Proteinstruktur

Question 1

Vad Består en aminosyra av?

Answer 1

En aminogrupp och en carboxylgrupp samt en sidokedja och ett väte

Question 2

Vad är “Alphakolet”?

Answer 2

Det kolet som aminogruppen och carboxylgruppen binder till

Question 3

Vad kallas en bindning mellan två aminosyror?

Answer 3

Peptidbindning

Question 4

vilka grupper samt undergrupper kan aminosyror klassificeras i?

Answer 4

polära och opolära är det två huvudgrupperna. Opolära kan vara alkyl och aromatiska. Polära kan vara neutrala, acidic, basic

Question 5

Vad innebär det att ett protein är denaturerat?

Answer 5

Att det endast har kvar sin primärstruktur.

Question 6

Vad är en proteins sekundärstruktur?

Answer 6

Lokala vikta strukturer inom en polypeptid som ett resultat av interaktioner mellan atomerna i backbone

Question 7

Vad är tertiär struktur?

Answer 7

Den tredimensionella strukturen av polypeptiden. Beror mest av interaktioner mellan R-grupperna hos aminosyrorna. V.D.waal, hydrofobisk, disulfidbryggor, samt vätebindningar.

Question 8

vad innebär hydroxylering? Ge exempel.

Answer 8

Innehär att man binder en hydroxylgrupp (OH-). Hydroxylerade aminosyror blir mer vattenlösliga. Hydroxylering av prolin är viktigt för kollagen

Question 9

vad innebär fosforylering av aminosyra? Vilka aminosyror?

Answer 9

Vanligt sätt att reglera cellprocesser genom att processerna slås av/på med hjälp av detta. Oftast på serin men även threonine and tyrosine

Question 10

Vad innebär metylering av aminosyror?

Answer 10

Argenin, histidin, lysin, prolin, och carboxylgrupper. Viktigt för att regulera cellulära processer som till exempel transkriptionsregulation

Question 11

Vad är “induced fit”?

Answer 11

en model för enzym-substrat interaktion. Menar att interationen mellan ett enzym och substrat är svagt till en början men leder till en konformationsförändring hos enzymet och bindningen blir starkare.

Question 12

Vad karaktäriserar en domän hos ett protein?

Answer 12

En konserverad del av ett protein som kan fungera och existera oberoende av resten av proteinet

Question 13

vad kan man dra för slutsats om en aminosyra har en kolvätekedja?

Answer 13

Att den är opolär

Question 14

vad kan man oftast dra för slutsats om en aminosyra med OH-grupp? Vad innebär det?

Answer 14

den är polär och löslig i vatten.

Question 15

Vilken aminosyra kan bilda disulfidbryggor vid oxiderins?

Answer 15

Cysteine

Question 16

Vad kan man dra för slutsats om en aminsyra har en karboxylgrupp i sidokedjan?

Answer 16

Den är acidic.

Question 17

Vilken slutsats kan man dra av att aminosyrans namn slutar på “ate”?

Answer 17

Att den har en karboxylgrupp i sidokejdjan

Question 18

vad är en “amide group” och vad säger det om aminosyran?

Answer 18

ett kol som är bundet till en NH2 och en dubbelbindning till O. Då är aminosyrar polär

Question 19

Vilken slutsats kan man dra när man ser en amine i sidokedjan på en aminosyra? Vad är en amine?

Answer 19

Att den är basisk. NH3+

Question 20

Vilken slutsats kan man dra av att en aminosyra har en bensenring?

Answer 20

Den är aromatisk

Question 21

vad karaktäriserar aminosyror med opolära sidokedjor?

Answer 21

Tar/tappar inte protoner och skapar inte väte eller jonbindningar. Lipidlika sidokedjor som promotar hydrofoba interaktioner.

Question 22

Vilka är aminosyrorna med opolära sidokedjor?

Answer 22

Valine, alanine, methionine, proline, glycine, isoleucine, leucine, phenylalanine, tryptophan, (tyrosine hydrofob enligt vissa men inte polär).

Question 23

vad karaktäriserar aminosyror med oladdade polära sidokedjor?

Answer 23

De har ingen laddning vid fysiologiskt pH. Serine threonine och tyrosine har en polär hydroxylgrupp som kan delta i vätebindningar. Asparagine och glutamine har en carbonyl och amide grupp i sina sidokedjor, och båda dessa kan bilda vätebindningar.

Question 24

Av de polära oladdade aminosyrorna, vilka kan bilda disulfidbindningar?

Answer 24

Cysteine, med sig själv.

Question 25

Vilka modifieringar kan ske vid aminosyror med polära oladdade sidokedjor?

Answer 25

Serine, threonine, och (sällan) tyrosine kan binda tex fosfatgrupper på sin OH-grupp. Asparagines amingrupp och serine och threonines hydroxylgrupp kan binda oligosackaridkedjor i glycoproteiner.

Question 26

Vad karaktäriserar aminosyror med sura sidokedjor?

Answer 26

Deras COOH-grupp har givit bort sin proton vid fysiologiskt pH och kallas aspartate och glutamate.

Question 27

Vad karaktäriserar aminosyror med basiska sidokedjor?

Answer 27

Deras sidokedjor accepterar protoner. Vid fysiologiskt pH är Lysine och arginine fullt joniserade och positivt laddade. Histidin är ofta inte laddat vid fysiologiskt pH. har därför viktig buffrande roll i många protin, tex hemoglobin.