9.2- déficience intellectuelle Flashcards

1
Q

qu’est ce que la déficience intellectuelle? caractérisé par

A
  • limitations substantielles dans le fonctionnement actuel
  • Caractérisé par un fonctionnement intellectuel sous la moyenne

* fonctionnement intellectuel sous la moyenne

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2
Q

DI est caractérisé par l’existence concomittante de limitations dans deux des sphères susivantes;

A

communication, autonomie, habilités sociales, santé et sécurité, utilisation de ressources sociales, apprentissage scolaire, loisirs et travails

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3
Q

tous ses symptômes doivent être diagnostiquer quand? et cb d’écart-type = DI

A
  • avant 18 ans
  • (+) que 2 écart-types = DI
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4
Q

combien de cas de DI selon les stats et en occident? + problème de quoi? Coute cb par individu

A

stats: 2,3%
Occident: 1-3%

  • problèmes socio économique le plus important dan les pays de l’Occident (coûte + que le coût total du cancer et des MCV)
  • Coûte + que 1 millions par individu
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5
Q

causes de 20% des cas de DI

A

environnementaux

  • alcool foetal
  • prématurité
  • anoxie
  • infection
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6
Q

50% des cas de DI

A

cause génétique identifié

ceux qui ne sont inexplicables = probs génétique aussi

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7
Q

à partir de quand peut ton dire que c’est un DI

A

4-5 ans

*avant; on parle de retard global de développement

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8
Q

quel QI correspond a une déficience légère

A

55-70

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9
Q

quel QI correspond a une déficience modérée

A

40-55

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10
Q

quel QI correspond a une déficience sévère

A

en bas de 40

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11
Q

comment différencier une forme syndromique de non syndromique de DI?

A

*syndromique=présence anomalies structurales ou métaboliques additionnelles (comme down syndrome

NS=pas d’anomalies additionnelles

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12
Q

à quel autre syndrome est relié le DI?

A

autisme et épilepsie!
50% sujets autistes ont aussi DI
20% autistes sont épileptiques
20% personnes avec DI sont épileptique

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13
Q

quelles sont les allèles rares?

A
  • effet important sur le phénotype
  • mendéliennes; maladies monogamiques, autosomique dominant et récessif, lié à X
  • très rare et va donner un phénotype précis (NLGN1, syndrome de Miller)
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14
Q

quelle sont les allèles intermédiaires?

A

-low frequency
-multifactorielle; donc pas un seul gène qui l’explique(1 variation n’est pas suffisante)
(déficience complexe I de la chaine respiratoire)

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15
Q

quelles sont les allèles communes?

A
  • effet modeste sur le développement d’un phénotype

- plusieurs gènes impliqués + que 1000

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16
Q

la DI est une maladie de type…

A

commune!

autour de 1000 gènes impliqués dans DI

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17
Q

Pour la génétique de la déficience intellectuelle est homogène ou hétérogène

A

HÉTÉROGÈNE

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18
Q

comment identifier les mutations affectant le nombre de copies? CNV

Hétérogénéité génétique de la déficience intellectuelle

A
  • 5% par le caryotype

- 14% par hybridation génomique sur micropuces

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19
Q

les mutations affectant le nombre de copies arrivent le plus souvent…

A

de novo

*peuvent aussi être transmises

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20
Q

la cause génétique la plus fréquente de DI

Hétérogénéité génétique de la déficience intellectuelle

A

trisomie 21 via une mutation qui affecte le nb de copie

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21
Q

qu’est ce qui différencie la DI du reste de la population?

A

excès mutation de novo de CNV (10-14% vs 1-2% dans la population normale)

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22
Q

nommer les 2 types de mutations ponctuelles (qui affecte un gène) QUI DÉMONTRE L’Hétérogénéité génétique de la déficience intellectuelle

A
  • lié x
  • autosomique

- autosomique

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23
Q

quel est la cause monogénique de DI la plus fréquente? (donc faisant aprti de mutation ponctuelle) + % des garcons

A

syndrome du X fragile retrouvés chez *2% des garçons avec DI

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24
Q

combien de gènes lié a DI sur chromosome X lié à une mutation ponctuelle + % de Di chez les garçons

A

plus de 100

*explique 10% des cas de DI chez garcon

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25
Q

mutations ponctuelle autosomique peut être de type.. + nb de gènes connus

A

récessif ou dominante (de novo ou transmise)

*plus de 250 gènes connus

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26
Q

combien de gènes au total associés à DI? et sont de quel type?

A

800

majorité autosomique

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27
Q

quelles sont les types de mutations ponctuelles de novo?

A

faux sens et non sens

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28
Q

quel est le taux de mutations des mutations ponctuelles de novo?

A

1x10-8

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29
Q

combien avons de nucléotides?

A

6 milliards

Pour diploïde moitié pour haploïde

30
Q

combien avons nous de mutations de novo par génome diploïde?

A

60

31
Q

exome correspond à quel portion du génome?

A

2%

32
Q

combien de mutations de novo par exome?

A

1,2 mutation de novo par exome

33
Q

quel site est associé à un taux de mutation 10x plus grand?

A

site CpG

Citosine Guanine

34
Q

Pourquoi on arrive a séquencer le génome mutée ajd et le nouveau séquencage du génome permet de détecter quoi

A
  • Moins couteux qu’avant
  • de détecter virtuellement toutes les mutations
35
Q

2 types de séquencages + avantages

A
  1. Exome : bcp d’informations riches (comme la plupart des muations) et moins couteux
  2. Genome : Plus long, mais excellent pour les translocation équilibré
36
Q

Comment on Capture de l’exome par une librairie d’oligonucléotides

A
  • Fragmentation de l’ADN
  • Hybridation des fragments d’ADN à des oligonucléotides de RNA
  • Les hybrides DNA-mRNA sont capturés par des billes recouvertes de streptavidine
  • Amplification des fragments capturés
  • Séquençage de nouvelle génération
37
Q

CNV de forte ampleur peut être détectée

A
  • CGH (micropuce)
  • Exome moyen
  • Génome
38
Q

CNV de faible ampleur peut être détecté par

A
  • exome (moyen)

- génome

39
Q

un réarrangement équilibré peut être détecté par

A
  • carytoypes

- génome

40
Q

une mutation ponctuelle sur une région codante pour être détectée

A
  • exome

- génome

41
Q

une mutation ponctuelle sur une région non codante pour être détectée

A

-génome

42
Q

une expansion de triplets peut être détecté par

A
  • exome (moyen)

- génome moyen

43
Q

qu’est ce que le syndrome de Schinzel-Gideon

A

à partir de 4 familles avec phénotype très semblables on trouve le gène muté de novo= SETBP1
(de novo PAS DE MUTATION HÉRÉDITAIRE)
(bébé grinch)

44
Q

qu’est ce que le principe du séquençage de l’exome en trio?

A

-analyse mère père et enfant (cas index) voir quelle mutation est présente chez lui et non chez les parents
En moyenne de 2 mutation pour une DI sévère
=excès de mutation de novo
=excès de mutation délétère (qui met en danger) de novo
*beaucoup de mutations missense

DOnc SURTOUT MUTATTIONS DE NOVO QUI DONNE DI

45
Q

quelle est la cause principale du DI? identifiés grâce…

A

Fraction importante serait causé par une mutations de novo touchant 1 seul gène
(trouver grâce au séquençage des exomes trios parents-enfants)

46
Q

comment différencier une mutation bénigne d’une mutation pathologique?

A
  • impact de la mutation sur la structure et l’activité de la protéine
  • fréquence de mutation dans la population cible vs population générale
  • fonction gène candidat (gène qu’on étudie)
47
Q

nommer les types d’impact fonctionnel des mutations dominantes?

A
  • haploinsuffisance (amorphique)
  • dominant négatif (antimorphique)
  • gain de fonction (néomorphique)
48
Q

qu’est ce que l’haploinsuffisance?

A
  • perte complète fonction protéines (allèle nul)
  • sensibilité du gène à effet de dosage (sensible à la quantité de protéine produite
49
Q

qu’est ce que la mutation dominante négatif (antimorphique)? + ex

A
  • protéine est produite mais est mutante; agit de façon antagoniste sur la protéine sauvage = récepteurs devient non fonctionnels (75%)
  • syndrome de marfan, ostéogenèse imparfaite de type II
50
Q

qu’est ce qu’un gain de fonction (néomorphique)?

A
  • gain activité aberrante (mutation dominante qui stabilise le récepteur sans ligand)
  • mutation FGFR3 achondroplasie, hypochondroplasie, dysplasie thanatophore
    =récepteur est activé même si pas de ligand
51
Q

quels sont les troubles dans le spectre de l’autisme?

A
  • altération qualitative des intéractions sociales et communication
  • caractère restreint, répétitif et stéréotypé des comportements, des intérêts et des activités
52
Q

autisme: retard ou caractère anormal du fonctionnement commence quand?

A

avant 3 ans

dans au moins 1 domaines suivants

53
Q

dans au moins quels domaines?

A
  • interactions sociales
  • langage pour communication sociale
  • jeu symbolique ou imagination
54
Q

quel est l’impact des mutations de novo dans le TSA?

A

25% des cas!

dont missense, LGD (frameshift,nonsens, faux sens), et CNV

55
Q

le taux de mutation de novo augmente selon l’âge du…

A

PÈRE!
(effet s’applique dans une fratrie)

56
Q

pourquoi arrive plus chez le père?

A

spermatogénèse=division constante!!!
-mutations de novo arrivent dans les divisons cellulaires
(donc explique le risque plus élevé chez l’homme)

57
Q

qu’est ce que la pénétrance?

A

TOUT OU RIEN

proportion des individus possédant un génotype donné qui exprime le phénotype correspondant

58
Q

qu’est ce que l’expressivité?

A

manifestation phénotypique de l’anomalie génétique ou chromosomique
*question de degré

59
Q

dans les maladies neuro développementale, il est fréquent qu’il aille un CNV, quel type est le plus fréquent

A

Héritée de la mère et surtout mutation de novo (en noir)

CNV pénétrant = Novo
CNV non pénétrant = héritée

60
Q

expliquer le cas de la microdélétion 16p12.1

A
  • enfants atteint de DI sont atteint de la microdélétion
  • mais certaines personnes l’ont cette microdélétion et exprime pas DI
  • doit donc être accompagné d’un autre CNV de grande taille (plus de 500 kb)
61
Q

est-ce que la microdélétion est souvent transmise par un parent avec un DI?

A

non dans 95% des cas la micro est transmise par un parent sans DI!

*donc parent avait la microdélétion mais pas un autre CNV de grande taille donc n’a pas exprimé le DI

62
Q

si la microdélétion a une grande pénétrance, avons nous besoin d’un autre CNV de grande taille pour exprimer le DI?

A

NON!

si pénétrance réduite oui

63
Q

quels sont les facteurs à considérer dans l’évaluation de la pathogénécité d’un CNV?

A
  • transmission de novo ou héritée (un CNV de novo n’est pas d’emblée pathogénique; un CNV hérité n’est pas d’emblée bénin)
  • données empiriques
  • Caractéristiques du CNV (plus est gros (taille) et plus est important et son contenu en gènes)
64
Q

est ce que CNV de novo est toujours pathogénique?

A

NON

2% des porteurs sont sans impact

65
Q

un CNV hérité est toujours bénin?

A

NON (pas d’emblée)

66
Q

dans le TSA; quels variant venant des parents peuvent avoir un impact sur autisme de l’enfant?

A

mutation de LGD (pas certain de cette parenthèse frameshift, faux sens, non sens)

Likely Gene Diruptive

67
Q

est-ce que les CNV ou SNV hérités/novo sont plus rares?

A

SNV hérité/novo sont plus rares que CNV

68
Q

quelles allèles ont une pénétrance très haute?

A

les allèles rares

69
Q

est-ce que la mutation du chromosome X explique pourquoi il y a plus de DI chez l’homme que la femme? (excès de 25%)

A

NON explique seulement 10% des cas de DI chez les hommes
C’est à cause que la femme doit avoir des plus gros et contenir + de gènes CNV pour être DI

70
Q

2% des garçons atteints de DI sont aussi atteints du …

A

syndrome du X fragile

1/6000

71
Q

est-ce les hommes sont plus atteints de CNV rares donc DI?

A

NON
plus les filles!

*femmes sont protégées; ont besoin de plus garnd avec plus de gène de CNV pour avoir un effet
*si affecté= ne le ressent pas donc plus de chance de le transmettre!

72
Q

met en ordre croissant SNV CNV de novo

A

CNV novo est plus fréquent que SNV