS (Major Facilitator Superfamily) efflux passive de drogues.
  • Aneuploïdies: Trisomie de certains chromosomes
    = Duplication de fragments intra-chromosomiques contenant des transporteurs d’efflux de drogues (Cas de C. albicans)