Leerdoelen pag. 5

Question 1

Een promotor

Answer 1

is een DNA element voor een gen of genen dat de werking van het gen reguleert. Het wordt niet afgelezen bij de transcriptie.

Question 2

Een ribosomaal binding site

Answer 2

is een sequentie van nucleotiden die begint voor het start codon van een mRNA transcript die verantwoordelijk is voor de rekrutering van een ribosoom tijdens de initiatie van eiwittranslatie.

Question 3

Een multiple cloning site

Answer 3

is een DNA regio in een plasmide die meerdere unieke knipplaatsen voor restrictie enzymen bevat. Plasmiden zijn erg nuttig in de biotechnologie en een belangrijk kenmerk van hun gebruik is de multiple cloning site. Hier kan namelijk vreemd DNA in de plasmide worden gebracht. Het plasmide kan dan functioneren als vector.

Question 4

Een transcriptioneel terminator

Answer 4

is een selectie van nucleïne zuur sequenties die het einde van een gen of operon in genomisch DNA markeren tijdens de transcriptie. Deze sequentie medieert transcriptionele terminatie door het leveren van signalen in het nieuw gesynthetiseerde transcript RNA die het proces aanzet waarbij het transcript RNA van het transcriptionele complex loslaat.
stopt transcriptie. Stopcodon stopt translatie.

Question 5

De Kozak sequentie

Answer 5

is een RBS(ribosomal binding site) voor eukaryoten: ACCAUGG. Deze sequentie in complementair aan eukaryote rRNA sequentie. Ribosoom begint te lezen tot het startcodon, dan begint het bouwen.

Question 6

De Shine-Dalgarno sequentie

Answer 6

is RBS voor prokaryoten: AGGAGGUX(4-8)AUG. Deze sequentie is complementair aan 16S rRNA sequentie.
Ribosoom bindt te lezen tot het startcodon, dan begint het bouwen.

Question 7

Rol Shine-Dalgarno sequentie

Answer 7

Een expressievector met een Shine-Dalgarno sequentie wordt gebruikt bij expressie in bacteriën.

Question 8

Rol Kozak consensus sequentie

Answer 8

Een Kozak consensus sequentie wordt gebruikt bij expressie in eukaryoten (humaan, gist).

Question 9

2 Bacteriële expressie systemen + functie

Answer 9

LAC-promotor (Het LAC operon is een operon dat voor de regulatie van de afbraak van lactose zorgt en voorkomt in onder andere de bacterie E. coli. Het is een stukje DNA dat voor de afbraak van lactose zorgt en daarbij de benodigde enzymen produceert.)
araBAD promotor (Het araBAD operon is een operon dat zorgt voor de regulatie van de afbraak van arabinose en zorgt en voorkomt in onder andere de bacterie E. coli.)

Question 10

2 Bakkersgist expressie systemen + functie

Answer 10

Gal-I promotor (Genexpressiesysteem in gist. Groei op glucose. Upregulatie van GAL4p. Groei op andere C -bronnen.)
LAC4 promotor

Question 11

Er zijn 4 belangrijke eiwittags:

Answer 11

GST-tag: Glutathione S transferse
His-tag: histidine
MBP tag: maltose binding protein
TAP tag: tandem affinity purification

Question 12

Sequencing

Answer 12

Sequencing is het bepalen van de nucleïnezuur of aminozuur volgorde van een DNA RNA of eiwit. Het gewenste DNA wordt lineair gemaakt. Het DNA wordt in vele stukjes gebroken. Aan elk stukje wordt een tag vastgemaakt. Deze tags worden vastgemaakt. Elk stukje DNA wordt dan vermeerderd. Hierna leest de sequencer het DNA en kan vaststellen uit welke basenvolgorde elk stukje DNA bestaat. Elke base geeft hierbij een andere kleur. Zo kan dan uiteindelijk de sequentie van het gehele DNA worden vastgesteld.

Question 13

RNA interference

Answer 13

RNA-interferentie (RNAi), is een biologisch verschijnsel dat voorkomt bij de meeste eukaryoten. De werking van RNAi berust op de remming van mRNA door de complementaire streng

Question 14

shRNA

Answer 14

Is een stukje RNA dat gebruikt kan worden om target gene expressie te silencen via RNA interference.

Question 15

miRNA

Answer 15

is een vorm van niet coderend RNA. miRNA is complementair aan een stukje sequentie van mRNA. Door hier te binden wordt er een dubbele streng gevormd. De translatie wordt dan tegengehouden.

Question 16

Agrobacterium tumefaciens

Answer 16

Bij Agrobacterium tumefaciens kunnen agrobacteriën recombinant DNA in een gastheer brengen. Agrobacteriën infecteren planten, ze induceren de celdeling van plantencellen.

Question 17

Gentherapie

Answer 17

is een medische behandeling die het DNA kan aanpassen.

Question 18

CRISPR-cas

Answer 18

(Clustered Regularly Interspaced Palindromic Repeats) is een nieuwe technologie die het mogelijk maakt om erfelijk materiaal van virussen, bacteriën, cellen, planten en dieren op relatief eenvoudige wijze zeer nauwkeurig en efficiënt te veranderen.

Question 19

Germline gentherapie

Answer 19

Het sperma of ei is aangetast om zo de aanpassingen over te brengen naar de nakomelingen.

Question 20

Somatische gentherapie

Answer 20

Het genoom wordt aangepast, maar dit wordt niet aan nakomelingen doorgegeven.

Question 21

In vivo gentherapie

Answer 21

Het gen wordt direct in de patiënt gebracht

Question 22

Ex vivo gentherapie

Answer 22

Cellen worden uit de patiënt verwijderd en hieraan wordt het gen toegevoegd. De cellen worden daarna weer in de patiënt gebracht.

Question 23

Cytokinese

Answer 23

het scheiden van de delende cellen.

Question 24

De drie mRNA bindingsplaatsen van het ribosoom + wat ze zijn/doen

Answer 24

A: aminozuur + tRNA
Hier komt een nieuw aminozuur waar de polypeptide aan bind.
P: polypeptide + tRNA
De polypeptide gevormd op A schuift op naar P.
E: Einde
Het tRNA waar nu geen aminozuur meer aan zit laat los.

Question 25

Polyribosomen

Answer 25

Er worden veel polypeptide ketens tegelijkertijd gemaakt door de ribosomen.

Question 26

De proteosoom

Answer 26

Dit is een groot eiwitcomplex wat eiwitten afbreekt in de kern. Bijvoorbeeld fout gevouwen eiwitten of eiwitten die heel kort leven.
Aan de foute eiwitten bind het ubiquitine, dit wordt herkent door de proteosoom waardoor het wordt afgebroken.